Das primäre Zilium ist grundlegend wichtig für die Proliferation von neuralen Stamm-/Vorläuferzellen und für die neuronale Differenzierung während des embryonalen, postnatalen und adulten Lebens. Darüber hinaus besitzen die meisten differenzierten Neuronen primäre Zilien, die Signalrezeptoren wie G-Protein-gekoppelte Rezeptoren und Signalmoleküle wie Adenylylcyclasen beherbergen. Das primäre Zilium bestimmt die Aktivität mehrerer Entwicklungswege, einschließlich des sonic hedgehog Signalwegs während der embryonalen neuronalen Entwicklung, und unterstützt auch die kompartimentelle subzelluläre Signalübertragung während der adulten neuronalen Funktion. Es überrascht nicht, dass Defekte in der primären Zilienbiogenese und -funktion mit Entwicklungsanomalien des Gehirns, zentraler Adipositas sowie Lern- und Gedächtnisdefiziten in Verbindung gebracht wurden. Daher ist es unerlässlich, die primäre Zilienbiogenese und den ziliären Transport im Kontext von neuralen Stamm-/Vorläuferzellen und differenzierten Neuronen zu untersuchen. Kultivierungsmethoden für primäre Neuronen erfordern jedoch beträchtliches Fachwissen und sind nicht für Frost-Tau-Zyklen geeignet. In diesem Protokoll diskutieren wir Kultivierungsmethoden für gemischte Populationen von neuralen Stamm-/Vorläuferzellen unter Verwendung primärer Neurosphären. Die Neurosphären-basierten Kultivierungsmethoden bieten die kombinierten Vorteile der Untersuchung primärer neuraler Stamm-/Vorläuferzellen: Zugänglichkeit für mehrere Passagen und Gefrier-Tau-Zyklen, Differenzierungspotenzial in Neuronen/Glia und Transfektionsfähigkeit. Wichtig ist, dass wir festgestellt haben, dass neurale Stamm-/Vorläuferzellen und differenzierte Neuronen in Kultur zilieniert sind und Signalmoleküle, die für die Ziliarfunktion relevant sind, in diesen Kompartimenten lokalisieren. Unter Verwendung dieser Kulturen beschreiben wir außerdem Methoden zur Untersuchung der Ziliogenese und des Ziliartransports in neuralen Stamm-/Vorläuferzellen und differenzierten Neuronen. Diese Neurosphären-basierten Methoden ermöglichen es uns, zilienregulierte zelluläre Signalwege, einschließlich der G-Protein-gekoppelten Rezeptor- und Sonic-Hedgehog-Signalwege, im Kontext von neuralen Stamm-/Vorläuferzellen und differenzierten Neuronen zu untersuchen.