Methodenartikel

Automatisierte Quantifizierung der Fluoreszenz-in Synaptic C elegans

DOI:

10.3791/4090

10. August 2012

In diesem Artikel

Zusammenfassung

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Die Fülle von Neurotransmitter-Rezeptoren an den Synapsen stark beeinflusst geclusterten synaptischen Stärke. Diese Methode quantifiziert fluoreszenzmarkierten Neurotransmitter-Rezeptoren in drei Dimensionen mit Single-Auflösung in Synapsen C elegans, So dass Hunderte von Synapsen zu schnell innerhalb einer einzigen Probe, ohne Verzerrungen, die durch z-Ebene Projektion eingeführt wird.

Zusammenfassung

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Synapse Stärke bezieht sich auf die Amplitude des postsynaptischen Antworten auf präsynaptische Freisetzung von Neurotransmittern Ereignisse, und hat einen großen Einfluss auf die Gesamt-neuronalen Schaltkreis-Funktion. Synapse Stärke hängt entscheidend von der Fülle von Neurotransmitter-Rezeptoren an Synapsen auf der postsynaptischen Membran gruppierten. Rezeptor-Ebenen sind entwicklungsgeschichtlich, etabliert und kann durch Rezeptortransport zwischen Oberflächen-lokalisierten, subsynaptischen und intrazellulären Pools, die für wichtige Mechanismen der synaptischen Plastizität und Neuromodulation verändert werden. Rigorosen Methoden zur synaptisch-lokalisierte Neurotransmitter-Rezeptor Fülle quantifizieren sind unerlässlich, um synaptischen Entwicklung und Plastizität zu studieren. Die Fluoreszenzmikroskopie ist optimal, weil es räumliche Information erhält, unterscheiden synaptischen aus nicht-synaptischen Pools und Unterscheiden zwischen Rezeptorpopulationen lokalisiert, um verschiedene Arten von Synapsen. Die genetischen Modellorganismus Caenorhabditis elegans ist besonders gut für diese Studien aufgrund der geringen Größe und der relativen Einfachheit seines Nervensystems, seine Transparenz, und die Verfügbarkeit von leistungsfähigen genetischen Techniken geeignet und ermöglicht Untersuchung der nativen Synapsen in intakten Tieren.

Hier präsentieren wir eine Methode zur Quantifizierung von fluoreszenzmarkierten synaptischen Neurotransmitter-Rezeptoren in C. elegans. Sein wesentliches Merkmal ist die automatisierte Identifikation und Analyse einzelner Synapsen in drei Dimensionen in mehreren Ebenen konfokalen Mikroskop Ausgabedateien, Tabellieren Position, Volumen, Intensität der Fluoreszenz, Fluoreszenz und insgesamt für jede Synapse. Dieser Ansatz hat zwei wesentliche Vorteile gegenüber der manuellen Analyse der z-Ebene konfokale Projektionen von Daten. Erstens, weil jede Ebene des konfokalen Datensatz enthalten ist, werden keine Daten über z-Ebene Projektion verloren, in der Regel auf Pixelintensität Durchschnitte oder Maxima basiert. Zweitens Identifizierung von Synapsen automatisiert ist, aber durch die ex überprüft werdenperimenter wie die Datenanalyse geht, so dass eine schnelle und genaue Extrahierung von Daten aus einer großen Anzahl von Synapsen. Hunderte bis Tausende von Synapsen pro Probe leicht erhalten werden, produzieren große Datensätze statistische Energie zu maximieren. Überlegungen zur Vorbereitung C. elegans zur Analyse und Durchführung konfokale Bildgebung an Variabilität zwischen den Tieren innerhalb Behandlungsgruppen zu minimieren werden ebenfalls diskutiert. Zwar entwickelt, um C zu analysieren elegans postsynaptischen Rezeptoren, ist dieses Verfahren im Allgemeinen für jede Art von synaptisch-lokalisierten Protein oder Tat, einem Fluoreszenz-Signal, das diskrete Cluster, Punkte oder Organellen lokalisiert ist nützlich.

