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Qualitätskontrollierte Sputumanalyse mittels Durchflusszytometrie

DOI:

10.3791/62785

August 9th, 2021

In This Article

Summary

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Dieses Protokoll beschreibt eine effiziente Methode zur Dissoziation von Sputum in eine einzelne Zellsuspension und die anschließende Charakterisierung zellulärer Untergruppen auf Standard-Durchflusszytometrieplattformen.

Abstract

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Sputum, weit verbreitet, um den zellulären Inhalt und andere mikroumweltliche Merkmale zu untersuchen, um die Gesundheit der Lunge zu verstehen, wird traditionell mit zytologischen Methoden analysiert. Sein Nutzen ist begrenzt, da das Lesen der Folien zeitaufwendig ist und hochspezialisiertes Personal erfordert. Darüber hinaus machen ausgedehnte Trümmer und das Vorhandensein von zu vielen Plattenepithelzellen (SECs) oder Wangenzellen eine Probe oft für die Diagnose ungeeignet. Im Gegensatz dazu ermöglicht die Durchflusszytometrie eine Hochdurchsatz-Phänotypisierung zellulärer Populationen bei gleichzeitigem Ausschluss von Trümmern und SECs.

Das hier vorgestellte Protokoll beschreibt eine effiziente Methode, um Sputum in eine einzelne Zellsuspension zu dissoziieren, Antikörper zu färben und zelluläre Populationen zu fixieren und Proben auf einer durchflusszytometrischen Plattform zu entnehmen. Eine Gating-Strategie, die den Ausschluss von Trümmern, toten Zellen (einschließlich SECs) und Zelldouletten beschreibt, wird hier vorgestellt. Darüber hinaus erklärt diese Arbeit auch, wie lebensfähige, einzelne Sputumzellen basierend auf einem Cluster von Differenzierungspopulationen (CD) 45 positiven und negativen Populationen analysiert werden können, um hämatopoetische und epitheliale Abstammungsuntergruppen zu charakterisieren. Eine Qualitätskontrollmaßnahme wird auch durch die Identifizierung lungenspezifischer Makrophagen als Beweis dafür bereitgestellt, dass eine Probe aus der Lunge stammt und kein Speichel ist. Schließlich wurde gezeigt, dass diese Methode auf verschiedene zytometrische Plattformen angewendet werden kann, indem Sputumprofile desselben Patienten bereitgestellt werden, die auf drei Durchflusszytometern analysiert wurden. Navios EX, LSR II und Lyric. Darüber hinaus kann dieses Protokoll modifiziert werden, um zusätzliche zelluläre Marker von Interesse aufzunehmen. Hier wird eine Methode zur Analyse einer gesamten Sputumprobe auf einer durchflusszytometrischen Plattform vorgestellt, die Sputum für die Entwicklung einer Hochdurchsatzdiagnostik von Lungenerkrankungen geeignet macht.

Introduction

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Technische Fortschritte in der Hard- und Software von Durchflusszytometern haben es ermöglicht, viele verschiedene Zellpopulationen gleichzeitig zu identifizieren1,2,3,4. Der Einsatz des Durchflusszytometers in der hämatopoetischen Zellforschung hat beispielsweise zu einem viel besseren Verständnis des Immunsystems2 und der zellulären Hierarchie des hämatopoetischen Systems5 sowie zur diagnostischen Unterscheidung einer Vielzahl verschiedener Blutkrebsarten geführt6,7,8<....

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Protocol

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Alle Schritte der Sputumaufbereitung werden in einer biologischen Sicherheitswerkbank mit entsprechender persönlicher Schutzausrüstung durchgeführt.

1. Reagenzienvorbereitung vor Beginn der Sputumdissoziation

  1. 1% Paraformaldehyd (PFA), 25 ml pro Probe auf Eis auftauen und bis zum Gebrauch kalt aufbewahren.
    VORSICHT: PFA ist giftig durch Einatmen und Hautkontakt. Bereiten Sie das Fixiermittel gemäß den Anweisungen des Herstellers vor und frieren Sie es bei -20 °C in 25 ml Aliquots bis zum Gebrauch ein.
  2. Ungefähr das Gewicht der Probe und 0,1% Dithiothreitol (DTT) für Schritt 2.2 auftauen und auf 37 °C bringen. (Aliquots....

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Results

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Dieses Protokoll wurde mit Blick auf ein klinisches Labor entwickelt. Der Fokus bei der Entwicklung des Protokolls lag auf Einfachheit, Effizienz und Reproduzierbarkeit. Es wurde festgestellt, dass der zeitaufwendigste Schritt bei der Verarbeitung von Sputum das Zählen der Zellen war. Daher ist das Protokoll so aufgebaut, dass die Sputumverarbeitung und Zellmarkierung unabhängig von der Zellzählung ohne Zeitverlust durchgeführt werden kann. Eine genaue Zellzahl, die immer noch notwendig ist, um die Probe für einen ungehi.......

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Discussion

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Der zelluläre Gehalt des Sputums umfasst eine Vielzahl von weit reichenden Zellen, oft begleitet von vielen Trümmern37. Darüber hinaus erfordert die Sputumanalyse eine Qualitätskontrolle, die bestätigt, dass die Probe aus der Lunge und nicht aus der Mundhöhle entnommen wird38. Daher ist es nicht so einfach, Sputum mittels Durchflusszytometrie zu analysieren, wie es beispielsweise bei Blut der Fall ist, das eine viel sauberere und homogenere Zellsuspension freisetzt. Dieses .......

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Disclosures

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Alle Autoren sind ehemalige oder aktuelle Mitarbeiter von bioAffinity Technologies.

Acknowledgements

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Wir danken David Rodriguez für seine Unterstützung bei der Figurenvorbereitung. Sputum-Proben wurden auf dem BD LSR II in der UT Health San Antonio Flow Cytometry Shared Resource Facility durchgeführt, unterstützt von UT Health, NIH-NCI P30 CA054174-20 (CTRC bei UT Health) und UL1 TR001120 (CTSA-Zuschuss).

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
1% Paraformaldehyd Flow-FixPolysciences25037
100 &Mikro; M Nylon Zellsiebe, Falcon #352360Fisher Scientific08-771-19
3 M NaOHEMDSX0593-1
50 mL konisches Falcon RöhrchenFisher Scientific14-432-22
Alexa488 Anti-Human-CD19BioLegend302219
Alexa488 Anti-Human-CD3BioLegend300415
Alexa488 Anti-Human-CytokeratinBioLegend628608
Alexa488 PanCK-, CD3- und CD19-IsotypBioLegend400129
BV510 Anti-Human-CD45BioLegend304036
CD66b FITC-IsotypBD Biosciences555748
CompBead Plus KompensationsperlenBD Biosciences560497
Corning Polystyrol sterile Einwegflasche 250 mLFisher Scientific09-761-4
Corning Polystyrol sterile Einwegflasche 500 mLFisher Scientific09-761-10
CS& T-KügelchenBD Biosciences655051
DTT FisherScientificBP172-5
FITC Anti-Human-CD66bGeneTexGTX75907
Fixable Viability StainBD Biosciences564406
FlowCheckBeckman CoulterA69183
FlowSetBeckman CoulterA69184
HBSSFisher Scientific14-175-095
NACSigma-AldrichA9165
NIST Beads, 05 μ MPolysciences64080
NIST Perlen, 20 μ MPolysciences64160
NIST Perlen, 30 μ MPolysciences64170
PE Anti-Human-CD45BioLegend304039
PE-CF594 Anti-Human-EpCAMBD Biosciences565399
PE-CF594 CD206/EpCAM IsotypBD Biosciences562292
PE-CR594 Anti-Human-CD206BD Biosciences564063
Natriumcitrat-DihydratEMDSX0445-1
Trypanblau-Lösung, 0,4 %Fisher Scientific15250061

References

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  1. Lugli, E., Roederer, M., Cossarizza, A. Data analysis in flow cytometry: the future just started. Cytometry. Part A: The Journal of the International Society for Analytical Cytology. 77 (7), 705-713 (2010).
  2. Perfetto, S. P., Chattopadhyay, P. K., Roederer, M.

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Sputum AnalysisFlow CytometrySingle Cell SuspensionGating StrategyCell ViabilityHematopoietic CellsEpithelial CellsLung MacrophagesHigh Throughput DiagnosticsCell Population Phenotyping

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