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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier präsentieren wir unsere etablierte Methode zur menschlichen Körperzellen in gentechnikfreien menschlichen iPS-Zellen mit Sendai-Virus, das konsequente Ergebnis-und Effizienzsteigerung zeigt neu zu programmieren.
Vor ein paar Jahren, die Einrichtung des menschlichen induzierten pluripotenten Stammzellen (iPS-Zellen) in eine neue Ära in der Biomedizin eingeläutet. Mögliche Verwendung von menschlichen iPS-Zellen umfassen Modellierung Pathogenese der menschlichen genetischen Erkrankungen, autologe Zelltherapie nach der Gen-Korrektur und personalisierte Wirkstoff-Screening durch eine Quelle von Patienten-spezifischen und Symptom relevanten Zellen. Allerdings gibt es einige Hürden zu überwinden, wie die Beseitigung der verbleibenden Umprogrammierung Faktor Transgen-Expression nach menschlichen iPS-Zellen-Produktion. Noch wichtiger ist, könnte Rest Transgen-Expression in undifferenzierten menschlichen iPS richtige Differenzierungen behindern und verleiten die Auslegung von krankheitsrelevanten In-vitro-Phänotypen. Mit diesem Grund haben die Integration frei und / oder Transgen-freien menschlichen iPS-Zellen mit verschiedenen Methoden, wie z. B. Adenovirus, der piggyBac System, Minicircle-Vektor, episomaler Vektoren, direkte Lieferung Protein entwickelt und synthetisiert mRNA. Jedoch Effizienz reprogrammierung mit Integration freie Verfahren ist in den meisten Fällen sehr gering.
Hier präsentieren wir eine Methode, um menschliche iPS-Zellen unter Verwendung von Sendai-Virus (RNA-Virus) auf der Basis Umprogrammierung System zu isolieren. Diese Umprogrammierung Methode zeigt, konsistente Ergebnisse und eine hohe Effizienz in kostengünstiger Weise.
Menschliche embryonale Stammzellen (hES-Zellen) haben eine Kapazität zur Selbsterneuerung in vitro und haben Pluripotenz, die potenziell nützlich für Krankheit Modellierung sein könnte, für Wirkstoff-Screening, und zellbasierte Therapien zu entwickeln, um Krankheiten und Gewebeverletzungen zu behandeln. Allerdings haben hESCs eine Beschränkung für die Zell-Ersatztherapie wegen der immunologischen, onkologischen und ethischen Schranken, und im Zusammenhang mit Krankheit Gene studieren, konnte krankheitsspezifische hESCs durch Präimplantations-Diagnostik (PID) Ansätze isoliert werden, aber es ist immer noch eine technische Herausforderung und die Embryo-Spenden sind ziemlich selten. Diese Fragen werden an die Fortschritte in der Stammzellbiologie, die zur Entwicklung von induzierten pluripotenten Stammzellen (hiPSCs) geführt hat, zusammen.
Menschliche iPS sind genetisch aus menschlichen adulten somatischen Zellen umprogrammiert und Hafen pluripotente Stammzelle-ähnliche Funktionen ähnlich hESCs, der sie macht eine nützliche Quelle für die regenerative Medizin wie dTeppich Entdeckung, Krankheit Modellierung und Zelltherapie in Patienten-spezifischen Weise 1,2.
Bis jetzt gibt es mehrere Methoden, um menschliche iPS-Zellen zu generieren, einschließlich Virus-vermittelte (Retrovirus und Adenovirus) 3, nicht-Virus-vermittelte (BAC-System und Vektoren Transfektion) 4-Gen Transduktionen und Protein-Liefersystem 7.5.
Obwohl eine Lieferung von Virus-vermittelte Gene können ein gewisses Maß an Effizienz zu gewährleisten, konnte virale Vektoren genetischen Fußabdruck zu verlassen, weil sie in Wirts Chromosomen zu integrieren, um eine Anpassung Gene unkontrolliert auszudrücken. Selbst wenn virale Integration Transkriptionsfaktoren aktivieren oder inaktivieren Wirtsgene 8 kann eine unerwartete genetische Aberration und das Risiko von Tumorgenese 5,9 verursachen. Auf der anderen Seite wurden die direkte Einführung von Proteinen oder RNA in somatische Zellen berichtet, haben aber einige Nachteile, wie arbeitsintensiv, wiederholt transfbschnitt, und niedrige Niveau der Umprogrammierung 7,10. Auch episomal und nicht-integrierenden Adenovirus, Adeno-assoziiertes Virus und Plasmid-Vektoren sind noch relativ weniger effizient 11. Aus diesen Gründen ist es plausibel, Nicht-Integration Umprogrammierung Verfahren mit hoher Wirksamkeit iPSC Erzeugung und weniger genetische Anomalien zu wählen. In dieser Studie verwenden wir ein Sendai-Virus-basierten Neuprogrammierung. Diese Methode ist bekannt, dass in das Wirtsgenom nicht integrierten und konsequent produziert menschlichen iPS-Zellen ohne Transgen-Integrationen.
