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Ionisierende Strahlung (IR) induziert zahlreiche stabile und instabile Chromosomenaberrationen. Instabile Aberrationen, bei denen die Chromosomenmorphologie erheblich beeinträchtigt ist, können mit herkömmlichen Chromosomenfärbetechniken leicht identifiziert werden. Der Nachweis stabiler Aberrationen, bei denen genetisches Material ausgetauscht oder translokiert wird, ohne dass die Chromosomenmorphologie wesentlich verändert wird, erfordert jedoch ausgeklügelte Chromosomenmaltechniken, die auf der In-situ-Hybridisierung von fluoreszenzmarkierten DNA-Sonden beruhen, einer Chromosomenmaltechnik, die im Volksmund als Fluoreszenz in situ bekannt ist Hybridisierung (FISH). FISH-Sonden können spezifisch für ganze(s) Chromosom(en) oder für präzise Unterregionen auf Chromosom(en) sein. Die Methode ermöglicht nicht nur die Visualisierung stabiler Aberrationen, sondern auch den Nachweis des Chromosoms bzw. der spezifischen DNA-Sequenzen, die an einer bestimmten Aberrationsbildung beteiligt sind. In der Zytogenetik steht eine Vielzahl von Chromosomenmaltechniken zur Verfügung; hier werden zwei hochempfindliche Methoden, die multiple Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (mFISH) und die spektrale Karyotypisierung (SKY), diskutiert, um interchromosomale stabile Aberrationen zu identifizieren, die sich in den Knochenmarkzellen von Mäusen nach Ganzkörperbestrahlung bilden. Obwohl beide Techniken auf fluoreszenzmarkierten DNA-Sonden beruhen, unterscheiden sich die Detektionsmethode und der Prozess der Bildaufnahme der Fluoreszenzsignale. Diese beiden Techniken wurden in verschiedenen Forschungsbereichen eingesetzt, wie z.B. in der Strahlenbiologie, der Krebszytogenetik, der retrospektiven Strahlenbiodosimetrie, der klinischen Zytogenetik, der evolutionären Zytogenetik und der vergleichenden Zytogenetik.