Waiting
Login-Verarbeitung ...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Biology

فحص الأنماط الجينية للتبغ لمقاومة النيكوتيانا النباتية

Published: April 15, 2022 doi: 10.3791/63054

Summary

هنا ، يتم تقديم بروتوكول للفحص الفعال والدقيق للأنماط الوراثية للتبغ لمقاومة Phytophthora nicotianae في الشتلات. هذا هو نهج عملي للتربية الدقيقة ، وكذلك أبحاث الآلية الجزيئية.

Abstract

الساق السوداء ، التي تسببها oomycetes Phytophthora nicotianae ، مدمرة للتبغ ، وهذا العامل الممرض شديد الإمراض للعديد من المحاصيل الباذنجانية. P. nicotianae تتكيف بشكل جيد مع درجات الحرارة المرتفعة. لذلك ، تكتسب الأبحاث حول هذا العامل الممرض أهمية في الزراعة في جميع أنحاء العالم بسبب الاحترار العالمي. عادة ما يتم فحص أنواع نباتات التبغ المقاومة ل P. nicotianae عن طريق التلقيح بحبوب الشوفان التي تستعمرها P. nicotianae ومراقبة أعراض المرض. ومع ذلك ، من الصعب تحديد كثافة التلقيح لأن التلقيح الدقيق أمر بالغ الأهمية في هذه الحالة. هدفت هذه الدراسة إلى تطوير طريقة فعالة وموثوقة لتقييم مقاومة التبغ للعدوى ببكتيريا P. nicotianae. تم استخدام هذه الطريقة بنجاح لتحديد الأصناف المقاومة ، وتم تأكيد كفاءة التلقيح بواسطة PCR في الوقت الفعلي. طريقة تقييم المقاومة المقدمة في هذه الدراسة فعالة وعملية للتربية الدقيقة ، وكذلك أبحاث الآلية الجزيئية.

Introduction

P. nicotianae مدمر للعديد من المحاصيل الباذنجانية. يمكن أن يسبب التبغ "عرقوب أسود"1 ، وتعفن أوراق البطاطس والدرنات 2 ، وتاج الطماطم والفلفل الحلو وتعفن الجذر3 ، وطوق غوجي وتعفن الجذر4. يمكن أن تهاجم P. nicotianae جميع أجزاء نباتات التبغ، بما في ذلك الجذور والسيقان والأوراق في أي مرحلة من مراحل النمو5. الأعراض الأكثر شيوعا للمرض هي القاعدة السوداء للساق. تكون الجذور مرئية في البداية على أنها غارقة في الماء ثم تصبح نخرية ، وتظهر الأوراق آفات دائرية كبيرة5. يمكن أن يكون هذا المرض مدمرا لنبات التبغ في الدفيئة ، وكذلك في الحقل6. الطريقة الأكثر عملية واقتصادية للسيطرة على P. nicotianae هي استخدام أصناف مقاومة7. ومع ذلك، يلزم وجود بروتوكول فحص فعال لتحديد المدخلات المقاومة للبكتيريا النيكوتيانية من مجموعات البلازما الوراثية للتبغ.

تم وصف طرق تحديد مختلفة لتقييم مقاومة P. nicotianae في التبغ7،8،9،10،11،12،13،14،15،16. وبوجه عام، استخدمت ثلاثة نهج رئيسية لتحديد الأنماط الجينية للتبغ المقاوم للبكتيريا النيكوتيانية. الأول يشمل خلط الفطريات مع وسط الأجار على ألواح بتري التي تحتوي على P. nicotianae. ثم تزرع الفطريات في الظلام في درجة حرارة الغرفة لمدة 2 أسابيع. يضاف 1 لتر من الماء منزوع الأيونات إلى الفطريات ويتجانس لمدة 30 ثانية. يتم الاحتفاظ بالتلقيح على الجليد حتى الحاجة إليه. يتم عمل ثقبين (قطرهما 1 سم وعمقهما 4-5 سم) على كل جانب من جوانب النبات ، ويتم سكب 10 مل من اللقاح في كل ثقب. ثم تمتلئ الثقوب بالتربة المحيطة بها ، ويتم مراقبة تطور المرض يوميا لمدة أسبوعين 8,10.

في الطريقة الثانية ، يتم تلقيح النباتات بالمسواك الموبوءة بمسببات الأمراض. لهذا النهج ، يجب استخدام النباتات بعد حوالي 6 أسابيع من الزرع ويجب أن يكون ارتفاعها 30 سم كحد أدنى. يتم وضع المسواك المعقمة على سطح الثقافات التي تحتوي على P. nicotianae mycelia. ثم يتم تخزين أطباق الثقافة تحت الضوء في درجة حرارة الغرفة لمدة 7 أيام. ثم ، يتم استخدام المسواك المستعمرة لتلقيح النباتات. يتم إدخال المسواك في سيقان التبغ بين العقدتين الرابعة والخامسة. تتم مراقبة النباتات يوميا لمدة 5 أيام9,15. هذه الطريقة غير قابلة للتطبيق على الشتلات الصغيرة. نظرا لأن اللقاح عبارة عن مسواك موبوء بمسببات الأمراض ، فلا يمكن التحكم في كثافة التلقيح بدقة.

