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Research Article
Andrea Soto-Padilla1,2, Rick Ruijsink3, Mark Span4, Hedderik van Rijn*4, Jean-Christophe Billeter*1
1Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences,University of Groningen, 2Department of Cell Biology, University of Groningen,University Medical Center Groningen, 3Ruijsink Dynamic Engineering, 4Department of Psychology,University of Groningen
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier präsentieren wir ein Protokoll, um automatisch bestimmen die lokomotorische Leistung von Drosophila bei schwankenden Temperaturen mit einer programmierbaren temperaturgeführte Arena, die schnell und präzise Temperaturänderungen in Zeit und Raum produziert.
Temperatur ist eine allgegenwärtige Umweltfaktor, das betrifft wie Arten verteilen und Verhalten. Verschiedene Arten von Drosophila Fruchtfliegen haben spezifische Reaktionen auf wechselnde Temperaturen entsprechend ihrer physiologischen Toleranz und Anpassungsfähigkeit. Drosophila -fliegen besitzen auch eine Temperatur sensing-System, die grundlegend für das Verständnis der neuronalen Grundlagen der Temperatur, die Verarbeitung in Kaltblütler geworden ist. Wir stellen Ihnen hier eine temperaturgeführte Arena, die schnelle und präzise Temperaturänderungen mit zeitlichen und räumlichen Steuerung, die Reaktion der einzelnen fliegen zu erkunden, wechselnde Temperaturen zulässt. Einzelne fliegen sind in der Arena platziert und vorprogrammierte Temperatur Herausforderungen ausgesetzt, wie einheitliche schrittweise Temperatur Reaktion Normen bestimmen oder räumlich verteilten Temperaturen gleichzeitig Vorlieben bestimmen erhöht. Einzelpersonen werden automatisch erfasst und erlauben die Quantifizierung der Geschwindigkeit oder Standort bevorzugt. Diese Methode kann verwendet werden, um schnell die Antwort über eine große Auswahl an Temperaturen Leistung Temperaturkurven in Drosophila bestimmen oder andere Insekten von ähnlicher Größe zu quantifizieren. Darüber hinaus kann es für genetische Studien verwendet werden, um Temperatur-Einstellungen und Reaktionen der Mutanten und Wildtyp fliegen zu quantifizieren. Diese Methode kann helfen, die Grundlage der thermischen Speziation und Anpassung sowie die neuronalen Mechanismen hinter Temperatur Verarbeitung aufzudecken.
Temperatur ist eine Konstante Umweltfaktor, das betrifft, wie Organismen funktionieren und1Verhalten. Unterschiede in Breite und Höhe führen zu Unterschieden in der Art des Organismus ausgesetzt sind, die Ergebnisse in evolutionäre Auswahl für ihre Reaktionen auf Temperatur2,3Klimazonen. Organismen reagieren auf unterschiedliche Temperaturen durch morphologischen, physiologischen und verhaltensbezogenen Anpassungen, die maximale Leistung unter ihre besondere Umgebungen-4. Zum Beispiel haben in der Taufliege Drosophila Melanogaster, Populationen aus verschiedenen Regionen unterschiedliche Temperatur-Einstellungen, Körpergrößen, Entwicklungsstörungen Times, Langlebigkeit, Fruchtbarkeit und walking Leistung bei unterschiedlichen Temperaturen2 ,5,6,7. Die Vielfalt zwischen fliegen unterschiedlicher Herkunft beobachtet wird teilweise durch genetische Variation und Kunststoff Gen Ausdruck8,9erklärt. In ähnlicher Weise Drosophila -Arten aus verschiedenen Bereichen Temperaturgradienten anders verteilen und zeigen Unterschiede im Widerstand zu extremer Hitze und Kälte Tests10,11,12.
