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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ein Protokoll , ein Poly (N iso-propylacrylamid) (PIPAAm) beschichtet Mikro für effektive Erfassung und thermoresponsive Freisetzung von lebenden zirkulierenden Tumorzellen (CTC) präsentiert zu nutzen. Diese Methode ermöglicht Erfassung von CTC aus dem Blut des Patienten und die anschließende Freisetzung von lebensfähigen CTC für Downstream-Off-Chip-Kultur, Analysen und Charakterisierung.
Wir zeigen ein Verfahren zur Größe basierte Erfassung von lebenden zirkulierenden Tumorzellen (CTC) aus Vollblut, zusammen mit der Freisetzung dieser Zellen aus Chip für Downstream-Analyse und / oder Kultur. Die Strategie setzt die Verwendung eines Porenmikro neuartigen Parylene C Membran Schlitz zu erfassen CTC und eine Beschichtung aus Poly (N -iso-propylacrylamid) (PIPAAm) für thermoresponsiven tragfähige Freisetzung des eingefangenen CTC. Das Einfangen von lebenden Zellen wird durch die Nutzung der Gestaltung eines Schlitzes Porengeometrie mit spezifischen Abmessungen ermöglichte die Scherspannung zu verringern, die typischerweise mit den Filtrationsprozess verbunden. Während die Filter nicht mit einer hohen Abscheidegrad aufweist, ist die Freisetzung dieser Zellen nicht trivial. Typischerweise sind nur ein kleiner Prozentsatz der Zellen freigesetzt wird, wenn Techniken wie Umkehrströmung oder Zell Schaben verwendet werden. Die starke Haftung dieser epithelialen Krebszellen auf die Parylene C-Membran ist auf unspezifische elektrostatische Wechselwirkung. Entgegenzuwirken thEffekt ist, verwendet wir die Verwendung von PIPAAm Beschichtung und ihre Wärme ansprechenden Grenzflächeneigenschaften ausgenutzt, die Zellen von dem Filter zu lösen. Blut wird zuerst bei Raumtemperatur filtriert. Unter 32 ° C, ist PIPAAm hydrophil. Danach wird der Filter entweder in Kultur platziert Medien oder einem Puffer bei 37 ° C gehalten wird, die in der PIPAAm führt hydrophoben Drehen und anschließend die elektrostatisch gebundenen Zellen freigesetzt wird.
Metastasierten Erkrankung ist verantwortlich für die meisten Todesfälle durch Krebs. Die Entwicklung prognostischen und diagnostischen Begleit Biomarker für die Metastasierung ist in der Krebs Management und Behandlung von entscheidender Bedeutung. Zirkulierende Tumorzellen (CTC) spielen eine zentrale Rolle bei der Tumorausbreitung und Metastasierung. Des Weiteren als "flüssige Biopsie Biomarker leicht zugänglich zu sein, CTC bei Krebspatienten Tummelplatz" für Krebs Biomarker-Forschung 'peripheren Blut wurde als gestiegen ". 3 - CTC wurden als prognostischer Biomarker bei verschiedenen Krebserkrankungen, einschließlich Brust-, Prostata- und Darmkrebs 1 gut validiert. Jüngsten Fortschritte in der CTC - Feld hat jedoch darauf hingewiesen , dass die bloße Aufzählung dieser seltenen Zellen klinischen Nutzen beschränkt hat, als 4 in der interventionellen klinischen Studien gezeigt. Somit gibt es eine wachsende Nachfrage nach Technologien, die für die molekulare und funktionelle Charakterisierung von CTC ermöglichen. Derzeit sind nur wenige Technologien existieren, mit denen for Nicht-Antigen voreingenommen, durchführbare Erfassung und Freigabe von CTC und ermöglicht robuste nachgeschalteten molekularen und funktionellen Analyse 5,6. Mehrzahl dieser mikrofabrizierten Geräte an mikrofluidischen Plattformen gekoppelt und damit einen begrenzenden Faktor in der Menge von Blut, die die verarbeitet werden können, die von 2 bis 4 ml 7 reicht - 10. CTC sind seltene Ereignisse in einem einzigen Rohr aus Blutentnahme (7,5 ml), daher weiter die Menge an Blut zu reduzieren, die verarbeitet werden können, stark behindert die Chancen für die Erfassung und diese Zellen von Interesse zu isolieren.