النهج الأكثر استخداما ينطوي على حبوب الشوفان للتلقيح. في هذه الحالة ، يتم تحضير حبوب الشوفان عن طريق تعقيم 500 مل من الشوفان و 300 مل من الماء منزوع الأيونات عند 121 درجة مئوية لمدة 1 ساعة مرة واحدة يوميا لمدة 3 أيام. ثم ، تضاف حبوب الشوفان إلى وسط الثقافة المستعمر الممرض. يتم ختم الأطباق مع فيلم البارافين واحتضانها عند 25 درجة مئوية في الضوء لمدة 7-12 يوما. يتم إجراء أربعة ثقوب منفصلة بعمق 5 سم على تربة الأصيص ، على بعد 4 سم من كل نبات ، ويتم وضع حبة شوفان واحدة موبوءة بمسببات الأمراض في كل حفرة. يتم تحديد فترة الحضانة بناء على وقت حدوث أول عرض فوق سطح الأرض7,11,12,13,14,15,16. هذه الطريقة فعالة وقابلة للتطبيق لفحص المقاومة على نطاق واسع. ومع ذلك ، فإن أحد قيود هذا النهج هو أن اللقاح عبارة عن حبوب شوفان موبوءة بمسببات الأمراض ، وبالتالي لا يمكن التحكم في كثافة التلقيح بدقة.

ومع ذلك ، فإن العرض هنا هو طريقة أكثر دقة تنطبق على تقييم مقاومة غرفة النمو. بالمقارنة مع الأساليب الأخرى ، فإن اللقاح هو تعليق بوغ الحيوان ، وبالتالي فإن كثافة التلقيح قابلة للتحكم فيها وتعديلها. نظرا لأن نباتات التبغ في هذه الدراسة تزرع بدون تربة ، فمن الأسهل ملاحظة النتائج. وعلاوة على ذلك، فإن أخذ عينات من جذور النباتات من التربة يسبب دائما ضررا للجذور، مما يؤدي إلى سلسلة من الاستجابات الفسيولوجية17. في هذه الطريقة ، حيث تزرع النباتات بدون تربة ، يمكن القضاء على التدخل في تلف الجذر. في الختام ، هذه الطريقة أكثر عملية لأبحاث الآلية الجزيئية والتربية الدقيقة. باستخدام هذا البروتوكول ، يتم الحصول على البيانات عادة في غضون 5 أيام ، مع تقييم أكثر من 200 نبات في تجربة واحدة.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. المواد

  1. الحصول على أصناف التبغ.
    ملاحظة: بالنسبة لهذه التجربة ، تم الحصول على "Beinhart1000-1" (مجموعة مختارة من Beinhart 1000) (BH) و "Xiaohuangjin1025" (XHJ) من بنك الجينات الوطني متوسط الأجل لمورد البلازما الوراثية للتبغ في الصين. BH مقاوم ، في حين أن XHJ عرضة لعدوى P. nicotianae16. تم استخدام عزل ميداني لسباق P. nicotianae 0 ، والذي تم الحفاظ عليه في معهد أبحاث التبغ التابع للأكاديمية الصينية للعلوم الزراعية ، لجميع عمليات التلقيح طوال فترة الدراسة.

2. زراعة الأنماط الوراثية للتبغ لتقييم مقاومة بكتيريا P. nicotianae

  1. امزج بذور التبغ مع الفيرميكوليت وبث البذور بلطف على تربة الأواني المعقمة. ضع الأواني في غرفة النمو. حافظ على درجة حرارة ثابتة تبلغ 25 درجة مئوية ، تحت 16 ساعة ضوء / 8 ساعات من الفترة الضوئية المظلمة.
  2. إعداد الأجهزة المائية مع الصواني وألواح الرغوة. بعد أن تنبت البذور ، قم بوخز الشتلات من تربة الأصيص ، واغسل الجذور بلطف بالماء المعقم منزوع الأيونات ، وزرعها في الأجهزة المائية.
  3. ضع الأجهزة في غرف المناخ عند 25 درجة مئوية تحت ضوء 16 ساعة / 8 ساعات من الفترة المظلمة لمدة 24 ساعة.
  4. تحضير محلول المغذيات Hoagland مسبقا (الجدول 1). زرع الشتلات إلى الأجهزة المائية باستخدام محلول المغذيات Hoagland (حوالي 125 مل لكل نبات).
  5. ضع الأجهزة في غرفة المناخ عند 25 درجة مئوية تحت ضوء 16 ساعة / 8 ساعات من الفترة المظلمة لمدة أسبوعين.

