Unter Verwendung einer gedruckten Glykan-Microarray-Strategie wurde ein konventioneller 96-Well-Plattenassay für die Analyse der Hämagglutinin-Avidität und Spezifität des Influenza-A-Virus für Sialinsäure-haltige Rezeptoren miniaturisiert.
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Methodenartikel
Unter Verwendung einer gedruckten Glykan-Microarray-Strategie wurde ein konventioneller 96-Well-Plattenassay für die Analyse der Hämagglutinin-Avidität und Spezifität des Influenza-A-Virus für Sialinsäure-haltige Rezeptoren miniaturisiert.
Influenza A-Virus (IAV) Hämagglutinine erkennen Sialinsäuren auf der Zelloberfläche als funktionelle Rezeptoren Eintritt in die Zellen zu gewinnen. Wilde Wasservögel sind das natürliche Reservoir für IAV, aber IAV können die Speziesbarriere zu Geflügel, Schweinen, Pferden und Menschen überqueren. Avian Viren erkennen zu einem vorletzten Galactose durch eine α2-3 Verknüpfung (aviäre-Typ-Rezeptoren) angebracht Sialinsäure während menschlichen Viren bevorzugt Sialinsäure mit einer α2-6 Verknüpfung (Mensch-Typ-Rezeptoren) erkennen. Zur Überwachung, ob Vogelviren für die menschliche Art der Anpassung sind Rezeptoren, können verschiedene Methoden verwendet werden. Glycan-Mikroarrays mit diversen Bibliotheken synthetischer Sialosiden werden zunehmend eingesetzt Rezeptorspezifität zu bewerten. Jedoch ist diese Technik zum Messen avidities nicht verwendet. Messung der Avidität wird durch Auswertung der Bindung von seriell verdünnt Hämagglutinin oder Virus Glykane adsorbiert zu herkömmlichen Polypropylen 96-Well-Platten typischerweise erreicht. In diesem Assay Glykane mit α2-3 oder α2-6 sind Sialinsäuren an Streptavidin Platten an Biotin und adsorbierte gekoppelt sind oder gekoppelt Polyacrylamid (PAA), die direkt an die Kunststoff adsorbieren. Wir haben diesen Test deutlich miniaturisiert durch direktes Drucken von PAA-linked Sialosiden und ihre nicht PAA gebundenen Pendants auf Mikro gut Objektträger aus Glas. Dieses Set-up, mit 48-Arrays auf einer einzelnen Folie, ermöglicht die gleichzeitige Assays von 6 Glycan Proteine bei 8 Verdünnungen, abfrage 6 verschiedene Glykane, darunter zwei nicht sialylierten Kontrollen verbindlich. Dies ist äquivalent zu 18-fach 96-Well-Platten in der herkömmlichen Platten-Assay. Das Glycan Array-Format zur Verringerung der Kosten Verbindungen und biologische Präparate und steigert somit die Effizienz deutlich.
Wilde Wasservögel sind das natürliche Reservoir für IAV, aber IAV ist in der Lage die Artengrenze zu Geflügel und Säugetieren, zu überqueren, einschließlich Menschen. Avian iAVS erkennen α2-3 verknüpften Sialinsäuren (aviäre-Typ-Rezeptoren), während menschliche Viren α2-6 verknüpften Sialinsäuren (human-Typ-Rezeptoren) binden. In der Lage sein, effizient zu replizieren , und zwischen Menschen ein avian IAV zu binden muss human-Typ - Rezeptoren 1 übertragen.
IAVS basieren auf Serologie unterteilt, die die Antigenität ihrer Hämagglutinin (HA) und Neuraminidase (NA) Hüllglycoproteine charakterisiert. HA bindet an Sialinsäuren, w....
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HINWEIS: Alle Schritte werden bei Raumtemperatur durchgeführt, sofern nichts anderes angegeben ist.
1. Array Construction
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Drucken, Scannen und Datenanalysen
Um eine ordnungsgemäße Druck, ist es wichtig, die richtige Ausrichtung des gefleckten Gitter innerhalb der Teflonmaske zu haben, die jedes Array auf dem Schlitten abgrenzt. Während des Druckvorgangs aufgrund der Natur der Teflonbeschichtung, spots kann nicht mit dem bloßen Auge auf den MPX Folien gesehen werden. Augenmerk wird dann auf die Erscheinung der vorge Flecken auf den poly-L-Lysin be.......
