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Tritonia
Der Hautkontakt mit seinem Seesternraubtier löst tritonia diomedea's Fluchtschwimmen aus, das aus einer rhythmischen Reihe von Ganzkörperbeugungen besteht, die es in Sicherheit bringen (Abbildung 3A). In isolierten Hirnpräparaten löst ein kurzer Reiz zum Pedalnerv 3 (PdN3) das rhythmische Schwimmmotorikprogramm (SMP) für dieses Verhalten aus, das in optischen Aufnahmen von den Pedalganglien leicht erkennbar ist. Abbildung 3B zeigt das Layout eines VSD-Bildgebungsexperiments, das die Feueraktivität von Neuronen auf der dorsalen Oberfläche des linken Tritonia-Pedalganglions, über dem der PDA positioniert wurde, als Stimulus für das kontralaterale (rechte) PdN3 aufzeichnen soll, das den SMP hervorruft. Roh- und gefilterte Daten (Bandpass Butterworth-Filter, 5- und 100-Hz-Cutoffs) von 20 Dioden, die die Aktivität vor, während und nach der Stimulation von PdN3 aufzeichnen, sind in den Abbildungen 3C,D dargestellt. Der Nervenreiz wurde 20 s in die 2-minütige Datei geliefert. Unmittelbar nach der Erfassung können die von allen 464 Dioden des Aufzeichnungsarrays gemessenen Signale topographisch über ein Bild der Zubereitung in der Bildgebungssoftware dargestellt werden (Abbildung 3E). Zu diesem Zeitpunkt enthalten viele Spuren Spitzen, die redundant von denselben Neuronen aufgezeichnet wurden, und einige Spuren enthalten Spitzen von mehr als einem Neuron. Die Spike-Sortierung der gefilterten Diodenspuren mit ICA ergab 53 einzigartige neuronale Spuren, von denen 30 in Abbildung 3Fdargestellt sind. Die Kinetik einzelner Spikes kann in Abbildung 3Gnachvollzogen werden, die einen Auszug von vier Spuren aus Abbildung 3F (rotes Feld) erweitert; Die Genauigkeit des ICA-Spike-Sortieralgorithmus wurde zuvor durch simultane scharfe Elektrodenaufnahmen verifiziert, die zeigten, dass alle Spikes in den sortierten Spuren intrazellulär aufgezeichneten Spikes von einzelnen Neuronen entsprechen11,14.
Aplysia
Ein stark aversiver Schwanzreiz zu Aplysia californica löst eine stereotype zweiteilige rhythmische Fluchtreaktionaus 15. Die erste Phase der Reaktion ist ein Galopp aus mehreren Zyklen von Kopflungenschritten und Schwanzzügen, die das Tier schnell vorwärts bewegen. Darauf folgt typischerweise eine Krabbelphase, bei der wiederholte Wellen von Kopf-an-Schwanz-Muskelkontraktionen das Tier mehrere Minuten lang mit langsamerer Geschwindigkeit vorwärts treiben(Abbildung 4A). Um diese fluchtmotorischen Programme in optischen Aufnahmen zu erfassen, wurde der PDA in einem isolierten Gehirnpräparat auf die dorsale Oberfläche des rechten Pedalganglions konzentriert und eine Saugelektrode auf den kontralateralen (linken) Pedalnerv 9 (PdN9; Abbildung 4B). Eine Minute nach einer kontinuierlichen 20-minütigen optischen Aufzeichnung(Abbildung 4C)wurde PdN9 stimuliert, um den Galopp-Crawl-Motor-Programmablauf auszunehmen. Die probabilistischen Gaußschen Raumverteilungen der Signale aller 81 aufgezeichneten Neuronen wurden auf das Ganglion abgebildet (Abbildung 4D). Die auf die vollständige Aufzeichnung angewendete Dimensionalitätsreduktion zeigte, dass die Galopp- (Cyan) und Kriechphasen (dunkelblau) des Fluchtprogramms unterschiedliche Bereiche besetzten und unterschiedliche Trajektorien bildeten, spiral- bzw. schleifenartig im Hauptkomponentenraum (Abbildung 4E).
