Multicolor 100 nm Durchmesser wurden fluoreszierende Kügelchen abgebildeten Standard TIRF TIRF-SIM zu vergleichen und die erreichbare Verbesserung der lateralen Auflösung (4A - B) zu quantifizieren. Die Rekonstruktion der Roh - Frames in Super-Resolution - Bilder wurde unter Verwendung von Standardalgorithmen durchgeführt , wie in der Literatur 27,28 skizziert. Es ist ersichtlich, dass TIRF-SIM hat eindeutig signifikant höhere laterale Auflösung im Vergleich zu TIRF. Die Punktbildfunktion (PSF) eines Mikroskops ist gut mit dem Bild eines einzelnen Unterbeugungs Größe fluoreszierende Perle angenähert, damit die PSF und die Auflösung kann durch Anbringen 2D-Gauß-Funktionen auf einzelne Perlen für jede Wellenlänge quantifiziert werden. Die geschätzte Auflösung des Mikroskops auf dem Mittelwert der Halbwertsbreite basiert (FWHM) beträgt 89 nm und 116 nm für 488 und 640 nm TIRF-SIM bzw. (4C). Dies entspricht einer zweifachen improserung in laterale Auflösung für beide Wellenlängen auf die theoretische beugungsbegrenzten Fall verglichen. Fluoreszenzmarkierte Amyloidfibrillen sind auch eine ausgezeichnete Testprobe für doppelte Auflösung (4D) zu demonstrieren. Amyloidfibrillen wurden in vitro durch Inkubation β-Amyloid , markiert mit 10% Rhodamin - Derivat - Farbstoffe (488 nm Anregung) für 1 Woche und anschließend Bildgebung mit TIRF-SIM gebildet. Siehe 12 für weitere Informationen verweisen.
Subzellulärer Strukturen mit hohem Kontrast wie emGFP markierte Mikrotubuli (5B, G) oder LifeAct-GFP (5D) sind ideal für TIRF-SIM - Bildgebung und ergeben einen hohen Kontrast superauflösende Bilder. TIRF-SIM-Bildgebung das Setup detailliert in diesem Protokoll ermöglicht die Beobachtung einer Subpopulation von Mikrotubuli befindet sich in der Nähe der basalen Zellkortex mit und Mikrotubuli-Polymerisation und Depolymerisation kann be gesehen im Laufe der Zeit (Animierte Abbildung 1). Nicht alle Proben sind zugänglich mit TIRF-SIM-Karte auf die Abbildung, insbesondere mit geringem Kontrast Proben ohne diskrete Strukturen. Zellen cytosolischen GFP fehlt beiseite Hochauflösungsinformationen exprimierenden von an den Rändern der Plasmamembran (5F, H und animierte Figur 2) und daher suboptimal sind für TIRF-SIM - Bildgebung wie die resultierenden Rekonstruktionen im wesentlichen TIRF Bilder mit Artefakte überlagert sind. In solchen Proben kann oft die Zunahme im Gegensatz zu dem Entfaltungsschritt des Rekonstruktionsalgorithmus zurückgeführt werden.
Hohe Modulationskontrast ist von wesentlicher Bedeutung für eine erfolgreiche SIM-Bildgebung. Die Fourier des rekonstruierten Bildes Transformation ermöglicht die Visualisierung der SIM optischen Übertragungsfunktion (OTF) (6A, Einschub). Ohne die Modulationskontrast für jede Orientierung zu maximieren durch Azimut polar sichergestelltModulation der Hochauflösungsinformation in der Probe führt zu einem niedrigen Signal-Rausch-Verhältnis in den SIM Durchlaßbänder isierung mit einem Polarisationsdreher, es sehr wenig. Rekonstruktionsalgorithmen , die den Standard Wiener - Filter - Ansatz verwenden , wird einfach das Rauschen in den SIM - Durchlaßbänder verstärken und ein Bild ergeben , das im Wesentlichen ein Standard TIRF Bild mit hexagonal überlagert (oder "Honigwabe") Ringing - Artefakten (6A, rechts). Eine mögliche Verbesserung könnte die Verwendung von iterativen 29,30 oder Blindrekonstruktionsalgorithmen 31,32 , um diese Artefakte zu reduzieren , die auf der Art der Probe abhängig. Wir empfehlen die Verwendung des ImageJ SimCheck Plugin die Qualität der SIM - Daten zu überprüfen , bevor und nach dem Umbau 33.

