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Methodenartikel

Gene Knock-in durch CRISPR/Cas9 und Zellsortierung in Makrophagen- und T-Zelllinien

11K Aufrufe

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DOI:

10.3791/62328

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13. November 2021

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In diesem Artikel

Zusammenfassung

Dieses Protokoll verwendet fluoreszierende Reporter und Zellsortierung, um Knock-in-Experimente in Makrophagen- und T-Zelllinien zu vereinfachen. Für diese vereinfachten Knock-in-Experimente werden zwei Plasmide verwendet, nämlich ein CRISPR/Cas9- und DsRed2-exprimierendes Plasmid und ein homologes Rekombinationsspenderplasmid, das EBFP2 exprimiert, das dauerhaft am Rosa26-Locus in Immunzellen integriert ist.

Zusammenfassung

Funktionelle Genomik-Studien des Immunsystems erfordern genetische Manipulationen, die sowohl die Deletion von Zielgenen als auch die Zugabe von Elementen zu interessierenden Proteinen beinhalten. Die Identifizierung von Genfunktionen in Zelllinienmodellen ist wichtig für die Genentdeckung und Erforschung zellintrinsischer Mechanismen. Genetische Manipulationen von Immunzellen wie T-Zellen und Makrophagenzelllinien mit CRISPR/Cas9-vermitteltem Knock-in sind jedoch aufgrund der geringen Transfektionseffizienz dieser Zellen, insbesondere in einem Ruhezustand, schwierig. Um Gene in Immunzellen zu modifizieren, werden typischerweise Arzneimittelresistenzselektion und virale Vektoren verwendet, um Zellen anzureichern, die das CRIPSR / Cas9-System exprimieren, was unweigerlich zu unerwünschten Eingriffen der Zellen führt. In einer früheren Studie haben wir duale fluoreszierende Reporter entwickelt, die mit CRISPR/Cas9 gekoppelt sind und nach der Elektroporation vorübergehend exprimiert wurden. Diese technische Lösung führt zu einer schnellen Genselöschung in Immunzellen; Das Einklopfen von Genen in Immunzellen wie T-Zellen und Makrophagen ohne den Einsatz von Arzneimittelresistenzselektion oder viralen Vektoren ist jedoch noch schwieriger. In diesem Artikel zeigen wir, dass durch die Verwendung von Zellsortierung zur Unterstützung der Selektion von Zellen, die transient CRISPR/Cas9-Konstrukte exprimieren, die auf den Rosa26-Locus in Kombination mit einem Spenderplasmid abzielen, ein Gen-Knock-in sowohl in T-Zellen als auch in Makrophagen ohne Arzneimittelresistenzanreicherung erreicht werden kann. Als Beispiel zeigen wir, wie man menschliches ACE2, einen Rezeptor von SARS-Cov-2, der für die aktuelle Covid-19-Pandemie verantwortlich ist, in RAW264.7-Makrophagen durch Knock-in-Experimente exprimiert. Solche Gen-Knock-in-Zellen können häufig für mechanistische Studien verwendet werden.

Einleitung

Immunzellen sind entscheidend für die Abwehr von Krankheitserregern. Sowohl angeborene als auch adaptive Immunität sind für die Clearance von Infektiva und die Aufrechterhaltung der Gewebeöostase erforderlich1,2. Zelllinienmodelle sind wesentliche Werkzeuge, um die molekularen Grundlagen des Immunsystems von Säugetieren zu verstehen. Sie werden in funktionellen In-vitro-Assays verwendet, z. B. bei der Modellierung der Aktivierung menschlicher T-Zellen und bei der Bestimmung der Funktion genetischer Faktoren bei der Aktivierung oder Dämpfung von Immunantworten3,

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Protokoll

1. Design und Plasmidkonstruktion von sgRNAs für Rosa26 Locus

  1. Designleitfaden-RNAs rund um die gewünschte Einfügestelle
    1. Stellen Sie sicher, dass sich die Einfügestelle für Rosa26-Knock-in-Experimente der Maus Rosa26 (im Folgenden als mRosa26bezeichnet) im ersten Intron von mRosa26befindet. Diese Seite wurde in früheren Studien verwendet28,29. Stellen Sie bei Knock-in-Experimenten in menschlichen Zellen sicher, dass sich die Insertionsstelle im menschlichen ROSA26-Locus (im Folgenden hROSA26genannt) befi....

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Ergebnisse

Nach dem oben beschriebenen Protokoll zur Durchführung von Knock-in-Experimenten am mRosa26-Locus mit murinen RAW264.7-Makrophagen haben wir einen Zielvektor entwickelt, um menschliches ACE2, einen Rezeptor für das SARS-Cov-2-Virus, zu exprimiert (Abbildung 2A). Mit einem ähnlichen Design erzeugten wir menschliche Jurkat-T-Zellen mit Knock-In des OST-markierten RASGRP1-Fusionsproteins (Abbildung 2C). Nach der Transfektion von drei Plasmiden, von denen z.......

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Diskussion

In unseren Experimenten haben wir gezeigt, wie man Knock-in-Editing in Immunzellen vom Konstruktdesign bis zum Knock-in-Zellscreening und Validierung am Beispiel menschlicher Jurkat-T-Zellen und muriner RAW264.7-Makrophagen durchführt. Sowohl T-Zell- als auch Makrophagen-Zelllinien sind resistent gegen Transfektion36,37; Das Problem der geringen Effizienz der CRISPR/Cas9-Abgabe kann jedoch mit Hilfe von fluoreszierenden Reportern in Verbindung mit der Zellsortier.......