Drosophila ist vor kurzem auch das Modell der Wahl zu verstehen, die genetischen und neuronalen Grundlagen der Temperatur Wahrnehmung13,14,15,16,17geworden. Im großen und ganzen wahrnehmen Erwachsene fliegen Temperatur, durch kalte und warme periphere Temperatur-Sensoren in die Antennen und Temperatursensoren im Gehirn13,14,15,16 , 17 , 18 , 19 , 20. die Peripherie-Rezeptoren für heiße Temperaturen auszudrücken, Gr28b.d16 oder Pyrexie21, während die Peripherie Kälterezeptoren zeichnen sich durch Brivido14. Im Gehirn wird die Temperatur von Neuronen, die mit dem Ausdruck TrpA115verarbeitet. Verhaltensstudien an Mutanten dieser Wege sind besser zu verstehen wie Temperatur verarbeitet wird und geben Einblicke in die Mechanismen, die Populationen von Drosophila aus verschiedenen Regionen sehr unterschiedlich sind.
Hier beschreiben wir eine temperaturgeführte Arena, die schnelle und präzise Temperaturänderungen produziert. Die Ermittler können diese Änderungen vorprogrammieren ermöglicht die standardisierte und reproduzierbare Temperatur Manipulationen ohne menschliches Zutun. Fliegen sind erfasst und verfolgt mit Spezialsoftware ihre Position und Geschwindigkeit in verschiedenen Phasen eines Experiments bestimmen. Der Messbildschirm präsentiert in diesem Protokoll ist die Gehgeschwindigkeit bei verschiedenen Temperaturen, weil es ein ökologisch relevanter Index der physiologischen Leistungsfähigkeit, die einzelnen thermischen Anpassungsfähigkeit5identifizieren können. Zusammen mit Temperatur-Rezeptor Mutanten kann diese Technik helfen, die Mechanismen der thermischen Anpassung auf zelluläre und biochemische Ebene zeigen.
1. Vorbereitung des Mediums fliegen Essen
2. Vorbereitung der fliegen
3. Rahmen der Lichter
4. temperaturgeführte Arena
(5) Temperatur Verhaltensexperimente
6. Video Tracking und Analyse von Daten
Die temperaturgesteuerten Arena (Abbildung 1A) besteht aus drei Kupfer Fliesen, deren Temperatur durch eine programmierbare Schaltung individuell gesteuert werden kann. Jede Kachel Kupfer besitzt einen Temperatursensor, der Feedback an die programmierbare Schaltung gibt. Die Schaltung aktiviert eine Stromquelle, um die Temperatur jeder Fliese zu erhöhen. Passive thermoelektrische Elemente fungieren als Konstante Heizelemente, die gewünschte Temperatur beizubehalten, während ein Kühlkörper gekühlt von einem Fan Konstante Kühlung sorgt. Das Ausmaß der Temperaturänderung bestimmt die Geschwindigkeit des Prozesses in eine nicht-lineare Weise. Eine Erhöhung von 2 ° C erfordert nur 0,1 s und einer Steigerung von 18 ° C erfordert 4 s. Ein Bildschirm angeschlossen an die programmierbare Schaltung (Abbildung 1) informiert den Benutzer über die Temperatur gemessen, die Temperatur-Sensoren in jedem der Fliesen. Die Kupfer Fliesen sind umgeben von einer Alu-Ring ständig durch Halbleiter an der Peripherie auf 50 ° C (Abbildung 1 b und 1 C) erhitzt. Dieser Ring bildet die Kanten der fliegen Arena (Abbildung 1), das Gebiet, in dem Fliegen platziert werden. Der fliegen-Arena fällt unter eine silikonisierte Glasabdeckung (Abb. 1A und 1 C), die einen 3 mm hohen Raum die sicherstellt bietet, dass fliegen gehen können aber nicht fliegen. Neben der Arena fliegen sind zwei rote LEDs (Abbildung 1), die programmiert werden können, um verschiedenen experimentellen Phasen zu markieren. Zum Beispiel für die Ergebnisse in Abbildung 2A, jede LED ist verbunden mit einer anderen Temperatur, während in Abb. 2 b, jede LED zeigt 60 s. Die FlySteps -Software kann registrieren, wenn jede der indikativ LEDs eingeschaltet ist, und der Forscher dann anhand dieser Informationen kann die experimentellen Phasen anhand der Temperatur oder Zeit automatisch zu bestimmen.