Das Verfahren wird in drei Schritten durchgeführt: 1) Herstellung von Proben, 2) konfokale Abbildung, und 3) Bildanalyse. Schritt 1 und 2 sind spezifisch für C elegans, und Stufe 3 ist allgemein anwendbar auf jede punktförmige Fluoreszenz-Signal in der konfokalen Aufnahmen.

Protokoll

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1. Vorbereitung der Würmer zur Bildgebung

Dieses Segment des Protokolls basiert auf veröffentlichten C. elegans-Kultivierungstechniken1,2 und ist in Abbildung 1 dargestellt.

  1. Züchten Sie die Würmer auf NGM-Agarplatten mit hohem Peptonanteil (10 cm) mit NA22 E. coli-Bakterien, bis sie nahezu verhungert sind. Für Immunfärbungen liefert eine Platte zuverlässig genügend Würmer für eine einzelne Färbung, wobei Verluste im Verlauf und die strengen Kriterien zur Auswahl der Würmer für die Bildgebung berücksichtigt werden (siehe Teil 2).
  2. Ernten Sie die Würmer, indem Sie einige ml dd....

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Diskussion

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Die hier vorgestellte Methode wurde entwickelt, um quantitative Multi-Parameter-Daten für große Populationen von Synapsen in C extrahieren elegans, bei gleichzeitiger Maximierung der Konsistenz innerhalb Behandlungsgruppen. Drei Merkmale tragen zu diesen Zielen. Zunächst wird Immunfärbung auf synchrone Wurm Populationen durchgeführt, um sicherzustellen, dass alle Tiere gleich alt sind. Dieser Schritt ist wichtig, weil Entwicklungs-Regulierung der Expression Effekte der experimentellen Behandlung zu ver.......

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Offenlegungen

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Keine Interessenskonflikte erklärt.

Danksagungen

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Die Autoren bedanken sich bei A. Benham für die Unterstützung bei der Entwicklung des Protokolls zu danken. Diese Arbeit wurde vom NIH finanziert NS06747 auf BAB

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Name der Software Firma Kommentare (optional)
Endgeschwindigkeit, v4.0 oder höher PerkinElmer / Improvision Überprüfen Sie Ihre lokalen Imaging Core Facility für den Zugang zu dieser Software. Demo-Software ist auf der Website von PerkinElmer zur Verfügung. Diese Methode erfordert nur die Quantifizierung des Moduls Endgeschwindigkeit.
Tabelle 2. Spezifischen Reagenzien und Geräte.
Egg-Puffer NaCl
KCl
CaCl 2
MgCl 2
HEPES
(Den pH-Wert 7,3)
118 mM
48 mM
2 mM
2 mM
24 mM
Alkalischem Hypochlorit (für 5 ml) Frische Haushaltsbleiche (verwerfen Flasche 30 Tage nach dem Öffnen)
10 N NaOH
ddH 2 O
1,0 ml 0,25 ml
3,75 ml

Tabelle 1. Solutions.

Referenzen

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  1. Christensen, M. A primary culture system for functional analysis of C. elegans neurons and muscle cells. Neuron. 33, 503-514 (2002).
  2. Lewis, J. A., Fleming, J. T. Basic culture methods. Methods Cell Biol. 48, 3-29 (1995).
  3. Bettinger, J. C., Lee, K., Rougvie, A. E.

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Schlagwörter

Quantifizierung der synaptischen FluoreszenzC elegans Imagingkonfokale Mikroskopieanalyseautomatisierte SynapsenidentifizierungMessung der Fluoreszenzintensit tdreidimensionale Bildanalysepunktf rmiges FluoreszenzsignalAbundanz von Neurotransmitter RezeptorenProtokoll zur ProbenvorbereitungExport der Datentabellierung

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