Wir beschreiben ein Protokoll zur Gewinnung von lentiviral basierten, reprogrammierten und charakterisierten faktorfreien humanen induzierten pluripotenten Stammzellen und zur Umwandlung in mutmaßliche klinische Bedingungen.
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Methodenartikel
Wir beschreiben ein Protokoll zur Gewinnung von lentiviral basierten, reprogrammierten und charakterisierten faktorfreien humanen induzierten pluripotenten Stammzellen und zur Umwandlung in mutmaßliche klinische Bedingungen.
Mit lentiviralen basierte Umprogrammierung Methoden kann Menschen induzierte pluripotente Stammzellen (hiPSCs) erzeugt werden. Jedoch Spuren von potenziell onkogenen Gene in aktiv transkribierten Regionen des Genoms übrigen, die ihr Potenzial für den Einsatz in menschlichen therapeutischen Anwendungen ein. Darüber hinaus nicht-menschlichen Antigene aus Stammzellen Neuprogrammierung oder Differenzierung in therapeutisch relevanten Derivate abgeleitet ausschließen diese hiPSCs können, in den menschlichen klinischen Kontext 2 verwendet. In diesem Video stellen wir ein Verfahren zur Umprogrammierung und Analyse von Faktor freie hiPSCs frei von exogenen Transgenen. Diese hiPSCs kann dann für die Genexpression Abnormalitäten im spezifischen Introns enthaltend das Lentivirus analysiert werden. Diese Analyse kann mit empfindlichen quantitativen Polymerase-Kettenreaktion (PCR), die einen Vorteil gegenüber weniger empfindlich Techniken bisher verwendet, um die Genexpression Differenzen 3 zu erkennen ist durchgeführt werden. Vollständige Umwandlung inklinischem guten Herstellungspraxis (GMP) Bedingungen, können die menschliche klinische Relevanz. Unser Protokoll bietet eine weitere Methode, sofern die aktuellen Safe-Harbour-Kriterien zu erweitern und umfassen Faktor freie dadurch gekennzeichnet hiPSC basierten Derivaten für den menschlichen therapeutischen Anwendungen zur Ableitung-GMP-grade hiPSCs, die keine Immunogenität Risiko durch nicht-menschlichen Antigene zu eliminieren sollte. Dieses Protokoll ist breit anwendbar auf lentiviralen umgewandelten Zellen jeglicher Art und stellt eine reproduzierbare Methode zur Umwandlung umgewandelten Zellen in GMP-grade Bedingungen.
Adulte menschliche Zellen haben gezeigt, dass sie in der Lage sind, epigenetische Remodellierung und Reprogrammierung zu durchlaufen, als Ergebnis der lentiviralen basierten Expression von vier Schlüsseltranskriptionsfaktoren4,5. Ein wichtiger Fortschritt auf dem Gebiet der Reprogrammierung war die Verwendung einer einzigen excisablen lentiviralen Stammzellkassette (STEMCCA), die alle vier Reprogrammierungstranskriptionsfaktoren enthielt, die ein präzises stöchiometrisches Verhältnis der Proteinexpression ermöglichten6. Darüber hinaus kann STEMCCA, wenn es in einer bestimmten Vielzahl von Infektionsbereichen transduziert wird, während des Reprogrammierungsprozesses zu überwiegend einzelnen genomischen Integrationsereignissen führen7. Die Einführung einer exzizierbaren Version von STEMCCA, die die Cre/loxP-Technologie verwendet, gefolgt von der Exzision des Reprogrammierungsvektors nach der Derivation der Stammzelllinie, ermöglichte die Gewinnung faktorfreier humaner induzierter pluripotenter Stammzelllinien (hiPSC)8. Darüber hinaus musste zur Verbesserung der therapeutischen Anwendungen von hiPS-Zellen eine neuartige, schnelle und leicht anwendbare Methodik für die Umwandlung von Zelllinien in GMP-Qualität (Good Manufacturing Practice) von xeno-haltigen zu xeno-freien Bedingungen implementiert werden. Hier diskutieren wir eine relevante Methodik, die Unterschiede in der integrierten Genexpression, insbesondere bei der Integration in ein Intron, und die Umwandlung von Zellen in klinischer Qualität in mutmaßliche GMP-Bedingungen genauer bewertet.
Frühere Forschungen haben nur relativ unempfindliche Microarray-Transkriptionsanalysen verwendet, um Genexpressionsunterschiede in integrierten Genen nach STEMCCA-Transduktionzu analysieren 3,9. Hier stellen wir die Methodik der sensitiven quantitativen Polymerase-Kettenreaktion (PCR)-Analyse vor, um integrierte Genexpressionsunterschiede weiter zu untersuchen. Wichtig ist, dass die derzeitigen Safe-Harbor-Kriterien hiPSCs mit Genen mit viraler Integration verwerfen, wodurch die Anwendbarkeit dieser Zellen für nachgelagerte humane zelluläre Therapeutika eingeschränktwird 9. Wir schlagen vor, dass sich der Status quo durch die Verwendung von vollständig charakterisierten und transgenfreien intronikal reprogrammierten hiPSCs ändern könnte. Darüber hinaus stellen wir ein robustes Zellkonversionsprotokoll in GMP-Qualität vor, das problemlos auf eine Vielzahl verschiedener Zelltypen angewendet werden kann, die ursprünglich unter xeno-haltigen Bedingungen gewonnen wurden10. Dies bietet erhebliche Möglichkeiten für die Entwicklung zukünftiger Zellreprogrammierungsexperimente, die klinische Bedingungen erfordern, um die therapeutische Relevanz für den Menschen zu erhalten.
Diese Methoden bieten eine Grundlage, auf der die aktuellen Safe-Harbor-Kriterien erweitert werden können, um charakterisierte STEMCCA-reprogrammierte hiPSC-Linien einzuschließen, die nach der STEMCCA-Exzision aus dem integrierten Intron ein normales Genexpressionsprofil beibehalten. Außerdem wird die vollständige Umwandlung in klinische Bedingungen, die frei von nicht-menschlichen tierischen Antigenen sind, dazu beitragen, viel mehr Zelltypen zu integrieren, die bisher nur unter Xeno-haltigen Bedingungen reprogrammiert und charakterisiert wurden. Diese Methoden zusammen sind für die US-amerikanische Food and Drug Administration (FDA) ein überzeugender Grund, eine Ausweitung ihrer eingeschränkten Zulassung von humanen embryonalen Stammzellen (ESC)-basierten Therapeutika auf hiPSC-basierte Therapeutika in Betracht zu ziehen11.
Wir haben kürzlich die Ableitung einer faktorfreien hiPSC-Linie detailliert beschrieben, die vollständig charakterisiert und in mutmaßliche klinische Bedingungen umgewandelt wurde10. Hier beschreiben wir das Protokoll für die hiPSC-Ableitung unter Verwendung des STEMCCA-Lentivirus. Diese Stammzellen durchlaufen dann einen Exzisionsprozess, gefolgt von einer Charakterisierung der Genexpression. Schließlich werden die hiPSCs durch eine langsame Umwandlungsmethode in GMP-Qualität überführt.
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. HINWEIS: Diese Methode wurde in der Forschung im Awe et al berichteten 10 verwendet.
1. Reprogrammierung Erwachsene menschliche Fibroblasten der Haut mit STEMCCA
2. Vektor-Integration Standortanalyse und STEMCCA Excision
3. Die Quantifizierung der Genexpression Unterschiede mithilfe von Quantitative PCR von Pre- und Post-geschnitten hiPSCs
4. Umwandlung in GMP-grade Bedingungen
5. Charakterisierung GMP-Grade-Post-geschnitten hiPSCs
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Wir präsentieren ein Protokoll zur Ableitung klinischem Faktor freie hiPSCs mit der STEMCCA lentiviralen basierte Umprogrammierung. 1A zeigt ein repräsentatives Bild der drei vorgeschnitten hiPSC Linien nach Neuprogrammierung mit dem STEMCCA Ansatz auf einer Schicht aus MEFs. Der Hauptvorteil der STEMCCA Umprogrammierung Ansatzes liegt in der konsequenten Neuprogrammierung Erfolg von mehreren Wissenschaftlern erreicht, in verschiedenen Forschungsgruppen und Standorte. 1B stellt die Post...
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Wir beschreiben eine Methode zur Ableitung Faktor freie hiPSCs und macht sie durch die Umwandlung dieser Zellen in GMP-grade Bedingungen für Downstream-Zelldifferenzierung in Zukunft Humantherapeutika klinisch relevant. Obwohl dieses Protokoll ist allgemein anwendbar auf eine Vielzahl von Zelltypen, wählten wir humane dermale Fibroblasten umprogrammieren, aufgrund der Einfachheit der Entnahme aus dem Patienten und ihre Anwendbarkeit auf personalisierten menschliche Therapeutika. Sobald Einschränkungen soweit vollständig...
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James A. Byrne (JAB) und Agustin Vega-Crespo erhalten Forschungsgelder von Fibrocell Science, Inc. JAB ist wissenschaftlicher Berater für Fibrocell Science, Inc. Keine anderen Autoren haben konkurrierende Interessen offenzulegen.
Wir möchten Patrick C. Lee, Cyril Ramathal und Saravanan Karumbayaram (SK) für ihre Unterstützung bei der Durchführung der iPSC-Ableitungs- und Charakterisierungsexperimente danken; Aaron Cooper für die Durchführung der iPSC-Analyseexperimente; Vittorio Sebastiano und Renee A. Reijo Pera für die Leitung der ersten Neuprogrammierung; SK, William E. Lowry, Jerome A. Zack und Donald B. Kohn für die Leitung der Einrichtung der UCLA GMP-Einrichtungen, die die Umwandlung und Charakterisierung von iPS-Zellen in klinischer Qualität ermöglichen; Gustavo Mostoslavsky für die Bereitstellung des polycistronischen Reprogrammierungsvektors STEMCCA. Diese Arbeit basiert auf einer Forschungskooperation mit Fibrocell Science und der Clinical Investigations for Dermal Mesenchymally Acquired Derivatives (CIDMOD) Initiative zur Entwicklung sicherer personalisierter zellulärer Therapeutika. Diese Arbeit wurde durch Mittel des Eli and Edythe Broad Center of Regenerative Medicine and Stem Cell Research an der UCLA, der Phelps Family Foundation, Fibrocell Science, Inc. und des UCLA CTSI Scholar's Award an JAB unterstützt.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| Medien und Reagenzien | |||
| DMEM/F12 (Basalmedium) | Invitrogen (Carlsbad, CA, USA) | 11330057 | |
| Fötales Rinderserum | Invitrogen | 16000044 | |
| Minimum essentielles Medium (MEM) nicht-essentielle Aminosäuren (NEAA), 100x | Invitrogen | 11140050 | |
| Glutamax, 100x | Invitrogen | 35050-061 | |
| PenStrep, Penicillin-Streptomycin, 100x | Invitrogen | 15140-122 | Auftauen bei 4 > C, aliquotieren und bei &minus lagern; 20 &Grad; C |
| Knockout-Serumersatz | Invitrogen | 10828028 | Auftauen bei 4 & Grad; C, aliquotieren und bei &minus lagern; 20 &Grad; C |
| Trypsin/EDTA, 0,5 % | Invitrogen | 15400-054 | Verdünnen Sie den Rohbestand auf 0,05 % in 1x PBS |
| Basischer Fibroblasten-Wachstumsfaktor | GlobalStem (Rockville, MD, USA) | GSR-2001 | Rekonstitution zu 10 &; Mikro; g/ml Bestand an 0,1 % Rinderserumalbumin, gelöst in 1x PBS und gelagert bei − 80°; C |
| β-Mercaptoethanol | Millipore (Billerica, MA, USA) | ES-007-E | |
| Matrigel (Basalmembranmatrix) | BD Biosciences (San Jose, CA, USA) | 356231 | Verdünnen Sie das Matrigel-Fläschchen mit 10 ml DMEM/F12 auf Eis für eine 1:2-Verdünnung. Aliquotieren und speichern bei − 20 °C. |
| CELLstart (Synthetisches Substrat) | Invitrogen | A1014201 | |
| Stemmolecule Y27632 | Stemgent (Cambridge, MA, USA) | 04-0012-02 | |
| Puromycin | Invitrogen | A1113802 | |
| LightCycler 480 Sonden Master | Roche (Basel, Schweiz) | 4707494001 | |
| ProFreeze-CDM Medium/Gefriermedium | Lonza (Basel, Schweiz) | 12-769E | |
| Dimethylsulfoxid | Sigma-Aldrich (St. Louis, MO, USA) | D8418 | |
| PBS | Invitrogen | 14190-250 | |
| 100 BP DNA Ladder | Invitrogen | 15628019 | |
| SYBR Safe DNA Gel Stain 10.000x | Invitrogen | S33102 | |
| Agarose | Bio-Rad Laboratories, Inc. (Hercules, CA, USA) | 161-3101 | |
| Gelatine, aus Schweinehaut | Sigma-Aldrich | G1890-100G | Zu 0,2 % PBS lagern, autoklavieren und bei Raumtemperatur lagern. |
| mTeSR1 | StemCell Technologies (Vancouver, BC, Canada) | 5850 | Supplement 5x mit dem Basismedium kombinieren, aliquotieren und bei 4 ° lagern; C für bis zu 2 Wochen. |
| Stemedia NutriStem XF/FF Nährmedium | Stemgent | 05-100-1A | Auftauen bei 4 > C O/N, aliquot und bei 4 μg lagern; C für bis zu 2 Wochen. |
| Primocin | InvivoGen (San Diego, CA, USA) | ant-pm-1 | |
| Accutase (Dissoziationsreagenz) | Invitrogen | A1110501 | |
| Esel Anti-Hühner-IgG AlexaFluor 488 | Jackson ImmunoResearch (West Grove, PA, USA) | 703-546-155 | |
| Polybrene/Transfektionsmittel | Millipore | TR-1003-G | |
| Plasticware | |||
| 12-Well-Platten | VWR (West Chester, PA, USA) | 29442-038 | |
| 6-Well-Platten | VWR | 29442-042 | |
| 10-cm-Platten | Sigma-Aldrich | Z688819 | |
| 18-Gauge-Nadel | Fisher Scientific (Pittsburgh, PA, USA) | 148265D | |
| 21-Gauge-Nadel | Fisher Scientific | 14-829-10D | |
| Equipment | |||
| BD LSRII Durchflusszytometer | KSystem von Nikon (Tokio, Japan) | ||
| BD FACSDiva Version 6.1.3 Software | BD Biosciences | ||
| Kits | |||
| PureLink Genomic DNA Mini Kit | Invitrogen | K182000 | |
| KAPA HiFi Hotstart ReadyMix PCR Kit | KAPA Biosystems (Wilmington, MA, USA) | KK2601 | |
| High Pure RNA Isolation Kit | Roche | 11828665001 | |
| Transkriptor Erststrang cDNA Synthese Kit | Roche | 4379012001 | |
| Sialix anti-Neu5Gc Basic Pack Kit | Sialix (Newton, MA, USA) | Basic Pack | |
| Media | |||
| Kombinierte Medien 1 | StemCell Technologies und Stemgent | besteht zu gleichen Teilen aus mTeSR1 und Nutristem | |
| Kombinierte Medien 2 | StemCell Technologies und Stemgent | bestehen zu gleichen Teilen aus TeSR2 und Nutristem | |
| HUF Medium | Dulbecco' s modifizierter Eagle" s Medium/F12 [DMEM/F12] ergänzt mit 10 % fötalem Rinderserum, 1x nicht-essentiellen Aminosäuren, 1x Glutamax und 1x Primocin | ||
| Human Pluripotent Stem Cell Media | DMEM/F12, ergänzt mit 20 % Knockout-Serumersatz, 1x Glutamax, 1x nicht-essentiellen Aminosäuren, 1x Primocin, 1x β-Mercaptoethanol und 10 ng/ml basischem Fibroblasten-Wachstumsfaktor. | ||
| DMEM/F12, Dulbecco' s modifizierter Eagle" s mittel/F12; PBS, phosphatgepufferte Kochsalzlösung. |
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