3. إعداد P. nicotianae تعليق الجراثيم الحيوانية

  1. تحضير دقيق الشوفان أجار المتوسط.
    1. يزن 33 غرام من دقيق الشوفان وينقل إلى الأواني الزجاجية ويضاف 1000 مل من الماء المعقم. تغلي على فرن موقد كهرومغناطيسي.
    2. بعد أن يصبح دقيق الشوفان لزجا ، قم بتصفية المحلول السائل من خلال قطعة من الشاش المعقم.
    3. صب المحلول السائل في أسطوانة متدرجة سعة 1000 مل واضبط الحجم إلى 1000 مل بالماء المعقم.
    4. صب المحلول السائل في زجاجة كاشف زجاجي وأضف 18 جم من الأجار. رج الخليط جيدا وأوتوكلافي (وسط أجار دقيق الشوفان) على حرارة 121 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة. اتركيه في درجة حرارة الغرفة لمدة 30 دقيقة.
    5. صب حوالي 20 مل من وسط أجار الشوفان المعقم في كل طبق بتري. اترك أطباق بتري في درجة حرارة الغرفة لتبرد جيدا قبل زراعة الميسيل.
  2. تنفيذ زراعة mycelial.
    1. قم بإعداد اللكمات والمسواك التي يبلغ قطرها 1 سم مسبقا عن طريق تعقيمها عند 121 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة.
    2. ثقب ثقوب في ثقافات الأجار Mycelial Mycelial P. nicotianae لصنع حصير mycelial مستدير.
    3. اختر الحصير الفطري ، وضع الجانب الفطري لأسفل على وسط أجار دقيق الشوفان ، واحتضن الميسيليوم عند 25 درجة مئوية في الظلام لمدة 14 يوما.
  3. إعداد P. nicotianae تعليق zoospore.
    1. أضف محلول KNO3 بنسبة 0.1٪ إلى كل زراعة فطرية (15 مل / طبق) ، متبوعا بالزراعة عند 4 درجات مئوية لمدة 20 دقيقة للحث على البوغ.
    2. احتفظ بالأطباق في درجة حرارة 25 درجة مئوية لمدة 25 دقيقة لإطلاق الجراثيم الحيوانية.
    3. جمع تعليق zoospore في دورق وقياس تركيز zoospore باستخدام المجهر ومقياس الدم.
    4. اضبط تركيز الجراثيم الحيوانية على 1 × 104 من الجراثيم الحيوانية / مل بالماء المعقم.

4- تحديد أصناف التبغ المقاومة للأمراض

  1. خذ الشتلات من محلول المغذيات Hoagland وتلقيحها عن طريق غمر الجذور في 20 مل من تعليق P. nicotianae zoospore في طبق بتري (90 ملم) عند 25 درجة مئوية لمدة 3 ساعات في الظلام.
  2. بعد التلقيح ، ضع شتلات التبغ في أطباق بتري جديدة مع 10 مل من الماء المعقم الذي يغمر الجذور. حافظ على رطوبة الجذور عن طريق تغطيتها بقطعتين من ورق الترشيح. حافظ على الأطباق في درجة حرارة 25 درجة مئوية مع فترة ضوئية مظلمة لمدة 16 ساعة / 8 ساعات.
  3. بعد 2-3 أيام ، لاحظ شدة المرض.
    1. للمعالجة الضابطة ، ضع شتلات التبغ مباشرة في أطباق بتري بماء معقم 10 مل يغمر الجذور ، وقم بتغطية الجذور بقطعتين من ورق الترشيح.
      ملاحظة: كان لكل علاج ثلاثة تكرارات ، مع 8 نباتات لكل تجربة.

5. تقييم عدوى P. nicotianae

  1. تقييم شدة المرض بعد 4-5 أيام من التلقيح. استنادا إلى المعيار الوطني الصيني18 ، سجل شدة الأمراض النباتية الفردية على مقياس من 0 إلى 9 (الجدول 2 ، الشكل 1).
  2. احسب مؤشر المرض باستخدام الصيغة التالية18:
    مؤشر المرض = Equation 1
    حيث أ ، ب ، ج ، د ، ه ، و و هي عدد النباتات في كل درجة من درجات شدة المرض.
    ملاحظة: قسمت شدة المرض إلى 6 درجات18 (الجدول 3).

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

تم تحدي النباتات التي يبلغ عمرها 4 أسابيع من الصنف المقاوم BH والصنف الحساس XHJ مع P. nicotianae باستخدام الطريقة المقدمة في هذه المقالة. تم تصميم التجربة مع ثلاث نسخ متماثلة ، كل منها يحتوي على 8 نباتات لكل مجموعة. ويرد في الشكل 2 عدوى P. nicotianae لنوعي التبغ، BH و XHJ. في 3 أيام بعد التلقيح ، بالنسبة ل XHJ ، غطت الآفات الجذعية ما يقرب من نصف محيط الساق ، وكان نصف الأوراق ذابلة قليلا. في الصنف المقاوم BH ، لم تلاحظ أي أعراض. في 4 أيام بعد التلقيح ، حدث ذبول الأوراق والآفات الجذعية الشديدة في XHJ ، في حين أن هذه الأعراض لم تظهر في BH.

وبعد 5 أيام من التلقيح، سجلت شدة الأمراض النباتية الفردية وحسبت استنادا إلى المعيار الوطني الصيني ل "طريقة الصف والتحقيق في أمراض التبغ والآفات الحشرية"18 (الجدول 4). كان متوسط مؤشر المرض ل BH 6.48 ، والذي اعتبر مقاوما (R) وفقا للمعيار ، وكان متوسط مؤشر المرض ل XHJ 76.85 ، والذي اعتبر عرضة (S) وفقا للمعيار.

