| REAGENZIEN - Tätowiermaschine | | | |
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| Reiniger | Tieridentifikations- und Markierungssysteme, Inc. | NMCR3 | Dies wird verwendet, um die Nadeln und den Halter nach dem Tätowieren zu reinigen. |
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| Maschinelles Trocknungsmittel | Tieridentifikations- und Kennzeichnungssysteme, Inc. | NDAR4 | Dies wird verwendet, um die Nadeln und den Halter nach der Reinigung zu trocknen. |
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| Neonate Tattoo Schwarzes Pigment | Tieridentifikations- und Markierungssysteme, Inc. | NBP01 | |
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| Skin Prep Applikator | Tieridentifikations- und -kennzeichnungssysteme, Inc. | NSPA1 | Wattestäbchen. |
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| Lösung zur Hautvorbereitung | Tieridentifikations- und -kennzeichnungssysteme, Inc. | NSP01 | Dieses Reagenz liefert eine dünne Ölschicht, die die Effizienz des Tätowierens verbessert und das Verblassen der Tätowierung verhindert, indem es (Informationen vom Anbieter): 1) verhindert, dass nicht tätowierte Haut vorübergehend verfärbt wird, wodurch die Qualität einer Pfotenballen-Tätowierung leicht beurteilt werden kann, bevor der Welpe in seinen Heimatkäfig zurückgebracht wird – Die fleckige Hautoberfläche kann mit der tätowierten Haut verwechselt werden, 2) Reduzierung von Hautschäden während des Tätowierens – Das Erweichen der Haut und das Schmieren der Nadel hilft der Nadel, in die Haut einzudringen, ohne Hautschäden zu verursachen, und 3) verhindert, dass molekularer Sauerstoff in die Haut eindringt, wodurch Entzündungsreaktionen auf reaktive Sauerstoffspezies reduziert werden, die erzeugt werden können. |
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| REAGENZIEN - Genotypisierung | | | |
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| EZ Fast Tissue/Tail PCR Genotypisierungskit (Streifenröhrchenformat) | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | |
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| 2X PCR Ready Mix II | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Ein roter Ladefarbstoff für die Elektrophorese ist in der 2X PCR Ready Mix-Lösung enthalten. |
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| Gewebelyselösung A | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Bereiten Sie DNA-Extraktionslösung durch Mischen von 20 & Mikro; l der Gewebelyselösung A und 180 µ l Gewebelyselösung B pro Probe. |
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| Gewebelyselösung B | EZ BioResearch LLC | G2001-100 | Bereiten Sie DNA-Extraktionslösung durch Mischen von 20 & Mikro; l der Gewebelyselösung A und 180 µ l Gewebelyselösung B pro Probe. |
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| Essigsäure, eiszeitlich | VWR | BDH 3092 | |
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| Agarose-optimierte Qualität, molekularbiologische Qualität | rpi | A20090-500 | Wir verwenden 2% Agarose-Gele in TAE-Puffer, die den SYBR Safe DNA-Gel-Farbstoff (10.000-fach verdünnt) oder Ethidiumbromid (0,5 µ g/ml Gelvolumen). |
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| Ethidiumbromid | Sigma-Aldrich | E7637-1G | |
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| Ethylendiamintetraessigsäure, Dinatriumsalzdihydrat (EDTA) | Fisher | BP120-500 | |
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| Gefilterte Pipettenspitzen, aerosolfrei, 0,1-10 &; Mikro; l | Dot Scientific Inc | UG104-96RS | Verwenden Sie Pipettenspitzen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. Verwenden Sie für alle Schritte, die DNA betreffen, gefilterte Pipettenspitzen, um Kreuzkontaminationen zu vermeiden. |