Drei Videos, die auf der in Abbildung 4 dargestellten Aplysia-Aufzeichnung basieren, zeigen weitere Arten von Analysen, die an solchen Datensätzen durchgeführt werden können. Video 1 animiert das Abfeuern aller aufgezeichneten Neuronen über die gesamte Dauer der Aufnahme. Die anfängliche poststimulatorische Phase des Fluchtmotorprogramms war durch einen Galopp gekennzeichnet, bei dem die Aktivität im Ganglion durch abwechselndes Platzen verschiedener funktioneller Cluster gekennzeichnet war (Video 2). Der Galopp ging anschließend in ein Krabbeln über, bei dem die Aktivität über neuronale Cluster weitgehend phasisch blieb, aber eine Rotationsbahn gegen den Uhrzeigersinn im Ganglion annahm (Video 3). Die letzten beiden Videos beinhalten auch Konsens-Clustering, das die Feuerung und Standorte der verschiedenen funktionalen Ensembles für die Galopp- und Crawl-Phasen der Fluchtreaktion separat zeigt. Beachten Sie, dass viele Neuronen, die sowohl in der Galopp- als auch in der Kriechphase demselben Cluster zugeordnet waren, im Ganglion physische Nähe zueinander aufwiesen, was mit früheren Befunden übereinstimmt12.
Berghia
Die aeolide Nacktschnecke Berghia stephanieae (Abbildung 5A) stellt ein neues Modellsystem für die Neurowissenschaften dar. Der Bildaufbau für ein typisches Berghia-Experiment ist in Abbildung 5B dargestellt. Um eine breit angelegte neuronale Aktivität hervorzulocken, wurde eine Saugelektrode auf den prominentesten linken Pedalnerv gelegt und ein Nervenreiz wurde 30 s in eine 2-minütige Aufnahme abgegeben. ICA-verarbeitete Spuren zeigten sowohl spontane als auch stimulus-evozierte Aktivität in 55 Neuronen (Abbildung 5C). Bei der Community-Erkennung mittels Konsens-Clustering wurden zehn verschiedene funktionale Ensembles identifiziert, die in Abbildung 5D in einem Netzwerkdiagramm und in Abbildung 5Edargestellt sind, die die in Abbildung 5C gezeigten Ablaufverfolgungen basierend auf ihren Clusterzuweisungen neu organisiert. Gaußsche Verteilungen der Signale aller aufgezeichneten Neuronen werden einem Bild des Präparats in Abbildung 5F überlagert, um die Positionen aller 55 aufgezeichneten Neuronen anzuzeigen.