Wir haben für die Erfassung von CTC zwei Arten von Parylene C Membranmikro Geräte entwickelt , die die Größenunterschiede zwischen größeren Tumorzellen und den kleineren normalen Blutzellen 11,12 auszunutzen. Wir haben zuvor auf dem runden Poren Enumeration Filter berichtet und verglichen sie mit einer FDA-zugelassenen Plattform, wo die Mikro in CTC - Capture - Effizienz überlegen gezeigt wurde ,für Krebspatienten Blutproben 13,14. Jedoch eine Begrenzung des Rundfilters ist die Notwendigkeit, eine Formaldehydbasis Fixiermittel vor der Filtration zu verwenden. Dieser Prozess bewahrt die Zellen Morphologie, während es ihnen ermöglicht, die Scherspannung und Druck während des Filtrationsprozesses zu widerstehen. Während Aufzählung und molekulare Untersuchungen können auf dem Chip 13 durchgeführt werden, beeinträchtigt die Fixiermittel die Fähigkeit , funktionelle Charakterisierung durchzuführen. Um diese Einschränkung zu begegnen, entwickelten wir einen Schlitz Porenfilter, der die Notwendigkeit negiert zu fixieren Zellen vor der Filtration (Abbildung 1). Die Schlitzporengeometrie (6 & mgr; m Breite x 40 & mgr; m Länge Schlitzporen) ermöglicht es den Tumorzellen, während nur teilweise eine Pore und somit noch ermöglicht einen freien Durchgang für andere Blutzellen und die Linderung der Druckanstieg Okkludieren erfasst werden, die zu Zellschäden führen würde und schließlich Platzen 15,16 der Schlitz Poren Kartusche besteht aus zwei Acrylstücke , die Sandwichder Schlitz Porenfilter , der zwischen dem oberen und unteren Teil mit Polydimethylsiloxan (PDMS) , die als eine Dichtung , die eine lecksichere Dichtung 14,15 (Figur 1) zu liefern.
Während die Abscheidungseffizienz des Schlitzes Porenfilter ist hoch, (Tabelle 1), werden die erfassten CTC an die Membran gebunden Parylene C durch starke unspezifische elektrostatische Wechselwirkungen statt extrazellulären Matrix (ECM) 15 vermittelte Adhäsion. Verfahren wie Umkehrströmung oder die Verwendung von Zell-Schaber versagen die Zellen von dem Filter effektiv zu lösen, oder in Zellschädigung und Zelltod führen. Wir erkundeten einen unkonventionellen Einsatz von PIPAAm Release - Strategie 15 zu formulieren. PIPAAm ist ein Polymer , das bei einer Lösungstemperatur von 32 ° C 17 eine reversible untere kritische Lösungstemperatur (LCST) Phasenübergang erfährt. Traditionell ist diese Eigenschaft von PIPAAm für Tissue-Engineering-Anwendungen weit erforscht. Typischerweise werden Zellenkultiviert auf PIPAAm bei 37 ° C beschichteten Oberflächen wenn PIPAAm hydrophob ist. Die Zellen können dann als Folie abgenommen werden , wenn die Kulturtemperatur auf unter 32 ° C verschoben wird, wo die beschichtete Oberfläche PIPAAm hydratisierten 17,18 wird. Wir nutzten diese thermische Eigenschaft durch das Filtrationsverfahren bei Raumtemperatur durchführt (unter 32 ° C) und dann ermöglicht Zellfreisetzung durch den Filter in Kulturmedien platziert bei 37 ° C gehalten. Bei dieser Temperatur wird die PIPAAm Polymerschicht hydrophob ist , wodurch die Freigabe der elektrostatisch gebundenen Zellen 15 (Abbildung 1).