Die temperaturgesteuerten Arena kann verwendet werden, die Verhaltensreaktion fliegen aus verschiedene genetische Hintergründe auf dynamische Temperaturänderungen zu vergleichen. Zum Beispiel können fliegen aus verschiedenen Arten ausgesetzt werden allmählich steigenden Temperaturen (Abbildung 3) thermische Leistung verglichen. Die Geschwindigkeit aller Arten mit zunehmender Temperatur steigt bis auf einen Punkt der Höchstleistung, woraufhin es zerfallen und umgekommen sind. Jede Art hat jedoch eine bestimmte Antwort-Kurve mit spezifische maximale Reaktion Geschwindigkeiten und thermischen Toleranzen. Frühere Berichte haben gezeigt, die Drosophila verschiedener Arten unterscheiden unter Entwicklungsstörungen Timing, Langlebigkeit, Fruchtbarkeit, Körpermaße, sexuelle Kommunikation und Temperatur Toleranz3,6,7 ,8,22. So, unsere Beschreibung der artspezifischen Fortbewegung in einem Temperaturgradienten verleiht dieser Werkgruppe.
Die temperaturgeführte Arena kann auch verwendet werden, um die Reaktion auf Konditionierung Experimente basierend auf Temperatur zu erkunden. Die einfachste Form dieses Ansatzes ist eine operanten Konditionierung Paradigma, in der fliegen ausgebildet sind zu bevorzugen, dass eine Seite der Arena über die andere, durch Erwärmen Sie die Seite, die23,24,25vermieden. Wir ausgesetzt einzelne fliegen auf 40 ° C in der Mitte und eine der Kacheln Seite, wobei die andere Seite Fliese bei angenehmen 22 ° C (Abbildung 4). Wildtyp fliegen schnell aufgehört sich zu bewegen entlang der Arena und blieb in der komfortablen Lage. Im Gegensatz dazu die klassischen Memory-Mutante Dunce gehalten die Arena erkunden und weniger Zeitaufwand als Kontrollen in der komfortablen Lage. Die Unterschiede zwischen der Leistung der Wildtyp fliegen und Dunce Mutanten wurde größer, wenn alle Spielsteine auf 22 ° C eingestellt wurden und zwischen den Behandlungsgruppen Vergleiche wurden. Dunce Mutanten zeigte auch größere Unterschiede zwischen Training und Testphasen im Vergleich zu Wildtyp fliegen (Abbildung 4). Diese Ergebnisse zeigen eine Wirkung des Speichers auf Verbleib in der komfortablen Lage.
Kombinationen von Temperatur und Standort sind auch nützlich, um die Funktion der unterschiedlichen Temperatur-Rezeptoren bei dynamischen Temperaturänderungen zu verstehen. Wir individuelle D. Melanogaster Gr28b.d und TrpA1GAL4 Mutanten auf steigende Temperaturen ausgesetzt (2 ° C erhöhen alle 60 s) und bietet eine komfortable Lage bei 22 ° C (Abbildung 5). Die komfortable Lage verschob sich von links nach rechts und umgekehrt, pro Iteration. Ergebnisse zeigen, dass die Peripherie Temperatur Rezeptor Gr28b.d Mutanten als das Steuerelement zu Verhalten, wie sie mehr Zeit in die komfortable Lage bei steigender Temperatur verbringen. Jedoch Gehirn Temperatur Rezeptor TrpA1GAL4 Mutanten sind nicht betroffen durch steigende Temperaturen und ändern Sie ihre Speicherorte in der Arena nicht. Die zu- und Abnahme in der Kurve der TrpA1GAL4 Mutanten zeigen den Effekt in fliegen, die bereits in der komfortablen Lage saßen, bevor es komfortabel und blieb es in dieser Phase wurde. Die Konsistenz der Gipfel und Täler der Kurve für TrpA1GAL4 legen nahe, dass diese fliegen nach wie vor für die meisten des Experiments blieb; Daher wurden sie ständig gezählt, wenn ihre Lage als komfortabel war. Diese Schlussfolgerung wurde durch Sichtprüfung der aufgezeichneten Videos bestätigt. Diese Ergebnisse unterstützen frühere physiologische Berichte, was darauf hindeutet, dass Peripherie Wahrnehmung von schnellen und großen Veränderungen hängt nicht am Gr28b.d17 und fliegt besitzen eine zentrale Hauptmechanismus Sinn Temperatur basierend auf TrpA1 14,21.