Abbildung 1: Ansichten des optischen Bildgebungsgeräts und des Photodiodenarrays (PDA). (A) Das optische Bildgebungsgerät mit PDA, Digitalkamera, Mikroskop und Bühne. (B) Das interne Design des PDA, bei dem Glasfasern die Abbildungsöffnung mit 464 Photodioden verbinden. Über den Fotodioden befindet sich eine Reihe von Verstärkern. (C) Die sechseckige Fläche der Abbildungsöffnung, auf die der abgebildete Bereich fokussiert ist. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Ein Flussdiagramm, das den wesentlichen Arbeitsablauf bei der Gewinnung optischer Aufzeichnungen veranschaulicht. Die wesentlichen Schritte im VSD-Bildgebungsprotokoll, von der Dissektion und Färbung bis hin zu den Details der Bildgebung, sind in diesem Flussdiagramm dargestellt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Ergebnisse von Tritonia diomedea, die Roh-, Filter-und Spike-sortierte Daten veranschaulichen. (A) Tritonia entkommt dem räuberischen Seestern Pycnopodia helianthoides durch sein Schwimmen, das aus abwechselnden dorsalen und ventralen Beugungen des Körpers besteht. (B) Schematische Darstellung des Imaging-Setups. Ce = Hirnlappen des Zerebropleuralganglions; Pl = Pleuralappen des Zerebropleuralganglions; Pd = Pedalganglion. (C) Rohdaten von 20 Photodioden, die die Aktivität im linken Pedalganglion zur Stimulation des kontralateralen PdN3 anzeigen (Reiz, der durch den Pfeil angezeigt wird). (D) Gefilterte Daten von den gleichen Dioden wie in C (5- und 100-Hz-Bandpass Butterworth-Filter). (E) Ausgabe einer Bildgebungssoftware, bei der komprimierte Spuren, die von allen 464 Dioden gesammelt wurden, topographisch über ein Bild der Zubereitung gelegt werden. Die Positionen der 20 Dioden, deren Spuren in C und D dargestellt sind, sind rot hervorgehoben. (F) Dreißig ausgewählte Einzelneuronspuren, die durch Spike-Sortierung über ICA erzeugt werden. (G) Eine erweiterte Ansicht von vier Einzelneuronspuren, die dem roten Kasten in Fentsprechen, zeigt ihre Aktionspotentiale bei höherer zeitlicher Auflösung. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Ergebnisse von Aplysia californica, die Langzeitaufzeichnung, Signalkartierung und Dimensionalitätsreduktion veranschaulichen. (A) Die beiden Phasen des sequenziellen Fluchtmotorprogramms von Aplysia, der Galopp und der Krabbeln. (B) Schematische Darstellung des Imaging-Setups. Ce = hirnes Ganglion; Pl = Pleuraganglion; Pd = Pedalganglion. (C) Eine 20-minütige Aufnahme von 81 Neuronen im rechten Pedalganglion, die auf einen Reiz auf das kontralaterale PdN9 reagieren (durch den Pfeil gekennzeichnet). Grüne, cyanfarbene und dunkelblaue Balken unterhalb der Spuren zeigen die Vorstimulationszeit, den Galopp und die Kriechphasen des Fluchtmotorprogramms an. (D) Ein Bild der Zubereitung mit kartierten probabilistischen Gaußschen Verteilungen der Standorte aller 81 neuronalen Signalquellen, die von ICA identifiziert wurden. Der grüne Umriss stellt die Position der sechseckigen Fläche des PDA in Bezug auf das Ganglion dar. Die Zahlen auf jedem Gaußschen entsprechen den Spurennummern in C. (E) Dimensionsreduktion durch Hauptkomponentenanalyse, bei der die ersten drei Hauptkomponenten im Laufe der 20-minütigen Datei gegeneinander dargestellt werden. Die prästimulatorischen Baseline-, Galopp- und Crawl-Epochen sind in Grün, Cyan und Dunkelblau dargestellt. Siehe Videos 1-3 für Animationen des neuronalen Feuerns, die dieser Aufnahme entsprechen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: Ergebnisse von Berghia stephanieae, einer neuen Spezies für die Neurowissenschaften, die Netzwerkgraphik, funktionelles Clusteringund bilaterale Signalkartierungveranschaulicht. (A) Ein Berghia-Exemplar. (B) Schematische Darstellung des