Obwohl die Temperatur ansprechende Methode sowie andere Methoden haben tragfähige CTC - Capture zu erreichen erfolgreich umgesetzt und Release 19-21, ein Schlüssel durch diese Technologien gemeinsam genutzt möglicher Nachteil berichtet, dass sie alle eine Antigen-abhängige Prinzip für CTC - Capture verwenden. Antigen basierte CTC-Capture, wie gezeigt previously, führen zu verzerrten CTC - Analyse 11,14. Zum Beispiel verwenden viele Affinität-basierten Technologien Antikörper, der EpCAM für CTC-Capture bindet. Allerdings CTC wurde verschiedenen Ebenen von EpCAM, was zu einer Auslassung von EpCAM niedrig und EpCAM negativen CTC durch diese Technologien zum Ausdruck gezeigt. Auch können Einschränkungen auftreten, wenn CTC aus nicht-epithelialen Ursprungs von Interesse ist, wie CTC in Melanom und Sarkom-Einstellungen. Somit ist eine Technologie, die ohne Potentialvorspannung für tragfähige CTC Erfassung und Freigabe ermöglicht durch Antigen-basierende Datenerfassung eingeführt ist höchst wünschenswert.
Wichtig ist, dass der Mikrofilter-Aufnahmegerät rein bemessen basiert und die Trennstrategie unabhängig auf das Vorhandensein von bestimmten Oberflächenmarker. Wir glauben, dass der Einsatz der Mikro PIPAAm beschichtet wird dazu beitragen, unser Verständnis des metastatischen Prozesses zu erweitern, durch die Möglichkeit bietet, effektiv und effizient zu erfassen und zu lösen CTC für Downstream-Analysen. Dies kann potentaussetzen mathematisch neue Moleküle, für die neuartige gezielte systemische Therapien als auch gerichtet werden könnten als Biomarker zur Verfügung stellen, die einfach und Hilfe bei der Krebspatientenmanagement überwacht werden kann.
Ethikerklärung: Um die Rechte der menschlichen Probanden zu schützen, wurden Blutproben unter den von der University of Miami Institutional Review Boards unter IRB 20150020 genehmigten Protokollen nach einer informierten Zustimmung erhalten.
HINWEIS: Blut für CTC-Capture gefiltert werden soll verhindern Koagulation in einem EDTA-Röhrchen gesammelt werden.
1. Beschichtung der Mikrofilter mit Poly (N-iso-Propylacrylamid) (PIPAAm)

Abbildung 2:. Repräsentative Darstellung des Mikrofilter - Set-up für PIPAAm Beschichtung 8 mm x 8 mm Mikro auf die 12 mm positioniert x 12 mm Kunststoff quadratisch geschnitten aus einem Kunststoff - Objektträger. Polyimide Band wird verwendet , um die Mikro an Ort und Stelle zu sichern Mantel zu spinnen die PIPAAm.Reproduced mit Genehmigung aus Lit. 15. Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.
2. Montage der Filtrationskassette mit PIPAAm Beschichtete Mikrofilter
3. Filtration von Blut-Probe mit Capture und Freisetzung von CTC aus dem Mikrofilter
4. CTC Viability Bewertung
Mit gesunden Spendern Blut (erhalten unter einem Protokoll, das von der University of Miami IRB 20.150.020 im Anschluss an eine informierte Zustimmung genehmigt) gespickt mit kultivierten Krebszellen, die thermoresponsive Technik zur Freisetzung von lebenden zirkulierenden Tumorzellen (CTC) erzielte Erfassung, Freigabe und Wieder Effizienz von 94% ± 9%, 82% ± 5% und 77% ± 5% (Tabelle 1) 15. Im Vergleich dazu waren die Freisetzung und Wiedergewinnungseffizienz von unbeschichteten Filter deutlich geringer (7% ± 1% Freisetzungseffizienz und 6% ± 1% Wiedergewinnungswirkungsgrad) (Tabelle 1) 15. Um die Lebensfähigkeit von CTCs aus Filter, ~ 1000 SK-Br-3-Zellen wurden versetzt in 7,5 ml gesunden Spenderblut, gefiltert durch den PIPAAm beschichtete Schlitzfilter und freigegeben unter Verwendung der oben beschriebenen Verfahren gelöst zu bewerten. Ein Live / Dead-Test wurde durchgeführt, die die Lebensfähigkeit der Zellen vor Spike in Blut zu bewertenund nach der Entlassung. Die Pre-Spitze Lebensfähigkeit betrug 98% (592 von 602 Zellen gezählt) und die Lebensfähigkeit von Zellen aufgenommen und von Blut freigesetzt betrug 95% (540 aus 567 Zellen gezählt) 15 (3A). Parallel dazu nahmen die Zellen und Nachverbrennung Filtration aus der Blutprobe kultiviert wurden in 5A Kulturmedium McCoy. Bilder bei Tag eingenommen wurden 3 und Tag 10. Wie in 3B gezeigt ist , aus dem Filter freigesetzten Zellen nicht lebensfähig blieben nur, aber rasch in Kultur expandiert, damit ihre Lebensfähigkeit Nachfiltervorrichtung herzustellen.

