Diese Studie umfasst Methoden, um Auswirkungen auf ein Modell Fisch-Host folgende Veränderung der Haut und Darm microbiome Gemeinden Zusammensetzung durch ein Antibiotikum zu offenbaren.
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In diesem Artikel
Zusammenfassung
Zusammenfassung
Die Gemeinsamkeit des Antibiotikaeinsatzes in der Medizin bedeutet, dass das Verständnis der daraus resultierenden Folgen für den Wirt von entscheidender Bedeutung ist. Antibiotika verringern oft die Vielfalt der Mikrobiomgemeinschaften des Wirts und verändern die Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaft. Viele Krankheiten wie Antibiotika-assoziierte Enterokolitis, entzündliche Darmerkrankungen und Stoffwechselstörungen wurden mit einer gestörten Mikrobiota in Verbindung gebracht. Das komplexe Zusammenspiel zwischen Wirt, Mikrobiom und Antibiotika erfordert ein handhabbares Modell für die Untersuchung von Wirt-Mikrobiom-Interaktionen. Unser Süßwasserwirbeltier dient als nützliches Modell für die Untersuchung der universellen Aspekte der Struktur und Funktion des mukosalen Mikrobioms sowie für die Analyse der daraus resultierenden Wirtseffekte durch die Veränderung der mikrobiellen Gemeinschaft. Zu den Methoden gehören Herausforderungen für den Wirt wie z. B. die Infektion mit einem bekannten Fischpathogen, die Exposition gegenüber Stuhl- oder Bodenmikroben, osmotischer Stress, Nitrattoxizität, Wachstumsanalysen und die Messung der Darmmotilität. Diese Techniken demonstrieren ein flexibles und nützliches Modellsystem für die schnelle Bestimmung von Wirtsphänotypen.
Einleitung
Es wurde festgestellt, dass Antibiotika können die menschliche microbiome stören zu dysbiosis führt, eine mikrobielle Gemeinschaft Ungleichgewicht bedeutet. Die kompositorische Veränderung der Mikrobiota nach einer Antibiotika - Behandlungen wurde die Vielfalt der Gemeinschaft gezeigt zu senken, wichtige Mitglieder zu reduzieren und Gemeinschaft Stoffwechsel verändern, vor allem im Darm 1, 2. Antibiotic Störung des Darms microbiome kann Kolonisationsresistenz auf Clostridium difficile 3, 4 und 5 Salmonella ver....
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Protokoll
Alle Tierversuche wurden unter Genehmigung von IACUC Protokolle durchgeführt, nummeriert 14-05-05-1018-3-01, 13-04-29-1018-3-01 und 14-04-17-1018-3-01.
1. Animal Collection, Handhabung und Ethical Pflege
- Sammeln Sie Gambusia affinis aus dem Feld Website (Bestimmungsführer bei http://www.sms.si.edu/irlspec/Gambusia_affinis.htm) mit einem kleinen Kescher und Platz in 19 L Eimer mit. Verwenden Sie visuelle Inspektion Arten zu identifizieren.
- Rest Fisch für 1 bis 2 d in einem Eimer mit Teichwasser. Danach übertragen Fisch in 76 oder 189 Tanks L Aquarium gefüllt mit Halbteichwasser / Halbleitungswasser bei 25 ° C, belüftet mit einer s....
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Ergebnisse
Ein Gesamtschemadiagramm des experimentellen Systems verwendet , um Fischaufnahmeeffekte aus antibiotischen Belichtungs 13 ist in 1A dargestellt und beinhaltet die Technik zum Extrahieren der Haut (1B) und gut (1C) microbiomes vom Fisch studieren. Drei Tage wurde als Antibiotikum Einwirkungszeit ausgewählt, weil früheren Daten, die zeigt, während die gesamte Haut kultivierbaren Zahl zu Beginn der Behandlung fällt,.......
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Diskussion
Einige Herausforderungen erfordern eine Ruhezeit in einem sauberen APW nach einer Antibiotika-Behandlung für das Medikament in Fischgewebe aufgebraucht werden. Wenn die Ruhezeit übersprungen wird, dann können die Ergebnisse antibiotische Anwesenheit vermengen, insbesondere wenn der Assay Exposition gegenüber Bakterien beinhaltet. Um Effekte aus einer veränderten microbiome Zusammensetzung ohne große Änderungen in der Gesamtzahl von Mikroben auf dem Host, Vorversuche Überwachung microbiome Zusammensetzung (16S Profiliere.......
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Offenlegungen
Die Autoren haben nichts offenzulegen.
Danksagungen
Dieses Projekt wurde teilweise durch einen FAST (Faculty and Student Team) Award an TPP und JMC von EURECA (Center for Enhancing Undergraduate Research Experiences and Creative Activities) an der Sam Houston State University finanziert.
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Materialien
| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| Rifampicin | Calbiochem | 557303-1GM | |
| Natriumnitrat | Sigma Aldrich | S5506 | |
| Fluorescein-markiertes 70 kDa anionisches Dextran | ThermoFisher Scientific | D1823 | |
| Phosphatgepufferte Kochsalzlösung (PBS) Tabletten | Calbiochem | 6500-OP | Tabletten lösen sich in Wasser auf, um PBS herzustellen |
Referenzen
- Panda, S., et al. Short-Term Effect of Antibiotics on Human Gut Microbiota. PloS ONE. 9 (4), 95476(2014).
- Perez-Cobas, A. E., et al. Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach. Gut. 62 (11), 1591-1601 (2013).
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Nachdrucke und Genehmigungen