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IAV Rezeptorspezifität Die Beurteilung ist ein wichtiger Schritt in Pandemie-Potenzial von Vogelviren zu analysieren. Sialinsäure-Erkennung durch das Virus auf mehrere biologische Eigenschaften verbunden, wie beispielsweise die Bindung an und die Freisetzung aus der Zelle. Deren Kenntnis Aminosäure Mutationen sind notwendig für die Vogelviren zu erreichen α2-6 Bindung und überqueren die Speziesbarriere Pandemievorsorge ermöglicht. Verschiedene Assays werden verwendet Rezeptorspezifität zu bestimmen; aber alle haben ihre.......
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Die Autoren haben nichts offenzulegen
Diese Arbeit wurde teilweise durch die Scripps Microarray-Core Facility, und einen Vertrag von den Centers for Disease Control (JCP) unterstützt. RPdV ist ein Empfänger eines Rubicon und VENI Zuschuss von der niederländischen Organisation für wissenschaftliche Forschung (NWO). Das Konsortium für Funktionelle Glycomics (http://www.functionalglycomics.org/) finanziert von NIGMS Zuschuss GM62116 (JCP), die mehrere Glykane in dieser Studie verwendet. Dies ist die Veröffentlichung 29113 von The Scripps Research Institute.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| NEXTERION® Slide H MPX-48 | Schott | 1091525 | Mikrotiterplatten |
| ProScanArray Plus | PerkinElmer | hat den konfokalen Microarray-Scanner | |
| Innoscan 1100AL eingestellt. Scanner/Mapix Software | Innopsys-konfokaler | Microarray-Scanner | |
| MicroGrid II | Digilab-microaray Drucker | ||
| SNA | Vector Labs | B-1305 | Pflanzliches Lektin |
| ECA | Vector Labs | B-1145 | Pflanzliches Lektin |
| Anti-Streptokokken-Antikörper | IBA | 2-1509-001 | Anitbody für HA-Bindung |
| Anti-Maus Alexa-647 | Life | A-21235 | Anitbody für HA-Bindung |
| Tween-20 | Sigma | P2287 | Reinigungsmittelmittel |
| zweibasisches Natriumphosphat | Sigma | 255793 | Druckpufferkomponente |
| monobasisches Natriumphosphat | Sigma | 229903 | Komponente für Druckpuffer |
| Poly-L-Lysin-Lösung | Sigma | P8920 | Vor-Spotting-Slide-Komponente |
| Natriumhydroxid | Sigma | 221465 | Vor-Spotting-Objektträgerkomponente |
| Ethanol | Sigma | 493546 | Pre-Spotting-Objektträgerkomponente |
| Phosphatgepufferte Kochsalzlösung | Corning | 46-013-CM | Inkubations-/Waschpuffer |
| SMP4B-Pins | Telechem | SMP4B-Druckstift | |
| Komprimierter Stickstoff (Grade5) | Praxair | UN1066 | allgemeines Staub-/Trocknungswerkzeug |
| Borsäure | Sigma | B6768-500G | Objektträgerblocker-Reagenz |
| Ethanolamin | Sigma | E9508-500ML | Objektträger-Blockierungsreagenz |
| Atto 488 | AttoTec | AD 488-91 | Gridmarker auf Array |
| PAA-LNLN | Konsortium für funktionelle Glykomik | PA368 | Fleckenglykane |
| PAA-3SLNLN | Konsortium für Funktionelle Glykomik | PA362 | Gefleckte Glykane |
| PAA-6SLNLN | Konsortium für Funktionelle Glykomik | PA343 | Fleckenglykane |
| LNLN | Konsortium für Funktionelle Glykomik | Te98 | Gefleckte Glykane |
| 3SLNLN | Konsortium für Funktionelle Glykomik | Te175 | Gefleckte Glykane |
| 6SLNLN | Konsortium für Funktionelle Glykomik | Te176 | Gefleckte Glykane |
| 384-Well-Mikrotiterplatte | Matrix TechCorp | 4361 | Druckplatte |
| VWR Labormarker | VWR | 52877-150 | Objektträgernummerierung |
| Wheaton Objektträgerfärbeschale | Sigma | Z103969-1EA | Blockieren und Trocknen |
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