ولتأكيد كفاءة التلقيح، تم تحديد الكتلة الحيوية المسببة للأمراض النسبية كميا بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي (الشكل 3). تم عزل الحمض النووي الجينومي النباتي والممرض من BH و XHJ المصابين وتم جمعهما في 24 ساعة و 72 ساعة و 168 ساعة بعد العدوى باستخدام بروتوكول CTAB 19. تم تحديد الكتلة الحيوية المسببة للأمراض النسبية كميا باستخدام أزواج التمهيدي Pn-Fw (5'-CTCCAGAACGTGTACATCCG-3') / Pn-Rev (5'-TAGCGCCCTTCTCCTCAG-3') ، وتضخيم البروتين الريبوسومي 40S S3A (WS21) من P. nicotianae20 ، و Nt-Fw (5'-CAAGGAAATCACCGCTTTGG-3') / Nt-Rev (5'-AAGGGATGCGAGGATGGA-3') ، تضخيم الجين المرجعي للتبغ 26S rRNA gene21. تم حساب تغيرات أضعاف التعبير بين الممرض والحمض النووي الرقمي للتبغ باستخدام طريقة 2-ΔΔCT Ct. أكدت نتائج PCR في الوقت الحقيقي ملاحظات النمط الظاهري.

تم تقييم خمسة ذرية من مجموعة BC4F2 من تقاطع بين BH و XHJ ونوعين من المقاومة الوسيطة ، K326 و Yunyan87 ، باستخدام طريقة التلقيح المعلق للبوغ الحيواني وطريقة تلقيح حبوب الشوفان (الجدول 5). تم تنفيذ طريقة تعليق zoospore على الشتلات الصغيرة ، وتم تنفيذ طريقة تلقيح حبوب الشوفان على النباتات البالغة. بالنسبة للأسلاف الخمسة من سكان BC4F2 ، تراوح مؤشر المرض من 16.49 إلى 77.60 لطريقة تعليق بوغ الحيوان ومن 10.33 إلى 83.08 لطريقة حبوب الشوفان. كانت تصنيفات المقاومة بين طريقتي العدوى متسقة في الغالب مع بعضها البعض. مع نوعين من المقاومة الوسيطة ، K326 و Yunyan87 ، أظهر التقييم "مقاومة" في كلتا الطريقتين. توضح هذه البيانات العلاقة بين طريقتي التلقيح ، على الرغم من إجرائهما على نباتات التبغ في فترات نمو مختلفة.

الخمور الأصلية نسبه حجم الخمور الأصلي (مل) العناصر المغذية المحتوى (ز)
OL 1 1000× 500 MgSO4 • 7 H2O 30.81
OL 2 1000× 500 Ca(NO3)2•4 H2O 221.39
OL 3 1000× 500 NaH2PO4•2 H2O 19.5
OL 4 1000× 500 NH4NO3 75.04
OL 5 1000× 500 (NH4) 2 SO4 123.75
OL 6 1000× 500 CaCl2 104.06
OL 7 1000× 500 FeSO4•7 H2O 2.78
Na2-EDTA 3.73
OL 8 1000× 500 K2SO4 87.1
OL 9 4000× 1000 MnCl2•4 H2O 7.24
H3BO3 11.44
ZnSO4•7 H2O 0.88
CuSO4•5 H2O 0.32
(NH4) 6 Mo7O24•2 H2O 0.36

الجدول 1: محلول المغذيات Hoagland.

درجة ظهور النمط الظاهري
الصف 0 لا توجد أعراض على النبات بأكمله
الصف 1 الآفات الجذعية < 1/3 من محيط الساق أو <1/3 من الأوراق الذابلة
الصف 3 الآفات الجذعية بين 1/3 و 1/2 من محيط الساق أو بين 1/3 و 1/2 من الأوراق الذبول قليلا
الصف 5 الآفات الجذعية >1/2 من محيط الساق ، ولكن ليس تماما حول المقاس ، أو بين 1/2 و 2/3 من الأوراق الذابلة
الصف 7 الآفات الجذعية حول محيط الساق الكامل أو >2/3 من الأوراق الذائبة
الصف 9 النباتات تبدو ميتة

الجدول 2: ترتيب شدة مرض الساق السوداء. استنادا إلى المعيار الوطني الصيني ل "طريقة الصف والتحقيق في أمراض التبغ والآفات الحشرية" (GB / T 23222-2008) ، تم تسجيل شدة الأمراض النباتية الفردية على مقياس من 0 إلى 9.

مؤشر المرض تقييم المقاومة
0 مقاومة عالية أو مناعة (I)
0.1 إلى 20 مقاوم (R)
20.1 إلى 40 مقاومة معتدلة (MR)
40.1 إلى 60 عرضة للإصابة المعتدلة (MS)
60.1 إلى 80 عرضة (ق)
80.1 إلى 100 عرضة للغاية (HS)

الجدول 3: تقييم المقاومة وفقا لمؤشر المرض. تم تقسيم شدة المرض إلى 6 درجات وفقا لمؤشر المرض. 0 تعني مقاومة عالية أو مناعة (I) ، 0.1 إلى 20 تعني مقاومة (R) ، 20.1 إلى 40 تعني مقاومة معتدلة (MR) ، 40.1 إلى 60 تعني عرضة بشكل معتدل (MS) ، 60.1 إلى 80 تعني عرضة (S) ، 80.1 إلى 100 تعني شديدة الحساسية (HS).