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| Gefilterte Pipettenspitzen, Premium Fit Filterspitzen, 0,5-20 & Mikro; l | Dot Scientific Inc | UG2020-RS | Verwenden Sie Pipettenspitzen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. Verwenden Sie für alle Schritte, die DNA betreffen, gefilterte Pipettenspitzen, um Kreuzkontaminationen zu vermeiden. |
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| Gefilterte Pipettenspitzen, Premium Fit Filterspitzen, 1-200 & Mikro; l | Dot Scientific Inc | UG2812-RS | Verwenden Sie Pipettenspitzen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. Verwenden Sie für alle Schritte, die DNA betreffen, gefilterte Pipettenspitzen, um Kreuzkontaminationen zu vermeiden. |
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| Molekulargewichtsmarker, EZ DNA Even Ladders 100 bp | EZ BioResearch LLC | L1001 | Wir verwenden einen dieser drei Molekulargewichtsmarker. |
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| Molekulargewichtsmarker, EZ DNA Even Ladders 1000 bp | EZ BioResearch LLC | L1010 | |
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| Molekulargewichtsmarker, TrackIt, 100 bp DNA Ladder | GIBCO-Invitrogen | 10488-058 | |
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| PCR-Röhrchen, 8-Röhrchen-Streifen mit einzeln angebrachten Domkappen, natur, 0,2 ml | USA Scientific | 1402-2900 | Verwenden Sie Röhrchen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. Ein 8-Röhrchen-Streifen ist einfacher zu handhaben und gruppiert die Proben als einzelne Röhrchen. |
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| PCR-Röhrchen, Ultraflux Individual | rpi | 145660 | Verwenden Sie Röhrchen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. |
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| Seal-Rite 0,5 ml Mikrozentrifugenröhrchen, natur | USA Scientific | 1605-0000 | Verwenden Sie Röhrchen, die steril und frei von DNA, RNase und DNase sind. |
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| SYBR Safe DNA Gel-Färbung * 10.000-fache Konzentration in DMSO | GIBCO-Invitrogen | S33102 | |
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| Tris base | rpi | T60040-1000 | |
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| Primer zur Amplifikation des Tor1a-Gens in & Delta; E-TorsinA-Knock-in-Mäuse: | | | 5'-AGT, CTG, TGG, CTG, GCT, CTC, CC-3' (vorwärts) und 5'-CCT, CAG, GCT, GCT, CAC, AAC, CAC-3' (Rückseite) (Referenz 18). Diese Primer wurden in einer Endkonzentration von 1,0 ng/µ l (~0,16 µ M) (Referenz 2). |
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| Primer zur Amplifikation des Tfap2a-Gens in Wildtyp-Mäusen | | | 5'-GAA AGG TGT AGG CAG AAG TTT GTC AGG GC-3' (vorwärts), 5'-CGT GTG GCT GTT GGG GTT GTT GTT GCT GAG GTA-3' (rückwärts) für das 498-bp Amplicon, 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CAA CTT TCG-3' (vorwärts), 5'-AGA CAC TCG GGC TTT GGA GAT CAT TC-3' (umgekehrt) für das 983-bp Amplicon, und 5'-CAC CCT ATC AGG GGA GGA CAA CTT TCG-3' (VORWÄRTS), 5'-ACA GTG TAG TAA GGC AAA GCA AGG AG-3' (Rückseite) für das 1990-bp Amplicon. Diese Primer werden bei 0,5 & micro;M verwendet. |
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| REAGENZIEN - Zellkultur | | | |
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| 5-Fluor-2′-Desoxyuridin | Sigma-Aldrich | F0503-100MG | Weitere Informationen finden Sie im Kommentarbereich von Uridin. |
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| B-27 Ergänzung | GIBCO-Invitrogen | 17504-044 | |
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| Zellkulturschalen 35 x 10 mm Schale, mit Gewebekulturen behandelte | BD falcon | 353001 | |
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| Zellkulturflaschen, T25, gewebekulturbehandelt, schräger Hals, Stopfenverschlusskappe, 25 cm2 Wachstumsfläche, 70 ml | BD falcon | 353082 | |
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| Zellkulturflaschen, T75, mit Gewebekulturen behandelt, schräger Hals, belüftete Kappe, 75 cm2 Wachstumsfläche, 250 ml | BD Falcon | 353136 | |
