Alle lebenden Zellen verarbeiten Informationen, indem sie Fracht wie extrazelluläre Liganden, Mikroorganismen, Nährstoffe, Transmembranproteine und Lipide von der Plasmamembran zu endozytären Vesikeln transportieren (d.h. Endozytose). Ein reziproker Prozess, der als Recycling bezeichnet wird, gleicht die Endozytose aus und gibt einen Großteil der internalisierten Membran und Fracht an die Zelloberfläche zurück. Das Gleichgewicht zwischen Endozytose und Recycling steuert die Zusammensetzung der Plasmamembran und versorgt die Zellen mit Informationen, die in Zeit und Raum aufgelöst wurden. Endozytose und Recycling sind Hauptregulatoren verschiedener zellulärer Funktionen wie Nährstoffaufnahme und -stoffwechsel, Entwicklung, Proliferation, Differenzierung und Polarität, Reprogrammierung, Migration, Zelladhäsion und -migration, Zytokinese und Neurotransmission1-3. Endozytäre und Recyclingwege sind sehr dynamisch und hochgradig koordiniert und ermöglichen es den Zellen, das Äquivalent der gesamten Plasmamembran 1-5x pro Stunde umzudrehen.
Die zellbasierten L-Glutahion-Schutzassays sind nützlich, um die Endozytose und das Recycling von Transmembranproteinen einschließlich Rezeptoren, Kanälen, Transportern und Adhäsionsmolekülen in epithelialen und nichtepithelialen Zellenzu untersuchen 4-8. Wir haben zuvor die Endozytose und das Recycling des Mukoviszidose-Transmembran-Leitfähigkeitsregulators (CFTR) in menschlichen Atemwegsepithelzellen und HEK293-Zellen9-15 untersucht. Die im Manuskript beschriebenen biotinylierungsbasierten Assays sind optimiert für die Untersuchung der Endozytose und des Recyclings in Epithelzellen, die unter polarisierenden Bedingungen auf semipermeablen Wachstumsträgern kultiviert wurden. Diese Protokolle können modifiziert werden, um die Endozytose und das Recycling von Proteinen in Epithelzellen zu untersuchen, die in plastischen Gewebekulturschalen oder in nichtepithelialen Zellen kultiviert wurden. Die Abbildungen 1 und 2 enthalten Beispiele für endozytäre und Recycling-Assays in epithelialen und nichtepithelialen Zellen.
Endozytäre Assays werden wie zuvor beschrieben9-15 durchgeführt. Die Zellen werden auf kollagenbeschichteten semipermeablen Wachstumsstützen kultiviert11,14. Alternativ können Zellen in mit Kollagen beschichteten Gewebekulturschalen aus Kunststoff kultiviert werden10,15. Die Zellen werden schnell auf 4 °C abgekühlt, um den Membrantransport zu stoppen, und die Plasmamembranproteine werden bei 4 °C mit einem zellmembranundurchlässigen Biotin markiert. Biotin reagiert mit ε-Amin von Lysinresten und die Disulfidbindung ist thiol-spaltbar. Nach der Biotinylierung werden die Zellen bei 37 °C inkubiert, um den Proteintransport zu induzieren und endozytäre Vesikel für 2,5, 5,0, 7,5 oder 10 Minuten zu beladen. Anschließend werden die Zellen auf 4 °C abgekühlt und die Disulfidbindung in Biotin, das kovalent an Plasmamembranproteine gebunden ist, mit L-Glutathion (GSH) reduziert. An diesem Punkt des Protokolls sind nur Proteine, die von der Plasmamembran endozytiert wurden, vor GSH geschützt und bleiben somit biotinyliert. Zellen, die nach der Biotinylierung bei 4 °C verbleiben, ohne bei 37 °C oder der GSH-Behandlung zu inkubieren, würden dazu dienen, die Menge an biotinyliertem CFTR zum Zeitpunkt Null zu bestimmen. Zellen, die nach der Biotinylierung bei 4 °C verbleiben, ohne Inkubation bei 37 °C, aber mit GSH-Behandlung, würden dazu dienen, die Effizienz der Disulfidbindungsreduktion zu bestimmen. Im Anschluss an die oben beschriebenen Behandlungen werden Zellen lysiert, biotinylierte Proteine werden durch Streptavidin-Agarose isoliert, in SDS-Probenpuffer eluiert und durch SDS-PAGE getrennt. Das interessierende Protein wird in den biotinylierten Proben durch Western Blot nachgewiesen. Die Menge an biotinyliertem Protein bei 4 °C zum Zeitpunkt Null (ohne die Erwärmung um 37 °C) wird als 100 % angesehen. Die Menge an Protein, die nach einer GSH-Behandlung bei 4 ºC biotinyliert verbleibt, gilt als Hintergrund und wird von der Menge an Protein subtrahiert, die nach dem Erwärmen auf 37 ºC zu verschiedenen Zeitpunkten biotinyliert bleibt. Die Proteinendozytose wird nach Subtraktion des Hintergrunds berechnet und ausgedrückt als Prozentsatz des biotinylierten Proteins zu jedem Zeitpunkt nach der Erwärmung auf 37 ºC im Vergleich zu der Menge an biotinyliertem Protein, die zum Zeitpunkt Null vorhanden ist.
