Die hier vorgestellte Methode ermöglicht Echtzeit-Verfolgung von Insekten Antenne und Rüssel Bewegungen ohne besondere Tierpräparate oder Hardware.
Einschränkungen:
Trotz dieser Vorteile gibt es einige Einschränkungen der Methode. Dazu gehören die Anforderung, dass der Kopf des Tieres aus Bewegung, muss der Benutzer die Position und Ausrichtung des Tieres für jedes Video auswählen eingeschränkt ist die Forderung nach Zugang zu einem Windows-Computer und die Software Unfähigkeit zu verfolgen Bewegung in drei Dimensionen (3D) und in einigen visuell mehrdeutige Anhängsel Positionen beschrieben.
Die Software erfordert, dass der Kopf des Tieres fixiert ist und sich nicht während des Videos bewegt. Dies ist vergleichbar mit den Vorbereitungen der vorherigen Arbeit48,49,50,51. Es ist möglich, die automatische Erkennung von Kopfdrehungen ermöglichen anzupassen, dies würde verbrauchen zusätzliche Bearbeitungszeit und eine neue Fehlerquelle vorstellen. Würden die modifizierte Software die Rotation des Kopfes nicht richtig erkennen, würde dies die Antennen-Winkel beeinträchtigen, da ihre Berechnung im Verhältnis zu den Kopf Drehwinkel ist. Derzeit, wählt der Benutzer die Ausrichtung des Kopfes einmal pro Video. Dieser Ansatz minimiert während nicht ohne menschliches Versagen, Winkel Berechnungsfehler, wenn der Kopf nicht zulässig ist, während das Video bewegen.
Die Software erfordert auch ein Windows 7 (oder höher) Operating System (OS). Ziel war es, machen die Software einfach zu installieren, einrichten und verwenden von Benutzern ohne Programmier- oder anspruchsvolle EDV-Verwaltung-Kenntnisse. Wir beschlossen, Ziel Windows, denn es weit verbreitet ist, und in Fällen, wo Zugriff darauf beschränkt ist, virtuelle Maschinen (z. B. VirtualBox, VMware, Parallels) mit Windows leicht erstellt werden können. Diese Wahl der OS stark vereinfacht die Software-Installation durch eine einfach zu bedienende, command-line-freie Installer und vermeidet Fehler, die spezifisch für verschiedene Betriebssysteme.
Die Software verfolgt nur die Position der Gliedmaßen im 2D-Raum. Insekten sind dafür bekannt, ihre Antenne bewegen in 3D, was bedeuten könnte, dass wichtige Informationen verloren geht, wenn nur 2D Koordinaten gemessen werden. Während die Verwendung von mehreren Kameras oder Spiegel helfen konnte, die zusätzliche benötigte Angaben für 3D Lokalisierung zu sammeln, ist es möglich, mit dem Einsatz von trigonometrischen Beziehungen, eine geschätzte Out-of-Plane-Position durch Berechnung geht man davon aus, dass die Antennen sind einzelne Liniensegmente konstanter Länge und nur auf einer Seite der Kameraebene bewegen. Für Honigbienen diese Annahme gilt, grobe Schätzungen für die Position in 3D zu erhalten, aber nicht notwendigerweise der Fall wäre für andere Arten und Situationen.
