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Methodenartikel

Zeitraffer-Bildgebung von Bakterienschwärmen und kollektive Stressreaktion

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DOI:

10.3791/60915

23. Mai 2020

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Wir beschreiben eine einfache Methode, um hochauflösende Zeitrafferfilme von Pseudomonas aeruginosa Schwärmen zu produzieren, die mit einem Flachbett-Dokumentenscanner auf Bakteriophage (Phagen) und Antibiotikastress reagieren. Dieses Verfahren ist eine schnelle und einfache Methode zur Überwachung der Schwärmedynamik und kann angepasst werden, um die Beweglichkeit und das Wachstum anderer Bakterienarten zu untersuchen.

Zusammenfassung

Schwärmen ist eine Form der Oberflächenbeweglichkeit, die bei vielen Bakterienarten wie Pseudomonas aeruginosa und Escherichia colibeobachtet wird. Hier bewegen sich dichte Bakterienpopulationen im Laufe der Stunden über große Entfernungen in charakteristischen rankenförmigen Gemeinschaften. Das Schwärmen ist empfindlich gegenüber mehreren Faktoren, einschließlich mittlerer Feuchtigkeit, Feuchtigkeit und Nährstoffgehalt. Darüber hinaus wehrt die kollektive Stressreaktion, die bei P. aeruginosa beobachtet wird, die durch Antibiotika oder Bakteriophagen (Phagen) gestresst sind, Schwärme ab, sich dem Bereich zu nähern, der den Stress enthält. Die hier beschriebenen Methoden befassen sich mit der Kontrolle der kritischen Faktoren, die das Schwärmen beeinflussen. Wir führen eine einfache Methode ein, um die Schwärmedynamik und die kollektive Stressreaktion mit hoher zeitlicher Auflösung mit einem Flachbett-Dokumentenscanner zu überwachen und zu beschreiben, wie eine quantitative Analyse von Schwärmen kompiliert und durchgeführt wird. Diese einfache und kostengünstige Methode ermöglicht eine präzise und gut kontrollierte Quantifizierung des Schwarms und kann auf andere Arten von plattenbasierten Wachstumstests und Bakterienarten ausgedehnt werden.

Einleitung

Schwärmen ist eine kollektive Form der koordinierten bakteriellen Beweglichkeit, die Antibiotikaresistenz und Produktion von Virulenzfaktoren im Wirt1,2,3erhöht. Dieses multizelluläre Verhalten tritt auf halbfesten Oberflächen auf, die denen von Schleimschichten ähneln, die Epithelmembranen in der Lungeabdecken 4,5. Biosurfactants werden üblicherweise von Schwärmepopulationen produziert, um die Oberflächenspannung auf Oberflächen zu überwinden, und die Produktion dieser stoffe wird durch komplexe Zell-Zell-Signalsyste....

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Protokoll

1. Vorbereitung Schwärmender Agarplatten für P. aeruginosa Schwärmen Zeitraffer-Imaging

  1. Bereiten Sie 1 L 5x M8 Mindestmedium in einer Glasflasche vor, indem Sie 64 g Na2HPO4•7H2O, 15 g KH2PO4und 2,5 g NaCl in 500 ml doppeldestilliertem Wasser (ddH2O) hinzufügen. Stellen Sie das Endvolumen auf 1 L mit zusätzlichem ddH2O. Autoklav ein, um flüssige Medien bei Raumtemperatur zu sterilisieren und zu lagern.
  2. Bereiten Sie 100 ml 1 M MgSO4 (Magnesiumsulfat) in einer Glasflasche vor, indem Sie 24,6 g MgSO4•7H2O in 50 ml ddH2O hin....

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Ergebnisse

Die Schritte zum Wachstum von P. aeruginosa, Stress die Zellen, und Bild die Schwarm Agar Platten sind in Abbildung 1dargestellt . Wir haben eine einzige Kolonie von Wild-Typ P. aeruginosa UCBPP-PA14-Stamm von einer LB-Agar-Platte in 2 ml LB-Brühe über Nacht bei 37 °C geimpft und 5 l in der Mitte der schwärmenden Agarplatte gesichtet. Die Zeitraffer-Bildgebung dieser Platte zeigt das anfängliche Wachstum in Form einer Kolonie in der Mitte und dann die Ausbreitung der Ranken radial aus d.......

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Diskussion

Dieses Protokoll konzentriert sich auf die Minimierung der Variabilität in Schwärmen von Agarplatten und die Bereitstellung einer einfachen und kostengünstigen Methode, um Zeitrafferbilder von P. aeruginosa zu erfassen, die schwärmen und auf Stress reagieren. Dieses Verfahren kann durch Anpassung der Medienzusammensetzung und der Wachstumsbedingungen auf andere Bakterielle Systeme erweitert werden. Für P. aeruginosa, obwohl M9 oder FAB minimales Medium verwendet werden kann, um Schwärme

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts zu verraten.