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| konisches Röhrchen, Polypropylen, 15 ml | BD Falcon | 352095 | |
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| Countess (Zellzahlzähler) Objektträger | GIBCO-Invitrogen | C10312 | |
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| Cytosin β-D-Arabinofuranosidhydrochlorid (Ara-C-Hydrochlorid) | Sigma-Aldrich | C6645-100mg | |
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| D-(+)-Glukose (Dextrose) wasserfrei, SigmaUltra, 99,5% (GC) | Sigma-Aldrich | G7528-250G | |
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| Schale, Petriglas 100 x 15 mm | Pyrex | 3160-101 | |
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| Destilliertes Wasser | GIBCO-Invitrogen | 15230-147 | |
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| DNase Typ II | Sigma-Aldrich | D4527-200KU | Stammlösung wird in einer Menge von 1.500 Einheiten/20 μm hergestellt; l = 75.000 Einheiten/ml in destilliertem Wasser. |
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| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), hoher Glukosegehalt, GlutaMAX, Pyruvat | GIBCO-Invitrogen | 10569-010, 500 ml | |
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| Fast PES Filtereinheit, 250 ml, Membran mit 50 mm Durchmesser, 0,2 &; Mikro; m Porengröße | Nalgene | 568-0020 | |
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| Schnelle PES-Filtereinheit, 500 ml, Membran mit 90 mm Durchmesser, 0,2 &; Mikro; m Porengröße | Nalgene | 569-0020 | |
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| Fötales Rinderserum (FBS) | GIBCO-Invitrogen | 26140-079 | |
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| Deckglas Deckglas, 12 mm Rund, Dicke 0,09 mm; 0,12 mm, Nr. 0 | Carolina | 633017 | |
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| GlutaMAX-I | GIBCO-Invitrogen | 35050-061 | |
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| Hanks' ausgewogene Salze | Sigma-Aldrich | H2387-10X | |
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| HEPES, ≥ 99,5 % (Titration) | Sigma-Aldrich | H3375-250G | |
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| Salzsäure, 37 %, A.C.S. Reagenz | Sigma-Aldrich | 258148-100 ML | |
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| Insulin | Sigma-Aldrich | I5500-250 mg | |
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| Magnesiumsulfat-Heptahydrat, MgSO4•( 7H2O), BioUltra, ≥ 99,5% (Fluka) | Sigma-Aldrich | 63138-250G | |
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| Matrigel Basalmembran-Matrix-Lösung, phenolrotfrei | BD Biosciences | 356237 | Dies ist das Beschichtungsmaterial für Deckgläser und Kolben. 1) Um es vorzubereiten, tauen Sie die Matrigel Basalmembran-Matrix-Lösung auf Eis auf, was normalerweise ~1 Tag dauert. Die aufgetaute Lösung wird mit einer vorgekühlten Pipette in vorgekühlte T25-Kolben auf Eis aliquotiert und die Kolben bei -20 °C gelagert. Zur Herstellung der Arbeitslösung Matrigel wird das aliquotierte Matrigel in einem Kolben auf Eis aufgetaut, durch Zugabe von vorgekühlter MEM-Lösung 50-fach verdünnt und die verdünnte Lösung bei 4 μC gehalten. Es ist wichtig, alle Kulturgefäße und Medien, die mit Matrigel in Berührung kommen, vorzukühlen, außer während und nach der Beschichtung von Deckgläsern, um zu verhindern, dass es vorzeitig ein Gel bildet. 2) Um die Glasdeckgläser oder Kulturflaschen mit Matrigel zu beschichten, tragen Sie die Matrigel-Lösung auf die Oberfläche auf. Vor dem Plattieren von Zellen ist es wichtig, die Oberfläche vollständig zu trocknen. Zu diesem Zweck kann es hilfreich sein, Matrigel während der Zellzentrifugation unmittelbar vor dem Plattieren der Zellen zu aspirieren und genügend Zeit zum Trocknen einzuplanen. |
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| Minimum Essential Medium (MEM) | GIBCO-Invitrogen | 51200-038 | |