صنف كرر 1 2 3 4 5 6 7 8 مؤشر المرض دني تقييم المقاومة
الهرسك 1 0 1 0 0 1 0 1 0 4.17 6.48
2 1 0 0 0 3 1 0 1 8.33 R
3 1 0 0 0 0 0 3 1 6.94
إكس إتش جي 1 7 5 7 7 9 7 7 7 77.78 76.85
2 9 7 9 7 5 9 7 5 80.56 S
3 7 5 7 9 5 9 5 5 72.22

الجدول 4: مؤشر المرض ومقاومته في BH و XHJ. كان متوسط مؤشر المرض ل BH 6.48 ، والذي يظهر المقاومة (R) وفقا للمعيار ، وكان متوسط مؤشر المرض ل XHJ 76.85 ، مما يدل على القابلية (S) وفقا للمعيار.

الجيني تعليق Zoospore طريقة حبوب الشوفان
التجربة 1 التجربة 2 دني تصنيف التجربة 1 التجربة 2 دني تصنيف
الهرسك 4.17 8.33 6.94 R 0 0 0 أنا
إكس إتش جي 77.78 80.56 72.22 S 84.89 90 87.45 النظام المنسق
K326 12.5 12.5 12.5 R 5.39 15.67 10.53 R
يونيان87 19.45 8.33 13.89 R 4.7 28.89 16.8 R
ج٤٢-٤ 21.28 21.89 21.59 السيد 7.56 13.11 10.33 R
ج١٣-٤ 18.16 14.81 16.49 R 38.89 19.66 29.27 السيد
ج9-5 77.41 77.78 77.6 S 79.83 82.86 81.34 النظام المنسق
ج٤٦-٨ 55.56 51.11 53.34 التصلب المتعدد 62.91 72.65 67.78 S
ج٦٦-٩ 79.88 74.07 76.98 S 93.94 72.22 83.08 النظام المنسق

الجدول 5: الاستجابة لعدوى P. nicotianae في الأنماط الجينية المختلفة باستخدام طريقة التلقيح المعلق للبوغ الحيواني وطريقة تلقيح حبوب الشوفان. تم تنفيذ طريقة التلقيح بتعليق الجراثيم الحيوانية على الشتلات الصغيرة ، وتم تنفيذ طريقة تلقيح حبوب الشوفان على النباتات البالغة. توضح هذه البيانات العلاقة بين طريقة تلقيح تعليق الجراثيم الحيوانية وطريقة تلقيح حبوب الشوفان. K326 و Yunyan87 لهما مستويات متوسطة من المقاومة ، و C42-4 و C13-4 و C9-5 و C46-8 و C66-9 هي ذرية من سكان BC4F2 من تقاطع بين BH و XHJ. تم تصنيف النباتات على أنها محصنة أو مقاومة أو مقاومة معتدلة أو حساسة بشكل معتدل أو حساسة أو عالية الحساسية.

Figure 1
الشكل 1: أعراض كل درجة . (A) الصف 0 ، خالية من أعراض النبات بالكامل. (ب) الصف الأول ، آفة الجذعية <1/3 من محيط الساق أو <1/3 يترك الذبول. (ج) الصف 3 ، آفات الساق بين 1/3 و 1/2 من محيط الساق أو بين 1/3 و 1/2 من الأوراق التي تذبل قليلا. (د) الصف 5 ، الآفات الجذعية >1/2 من محيط الساق ، ولكن ليس تماما حول المحيط ، أو بين 1/2 و 2/3 من الأوراق الذابلة. (ه) الصف 7 ، آفات الساق حول محيط الساق الكامل أو >2/3 من ذبول الأوراق. (و) الصف 9 ، تبدو النباتات ميتة. تشير الأسهم الحمراء إلى الآفات الجذعية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 2
الشكل 2: التباين الملحوظ في نمطين وراثيين للتبغ . (أ) خال من أعراض النبات الكامل في الصنف المقاوم BH بعد 3 أيام من التلقيح. (ب) الآفات الجذعية حوالي 1/2 من محيط الساق و 1/2 من الأوراق تذبل قليلا في XHJ بعد 3 أيام من التلقيح. (ج) خال من أعراض النبات الكامل في الصنف المقاوم BH بعد 4 أيام من التلقيح. (د) الآفات الجذعية >1/2 من محيط الساق ، ولكن ليس تماما حول المحيط ، وبين 1/2 و 2/3 من الأوراق التي تذبل في مجموعة متنوعة حساسة XHJ بعد 4 أيام من التلقيح. تشير الأسهم الحمراء إلى الآفات الجذعية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 3
الشكل 3: القياس الكمي النسبي للكتلة الأحيائية P. nicotianae في BH و XHJ المصابين في 24 ساعة و 72 ساعة و 168 ساعة بعد التلقيح. يتم حساب هذا على أنه نسبة تضخيم جين P. nicotianae WS21 مقارنة بجين التبغ 26S rRNA. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

