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Methodenartikel

Ein Mikrofluidik-Plattform für Hochdurchsatz-Einzelzell-Isolierung und Kultur

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DOI:

10.3791/54105

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16. Juni 2016

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Hier präsentieren wir ein Protokoll zur Isolierung und Kultivierung einzelner Zellen mit einer mikrofluidischen Plattform, die ein neues Mikrotiter-Designkonzept verwendet, um eine hocheffiziente Einzelzellisolierung und eine langfristige klonale Kultur zu ermöglichen.

Zusammenfassung

Die Untersuchung der Heterogenität einzelner Zellen ist für viele biologische Fragen entscheidend, aber technisch schwierig. Daher besteht ein Bedarf an einer einfachen, aber dennoch hochdurchsatzstarken Methode, um Einzelzellkulturexperimente durchzuführen. Hier berichten wir über eine mikrofluidische Chip-basierte Strategie für die hocheffiziente Einzelzellisolierung (~77%) und demonstrieren ihre Fähigkeit, langfristige Einzelzellkulturen (bis zu 7 Tage) und zelluläre Heterogenitätsanalysen mit klonogenen Assays durchzuführen. Diese Anwendungen wurden mit KT98 neuralen Stammzellen der Maus und A549 und MDA-MB-435 menschlichen Krebszellen demonstriert. Eine hohe Effizienz der Einzelzellisolierung und eine langfristige Kulturfähigkeit werden durch die Verwendung von Mikrovertiefs unterschiedlicher Größe an der Ober- und Unterseite des mikrofluidischen Kanals erreicht. Das kleine Mikrotiter-Array ist für die präzise Isolierung von Einzelzellen ausgelegt, und das große Mikrotiter-Array wird für die klonale Einzelzellkultur im mikrofluidischen Chip verwendet. Diese mikrofluidische Plattform stellt einen attraktiven Ansatz für Einzelzellkulturanwendungen dar, da sie flexibel anpassbare Zellkulturräume für verschiedene Kulturstrategien bietet, ohne die Isolationseffizienz zu verringern.

Einleitung

Derzeit Einzelzellen einzeln in einem Kulturraum platziert wird üblicherweise durch Verwendung limitierende Verdünnung oder fluoreszenzaktivierte Zellsortierung (FACS) erzielt. Für viele Laboratorien limitierende Verdünnung ist ein zweckmßiges Verfahren, da es nur eine Pipette und Gewebekulturplatten benötigt, die leicht verfügbar sind. In diesem Fall wird eine Zellsuspension zu einer geeigneten Zelldichte seriell verdünnt und dann in Kulturvertiefungen gegeben durch eine manuelle Pipette. Diese abgeteilten Einzelzellen werden dann für die Zellanalyse verwendet werden, wie genetische Heterogenität Screenen 1 und Koloniebildung 2. Jedoch ist dies....

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Protokoll

Hinweis: Die Fotomasken-Designs für unsere Mikrofluidik-Vorrichtung Fertigung wurden gezeichnet von einem Computer Aided Design (CAD) Software. Die Entwürfe wurden dann verwendet, um Chrom Photomasken herzustellen Kommerzielle Dienst. Die PDMS - Geräte wurden unter Verwendung von weichen Lithographietechniken hergestellt. 11

1. Herstellung von Urformen von Lithography

  1. Vor dem photolithographischen Prozeß 12, verwenden , um die 4-Zoll - Siliziumwafer als Substrat und entwässern um die Wafer in einem konventionellen Ofen bei 120 ° C für 10 min.
  2. Reinigen Sie die dehydriert Silizium-Wafern durch Saue....

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Ergebnisse

Die mikrofluidische Plattform für Einzelzellisolierung und Kultur umfasst einen Mikrokanal (200 & mgr; m in der Höhe) mit zwei Sätzen von Mikrovertiefungsanordnungen (2A). Die zwei Sätze von Mikrovertiefungsarrays werden als capture-Well (25 um Durchmesser und 27 um Tiefe) und Kultur-Well (285 & mgr; m im Durchmesser und 300 & mgr; m in der Tiefe) bezeichnet für die Einzelzell-Isolierung und Kultur sind und jeweils Capture-gut ist in der Mitte einer Kultur gu.......