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Offenlegungen

Die Autoren haben nichts preiszugeben.

Danksagungen

Wir danken der Durchflusszytometrie-Kerneinrichtung der Xinxiang Medical University. Die Entwicklung einer solchen Technologie wurde durch NSFC-Zuschüsse 81601360 an LZ, 81471595 und 32070898 an YL unterstützt. Die Arbeit wird auch von der Stiftung des Henan Educational Committee Nr. 21IRTSTHN030 unterstützt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Amersham Imager 600Ge HealthcareBildgebung von Chemilumineszenz
Ampicillin, NatriumsalzMP Biomedicals194526
Anti-Kaninchen-IgG, HRP-linked AntikörperCell Signaling Technology7074bei 1/5000 Verdünnung
Anti-RasGRP1-Antikörper, Klon 10.1MerckMABS1461.0 μ g/mL der Arbeitskonzentration
AscINew England BioLabsR0558S
β-Aktin (D6A8) Kaninchen mAbZellsignaltechnologie8457bei 1/1000 Verdünnung
BamHI-HFNew England BioLabsR3136S
BbsI-HFNew England BioLabsR3539S
Cellometer Mini Automatisierter ZellzählerNexcelom Bioscience
E.coli DH5α Kompetente ZellenTakara9057
DMSO (Dimethylsulfoxid)MP Biomedicals196055
DNeasy Blut & Tissue KitsQiagen69506Zellkultur-Reagenz
DPBS (10X), kein Kalzium, kein MagnesiumThermoFisher Scientific14200075
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) mit hohem GlukosegehaltHyCloneSH30022.01
EcoRI-HFNew England BioLabsR3101S
FACSAria™ FusionBD Biosciencesausgestattet mit Biosicherheitswerkbank
FACS Canto DurchflusszytometerBD Biosciences
Falcon 5 ml Polystyrol Reagenzglas mit rundem BodenBD Biosciences352003
Fötales Rinderserum (FBS)ThermoFisher Scientific10099141
FlowJo Version 10.7BD Biosciences
GAPDH (D16H11) XP  Kaninchen mAbCell Signaling Technology5174bei 1/1000 Verdünnung
Ziege Anti-Maus IgG (H+L) Sekundärantikörper, HRPThermoFisher Scientific31430bei 1/5000 Verdünnung
Immobilon ECL Ultra Western HRP SubstratMilliporeWBKLS0500
Immobilon-PSQ PVDF MembranMilliporeISEQ00010
JurkatATCCTIB-152https://www.atcc.org/
KanamycinsulfatMP Biomedicals194531
LB Agar PulverThermoFisher Scientific22700041
Mehrkanalpipette (30-300 μ L)Eppendorf, oder ähnlich
Neon-TransfektionssystemThermoFisher ScientificMPK5000
Neon Transfektionssystem, 10 μ L KitThermoFisher ScientificMPK1096
Nunc 15 mL Konische sterile ZentrifugenröhrchenThermoFisher Scientific339651
OneTaq® Heißstart Quick-Load® 2X MasterMix New England BioLabs(M0489)für Vorlage mit hohem GC%
PageRuler Vorgefärbte Proteinleiter, 10 bis 180 kDaThermoFisher Scientific26616
Pipettenspitze 0,1-20 Mikro; lEppendorf, o.ä0030 075.005
Pipettenspitze 2-200µ lEppendorf, o.ä0030 075.021
Pipettenspitze 50-1000µ lEppendorf, oder ähnlich0030 075.064
Plasmid Maxi KitQiagen12163
pX458-DsRed2Addgene112219
QIAquick PCR Purification KitQiagen28104Aufreinigung von Plasmid aus Restriktionsaufschluss
Q5 Hot Start High-Fidelity 2X Master MixNew England BioLabsM0494S
RAW264.7ATCCTIB-71https://www.atcc.org/
Rekombinanter Anti-ACE2-Antikörper [EPR4435(2)]Abcamab108252bei 1/1000 Verdünnung
RPMI 1640 MediumHyCloneSH30027.01
Strep-Tactin SepharosekügelchenIBA Lifesciences2-1201-010
Penicillin-StreptomycinThermoFisher Scientific15140122
SYTOX&Handel; Rote Totzellenfärbung, für 633 oder 635 nm AnregungThermoFisher ScientificS34859
T4 DNA-LigaseNew England BioLabsM0202S
T4 PolynukleotidkinaseNew England BioLabsM0201S
Trypanblau-Lösung, 0,4 %ThermoFisher Scientific15250061
Trypsin-EDTA-Lösung (0,25 %), mitPhenolrot ThermoFisher Scientific25200056
ZOE Fluorescent Cell ImagerBio-Rad
1,5 mL Mikroröhrchen, PCR-cleanEppendorf oder ähnlich0030 125.215
24 Well Clear TC-behandelte Multi-Well-PlattenCorning3524
96 Well Clear Flat Bottom Polystyrol TC-behandeltCorning3599
96-Well-Mikrotiterplatte mit klarem und rundem Boden TC-behandeltCorning3799
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Referenzen

  1. Cronkite, D. A., Strutt, T. M. The Regulation of Inflammation by Innate and Adaptive Lymphocytes. Journal of Immunology Research. 2018, 1467538(2018).
  2. Iwasaki, A., Medzhitov, R. Control of adaptive immunity by the innate immune system. Nature Immunology.

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Nachdrucke und Genehmigungen

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