تم استخدام مصادر مقاومة متعددة لتحسين مقاومة P. nicotianae في التبغ المزروع. تم إدخال جينات R المهيمنة المفردة ، Php و Phl ، من Nicotiana plumbaginifolia و Nicotiana longiflora ، على التوالي 10. يحتوي صنف تبغ السيجار Beinhart 1000 على أعلى مستوى تم الإبلاغ عنه من المقاومة الكمية ل P. nicotianae13. وقد اقترحت تجارب رسم الخرائط الفواصل الزمنية المتعددة أن ما لا يقل عن ستة مواقع سمة كمية (QTLs) قد تسهم في المقاومة في هذا الخط13،22. بالإضافة إلى المصادر المقاومة المذكورة أعلاه ، تم العثور على جين غريب آخر ، Wz ، يمنح أيضا مستوى عاليا من المقاومة للسباق 0 والعرق 123,24. وبالنظر إلى المصادر المقاومة المتعددة والخلفية الجينية المعقدة للأصناف المقاومة، يلزم اتباع طريقة دقيقة وموثوقة لتقييم المقاومة من أجل 1) تحديد الأنماط الوراثية للتبغ المقاوم للبكتيريا P. nicotianae، 2) الأصناف المقاومة للتربية، و 3) دراسات الآلية الجزيئية للتفاعلات بين النبات ومسببات الأمراض. كانت الطرق السابقة المستخدمة لتقييم شدة عدوى P. nicotianae تستغرق وقتا طويلا أو كان من الصعب السيطرة على كثافة التلقيح. وبالتالي ، من الملح وضع طريقة جديدة لتقييم مقاومة P. nicotianae.

تقليد عمليات العدوى الطبيعية هو النقطة الرئيسية في طريقتنا الجديدة. أولا ، خلال دورة الحياة النموذجية ل P. nicotianae ، تعد الجراثيم الحيوانية هي العوامل المعدية الرئيسية التي تبدأ الأمراض النباتية. بمجرد وصول جراثيم الحيوانات إلى سطح النبات ، فإنها تصبح كيسات غير متحركة ، ثم تنبت لاحقا ، وتشكل أنابيب جرثومية. ثم ، يتم إنتاج appressoria في طرف الأنابيب الجرثومية25. في بروتوكولنا ، تم استخدام تعليق zoospore كلقاح ، والذي يقلد حالة العدوى الطبيعية. ثانيا ، على أوراق نيكوتيانا بنثاميانا ، نبتت الخراجات واستعمرت خلايا البشرة في 3 h26. في جذور أرابيدوبسيس ، اخترقت جميع الجراثيم الحيوانية المنتشرة الجذور بنجاح في الساعة 6 بعد التلقيح27. في نهجنا ، تضمنت عملية التلقيح غمر الجذور في تعليق بوغ حيواني P. nicotianae لمدة 3 ساعات في الظلام ، مما يقلد البيئة الطبيعية ويعزز استعمار العامل الممرض ، مما يؤدي إلى عدوى مستقرة وفعالة.

النهج الأكثر استخداما لتقييم مقاومة P. nicotianae في التبغ ، طريقة حبوب الشوفان ، فعال وسهل لتلقيح عدد كبير من النباتات7،11،12،13،14،15،16. ومع ذلك ، فإن لديها بعض العيوب. العيب الرئيسي هو كثافة التلقيح غير المنضبطة ، والتي تحد من تطبيقها في التربية الدقيقة. بالمقارنة مع طريقة حبوب الشوفان والطريقتين الأخريين الحاليتين ، في هذا النهج الجديد ، يتم استخدام تعليق zoospore كلقاح ، وبالتالي فإن كثافة التلقيح قابلة للتحكم فيها وتعديلها. نظرا لأن النباتات مستزرعة في بيئة مائية ، يتم التخلص من تداخل التربة ، مما يزيد من دقة التقييم. ومع ذلك ، يوجد قيد واحد لهذه الطريقة ، وهو أنه لا يمكن استخدامهاعلى النباتات البالغة. طريقة حبوب الشوفان ، من ناحية أخرى ، قابلة للتطبيق على فحص المقاومة على نطاق واسع للنباتات البالغة7,13. لذلك ، يمكن لهذه الطريقة وطريقة حبوب الشوفان أن تكمل بعضها البعض لفترات نمو مختلفة لنبات التبغ وفي مواقف مختلفة.

البروتوكول الموصوف هنا هو طريقة فعالة وموثوقة لتقييم مقاومة التبغ للعدوى بواسطة P. nicotianae في مرحلة الشتلات. يمكن استخدام هذا البروتوكول للتكاثر ولأبحاث الآلية الجزيئية.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

ليس لدى المؤلفين ما يكشفون عنه.

