Method Article

Eine mikrofluidische Chip für die vielseitige chemische Analyse von Einzelzellen

DOI:

10.3791/50618

October 15th, 2013

In This Article

Summary

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In diesem Artikel präsentieren wir ein Mikrofluidik-Chip für Einzelzellanalyse. Es ermöglicht die Quantifizierung der intrazellulären Proteine, Enzyme, Cofaktoren und zweiten Boten mittels Fluoreszenzassays oder Immunoassays.

Abstract

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Wir stellen eine Mikrofluidik-Vorrichtung, die die quantitative Bestimmung der intrazellulären Biomoleküle in mehreren Einzelzellen parallel ermöglicht. Zu diesem Zweck werden die Zellen passiv in der Mitte eines Mikrokammer gefangen. Nach der Aktivierung des Steuerungsschicht wird die Zelle von der umgebenden Volumen in einer kleinen Kammer isoliert. Die umgebende Volumen kann dann ohne die isolierte Zelle ausgetauscht werden. Jedoch nach kurzer Öffnen und Schließen der Kammer, wobei die Lösung in der Kammer in ein paar hundert Millisekunden ersetzt werden. Aufgrund der Reversibilität der Kammern, die Zellen können an verschiedenen Lösungen nacheinander in einer hoch steuerbar, z. B. für die Inkubation, Waschen und schließlich Zelllyse ausgesetzt werden. Die dicht verschlossenen Kleinst ermöglichen die Retention des Lysats, zu minimieren und die Verdünnung zu steuern, nachdem Zell-Lyse. Seit Lyse und Analyse an der gleichen Stelle auftreten, wird eine hohe Empfindlichkeit beibehalten, da keine weitere dilution oder Verlust der Analyten erfolgt während des Transports. Die Mikrokammer-Design ermöglicht somit die zuverlässige und reproduzierbare Analyse sehr kleiner Kopienzahlen von intrazellulären Molekülen (attomol, zeptomoles) aus einzelnen Zellen freigesetzt wird. Darüber hinaus können viele Mikrokammern in einem Array-Format angeordnet werden, wodurch die Analyse von vielen Zellen gleichzeitig, da die geeignete optische Geräte für die Überwachung verwendet wird. Wir haben bereits die Plattform für den Proof-of-Concept-Studien verwendet, um intrazelluläre Proteine, Enzyme, Cofaktoren und Botenstoffe in relativ oder absolut quantifizierbare Weise zu analysieren.

Introduction

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Viele Studien haben in der Vergangenheit Zell-zu-Zell-Unterschiede innerhalb einer großen Zellpopulation 1-3, insbesondere Signalprozesse 4 oder die Mengen an intrazelluläre Biomoleküle wie Proteine ​​5,6, Metaboliten, und Cofaktoren 7,8 ergab. Diese Heterogenitäten werden als grundlegend wichtig für die Zell Anpassung und Evolution 9 zu sein, aber auch eine Schlüsselrolle in der Entstehung und Behandlung von Krankheiten wie Krebs 13.10. Daher Studien über die Einzelzellebene sind von hohem Interesse in der biologischen und pharmakologischen Forschung, insbesondere, wenn diese Studien zeigen die versch....

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Protocol

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1. SU-8 Master Fabrication

Bereiten Sie die beiden Master-Formen für die Kanäle (fluidische und Kontrolle, für Schaltpläne und Abmessungen siehe Abbildung 2) mit dem folgenden Protokoll, aber mit unterschiedlichen Maskenmustern. Das Verfahren wird in Fig. 3a gezeigt.

  1. Beginnen, indem eine 4-Zoll-Siliciumwafer 10 min lang bei 180 ° C Laden Sie die dehydriert Wafer auf einem Spin-Coater und verwenden Sie die folgende Protokoll für Spin-Coating-SU-8 2015:
    1. Spin-Wafer bei 100 Upm für 20 sec (offene Deckel des Spin-Coater, verzichten SU-8 in diesem Schritt, Deckel schließen nach der Ausgabe).

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Results

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Unsere Plattform ist in der Lage, eine Vielzahl von intrazellulären und sekretierten Molekülen in Gegenwart oder durch einzelne Zellen produziert analysieren. Hier möchten wir beispielsweise verschiedene Studien, um die Vielfalt der möglichen Tests unterstreichen präsentieren. Wir werden ein Beispiel für ein sezerniertes Enzym (5a) sowie ein intrazelluläres Enzym (Fig. 5b) und Protein (Fig. 5c und d) erhalten wird. Weitere Beispiele, wie Cofaktoren oder.......