1. Herstellung von Zell und Medien (Tag 1)
2. Führen Transduction (Tag 2)
3. Austausch von Kultur-Medium (Tag 3 und Tag 5)
4. Bereiten MEF Geschirr für die Co-Kultur (Tag 8)
5. Starten Co-Kultur Transduzierte MEF-Zellen mit Feeder-Zellen (Tag 9)
6. Feed-menschlichen embryonalen Stammzellen Medium und Überwachung der Zellen (Tag 10)
7. Picking die induzierten pluripotenten Stammzellen Kolonien und erweitern die Zellen (Tag 20 ~)
8. Charakterisierung humaner iPS-Zellen (nach 10 Passagen)
Normalerweise infizierten Fibroblasten keine morphologischen Veränderungen in mehrere Tage nach Sendai-Virus-Transduktion zu zeigen, aber fünf Tage später, beginnen sie zu verschiedenen Formen (Abbildung 1) zu haben. Wie im rechten Teil der Abbildung 1 beschrieben, funktionieren Zellen nicht typisch Fibroblastenmorphologie mehr. Sie haben eine runde Form und größeren Kern als Zytoplasma. Auch bei Übertragungs wird in 80% zellulären Konfluenz durchgeführt wird, sieht es aus wie sie sind weniger in der konfluenten gut, nachdem sie beginnen, neu zu programmieren. Wenn diese Art von morphologischen Veränderungen beginnen, in der die meisten der gut zu erkennen ist, sind transduzierten Fibroblasten bereit, auf MEF-Feeder-Kulturschalen plattiert werden.
In unserem Protokoll, minimiert wir Zellkultur Skala und gab auch verschiedene Möglichkeiten Reprogrammierung, wie Fibroblasten, die unterschiedliche Zelldichte und Viren-Titer und die anschließende Re-Beschichtung mehrere Verhältnis MEF, die hiPSCs Erzeugungseffizienz erhöhen wird ( Zu Beginn der Umprogrammierung auf MEF Feeder, ist es schwer zu transduzierten Zelltypen zu unterscheiden, aber nach über einer Woche Co-Kultur, erscheinen teilweise neu programmiert Fibroblasten und sehen aus wie gelockert ES-ähnliche Form (Abbildung 3). Aus diesem Grund, wenn menschliche iPS-Kolonien sind bereit für die Passage in neue MEF Feeder-Gericht, ist die manuelle Kommissionierung effizienter Weg für die Übertragung statt Spaltung mit dem Enzym. In Abbildung 3 und Abbildung 4, unter dem Mikroskop nur menschliche iPS-Zellen haben klare Kanten, die eine klare Unterscheidung zwischen menschlichen iPS-Zellen (als 'völlig neu programmiert Zellen "betrachtet) und" unvollständig Zellen umprogrammiert' von Morphologie zu machen. Komplett neu programmiert Zellen look, wie kompakt und dicht verpackt. Vor allem die Kolonien haben klare Grenze, während teilweise neu programmiert Zellen aussehen versammeln, um Kolonie zu machen, aber sehr zerbrechlich zu verlieren und zu brechen. Selbst wenn wir eine Pipettieren vorsichtig tun, es ist leicht gelöst. Auch nach dem Ausschluss teilweise umprogrammiert menschlichen iPS-Zellen Kolonien (während sie erweitern und Passagieren), müssen vollständig neu programmiert menschlichen iPS-Zellen, die von der manuellen Kommissionierung gepflegt werden. Nach der Kommissionierung Kolonien und den Ausbau hiPSC Klone in mehreren Wochen, Ausdruck stemness Marker bestimmt werden muss. Nach dem Ausbau der hiPSC Klone, haben wir sie überprüfen mit verschiedenen Gruppen von Tests, einschließlich Antikörperfärbung (SSEA4, Oct-4, TRA-81 und Nanog) und RT-PCR von pluripotenten Marker (Daten nicht gezeigt) als eine Qualitätskontrolle. Im Vergleich zu H9, sind zwei verschiedene hiPSCs positiv SSEA4, Oct-4, TRA-81, und Nanog. Dieses Ergebnis zeigt, dass isolierte menschliche pluripotente iPS erworben Qualität ( Schließlich Abbildung 6 zeigt, dass wir keine Expression des Transgens in hiPSC Klone nicht erkennen, durch RT-PCR. Zumindest über 10 Passagen hiPSCs, spezifischen Primern (Tabelle 1) für exogene Oct-4, Sox-2, Klf-4 und c-Myc mit positiven Kontrollproben mit starker Expression des Transgens Ebene verwendet werden. Tabelle 1. RT-PCR-Primer für Transgen Bestätigung. Sind die Primer-Sequenzen, die für tra verwendet werden,NsGene Bestätigung. T m 50,6 ° C in allen Primer-Sets. 