Abb . 1: Aufbau des Multicolor-TIRF SIM - Setup Das TIRF-SIM mikop besteht aus drei Hauptteilen, die Strahlerzeugungseinheit, die Musterprojektionseinheit und die Detektionseinheit. In der Strahlerzeugungseinheit werden drei verschiedene Laser auf dem gleichen Strahlengang durch dichroitische Spiegel (DM1 und DM2) ausgerichtet ist und durch vier optische Elemente zur Polarisationssteuerung gerichtet. Zuerst wird ein Polarisator (P) gewährleistet, um die Reinheit des linearen Polarisationszustand von jedem der Laserstrahlen. Die folgenden drei optische Elemente benötigt, um die Polarisation in einem schnellen, automatisierten Weise zu drehen, wie im Detail im Text beschrieben. Danach zwei Linsen (L1 und L2) in einem Teleskop-Konfiguration den Strahl erweitern, um die aktive Fläche des räumlichen Lichtmodulator (SLM) zu entsprechen und sind in drei Teilstrahlen gebeugt durch die projizierten SLM binären Gitterstrukturen (Beispiele sind in Kacheln dargestellt 1- 9). Der Polarisationszustand des Beleuchtungslichts relativ zu dem SLM Muster wird als Pfeil dargestellt ist. Ein zweites Teleskop (L3 und L4) de-preist die Größe des Musters und bietet Zugang zu the Fourier-Ebene des SLM Muster. In dieser Ebene eine räumliche Maske (SM) wird verwendet, um die zentrale Komponente und andere unerwünschte Beugungskomponenten von dem pixelierten Struktur des SLM und die interne Verdrahtung auszufiltern. Bevor die beiden verbleibenden Strahlen auf der hinteren Brennebene des Objektivs (OB) über die Kondensorlinse (L5), zwei dichroitische Spiegel (DM3 und DM4) fokussiert werden, werden in der Einrichtung enthalten. DM4 wirkt als herkömmliche von Emissionslicht zu trennen Beleuchtung in der Fluoreszenzmikroskopie dichroitische Spiegel. Jedoch bewirkt dieser Spiegel unvermeidbar Elliptizität des Polarisationszustandes des Beleuchtungslichtes, das durch DM3, einen dichroitischen Spiegel vom Idealfall der gleichen Charge wie DM4 kompensiert werden kann. Das Eintauchen in Öl TIRF Ziel hat eine ausreichend große NA direkt auf das Deckglas zwei gegenläufigen Wellen zu starten, die vollständig und führen zu einer strukturierten abklingende Feld in das Deckglas reflektiert werden. Die Probe wird auf einem xyz-Translationsstufe montiert. Die Erkennung ist perfORMED durch das gleiche Ziel und DM4 in Übertragung, sowie eine zusätzliche Filterung durch Bandpaß-Emissionsfilter, montiert in einem computergesteuerten Filterrad (EFW). Schließlich wird das Bild auf eine sCMOS projiziert Kamera durch das interne Mikroskoptubus Linse (L6). Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Fig . 2: Alignment von überlappenden Strahlen (A) Ein SLM Gittermuster mit einer kreisförmigen Öffnung gefenstert ist nützlich für die Ausrichtung. Wenn zwei nicht überlappenden Strahlen auf der Kamera (links) sichtbar sind, dann die Position der Probenebene muss durch iteratives Einstellen der axialen Position der Objektivlinse und der Kamera positioniert werden, um einen einzelnen kreisförmigen Beleuchtungsfleck zu geben (rechts). Die Träger müssen in orde überlappenr den sinusförmigen Erregungsmuster für TIRF-SIM erforderlich zu produzieren. Wenn die Strahlen nicht vollständig überlappen, reduziert dies das Sichtfeld über die das Interferenzmuster gebildet wird. (B und C) Die genaue Einfallswinkel der Strahlen ist wichtig für die TIRF-SIM. Wenn der Winkel nicht korrekt ist, einer der Strahlen wird nicht auf dem erforderlichen Winkel für TIRF sein, und dies ist leicht sichtbar, wenn eine Fluoreszenzfarbstofflösung Bildgebung. Ein Strahl hat einen Einfallswinkel größer als der kritische Winkel, der der kreisförmigen Fleck liefert und die andere nicht, die auf der linken Seite des Bildes in (B) zu dem hellen Streifen führt. (D) Einstellen des Winkels des Spiegels DM3 sorgt bei beiden Strahlen fallen im gleichen Winkel, und dies kann durch Defokussieren des Ziels validiert werden: wenn sie richtig ausgerichtet sind , die XZ - Projektion eines z Stapel von einem fluoreszierenden Farbstoff Probe zeigen sollten zwei symmetrisch sich kreuz Strahlen mit vernachlässigbarer Hintergrund bei derkonzentrieren. Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 3:. Synchronization Abhängigkeiten der verschiedenen Systemkomponenten (A) Für eine schnelle SIM Akquisition Synchronisation der Systemkomponenten eine Hardware - basierte Lösung mit unabdingbar. (B) Ein Datenerfassungskarte (DAQ) sollte als Master - Trigger verwendet werden. Ein TTL-Signal von der Messkarte ist mit dem sCMOS External Input und verwendet geschickt, um die Belichtung der Kamera auszulösen. Die Kamera Globale Belichtungs Ausgang löst dann die SLM ein Gittermuster angezeigt werden, und die SLM-LED-Freigabeausgang digital verwendet wird, um die Laseranregung modulieren, dass der Laser nur emittiert, wenn die SLM-Pixel in der "Ein" -Zustand sind. Nach der Belichtung ist complete, die Kamera Globale Belichtungsausgang wird verwendet, um auf die nächste Gitterphase oder der Winkel des SLM Muster vorzurücken. Der DAQ-Board gibt auch eine analoge Spannung an den LCVR Steuerung den linearen Polarisationszustand des Beleuchtungsstrahls zu steuern. Diese Spannung wird nach dem Erwerb der 3 Phasenbilder für jedes Muster Winkel umgeschaltet. Nach dem Erwerb von 9 Bildern für eine einzelne Wellenlänge, gibt der Messkarte ein Signal an den Emissionsfilter Radregler und schaltet auf die nächste Wellenlänge. Die Messkarte gilt auch für eine z-Offset auf die Probe durch eine analoge Spannung an die Steuerung z-Stufe Piezo ausgibt. Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 4: TIRF-SIM - Imaging von Testproben von 100 nm Multicolor Perlen und fluoreszenz Labelled Amyloidfibrillen. (A und B) Vergleich von Standard - TIRF im Vergleich zu TIRF-SIM - Rekonstruktionen für 488 nm und 640 nm Anregung. (C) Histogramm von voller Breite Halbmaximum (FWHM) der Gaußschen passt zu den TIRF-SIM - Perlen die erwartete Verbesserung der Auflösung zeigt. (D) TIRF gegen TIRF-SIM von β-Amyloid - Fibrillen mit 10% Rhodamin - Derivat - Farbstoff markiert (488 nm Anregung). Maßstabsbalken = 1 um. Bitte klicken Sie hier , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abb . 5: Live Cell TIRF-SIM Imaging Vergleich konventioneller und TIRF TIRF-SIM Bilder (A, B) Mikrotubuli (emGFP-Tubulin) in eine HEK293 - Zelle, (C, D ) filamentösen Aktin (LifeAct-GFP) in einer COS-7 - Zelle und (E, F) cytosolischen GFP in einer HEK293 - Zelle. Bilder in B und F sind einzelne Zeitpunkte aus den Filmen. Boxed Bereiche werden in (G, H) vergrößert. Maßstabsbalken = 3 & mgr; m. Bitte klicken Sie hier , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abb . 6: Einfluss der Polarisationsdreher auf Reconstructed Bead Bilder (A) , ohne die Verwendung eines Polarisationsdreher, wie einem LCVR, das Signal-Rausch - Verhältnis in den SIM Durchlaßbänder niedrig ist, die in charakteristischen hexagonal Artefakte in dem rekonstruierten SIM Ergebnisse Bilder (rechts), (B) in 2D-SIM sind die strukturierten Beleuchtungsmuster direkt sichtbar in der FourierTransformation der Rohbilder (links, Anregung Raumfrequenz markiert), da sie innerhalb des Radius der Emission OTF Unterstützung fallen, jedoch in TIRF-SIM, sie sind außerhalb der OTF Unterstützung und somit nicht sichtbar (rechts). In diesem Fall muss das Muster Modulationskontrast mit einer spärlichen Perle einschichtigen beurteilt werden, wie im Protokoll beschrieben. Bitte klicken Sie hier , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 7:. Spatial Light Modulator Basierend Pattern Generation ermöglicht die Implementierung von anderen Bildgebungsverfahren wie die multifokale SIM (A) In MSIM, ein Gitter aus quadratischen pointsdisplayed auf dem SLM (kleines Bild) ergibt ein Gitter von beugungsbegrenzten Brennpunkte auf der Bildebene. Eine dünne Schicht mit niedriger Konzentration Rhodamin 6G auf visua abgebildet Lize die Brennpunkte. Das Muster wird über die Probe (B) und die erworbene Rohbild z-Stack wird rekonstruiert übersetzt ein Bild zu erzeugen mit Out-of-Focus - Licht (C) reduziert. Maßstabsbalken = 5 & mgr; m. Bitte klicken Sie hier , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Animierte Abbildung 1:. Time Series Film von EmGFP-Tubulin in einer HEK293 Zellen eine schnelle Polymerisation und Depolymerisation von emGFP markierten Mikrotubuli beobachtet werden kann TIRF-SIM verwenden. Bilder mit 50 ms Belichtungszeit pro rohen Rahmen (450 ms pro SIM-Rahmen) in Intervallen von 0,5 Sekunden Abstand erworben. Belichtungszeit verwendet wurde, durch die Helligkeit des Fluorophors, nicht durch die Geschwindigkeit der Kamera oder SLM beschränkt. 3988movie1.mov "target =" _ blank "> Bitte hier klicken, um dieses Video anzusehen.

Animierte Abbildung 2:. Time Series Film von Cytosolic GFP in einer HEK293 von Zellproben mit geringem Kontrast wie diese sind nicht ideal Proben für die TIRF-SIM - Bildgebung. Retrograden Membranfluss in den TIRF-Bilder zu sehen, aber TIRF-SIM liefert keine zusätzliche Information außer an den Zellenrändern. TIRF-SIM - Bilder wurden mit 50 ms Belichtungszeit pro rohen Rahmen (450 ms pro SIM - Rahmen) erworben in Abständen von 5 sec. Bitte hier klicken , um dieses Video anzusehen.
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