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Diskussion

Mikrowell-basierten Gerätesysteme 6,14 wurden für die Einzelzell - Manipulation und Analyse, wie beispielsweise großflächige Einzelzelle verwendet und 6 einzigen hämatopoetischen Stammzellproliferation Trapping 15. Obwohl gut Größe, Anzahl und Form können für spezifische Anwendungen angepasst werden, die Einzelzellisolierung Effizienz wird immer gefährdet , wenn die Größe des Bohrlochs erhöht. 9,15

Um diese Einschränkung zu überwinden, Park et .......

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Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden finanziellen Interessen haben.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde durch einen Zuschuss der National Health Research Institutes (03-A1, BNMP11-014) unterstützt.

....

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
AutoCAD-SoftwareAutodeskAutoCAD LT 2011Teile-Nr. 057C1-74A111-1001
Siliziumwafer Eltech corperation SPE0039
Konventioneller OfenYEONG-SHIN Firmaovp45
PlasmareinigerNordsonAP-300Bench-Top Plasmabehandlungssystem
SU-8 50 Negativ-FotolackMicroChemY131269
SU-8 100 Negativ-FotolackMicroChemY131273
Spin CoaterSynrex Co., GmbH.SC-HMI 2" ~ 6"
HeizplatteYOTEC FirmaYS-300S
Msak AlignerDeya Optronic CO.A1K-5-MDA
SU-8 EntwicklerGrand Chemical CompaniesGP5002-000000-72GCPropylenglykolmonomethyletheracetat
Scanning-Laser-ProfilometerKEYENCEVK-X 100
TrichlorsilanGelest, IncSIT8174.0Tridecafluor-1,1,2,2-tetrahydrooctyl. Gefährlich. Korrosiv für die Atemwege, reagiert heftig mit Wasser.
ExsikkatorBel-Art ProductsF42020-0000Platzsparender Vakuum-Exsikkator 190  mm weißer Boden
Polydimethylsiloxan (PDMS) KitDow CorningSylgard 184
Harris Uni-Core StanzerTed Pella Inc.15072mit 0,75 mm Innendurchmesser
Ablösbares Klebeband3M CompanyScotch Ablösbares Klebeband 811
StereomikroskopLeica MicrosystemsLeica E24
Rinderserumalbumin (BSA)Bersing TechnologyALB001.500
DMEM BasalmediumGibco12800-017
Fötales RinderserumThermo HycloneSH30071.03HI
AntibiotikaBiowestL0014-100Glutamin-Penicillin-Streptomycin
Rekombinantes EnzymgemischInnovative ZelltechnologieAM-105Accumax
DiIC12(3) ZellmembranfarbstoffBD Biosciences354218Wird als Zelltracker verwendet
SpritzenpumpeHarvard Gerät703007
Kunststoff Spritze (1 ml)BD Biosciences309659
23 Gauge stumpfe NadelnEver Sharp Technology, Inc.TD21
Schlauch aus Polytetrafluorethen (PTFE)Ever Sharp Technology, Inc.TFT-23TInnendurchmesser, 0,51  Mm; Außendurchmesser, 0,82  Mm

Referenzen

  1. Meacham, C. E., Morrison, S. J. Tumour heterogeneity and cancer cell plasticity. Nature. 501 (7467), 328-337 (2013).
  2. Vermeulen, L., et al. Single-cell cloning of colon cancer stem cells reveals a multi-lineage differentiation capacity. P Natl Acad Sci USA

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

Mikrofluidischer ChipHochdurchsatzkultivierungMikrowell-ArrayZellauffangmuldengravitative BeladungPDMS-HerstellungPlasmabondingKlonkulturHeterogenitätsanalyse