Abbildung 1: Darstellung der Temperatur gesteuert-Arena. (A) einen seitlichen Blick auf die temperaturgeführte Arena. Eine programmierbare Schaltung verbindet eine Power Supply und Temperatursensoren mit Heizelementen unter Kupfer Fliesen um die Temperatur zu kontrollieren. Fliesen werden ständig durch einen Kühlkörper verbunden mit einem Lüfter gekühlt. Ein beheizte Alu-Ring über dem ruht eine Glasabdeckung umgibt die Fliesen. (B) Wärmebildkamera zeigt die Fliesen auf 24 ° C (oben) und die Seite Fliesen bei 24 ° C mit einer mittleren Kachel bei 30 ° C (unten). (C) eine Draufsicht der Arena. Eine Kamera zeichnet die Kupfer Fliesen, Alu-Ring und roten LEDs dann experimentelle Phasen automatisch ermittelt. Ein Bildschirm in der Ecke des Feldes, nicht durch die Kamera notiert zeigt die aktuelle Temperatur der Fliese. (D) Ring aus Licht: zwei warme weiße LED-Streifen in einer Holzkiste in weißes Papier bedeckt gewährleisten konstant und symmetrischen Ausleuchtung der gesamten Arena. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 2: fliegen müssen vor Beginn der Temperatur-Protokoll zur Arena akklimatisieren. (A) einzelne männliche fliegen wurden eingeführt, um die Arena und erkunden konstant 16 ° c für 1 min, danach begann die Temperatur erhöhen durfte. (B) einzelne fliegen 16 ° C, 20 ° C und 24 ° C ausgesetzt (keine gruppenunterschiede, zwei-Wege-ANOVA F (2.570) = 4.156, p = 0.162) haben eine höhere Fortbewegung zu Beginn des Experiments als nach 5 min (zwei-Wege-RM ANOVA F (9.570) = 7.803, p < 0,0001). Daten sind Mittelwert und Standardfehler des Mittelwerts (± SEM) 20 Jungfrau weibliche fliegen 5 bis 7 Tage alt über mehrere Tage getestet. Sternchen gibt signifikanten Unterschied zwischen den Gruppen (*** p < 0,0001; Tukey's multiple Vergleichstest, p = 0,05). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 3: Fortbewegung 5 Drosophila -Arten, die allmählich steigende Temperaturen ausgesetzt. Einzelne Männchen fliegt von gemäßigten (blau), tropisch (rot) und kosmopolitische (braune) Drosophila -Arten waren eine zunehmende Temperaturgradienten ausgesetzt (2 ° C alle 60 s) zwischen 16 und 46 ° C. Die erste 7 min waren ständig bei 22 ° C zu fliegen um die Arena zu erkunden. Arten unterschieden sich signifikant (zwei-Wege-RM ANOVA F(4,70) = 28,46, p < 0,001). (a) D. Melanogaster (braun; gefüllte Kreise) war schneller als in der Arena eingeführt. (b) D. Yakuba (rot; leeren Quadrate) war schneller als Temperatur erhöht. (c) D. Suzukii (braun; gefüllten Quadrat) war langsamer als die anderen kosmopolitischen fliegen irgendwann seine maximale Leistung. (d) D. Simulans (braun, leeren Kreise) wurde in Schutt und Asche an der höchste Stelle des D. Melanogaster. Jeder Punkt entspricht den Mittelwert (± SEM) von 15 männlichen fliegen 5 bis 7 Tage alt über mehrere Tage getestet. Bedeutung durch Symbole angezeigt (♦ = Differenz aus allen p < 0,0001; † = Differenz von allen außer D. Melanogaster, p < 0,0001; • = Differenz aus D. Melanogaster, p < 0,01; ¢ = Differenz aus D. Melanogaster, p < 0.001; Unterschied zwischen benannten Gruppen, p < 0,0001 =; Tukey's multiple Vergleichstest, p = 0,05). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 4: die temperaturgeführte Arena eignet sich für operanten Konditionierung. D. Melanogaster Kanton-S-Stamm (Wildtyp; schwarze Grenze) und Dnc1 (Dunce; rot umrandet) Mutanten wurden ausgebildet, um eine seitliche Kachel bei 22 ° C bis 40 ° C für 4 min (Ausbildung, nicht nach Erwärmung der Mitte und gegenüber seitlichen Fliesen bevorzugen (Muster). Erinnerung an den beheizten Räumen wird dann getestet, indem alle Fliesen auf 22 ° C (Test, Raster). Fliegen waren darauf konditioniert, Fliesen auf der linken Seite in der Hälfte der Versuche, dann Fliesen auf der rechten Seite in die andere Hälfte zu bevorzugen. Der Prozentsatz der gesamten Zeit in der Kachel bei 22 ° C während des Trainings und Tests wurde gemessen, um Leistungen zu vergleichen. Gruppen unterschieden sich signifikant (One-Way ANOVA F(3,76) = 23.23, p < 0,0001), mit Dunce insgesamt schlechter als Wildtyp durchführen. Daten sind Fies (± SEM) 20 Jungfrau weibliche fliegen 5 bis 7 Tage alt über mehrere Tage getestet. Sternchen geben Bedeutung Unterschied zwischen den Gruppen (*** p > 0,0001; *** p > 0,001; ** p > 0,01; Tukey's multiple Vergleichstest, p = 0,05) Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Abbildung 5: Reaktion der Temperatur Mutanten auf Temperatur erhöht, sofern eine komfortable Lage. Temperatur durch Mutation entstehende Variationen Gr28b.d (grün, Quadrate) reagieren als Steuerelemente (w1118, schwarz, Kreise) durch Erhöhung des Anteils der Zeit in der komfortablen Umgebung als Temperaturerhöhungen (zwei-Wege-RM ANOVA F (1,38) = 0.5107, p = 0.479). TrpA1GAL4 -Mutanten (gelb, Dreiecke) unterscheiden sich von Kontrollen (w1118, schwarz), da sie nicht die Zeit in der komfortablen Umgebung bei steigender Temperatur erhöhen (zwei-Wege-RM ANOVA F (1,38) = 1.670, p = 0,019). Daten sind Fies (± SEM) 20 männlichen fliegen 5 bis 7 Tage alt über mehrere Tage getestet. TrpA1GAL4 unterscheidet sich deutlich von der Gr28b.d und der Kontrolle (p < 0,05; Tukey's multiple Vergleichstest, p = 0,05). Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.
Die Autoren erklären, dass sie keine finanziellen Interessenkonflikte.
Hier präsentieren wir ein Protokoll, um automatisch bestimmen die lokomotorische Leistung von Drosophila bei schwankenden Temperaturen mit einer programmierbaren temperaturgeführte Arena, die schnell und präzise Temperaturänderungen in Zeit und Raum produziert.
Diese Arbeit wurde zum Teil durch ein Stipendium von der Behavioural and Cognitive Neuroscience-Programm von der Universität Groningen und Diplom als Stipendiat der Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT) aus Mexiko, gewährt, Andrea unterstützt Soto-Padilla, und einen Zuschuss von der John Templeton Foundation für das Studium der Zeit an Hedderik van Rijn und Jean-Christophe Billeter vergeben. Wir sind auch dankbar, Peter Gerrit Bosma für seine Beteiligung an der Entwicklung des FlySteps -Trackers.
Scripts, TemperaturePhases, FlySteps, und FlyStepAnalysis können als ergänzende Information und in den folgenden temporären und öffentlich zugänglichen Link gefunden:
https://Dataverse.nl/privateurl.XHTML?Token=c70159ad-4d92-443d-8946-974140d2cb78
| Arduino Due | Arduino | A000062 | Software RUG |
| Electronics Board | Ruijsink Dynamic Engineering | FF-Main-02-2014 | |
| Netzteil Boost | XP-Power 48. V 65 W | ECS65US48 | Set auf 53 Volt |
| Netzteil Fliesenheizung | XP-Power 15. V 80 W | VFT80US15 | |
| Netzteil Kühlung | XP-Power 15. V 130 W | ECS130U515 | |
| Peltier-Elemente | Marlow Industries | RC12-4 | 2 Elemente, geregelte DC-Einspeisung |
| Kühlkörper | Fisher Technik | LA 9/150-230V | Entkoppelt für |
| Vibrationen Temperatursensoren | Messung Spezialitäten | MCD_10K3MCD1 | Mikrothermistor Sonde |
| Kupferblock/Fliesen | Ruijsink Dynamic Engineering | FF-CB-01-2014 | |
| Aluminiumring | Ruijsink Dynamic Engineering | FF-RoF-02-2015 | |
| Tesa 4104 weißes Band 25 x 66 mm | RS Komponenten | 111-2300 | Weißes leitfähiges Klebeband |
| Rote LEDs | Lucky Ligt | ll-583vc2c-v1-4da | Wellenlänge zwischen 625 nm, 20 mAmp und 6 V |
| Warmweißer LED-Streifen | Ledstripkoning | HQ-3528-SMD | 60 LEDs pro Meter |
| Schalter Netzteil | Generisch | T-36-12 | |
| Logitech c920 | Logitech Europe S.A | PN960-001055 | |
| QuickTime Player | Apple Computer | Aufnahme Programm | |
| Tracking-Analysesoftware | R | Pakete: pacman | |
| Tracking-Analysesoftware | MATLAB | ||
| Thermal Imaging | FLIR T400sc | ||
| Graphs and Statisticsts Software | Graph Pad Prism | ||
| Sigmacote | Sigma-Aldrich | SL2-100ML | Silikonisiermittel |
| Fliegenaufzuchtflaschen | Flystuff | 32-130 | 6oz Drosophila Vorratsflasche |
| Flypad | Flystuff | 59-114 | |
| Fläschchen für die Fliegenaufzucht | Dominique Dutscher | 789008 | Drosophila Röhren schmal 25x95 mm |
| Inkubator | Sanyo | MIR-154 | |
| Magnetische Heizplatte | Heidolph | 505-20000-00 | MR Hei-Standard |
| Agar | Caldic Zutaten B.V. | 010001.26.0 | |
| Glukose | Gezond& wel | 1019155 | Dextrose/Druivensuiker Saccharose |
| Van Gilse | Kristallzucker | ||
| Maismehl | Fliegenzeug | 62-100 | |
| Weizenkeime | Gezond& wel | 1017683 | |
| Sojamehl | Fliegenfutter | 62-115 | |
| Melasse | Fliegenfutter | 62-117 | |
| Aktive Trockenhefe | Roter Stern | ||
| Tegosept | Fliegenfutter | 20-258 | 100% |