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| MITO+ Serum-Extender, 5 ml | BD Biosciences | 355006 | |
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| Multiwell-Platten, mit Gewebekulturen behandelte 24-Well-Platte | BD Falcon | 353047 | |
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| Multiwell-Platten, mit Gewebekulturen behandelte 6-Well-Platte | BD Falcon | 353046 | |
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| Neurobasal-A Medium (1X), flüssig | GIBCO-Invitrogen | 10888-022 | |
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| Salpetersäure | VWR | bdh 3044 | |
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| NS (Neuronale Ergänzung) 21 | im Labor | | Quelle: Referenz 69 |
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| Pasteurpipetten, 5 ¾ ” | Fisher | 13-678-6A | Verwenden Sie diesen 5 ¾ mit Wattestecker; ” Pasteurpipette für die zelluläre Verreibung. Politieren Sie die Spitze vorher, um die Schnittfläche zu glätten und den Innendurchmesser auf 50-80% des Originals zu reduzieren. Eine zu kleine Spitze zerstört die Zellen und verringert die Lebensfähigkeit der Zellen, aber eine zu große Spitze verringert die Effizienz der Verreibung. |
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| Pasteurpipetten, 9" | Fisher | 13-678-6B | |
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| Kaliumchlorid (KCl), SigmaUltra, ≥ 99,0% | Sigma-Aldrich | P9333-500G | |
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| Serologische Pipette, 2 ml | BD Falcon | 357507 | |
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| Serologische Pipette, 5 ml | BD Falcon | 357543 | |
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| Serologische Pipette, 10 ml | BD Falcon | 357551 | |
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| Serologische Pipette, 25 ml | BD Falcon | 357525 | |
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| Serologische Pipette, 50 ml | BD falcon | 357550 | |
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| Natriumbicarbonat (NaHCO3, Natriumhydrogencarbonat), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S6297-250G | |
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| Natriumchlorid (NaCl), SigmaUltra, ≥ 99,5% | Sigma-Aldrich | S7653-250G | |
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| Natriumhydroxid (NaOH), Pellets, 99,998% Spurenmetallbasis | Sigma-Aldrich | 480878-250G | |
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| Natriumphosphat zweibasisches Heptahydrat (Na2HPO4•( 7H2O)), ≥ 99,99%, Aldrich | Sigma-Aldrich | 431478-250G | |
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| Saccharose, SigmaUltra, ≥ 99,5% (GC) | Sigma-Aldrich | S7903-250G | |
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| Spritzenvorsatzfilter, steril, 0,2 & Mikro; m | Corning 431219 | | |
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| Spritze, 3 ml | BD Falcon | 309585 | |
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| Transferrin, Holo, Rinderplasma | Calbiochem | 616420 | |
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| Trypanblau-Färbung, 0,4% | GIBCO-Invitrogen | T10282 | Dies wird zur Zählung lebender/toter Zellen verwendet. Erneuern Sie eine alte Trypanblau-Lösung, wenn sie mehrere Male wiederverwendet wird (z. B. mehrmals pro Woche über mehrere Wochen), da sie Ausfällungen bildet und zu fehlerhaften Messwerten der Zelldichte führt. |
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| Trypsin, Typ XI | Sigma-Aldrich | T1005-5G | |
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| Trypsin-EDTA-Lösung, 0,25% | GIBCO-Invitrogen | 25200-056 | |
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| Uridin | Sigma-Aldrich | U3003-5G | Stammlösung wird in einer Dosis von 50 mg 5-Fluor-2'-Desoxyuridin und 125 mg Uridin in 25 ml DMEM (8,12 bzw. 20,48 mM) hergestellt. |