Abb . 1: PIPAAm Slot Filter Coated Capture and Release zirkulierender Tumorzellen aus Blut (oben) (A) Hell Bild von PIPAAm beschichtet Schlitz - Filter; (B) Filtration von Vollblut für CTC - Capture. (C) Schematische Darstellung der ter Mikrofilter Kassette, wo die, PIPAAm beschichtet Schlitz Filter zwischen der oberen und unteren Kassette angeordnet ist. (Bodenplatte) (D) Schematische Darstellung des Prozesses freizugeben CTC von PIPAAm beschichtet Schlitz Filter erfasst. Wiedergabe mit freundlicher Genehmigung aus Lit. 15. Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 3:. Erfassung, Freigabe und Kultur von lebenden Tumorzellen Zellen Brustkrebs (SKBR-3) versetzt in normalen Spenderblut wurden gefangen genommen und veröffentlicht eine PIPAAm beschichtete Mikro verwenden. Die Zellen blieben tragfähige nachträglicher und rasch in Kultur expandiert. (A) Live - toten Test durchgeführt auf den vom Filter freigesetzten Zellen. 95% (540 aus 567 gezählten Zellen) der Zellen zeigte lebensfähig zu sein(Grün) nach der Veröffentlichung. Tote Zellen sind rot markiert. (F) Tag 3 bis Tag 10 der Kultur der aus PIPAAm beschichtet Schlitz - Filter freigesetzten Zellen. Die Zellen blieben lebensfähig und in Kultur expandiert. Maßstabsbalken = 100 μm.Reproduced mit Genehmigung aus Lit. 15. Bitte hier klicken , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 4: Messung der Pore Parameter Vor- und Nach - PIPAAm Beschichtung Hell Bilder von Schlitzfilter (A) vor und (B) post- PIPAAm Beschichtung.. (C) Porenlänge wurde um 7,3% ± 2,1% gesunken nach PIPAAm Beschichtung und Porenweite von 15,3% ± 5,6% nach PIPAAm Beschichtung verringert wurde. Wiedergabe mit freundlicher Genehmigung aus Lit. 15.Bitte klicken Sie hier , um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Abbildung 5: Contaminating Erythrozyten und Leukozyten werden entfernt von Gentle Wäscht Rund 1.000 SKBR-3 - Zellen wurden aus dem Blut zurückgeholt durch PIPAAm beschichtet Schlitz - Filter und wurden auf einer 48-Well - Platte plattiert.. (A) bei 16 Stunden in Kultur, SKBR-3 Tumor Kulturplatte geklebt Zellen (grüne Pfeile), während apoptotische Erythrozyten und Leukozyten wurden Absetzen auch an der Unterseite der Platte (rote Pfeile). (B) Nach dem Waschen, nicht haftenden Zellen wurden entfernt, so dass anhaftende Tumorzellen auf der Platte (grüne Pfeile). Wiedergabe mit freundlicher Genehmigung aus Lit. 15. Bittehier klicken, um eine größere Version dieser Figur zu sehen.

Tabelle 1:. Erfassung, Freigabe und Retrieval Effizienz von PIPAAm Coated Slot Filter Abscheidegrad = Zellzahlen erfasst auf Filter vor der Freigabe / Zellzahlen versetzt in das Blut. Lassen Sie Effizienz = Zellzahlen veröffentlicht von den Filter / Zellzahlen auf dem Filter vor der Freigabe eingefangen. Retrieval Effizienz = Zellzahlen aus dem Filter / Zellzahlen veröffentlicht versetzt in blood.Reproduced mit Genehmigung aus Lit. 15.