Danksagungen

J.-L.B., A.S., und N.M.H-K. das Manuskript geschrieben und überarbeitet. Alle Autoren haben die Experimente entworfen. J.-L.B. führte die Experimente und Analysen durch. Diese Arbeit wurde durch den NIH Award K22AI112816 und R21AI139968 Stipendium an A.S. und die University of California unterstützt. N.M.H-K. wurde unterstützt von den Lundbeck Fellowships R220-2016-860 und R251-2017-1070. Die Geldgeber spielten bei der Entscheidung, das Werk zur Veröffentlichung einzureichen, keine Rolle. Wir haben keine konkurrierenden Interessen zu erklären.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Reagenzien
Bacto Agar, dehydriertBD Difco214010Für LB-Agarplatte und Schwarmagarplatte
CasaminosäurenBD Difco223050Für Schwarmmedien
D-GlucoseFisher ChemicalD16500Dextrose. Für Schwarmmedien
Fosfomycin-DinatriumsalzTokyo Chemical IndustryF0889Stammkonzentration: 200 mg/ml. Gelöst in ddH2O
GentamycinsulfatSigma-AldrichG1914Stammkonzentration: 3 mg/ml. Gelöst in ddH2O
KanamycinsulfatSigma-Aldrich60615Stammkonzentration: 100 mg/ml. Gelöst in ddH2O
LB-MillerBD Difco244620Für LB-Bouillon und LB-Agarplatten
Magnesiumsulfat-HeptahydratSigma-Aldrich230391Für Schwarmmedien
Kaliumphosphat monobasischSigma-AldrichP0662Für 5x M8 Medien
NatriumchloridSigma-AldrichS9888Für 5x M8 Medien
Natriumphosphat zweibasisches HeptahydratFisherChemical S373Für 5x M8 media
Stämme
Pseudomonas aeruginosaSiryaporn labAFS27E.118PA14 Stamm
DMS3virO'Toole labDMS3vir20Bakteriophagen
< strong>Supplies
Aluminiumoxid-Schleifpapier3M150 FeinFür schwarze Deckel
Schwarzer StoffJoannPRD7089Schwarzer Stoff
Schwarze SprühfarbeKrylon5592 Matt SchwarzFür schwarze Deckel
ErlenmeyerkolbenKimax26500250 mL
GlasvorratsflaschenPyrex13951L250 mL, 500 mL, 1.000 mL
8 Zoll KabelbinderGardner BenderE173770Zum Anbringen von Petrischalen aus schwarzem mattem Stoff
(100 mm x 15 mm)FisherFB0875712100 mm x 15 mm Polystyrolplatten
HolzstäbchenFisher23-400-102Zum Streifen und Impfen von Bakterien
Ausrüstung
AutoklavMarkt Forge IndustriesSTM-EZum Sterilisieren von Reagenzien
25 mL PipetteUSA Scientific, Inc.1072-5410Zum Pipettieren von 20 mL zum Schwärmen von Agarplatten
LuftentfeuchterFrigidaireFAD704DWD 70 PintZur Aufrechterhaltung der relativen Luftfeuchtigkeit im Raum bei ca. 45%
ImageJNIHv1.52aSoftware zur Bildanalyse
InkubatorVWR89032-092Für das Wachstum von Bakterien bei 37 > C
Isotemp WasserbadFisher15-462-21QZum Kühlen von Medien bis 55°; C
Laminar-Flow-HaubeThe Baker CompanySG603AZum Trocknen von Platten
P-20 PipetteGilsonF123601Spotting auf schwärmenden Agarplatten
Pipette ControllerBrandTechaccu-jetZum Pipettieren von 20 mL für schwärmende Agarplatten
Roller DrumNew BrunswickTC-7Für das Wachstum von Bakterien bei 100 U/min
ScannerEpsonEpson Perfection V370 Fotoscannerfür Speicherfolien
Scanner-AutomatisierungssoftwareRoboTask Litev7.0.1.932Für 30 min interne Bildgebung
Scanner BilderfassungssoftwareEpsonv9.9.2.5USSoftware für Speicherfolien

Referenzen

  1. Butler, M. T., Wang, Q., Harshey, R. M. Cell density and mobility protect swarming bacteria against antibiotics. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (8), 3776-3781 (2010).
  2. Lai, S., Tremblay, J., Déziel, E.

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

Bakterielles SwarmingSwarming AgarplattenPseudomonas aeruginosaBakteriophagen ReaktionAntibiotika StressDokumentenscannerImageJ AnalyseAVI ZeitrafferHellfeldmikroskopie