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Discussion

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Mikrofluidik-Technologie hat neue und faszinierende Möglichkeiten für die Einzelzellanalyse eröffnet. Insbesondere hat die Möglichkeit, zu fangen und zu immobilisieren Zellen einzeln von Mikrofluidik-Tools systematische Kurz-und Langzeitstudien auf Einzelzelleigenschaften und der Reaktion erlaubt. Zusätzlich Verkapselung von Zellen in hoher Frequenz Mikrotröpfchen auf einem Mikrochip erzeugt hat einzelne Zelle Sekretion Studien, die mit herkömmlichen Vorrichtungen durchgeführt werden Zytometrie kann aktiviert. Die Mikro.......

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Disclosures

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Die Autoren erklären, dass sie keine finanziellen Interessen konkurrieren.

Acknowledgements

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Die Autoren danken Tom Robinson für das Korrekturlesen des Manuskripts, C. Bärtschi und H. Benz für den Bau des custom-built Druck-Kontrollsystem. Wir möchten auch auf die Verwendung des Reinraum FIRST und der Lichtmikroskopie Center (LMC), die beide an der ETH Zürich zu bestätigen. Die Arbeit wurde von Merck Serono und des Europäischen Forschungsrates (ERC) im 7. Rahmenprogramm (ERC Starting Grant, Projekt-Nr. 203428, nμLIPIDs) finanziert.

....

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
REAGENTS:
Name des ReagenzesKatalognummerdes Unternehmens Bemerkungen (optional)
SU-8 2015MicroChem Corp. (Netwon, MA)
ABCR (Karlsruhe, Deutschland)AB103608
4-Methylumbelliferyl β-D-N,N′-DiacetylchitobiosidhydratSigma AldrichM9763
AcetonMerck VWR (Darmstadt, Deutschland)100014
AvidinAppliChem (Axon Lab AG)A-2568
AZ 1518AZ Electronic Materials (Wiesbaden, Deutschland)n.a.AZ
726 EntwicklerAZ Electronic Materials (Wiesbaden, Deutschland)n.a.
RinderserumalbuminSigma AldrichA-4503
Rinderserumalbumin, BiotinSigma AldrichA-8549
ZelldissoziationspufferInvitrogen13151-014
Hexamethyldisilazan (HDMS)Sigma Aldrich40215
SalzsäureFluka84422
IsopropanolMerck VWR (Darmstadt, Deutschland)109634
Magnesiumchlorid-HexahydratFluka63068
MR Entwickler 600Microresist technology GmbH (Berlin, Deutschland)n.a.PBS
Invitrogen10010-031
PLL-g-PEG transplantiertesSuSoS, (Dü bendorf, Schweiz)n.a.PLL-g-PEG
gepfropftes BiotinSuSoS, (Dü bendorf, Schweiz)n.a.Kaliumchlorid
Fluka60132
Protein G, BiotinSigma Feinchemikalien41624
SiliziumwaferSi-Mat (Kaufering, Deutschland)n.a.Sylgard
184 Silikonelastomer Kit (PDMS)Dow Corning39100000
Tris(hydroxymethyl)-aminomethanBiorad
Tween 20Biorad1706531
AUSSTATTUNG:
MaterialnameFirmaKatalognummerKommentare (optional)
0.22 µ m PES SpritzenvorsatzfilterTRP99722
1/1,5 mm Biopsie-PuncherMiltex, York PA33-31AA/33-31A
Cell Trics Filter 20 & Mikro; mPartec04-004-2325
Zentrifuge Sigma 3-18KKuehnern.a.Hotplate
HP 160 III BMSawatec, Sax, Schweizn.a.MA-6
Mask AlignerKarl Suessn.a.Multizoom
AZ100M MikroskopNikon Corporationn.a.Photomask
Microlitho, Essex, U.K.n.a
Plasmareiniger PDC-32GHarrickn.a.Spin
Coater Modell WS-400 BZ-6NPP/LITELaurelln.a.Spin
Module SM 180 BMSawatec, Sax, Schweizn.a.Step
Profiler Dektak XT AdvancedBrukern.a.Spritzenpumpe
neMESYSCetonin.a.
n.a.1H,1H,2H,2H-Perfluordecyl-dimethylchlor-silan 1610716

References

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  1. Walling, M. A., Shepard, J. R. E. Cellular heterogeneity and live cell arrays. Chem. Soc. Rev. 40 (7), 4049-4076 (2011).
  2. Schmid, A., Kortmann, H., Dittrich, P. S., Blank, L. M. Chemical and biological single cell analysis. Curr. Opin. Biotechnol. 20 (1), 12-20 (2010).
  3. Lecault, V....

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Microfluidic ChipSingle Cell AnalysisCell LysisFluorescence MicroscopyImmunoassay DetectionFluidic ControlPDMS FabricationChamber TrappingSolution ExchangeBiomolecule Quantification

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