Ein Teil dieser Arbeit wurde durch die vorläufige US-Patentanmeldung Nr. 62/219,808 geschützt. Siddarth Rawal ist ein Aktionär von Circulogix Inc., das die in diesem Artikel verwendeten Filter und Filterkassetten/-patronen kommerziell herstellt.
Ein Protokoll , ein Poly (N iso-propylacrylamid) (PIPAAm) beschichtet Mikro für effektive Erfassung und thermoresponsive Freisetzung von lebenden zirkulierenden Tumorzellen (CTC) präsentiert zu nutzen. Diese Methode ermöglicht Erfassung von CTC aus dem Blut des Patienten und die anschließende Freisetzung von lebensfähigen CTC für Downstream-Off-Chip-Kultur, Analysen und Charakterisierung.
Wir danken allen Patienten, die Blutproben gespendet haben, um diese Arbeit zu unterstützen. Wir danken Dr. Guiseppe Giaconne, Dr. Ritesh Parajuli und Dr. Marc E. Lippman für ihre Unterstützung bei der klinischen Probenbeschaffung sowie Dr. Carmen Gomez, Dr. Ralf Landgraf, Dr. Stephan Züchner, Toumy Guettouche und Dr. Diana Lopez für ihre aufschlussreichen Gespräche. Zheng Ao bedankt sich für die teilweise Unterstützung und Hilfe durch das Sheila and David Fuente Graduate Program in Cancer Biology, Sylvester Comprehensive Cancer Center.
| Schlitzfilter | Circulogix Inc. | MSF-01 | Filter in verschiedenen Größen erhältlich, basierend auf der Filtration von CTC aus Blut oder Urin (www.circulogixinc.com) |
| Poly(N-iso-propylacrylamid) (PIPAAm) | Ploysciences Inc. | 21458 | Nicht gefährlich. Bei Raumtemperatur lagern. |
| 1-Butanol | Sigma Aldrich | B7906 | Verwendung in gut belüfteten Bereichen |
| Kunststoff-Objektträger | Cole-Parmer | 48510-30 | Alle Kunststoffobjektträger oder alternativ jede Art von Quadrat (Metall, Acryl usw.) können verwendet werden, wenn es sich um einen Ballen handelt, um das 8mmx8mm Filterquadrat zu halten |
| Spin Coater | Spezialbeschichtungssysteme | SCS G3 Spin Coater | Instrument |
| Polyimid Band | Uline | S-7595 | Polyimid ist der generische Name für Kapton Tape, das von mehreren Anbietern (Amazon, Kaptontape.com) erworben werden |
| kann.HBSS- Hank's Balanced Salt Solution | Gibco | 14025-092 | |
| 1x PBS | Gibco | 10010-023 | |
| Falcon Petrischalen 35 x 10 mm | VWR | 25373-041 | |
| Mikrofilterkassette | Circulogix Inc. | FC-01 | Custom Catridges sind auf der Grundlage einer Filtration für CTC aus Blut oder Urin erhältlich. |
| Spritze 20 ml | BD Scientific | 302830 | |
| Spritzenpumpe | KD scientific | 78-0100V | Jede Spritzenpumpe, die eine 25-ml-Spritze aufnehmen kann, kann verwendet werden |
| Cellstar 50 ml Zentrifugenröhrchen | VWR | 82050-322 | |
| Greiner Bio One 6-Well-Platte | VWR | 89131-688 | JedeMarke kann verwendet werden, solange die Oberfläche für die Zelladesion verträglich und nicht abstoßend ist |
| SKBR3-Zellen | ATCC | HTB-30 | |
| Live Dead Assay | Life Technologies | L3224 | Jeder Assay, der eine vernünftige Analyse zur Bewertung lebender Zellen liefern kann, funktioniert |
| Zellkultur-Inkubator | VWR | 98000-368 | Jeder Inkubator, der für die Zellkultur verwendet werden kann, ist ausreichend |