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| REAGENZIEN - Immunzytochemie | | | |
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| Antikörper, polyklonales Kaninchen Anti-MAP2 | Merck Millipore | AB5622 | |
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| Antikörper, monoklonaler Anti-GFAP-Cocktail der Maus | Merck Millipore | NE1015 | |
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| AUSRÜSTUNG - Tätowieren | | | |
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| AIMS | Animal Identification and Marking Systems, Inc. | NEO– 9 | Dieses Nagetier-Tätowiersystem für Neugeborene ist ein elektrisches System, das durch schnelles Bewegen von 1- oder 3-Punkt-Tätowiernadeln vertikal in die Haut funktioniert. Aktiviere die Tätowiermaschine einmal für ca. 0,5 Sekunden, während die Tattoo-Nadelspitzen senkrecht zur Hautoberfläche gehalten werden. Wir bevorzugen die Drei-Nadel-Tätowierung, um den tätowierten Bereich zu maximieren, aber die Einnadel-Tätowierung ist effektiv auf schmaleren Bereichen, z.B. den Zehen, oder wenn eine feine mechanische Kontrolle erforderlich ist, z.B. wenn Zahlen tätowiert werden. Zwei Tätowierrunden mit der langsamsten Geschwindigkeit (Einstellung "1" aus 3 Schritten) reichen in der Regel aus, um eine sichtbare und lang anhaltende Tätowierung der Pfotenballen zu erzeugen. |
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| AUSRÜSTUNG - Genotypisierung | | | |
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| Elektrophoresesystem, horizontal, Wide Mini– Sub Cell GT | BIO– RAD | 170– 4405 | Typische Elektrophoreseparameter sind die elektrische Feldstärke bei 6 V/cm und die Dauer von 25 min für ein 10 cm langes Gel. |
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| FluorChem 8800 | ProteinSimple | FluorChem 8800 | |
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| PCR, MJ Mini Thermocycler | BIO-RAD | PTC-1148EDU | Unsere PCR-Reaktionen für das Tor1a-Gen in Δ E-TorsinA-Knock-in-Mäuse sind wie folgt: 1 Denaturierungszyklus bei 94 ° C für 3 min, 35 Denaturierungszyklen bei 94 ° C für 30 Sekunden, Glühen bei 58 ° C für 30 Sekunden, Verlängerung bei 72 ° C für 2 Min. Es folgt die endgültige Verlängerung bei 72 ° C für 10 min und halten bei 4 °C. |
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| Netzteil, PowerPac Basic | BIO-RAD | 164-5050 | |
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| EQUIPMENT - Zellkultur | | | |
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| Automatisierter Zellzähler, Countess | GIBCO-Invitrogen | C10310 | Dieser automatisierte Zellzähler misst getrennt die Dichten von lebenden und toten Zellen (nicht gefärbt bzw. mit Trypanblau gefärbt). Es ist wichtig, den optimalen Bereich der Dichtemessungen zu kennen: Der von uns verwendete Zähler hat die höchste Genauigkeit im Bereich von 1 x 105 bis 4 x 106 Zellen/ml. Wenn die gemessenen Werte für die Zelldichte außerhalb des empfohlenen Bereichs liegen, passen Sie das Resuspensionsvolumen entsprechend an. |
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| Biologische Sicherheitswerkbank, Klasse II, Typ A2 | NUAIRE | NU-425-400 | Diese Haube wird für alle Zellkulturverfahren verwendet, mit Ausnahme der Hirndissektion. |
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| CO2 Inkubator, AutoFlow, Feuchtigkeitskontrolle Wassermantel | | NUAIRE NU-4850 | |
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| Horizontale Reinbank | NUAIRE | NU-201-330 | Diese Reinbank wird für die Dissektion des Gehirns verwendet (Schritte 3.1.1 und 3.1.2 von "Hirndissektion und zelluläre Dissoziation)". |
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| Orbit LS Low Speed Shaker | Labnet | S2030-LS-B | |
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| SORVALL RC-6 Plus Superspeed Zentrifuge | Fisher | 46910 (Zentrifuge)/46922 (Rotor) | |
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