Acknowledgments

تم تمويل هذا البحث من قبل المؤسسة الوطنية للعلوم الطبيعية في الصين (31571738) وبرنامج الابتكار في العلوم والتكنولوجيا الزراعية في الصين (ASTIP-TRIC01).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
(NH4)2SO4 Sinopharm 10002917 Analytical Reagent
(NH4)6 Mo7O24•2 H2O Sinopharm XW131067681 Analytical Reagent
1.5 ml Safe-lock Microcentrifuge Tubes Eppendorf 30120086 Used for Sample Extarction
2 ml Safe-lock Microcentrifuge Tubes Eppendorf 30120094 Used for Sample Extarction
Agar MDBio, Inc 9002-18-0 Materials of Culture Medium
Analytical Balance AOHAOSI AX2202ZH Equipment
Autoclave Yamatuo SQ510C Equipment
Autoclave YAMATUO SQ510C Equipment
Beaker Bio Best DHSB-2L Materials of Culture Medium
Biological Incubator JINGHONG SHP-250 Equipment
Ca(NO3)2•4 H2O Sinopharm 80029062 Analytical Reagent
CaCl2 Sinopharm 10005817 Analytical Reagent
CuSO4•5 H2O Sinopharm 10008218 Analytical Reagent
Electromagnetic Oven Bio Best DHDCL Equipment
FeSO4•7 H2O Sinopharm 10002918 Analytical Reagent
Filter Paper Bio Best DHLZ-9CM Material
Fluorescence Ration PCR Instrument Roche LightCycler96 Equipment
Gauze Bio Best 17071202 Materials of Culture Medium
H3BO3 Phytotechnology B210-500G Analytical Reagent
Hemocytometer Solarbio 17072801 Material for disease-resistant  identification
K2SO4 Sinopharm 10017918 Analytical Reagent
KNO3 Sinopharm 10017218 Analytical Reagent
KT Foam Sheet Bio Best DHKTB Material for Seedling
Low Constant Incubator Jinghong SHP-250 Equipment
Measuring Cylinder Bio Best DHBLLT-1000ML Materials of Culture Medium
MgSO4•7 H2O Sinopharm 10013080 Analytical Reagent
Microscope ECHO RVL-100-G Equipment
MnCl2•4 H2O Sinopharm G5468154 Analytical Reagent
Na2-EDTA Sinopharm G21410-250 Analytical Reagent
NaH2PO4•2 H2O Sinopharm 20040717 Analytical Reagent
NH4NO3 Sinopharm B64586-100g Analytical Reagent
Oatmeal Bio Best DHYMP-1.5KG Materials of Culture Medium
Petri Dish Bio Best DHPYM-9CM Material for disease-resistant  identification
Pipettor THERMO S1 Equipment
Potting Bio Best DHYCXHP-12CM Material for Seedling
Potting Soil Bio Best DHYMJZ-50L Seedling Material
Punch Bio Best DHDKW Material
qRT-PCR Plate Monad MQ50401S qRT-PCR Plate
SYBR Green Premix Pro Taq HS qPCR Kit Accurate Biology AG11718 PCR Reagent
Toothpick Bio Best DHYQ-900 Material
Total RNA Kit II Omega R6934-01 PCR Reagent
TransScript® II One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix Transgen AH311-02 PCR Reagent
Trays Bio Best DHYMTP-90G Material for Seedling
Vermiculite Bio Best DHZS Seedling Material
Water Purification System HEAL FORCE HSE68-2 Equipment
ZnSO4•7 H2O Sinopharm 10024018 Analytical Reagent