Abbildung 1. Morphologische Veränderung nach Sendai-Virus-Transduktion. Vor der Transduktion, Fibroblasten zeigen typische spindelförmig (links). Etwa acht Tage nach Transduktion, Morphologie der transduzierten Zellwechsel wie viel mehr runde Form (rechts). Bitte klicken Sie hehe um eine größere Version dieser Figur zu sehen. 
Abbildung 2. Diagramm der Einarbeitungsplan, um maximale Effizienz zu gewährleisten. Über vier verschiedene Zelltypen können in einer 24-Well-Platte überzogen werden (von 1 bis 4). Da ihre Befestigung und Zellüberlebensfähigkeit könnte abhängig von den verschiedenen Zelltypen sein, wird vorgeschlagen, unterschiedliche Zelldichte (von 200 K bis 6.25K Zellen pro Vertiefung) zu plattieren. Darüber hinaus kann Viruskonzentration eingestellt werden (0,5 X, 1X und 2X). 
Abbildung 3. Bildung von menschlichen induzierten pluripotenten Stammzellen Zellkolonie aus transduzierten fibroblast. In etwa zwei Wochen nach der erneuten Plattierung sie in MEFs, sollte umgehen Kolonien erscheinen und sehen aus wie menschliche embryonale Stammzellkolonien. Normalerweise werden die vollständig neu programmiert menschlichen iPS-Kolonien haben sehr klare Grenzen. (Pfeil: vollständig neu programmiert menschlichen iPS Kolonien, Pfeilspitze: teilweise neu programmiert menschlichen iPS-Zellen). Klicken Sie hier für eine größere Ansicht . 
Abbildung 4. Picking up menschlichen induzierten pluripotenten Stammzellen Zellkolonien. Menschliche iPS Kolonien werden oft von teilweise neu programmiert Zellen (links) umgeben ist. Unter dem Mikroskop, Kommissionierung der ES-Kolonie nur wie, brechen in kleine Klumpen und dann Übertragung (rechts). Nach 2 bis 3 Passagen, es sind undifferenzierte hiPSC Kolonien (unten und links). (Pfeil: vollständig neu programmiert menschlichen iPS Kolonien, Pfeilspitze: teilweise neu programmiert menschlichen iPS-Zellen) Klicken Sie hier für eine größere Ansicht . 
Abbildung 5. Immunfluoreszenzfärbung mit pluripotenten Stammzellmarker. Immunfluoreszenz-Test zeigt menschliche iPS-Zellen haben stemness features.SSEA-4, TRA-81, Nanog, Oct-4as pluripotenten Marker und DAPI ist eine Steuerung für Kernfärbung. (A) stellt H9-Färbung als eine Kontrollprobe. (B) und (C) zeigen menschlichen iPS-Klone.et = "_blank"> Klicken Sie hier für eine größere Ansicht. 
6. Bestätigung der Transgenexpression Ebene. Spätestens nach 10 Gang Kultur menschlicher iPSCs, Silencing von exogenen Sox2, Klf-4, c-Myc und Oct-4-Genexpression wird durch reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion bestätigt. hGAPDH ist eine interne Kontrolle. Für eine positive Kontrolle wird RNA aus Rest transduzierten Fibroblasten (Tag 7 nach der Sendai-Virus-Infektion) extrahiert. (Spur 1: Marker, Spuren 2-6: GAPDH, Klf4, c-Myc, Oct-4, Sox-2 und in Positiv-Kontrolle, Bahnen 7-11: GAPDH, Klf4, c-Myc, Oct-4 und Sox -2 in hiPSCs). Primer Namen <td> Sequenz hOCT4 (F) CCC GAA GAA AGA AGC GAA CCA G hOCT4 (R) AAT GTA TCG AAG GTG CTC AA hMYC (F) TAA CTG ACT AGC AGG CTT GTC G hMYC (R) TCC ACA TAC AGT CCT GGA TGA TGA TG hSOX2 (F) ACA AGA GAA AAA ACA TGT ATG G hSOX2 (R) ATG CGC TGG TTC ACG CCC GCG CCC AGG hKLF4 (F) ACA AGA GAA AAA ACA TGT ATG G hKLF4 (R) CGC GGC GCT AGG GCC GCT GCT CGA C hGAPDH (F) AGG TCG GAG TCA ACG TTG GAT hGAPDH (R) ATG GTG GCA TGG ACT GTG GT
Die Autoren haben nichts zu offenbaren.
Hier präsentieren wir unsere etablierte Methode zur menschlichen Körperzellen in gentechnikfreien menschlichen iPS-Zellen mit Sendai-Virus, das konsequente Ergebnis-und Effizienzsteigerung zeigt neu zu programmieren.
Wir möchten den Mitgliedern des Lee-Labor für wertvolle Diskussionen zum Manuskript danken. Die Arbeit im Labor Lee wurde durch Zuschüsse von Robertson Investigator Award der New York Stem Cell Foundation und von Maryland Stem Cell Research Fund (TEDCO) unterstützt.
| CytoTune-iPS Reprogrammierungskit | Invitrogen | A1378002 | |
| CF-6,MEFs, Neomycin-resistent, Mitomycin C behandelt | Globaler Stiel | GSC-6105M | 5 x 105/6 cm oder 12,5 x 105/24-Well-Platte |
| Trypsin EDTA 0,25 % Trypsin mit EDTA 4Na 1X | Invitrogen | 25200114 | |
| DMEM/F-12 Medium | Invitrogen | 11330-032 | |
| 24-Well-Zellkulturplatte, flacher Boden mit Deckel | BD | 353935 | |
| Y-27632 | TOCRIS | 1254 | 10 μ M (Lagerbestand: 10 mM) |
| basischer Fibroblasten-Wachstumsfaktor | LIFE TECHNOLOGIES | PHG0263 | 10 ng (Lagerbestand: 100 μg) |
| Knock-out-Serumersatz | Gibco | 10828028 | |
| Dulbecco' s Modifiziertes Eagle Medium (D-MEM, DMEM) (1X), flüssig (hoher Glukose) | Invitrogen | 11965118 | |
| Fötales Rinderserum | Thermo Scientific Fermentas | SH30071,03 | |
| L-Glutamin-200 mM (100X), flüssig | GIBCO | 25030-081 | 1/100 |
| MEM Lösung nicht-essentieller Aminosäuren, 100X | LIFE TECHNOLOGIES | 11140050 | 1/100 |
| 2-Mercaptoethanol (1.000X), flüssig | GIBCO | 21985023 | 1/1.000 |
| Hausser Phasenkontrast-Hämazytometer | Hausser Scientific | 02-671-54 | |
| EmbryoMax 0,1% Gelatinelösung | Millipore | ES-006-B | |
| SSEA-4 | DSHB | MC-813-70 | 1/200 |
| anti-Tra-1-81 | Cell Signaling | 4745S | 1/200 |
| Maus monoklonaler Oct4 Antikörper | Santa Cruz | SC-5279 | 1/1.000 |
| Nanog | R& D | AF1997 | 1/1.000 |
| Alexa Flouor 488 Anti-Maus für Ziegen | Invitrogen | 948492 | 1/2.000 |
| DPBS (Dulbecco' s Phosphatgepufferte Kochsalzlösung), 1X ohne Kalzium & magnesium | Cellgro | 21-031-CV | |
| QuantiTect Reverse Transkriptionskit | QIAGEN | 205313 | |
| PCR Master Mix [2X] | Thermo Scientific Fermentas | K0171 | |
| Trizol | Invitrogen | 15596018 | |
| Zupfhaube | NuAire | NU-301 | |
| Präparierfernrohr | Nikon | SMZ745 |