Recycling-Assays werden wie zuvor beschrieben durchgeführt11,16. Die Zellen werden auf kollagenbeschichteten semipermeablen Wachstumsstützen kultiviert11. Alternativ können Zellen auf mit Kollagen beschichteten Gewebekulturschalen aus Kunststoff kultiviert werden13. Die Zellen werden nach der Biotinylierung auf 37 °C erwärmt, um endozytäre Vesikel mit biotinylierten Proteinen zu beladen. Der Zeitpunkt der ersten Inkubation bei 37 ºC wird durch den Zeitpunkt bestimmt, zu dem die Endozytose des interessierenden Proteins während des linearen Anstiegs des endozytären Signals das Maximum erreicht. Die Zeit ist proteinspezifisch und kann vom Zelltyp und den Zellkulturbedingungen abhängen. Nach unseren Erfahrungen erreichte die CFTR-Endozytose ein Maximum bei 5,0 bzw. 7,5 min13,14 (Abbildungen 1 und 2). Anschließend werden die Zellen sofort auf 4 °C abgekühlt und die Disulfidbindung in Biotin, das an Plasmamembranproteine gebunden ist, wird mit GSH reduziert. Anschließend werden die Zellen entweder lysiert, um die Menge des endozytierten Proteins von Interesse zu bestimmen, oder sie werden für verschiedene Zeiträume erneut auf 37 °C erwärmt, damit das endozytierte biotinylierte Protein von Interesse zur Plasmamembran recycelt werden kann. Anschließend werden die Zellen wieder auf 4 °C abgekühlt, und die Disulfidbindung an Biotin, die an Proteine gebunden ist, die an die Plasmamembranen zurückgeführt werden, wird mit GSH reduziert. Das Recycling des interessierenden Proteins wird aus der Differenz zwischen der Menge an biotinyliertem Protein nach der ersten und zweiten GSH-Behandlung bestimmt.
Die Machbarkeit der endozytären und Recycling-Assays hängt von mehreren Faktoren ab. Erstens ist die Bildung von Zellmonoschichten eine Voraussetzung, und Zellen, die keine Monoschicht bilden oder als Mehrschichten wachsen, sind für die in diesem Manuskript beschriebenen Assays nicht geeignet. Zweitens sind die Häufigkeit des interessierenden Proteins auf der Zelloberfläche und das Vorhandensein eines Antikörpers zum Nachweis des Proteins durch Western Blotting entscheidend. Wir empfehlen, dass die Steady-State-Häufigkeit des Proteins zunächst in Ganzzelllysaten (WCL) bestimmt wird. Drittens soll die Fähigkeit getestet werden, das spezifische Zelloberflächenprotein zu biotinylieren. Biotin bindet sich an Lysinreste. Die Effizienz der Biotinylierung hängt also zum Teil von der Anzahl der Lysinreste in der extrazellulären Domäne des Proteins ab. Dementsprechend empfehlen wir, die Proteinsequenz zu screenen, um festzustellen, ob Lysinreste in der/den extrazellulären(n) Domäne(n) vorhanden sind. Nicht alle Lysinreste der extrazellulären Domäne sind aufgrund der Proteinfaltung für Biotin gleichermaßen zugänglich. Daher sollte eine Proteinbiotinylierung im stationären Zustand, gefolgt von Western Blotting, durchgeführt werden, um nicht nur die Stetigkeitshäufigkeit des Proteins an der Zelloberfläche zu bestimmen, sondern auch die Durchführbarkeit der auf Biotinylierung basierenden Assays für das interessierende Protein zu untersuchen.
Dieses Protokoll ist optimiert für die Untersuchung der Endozytose und des Recyclings von Wildtyp-CFTR in menschlichen Atemwegsepithelzellen CFBE41o-kultiviert auf 24 mm semipermeablen Wachstumsträgern in der Luft-Flüssig-Grenzfläche9,10,13-15. CFTR polarisiert zur apikalen Membrandomäne; Somit beschreibt das Protokoll die Biotinylierung der apikalen Membrandomäne. Die Biotinylierung der basolateralen Membrandomäne wird erforderlich sein, um die Endozytose und das Recycling von Proteinen, die zur basolateralen Membran polarisieren, zu untersuchen. Das in diesem Manuskript beschriebene endozytäre Assay-Protokoll hat 6 Bedingungen: Nur biotinyliert (BT = Zeit Null; Probe a); GSH-Kontrolle (GSH; Probe b); und die endozytären Zeitpunkte von 2,5, 5,0, 7,5 oder 10 Minuten (Proben c; Tabelle 1). Die Anzahl und/oder Länge der endozytären Zeitpunkte im Protokoll kann nach Bedarf geändert werden.
Der Recycling-Assay wird durchgeführt, nachdem der Zeitpunkt bestimmt wurde, zu dem die Endozytose des interessierenden Proteins während des linearen Anstiegs des endozytären Signals das Maximum erreicht. Dieser Zeitpunkt wird verwendet, um endozytäre Vesikel mit dem interessierenden Protein zu beladen, bevor das Recycling induziert wird. Die Zeit ist proteinabhängig und kann je nach Zelltyp und Kulturbedingungen variieren15. Wir haben bereits festgestellt, dass die CFTR-Endozytose bei 7,5 Minuten in humanen Atemwegsepithelzellen CFBE41o, die CFTR15 stabil exprimieren, ein Plateau erreichte. Im Gegensatz dazu erreichte die CFTR-Endozytose bei 5,0 Minuten in HEK293-Zellen, die CFTR13 stabil exprimierten, ein Plateau. Das in diesem Manuskript beschriebene Recycling-Assay-Protokoll hat 5 Bedingungen: Nur biotinyliert (BT = Zeit Null; Probe a); GSH-Kontrolle (GSH; Probe b); 5,0 min Endozytose (Endo; Probe c), 5,0 min Endozytose, gefolgt von den 2,5 oder 5,0 min Recycling-Zeitpunkten (Rec; Proben d; Tabelle 2). Die Anzahl und/oder Länge der Recycling-Zeitpunkte im Protokoll kann nach Bedarf geändert werden.