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Antonopoulos, D. F., Melton, T., Mila, A. L. Effects of chemical control, cultivar resistance, and structure of cultivar root system on black shank incidence of tobacco. Plant Disease. 94 (5), 613-620 (2010).
  2. Taylor, R. J., Pasche, J. S., Gallup, C. A., Shew, H. D., Gudmestad, N. C. A foliar blight and tuber rot of potato caused by Phytophthora nicotianae: New occurrences and characterization of isolates. Plant Disease. 92 (4), 492-503 (2008).
  3. Amalia, B. R., José, I. M. G., Miguel, D. C. G., Francisco, C. F., Julio, C. T. M. Pathogenicity of plant and soil isolates of Phytophthora parasitica on tomato and pepper. European Journal of Plant Pathology. 148 (3), 607-615 (2017).
  4. Corrado, C., Annamari, M., Leonardo, S., Antonio, I., Simona, M. S. First report of collar and root rot caused by Phytophthora nicotianae on Lycium barbarum. Journal of Plant Pathology. 100 (2), (2018).
  5. Meng, Y. L., Zhang, Q., Ding, W., Shan, W. X. Phytophthora parasitica.: a model oomycete plant pathogen. Mycology. 5 (2), 43-51 (2014).
  6. Biasi, A., Martin, F. N., Cacciola, S. O., Lio, G. M., Grunwald, N. J., Schena, L. Genetic analysis of Phytophthora nicotianae populations from different hosts using microsatellite markers. Phytopathology. 106 (9), 1006-1014 (2016).
  7. Sullivan, M. J., Melton, T. A., Shew, H. D. Fitness of races 0 and 1 of Phytophthora parasitica var. nicotianae. Plant Disease. 89 (11), 1220-1228 (2005).
  8. Carlson, S. R., Wolff, M. A. F., Shew, H. D., Wernsman, E. A. Inheritance of resistance to Race 0 of Phytophthora parasitica var. nicotianae from the flue-cured tobacco cultivar Coker 371-Gold. Plant Disease. 81 (11), 1269-1274 (1997).
  9. Csinos, A. S. Stem and root resistance to tobacco black shank. Plant Disease. 83 (8), 777-780 (1999).
  10. Johnson, E. S., Wolff, M. F., Wernsman, E. A., Atchley, W. R., Shew, H. D. Origin of the black shank resistance gene, Ph, in tobacco cultivar coker 371-Gold. Plant Disease. 86 (10), 1080-1084 (2002).
  11. Osmany, C., Ingrid, H., Roxana, P., Yunior, L., Merardo, P., Orlando, B. H. Identification of defense-related genes in tobacco responding to black shank disease. Plant Science. 177 (3), 175-180 (2009).
  12. Hernández, I., et al. Black shank resistant tobacco by silencing of glutathione S-transferase. Biochemical and Biophysical Research Communications. 387 (2), 300-304 (2009).
  13. Vontimitta, V., Lewis, R. S. Growth chamber evaluation of a tobacco 'Beinhart 1000' × 'Hicks' mapping population for quantitative trait loci affecting resistance to multiple races of Phytophthora nicotianae. Crop Science. 52 (1), 91-98 (2012).
  14. Xiao, B., et al. Location of genomic regions contributing to Phytophthora nicotianae resistance in tobacco cultivar florida 301. Crop Science. 53 (2), 473-481 (2013).
  15. McCorkle, K., Lewis, R., Shew, D. Resistance to Phytophthora nicotianae in tobacco breeding lines derived from variety Beinhart 1000. Plant Disease. 97 (2), 252-258 (2013).
  16. Zhang, Y., et al. Identification of stably expressed QTL for resistance to black shank disease in tobacco (Nicotiana tabacum L.) line Beinhart 1000-1. The Crop Journal. 6 (3), 282-290 (2018).
  17. Yu, X., Feng, B., He, P., Shan, L. From chaos to harmony: responses and signaling upon microbial pattern recognition. Annual Review of Phytopathology. 55, 109-137 (2017).
  18. Ren, G., et al. GB/T 23222 Grade and Investigation Method of Tobacco Diseases and Insect Pests. , China Standard Press. Beijing. (2008).
  19. Doyle, J. J., Doyle, J. L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin. 19 (11), 11-15 (1987).
  20. Yan, H. Z., Liou, R. F. Selection of internal control genes for real-time quantitative RT-PCR assays in the oomycete plant pathogen Phytophthora parasitica. Fungal Genetics and Biology. 43, 430-438 (2006).
  21. Chacón, O., Hernández, I., Portieles, R., López, Y., Pujol, M., Borrás-Hidalgo, O. Identification of defense-related genes in tobacco responding to black shank disease. Plant Science. 117 (3), 175-180 (2009).
  22. Vijay, V., Ramsey, S. L. Mapping of quantitative trait loci affecting resistance to Phytophthora nicotianae in tobacco (Nicotiana tabacum L.) line Beinhart-1000. Molecular Breeding. 29 (1), 89-98 (2012).
  23. McCorkle, K. L., Drake-Stowe, K., Lewis, R. S., Shew, D. Characterization of Phytophthora nicotianae resistance conferred by the introgressed Nicotiana rustica region, Wz, in flue-cured tobacco. Plant Disease. 102 (2), 309-317 (2018).
  24. Drake, K. E., Moore, J. M., Bertrand, P., Fortnum, B., Peterson, P., Lewis, R. S. Black shank resistance and agronomic performance of flue-cured tobacco lines and hybrids carrying the introgressed Nicotiana rustica Region. Wz. Crop Science. 55 (1), 79-86 (2015).
  25. Kebdani, N., Pieuchot, L., Deleury, E., Panabières, F., Berre, J. -Y. L., Gourgues, M. Cellular and molecular characterization of Phytophthora parasitica appressorium-mediated penetration. New Phytologist. 185 (1), 248-257 (2010).
  26. Huang, G., et al. An RXLR effector secreted by Phytophthora parasitica is a virulence factor and triggers cell death in various plants. Molecular Plant Pathology. 20 (3), 1-16 (2019).
  27. Agnès, A., Mathieu, G., Nicolas, C. -T., Harald, K. The immediate activation of defense responses in Arabidopsis roots is not sufficient to prevent Phytophthora parasitica infection. New Phytologist. 187 (2), 229 (2010).

Tags

علم الأحياء ، العدد 182 ، Phytophthora nicotianae ، عرقوب أسود ، بلازما وراثية ، مقاومة النبات ، عرضة ، زراعة مائية ، تعليق بوغ الحيوان
فحص الأنماط الجينية للتبغ لمقاومة <em>النيكوتيانا النباتية</em>
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Liu, Y., Sun, M., Jiang, Z., Wang,More

Liu, Y., Sun, M., Jiang, Z., Wang, X., Xiao, B., Yang, A., Meng, H., Cheng, L. Screening of Tobacco Genotypes for Phytophthora nicotianae Resistance. J. Vis. Exp. (182), e63054, doi:10.3791/63054 (2022).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter