Das Studium der menschlichen T-Lymphozytenbiologie beinhaltet oft die Untersuchung von Reaktionen auf aktivierende Liganden. T-Zellen erkennen und reagieren auf prozessierte Peptidantigene, die von MHC-Molekülen (humaner orthologer HLA) über den T-Zell-Rezeptor (TCR) präsentiert werden, und zwar auf hochempfindliche und spezifische Weise. Während die Hauptfunktion von T-Zellen darin besteht, schützende Immunantworten auf fremde Antigene zu vermitteln, die von self-MHC präsentiert werden, reagieren T-Zellen robust auf antigene Unterschiede in allogenen Geweben. T-Zell-Antworten auf Alloantigene können entweder als direkte oder indirekte Alloreaktivität beschrieben werden. Bei der Alloreaktivität reagiert die T-Zelle durch eine hochspezifische Erkennung sowohl des vorgestellten Peptids als auch des MHC-Moleküls. Die robuste oligoklonale Reaktion von T-Zellen auf allogene Stimulation spiegelt die große Anzahl potenziell stimulierender Alloantigene wider, die in allogenen Geweben vorhanden sind. Während die Breite der alloreaktiven T-Zell-Antworten ein wichtiger Faktor bei der Initiierung und Vermittlung der Pathologie ist, die mit biologisch relevanten alloreaktiven Reaktionen wie der Graft-versus-Host-Krankheit und der Allotransplantatabstoßung verbunden ist, kann sie eine Analyse der T-Zell-Antworten auf allogene Liganden ausschließen. Zu diesem Zweck beschreibt dieses Protokoll ein Verfahren zur Erzeugung alloreaktiver T-Zellen aus naiven humanen peripheren Blutleukozyten (PBL), die auf bekannte Peptid-MHC (pMHC)-Alloantigene ansprechen. Das Protokoll wendet die pMHC-Multimermarkierung, die Anreicherung magnetischer Beads und die Durchflusszytometrie auf Einzelzell-In-vitro-Kulturmethoden zur Erzeugung von Alloantigen-spezifischen T-Zell-Klonen an. Dies ermöglicht es, die Biochemie und Funktion von T-Zellen zu untersuchen, die auf allogene Stimulation reagieren.