Die Software wird nicht korrekt erkennen, die Antennen und Rüssel Tipp Standorte in einige unklare Situationen. Wenn ein Tier eine Antenne bewegt sich so, dass in dem Video, es einen längeren Rüssel überlappt, erkennt die Software wahrscheinlich die Spitze der Antenne als die Spitze der Rüssel. Der Antenne Winkel wird jedoch nach wie vor wahrscheinlich richtig (aus dem nicht-überlappende Teil) berechnet werden. In ähnlicher Weise bewegt sich die Antenne Tipps direkt über dem Kopf des Tieres (d. h. nicht an den Seiten) könnte dann die Software nur erkennen, die Teil der Antenne, die außerhalb der Kopf sichtbar ist übernehmen die früheren Standort der Antenne oder unechte zu erkennen Bildrauschen als Antennenstandort. In beiden Fällen haben auch die menschliche Rater Schwierigkeit anspruchsvolle die Antenne aus dem Rüssel oder den Kopf. Um dieses Problem zu umgehen, empfehlen wir, Anwenden eines 3-Frame, symmetrischen rollenden Median57 Filters auf die rohen X und Y Koordinaten durch die Software produziert. Dieser Filter entfernt große transient (Einzelbild) Position Schwankungen und längere Antenne Position Bewegungen bewahrt. Wir haben festgestellt, dass der 3-Frame-Filter entwickelten sich besser als kein Filter, während die breitere Filter (z. B. 5, 11 oder 15 Frames) Genauigkeit reduziert. R-Beispielcode, der Filter und ein video-Tutorial verwendet, finden Sie Online-58.
Wert als ein wissenschaftliches Instrument:
Die Verfügbarkeit einer Methode schnell genaue Insekt Anhängsel Bewegungen in einer kosteneffektiven Weise zu erhalten, hat das Potenzial, Erschließung neuer Untersuchung.
Rüssel Erweiterung Reflex (PER) ist eine häufig verwendete Verhaltensreaktion, lernen und Gedächtnis einer Vielzahl von Insekten59zu untersuchen. Frühere Studien haben in der Regel auf eine binäre verlängert oder nicht-Maßnahme von PER, verlassen, obwohl Video- und elektromyographische Untersuchungen, viel komplexere Topologien Rüssel Bewegungen65,66 gezeigt haben. Die Methode hier ermöglicht schnelle Quantifizierung der Rüssel Bewegungen in hoher zeitlicher und räumlicher Auflösung.
Insekt Antenne Bewegungen als Reaktion auf Gerüche sind kaum erforscht. Ein Grund dafür ist, dass die Antennen sind in der Regel so schnell bewegen, dass kostengünstige, automatisierte Mittel zur Antenne Bewegungsdaten zu erhalten nicht verfügbar ist. Die hier vorgestellte Methode ließe sich schnell Antenne Bewegungsdaten für eine große Anzahl von Insekten in eine große Anzahl von Bedingungen zu erhalten. Dies könnte zum Beispiel Forscher untersuchen die Zuordnung zwischen Antenne Bewegungen in Reaktion auf verschiedene Reize, insbesondere flüchtige Gerüche Beihilfen. Mit Kameras, die Bilder bei 30 Hz zu erfassen, die Software kann verwendet werden, um Riechzentrum Bewegungsdynamik charakterisieren bis zu 15 Hz (Nyquist-Grenze). Bei Bedarf Charakterisierung in höheren Frequenzen könnten Kameras mit höheren Datenerfassungsraten (z. B. 60 oder 120 fps) genutzt werden. Jedoch möglicherweise ein schneller Rechner müssen höhere fps-Videos in Echtzeit zu verarbeiten. Wir spekulieren, dass Klassen von Gerüchen und vielleicht sogar einige einzelne Gerüche charakteristischen angeborene Riechzentrum Bewegungen haben. Wäre diese Klassen oder Verbindungen entdeckt, unbekannte konnte Gerüche oder ihrer Klasse aus Riechzentrum Bewegung der ungeübte Insekten nachgewiesen werden. Wenn solch eine Zuordnung vorhanden ist, sollte die Kombination von ausreichend Antenne Bewegungsdaten und State-Of-The-Art Machine learning Algorithmen beginnen, um es zu entdecken. Auch, wie diese Zuordnung als Reaktion auf Lernformen im Laufe der Entwicklung verändert oder gestört ist mit könnten genetische Interventionen Einblick in die Funktionen des olfaktorischen Systems anbieten.Schließlich könnte diese Arbeit geben Einblick in künstliche Erkennung von Gerüchen, wenn es optimale Probenahmeverfahren für Gerüche in komplexen Umgebungen zeigt.