Imaging-Setups. Ce = Hirnlappen des Zerebropleuralganglions; Pl = Pleuralappen des Zerebropleuralganglions; Pd = Pedalganglion; Rh = Rhinophore Ganglion. (C) Spuren, die die spontane und stimulus-evozierte Aktivität von 55 bilateralen Neuronen in den zerebropleuralen Ganglien zeigen (die Abgabe des Reizes wird durch den Pfeil angezeigt). (D) Ein Netzwerkdiagramm, das die zehn funktionalen Ensembles zeigt, denen jeweils eine eindeutige Farbe zugewiesen ist, die durch Konsens-Clustering identifiziert wurden. Knoten in diesem Diagramm stellen Neuronen dar, wobei die Entfernung im Netzwerkraum den Grad der Feuerkorrelation innerhalb und zwischen Ensembles darstellt. (E) Die Spuren in C werden neu angeordnet und farbcodiert (nach dem Farbschema von D)zu funktionalen Ensembles. (F) Ein Bild der Zubereitung, das die kartierten Positionen der Signale von jedem aufgezeichneten Neuron und die Spurennummern in C und E zeigt, denen sie entsprechen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Video 1: Animation des vollständigen, 20-minütigen Aplysia Flucht-Bewegungsprogramms. Die Opazität der weißen Formen über 81 einzelnen Neuronen im rechten Pedalganglion (linkes Panel) wurde durch die entsprechenden neuronalen Spuren (rechtes Panel) gesteuert und variierte linear in Abhängigkeit von der durchschnittlichen Spike-Rate (binned pro 0,61 s Echtzeit in der Aufnahme). Für jedes Neuron wurde die volle Opazität über die Dauer der Aufnahme auf seine maximale Feuerrate normalisiert. Eine Sekunde der verstrichenen Zeit im Video entspricht 12,2 s Echtzeit. Der Maßstabsbalken entspricht der Echtzeit, wobei die grünen, cyanfarbenen und dunkelblauen Linien unter den Spuren die Phasen vor dem Stimulus, den Galopp und die Kriechphasen des Fluchtlokomotorprogramms anzeigen. Die gelben Kästchen um die Galoppphase und ein Teil der Crawling-Phase zeigen die Aufnahmeausschnitte an, mit denen die Animationen in den Videos 2 und 3generiert wurden. Bitte klicken Sie hier, um dieses Video anzusehen. (Klicken Sie mit der rechten Maustaste zum Herunterladen.)
Video 2: Animation der Galoppphase des Aplysia Escape Bewegungsprogramms. Konsens-Clustering wurde an allen 81 aufgezeichneten Neuronen allein in der Galoppphase des motorischen Programms durchgeführt, um die funktionellen Ensembles abzuleiten, wobei der Ansatz und die Software verwendet wurden, die in Referenz12beschrieben und zur Verfügung gestellt wurden. Neuronale Ensembles, die in dieser Phase des Fluchtprogramms weitgehend tonische oder unregelmäßige Feuermuster aufwiesen, wurden in diesem Video weggelassen. Die Aktionspotentiale der Neuronen, die zu den schwarzen und olivgrünen Ensembles gehören, sind in der Audiospur des Videos zu hören, wobei die entsprechenden Neuronen und Spuren hervorgehoben werden. Die durchschnittlichen Spitzenraten wurden wie in Video 1 und mit äquivalentem Zeitbinning normalisiert; 1 s verstrichene Zeit im Video entspricht 6,1 s Echtzeit. Bitte klicken Sie hier, um dieses Video anzusehen. (Klicken Sie mit der rechten Maustaste zum Herunterladen.)
Video 3: Animation der Kriechphase des Aplysia Fluchtmotorprogramms. Konsens-Clustering wurde an allen 81 aufgezeichneten Neuronen nur in der Crawl-Phase des motorischen Programms durchgeführt, um die funktionellen Ensembles abzuleiten. Ensembles, die in dieser Phase des Motorprogramms weitgehend tonische oder unregelmäßige Zündmuster aufwiesen, wurden in diesem Video weggelassen. Die durchschnittlichen Spitzenraten wurden wie in den Videos 1 und 2 und mit äquivalentem Zeitbinning normalisiert; 1 s verstrichene Zeit im Video entspricht ca. 12,2 s Echtzeit. Bitte klicken Sie hier, um dieses Video anzusehen. (Klicken Sie mit der rechten Maustaste zum Herunterladen.)