Zukünftige Arbeit:
Hier zeigten wir, dass die Antenne Bewegungsdaten schnell gewonnen und analysiert werden können: bedeutende Verhalten Antworten aus den Daten generiert durch unsere Software erkannt werden, und mehrere Bereiche der weiteren Untersuchung ermittelt wurden.
Die Zeit Kurse der Reiz ausgelöst Antenne Winkel Abweichungen und Wiederherstellung zur Grundlinie und Reiz-Abschluss Rebound-Effekte und seine Abhängigkeit auf Geruch Konzentration untersucht und mathematisch modelliert werden können. Darüber hinaus Änderungen der Antenne Bewegungen induziert durch begehrliche oder aversive Konditionierung auch mit der Software beurteilt werden kann.
Bessere Differenzierung von Gerüchen zu erkunden. In dieser Studie, Gerüche, in reiner und 35 x verdünnten Versionen entlockte ähnliche Reaktionen: die Antennen im Durchschnitt schien schnell weg von der Quelle Geruch zurückziehen und vor Geruch Basislinien nach ein paar Sekunden zurück. Wir spekulieren, dass sogar die verdünnten Versionen sehr starke olfaktorische Reize für die Honigbienen gewesen sein mag. Wenn "true", könnte eine breitere Palette von Konzentrationen verwendet werden, um festzustellen, ob die Riechzentrum Antworten die Gerüche unterscheiden. Darüber hinaus kann komplexere Analyse Unterschiede im Riechzentrum Bewegungen als Reaktion auf verschiedene Gerüche besser offenbaren. Wir haben die Datendateien verwendet, um Zahlen in diesem Manuskript zur Verfügung, um interessierten Forscher auf der SwarmSight Webseite67generieren.
Darüber hinaus konnte zwar nicht in den Anwendungsbereich dieser Handschrift, die Software erweitert werden um Videos von Tieren platziert in Kammern mit zwei Spiegeln, die Winkel von 45° (siehe Abbildung 1 zum Beispiel) zu verarbeiten. Dies könnte verwendet werden, um genau zu lokalisieren und zu verfolgen, die Gliedmaßen und ihre Bewegung im 3D-Raum. Jedoch die Algorithmen für 3D-Tracking wäre erforderlich, um effizient: (a) zu unterscheiden zwischen mehreren Antennen, wenn sie in einer der die Seitenspiegel, (b) für Mängel im Spiegel Winkel korrekt sichtbar und (c) Verzerrungen durch Kamera entfallen Positionierung.
Zu guter Letzt zusätzliche Gewinne in der Positionsgenauigkeit könnte durch den Einsatz von einem Kalman Filter68, welche Modelle realisiert werden und nutzt Aggregatzustand Informationen wie Anhängsel Geschwindigkeits- und Beschleunigungswerte vorhergesagten Standorte beschränken. Allerdings sollte keine Gewinne in der Genauigkeit gegen Kürzungen in der Geschwindigkeit durch zusätzliche Berechnungen ausgewertet werden.
Fazit:
Viele Insekten nutzen Antennen, um flüchtige Verbindungen in ihrem lokalen Umfeld aktiv zu probieren. Muster im Riechzentrum Bewegungen können Einblick in die Insekten Geruch Wahrnehmung und wie es Klimaanlage, toxische Verbindungen und genetische Veränderungen betroffen ist. In ähnlicher Weise wurden Rüssel Bewegungen zur Wahrnehmung der Geruch und der Modulation zu beurteilen. Jedoch ist es schwierig gewesen, schnell große Mengen an hochauflösenden Anhängsel Bewegungsdaten zu erhalten. Hier wird ein Protokoll und Software beschrieben, die diese Aufgabe automatisiert. Zusammenfassend haben wir erstellt und gezeigt, wie die Kombination von preiswerte Hardware, eine gemeinsame tierische Vorbereitung und die Open-Source-Software verwendet werden, um schnell hochauflösende Insekt Anhängsel Bewegungsdaten zu erhalten. Die Ausgabe der Software, wie es menschliche Rater in Geschwindigkeit und Genauigkeit übertrifft, und wie seine Ausgabedaten analysiert und visualisiert werden können wurden gezeigt.