Die Depletionseffizienz kann flusszytometrisch beurteilt werden, indem die magnetisch unmarkierte Zellfraktion für CD4 und CD8 nach immunmagnetischer Zelltrennung (MACS) markiert und an einem zweidimensionalen bivariaten Punktdiagramm analysiert wird (Abbildung 3). Eine gute Ausbeute an doppelt negativen Zellen (CD4−, CD8−) liegt bei 95 % oder mehr, wie in Abbildung 3 dargestellt. Zwei der häufigsten Ursachen für eine geringere Ausbeute sind die Fehlberechnung der Mikrokügelchen aufgrund der Anzahl der Zellen und der Anzahl der markierten Zellen, die die Säulenkapazität überschreiten. Es wird empfohlen, die richtige Anzahl von MACS-Spalten entsprechend der Anzahl der beschrifteten Zellen auszuwählen. Bei der Arbeit mit Thymozyten ist die Anzahl der markierten Zellen (DP- und SP-Zellen) fast gleich der Anzahl der Gesamtzellen (mehr als 96%). Die Zellzählung kann in einem automatischen Zellzähler, einer Neubauer-Kammer oder mit jeder anderen Methode erfolgen. Infolgedessen müssen die für die Zellzählung zugewiesenen Volumina je nach Maschine und gewählter Zählmethode möglicherweise angepasst werden.
Es ist wichtig, die Anzahl der Zellen zu bestimmen, die vor und nach der Verarmung vorhanden sind. Diese Zellzahlen werden benötigt, um die Anzahl der benötigten LD-Depletionssäulen zu berechnen und die DN-Thymozyten gleichmäßig auf die entsprechende Anzahl von OP9-DL4-Kolben zu verteilen. Die Kontrollen für die Durchflusszytometrie (unmarkierte Zellen, CD4-markierte Zellen und CD8-markierte Zellen) können mit der reservierten Pre-Depletion-Probe durchgeführt werden, da diese mehr Zellen enthält. Da jedoch davon ausgegangen wird, dass die meisten Zellen in der Säule verbleiben, erfordert die zu markierende Probe nach der Verarmung ein höheres Volumen. Folglich müssen möglicherweise Anpassungen entsprechend dem gewählten Kennzeichnungsprotokoll vorgenommen werden.
Bei der Verwendung von Vektoren, die screenbare Marker exprimieren, wie z. B. ein Fluoreszenzgen, können die Transfektion und Transduktion grob und empirisch durch Fluoreszenzmikroskopie beurteilt werden (Abbildung 2). Die Transduktionseffizienz kann analysiert werden, indem der Thymozyten aus der OP9-DL4-Monoschicht entnommen wird, wie in Schritt 8.3 beschrieben, und die Expression eines Fluoreszenzgens mittels Durchflusszytometrie untersucht wird. Die Effizienz der Transduktion mit einem leeren retroviralen Vektor mit GFP als Reportergen betrug 84,2 % (Abbildung 4).
Die Differenzierung der T-Zellen auf OP9-DL4-Zellen kann 4 Tage nach der Transduktion beobachtet werden. Die Durchflusszytometrie wird in der Regel durchgeführt, um die durch die Kokultur auf OP9-DL4-Zellen induzierte Zelldifferenzierung und/oder die Transgenexpression zu beurteilen, wie in Abbildung 5 dargestellt, wobei die Zellen für CD4, CD8, CD44 und CD25 markiert wurden. Es gibt mehrere mögliche Kombinationen der Markierung von Zelloberflächenmolekülen, die sich als nützlich erwiesen haben, um die molekularen und zellulären Mechanismen der T-Zell-Entwicklung in Mäusen zu untersuchen24,25,26,27. Daher können die Panels mit fluoreszierenden Antikörpern je nach der Frage, die behandelt wird, variieren. Die Transduktion von DN-Thymozyten mit dem leeren retroviralen Vektor pMIG, die in Tafel B dargestellt ist, zeigte ungefähr die gleichen Anteile an einfach positiven (CD4+ oder CD8+), doppelt positiven (CD4+/CD8+), doppelt negativen (CD4−/CD8−) und ihren Unterstufen doppelt negativ 1–4 (DN1–DN4) wie die nicht transduzierten Thymozyten, die in Tafel A gezeigt werden, was darauf hindeutet, dass die T-Zellentwicklung durch den Transduktionsprozess nicht beeinflusst wurde.

Abbildung 1: Diagramm der Schritte der Thymozytenisolierung, -transduktion und -kokultur. Abkürzung: DN = doppelt negativ. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 2: Co-Kultur-Fluoreszenzmikroskopie von GFP-transduzierten Thymozyten oder untransduzierten Thymozyten und OP9-DL4-Zellen. (A) Untransduzierte Thymozyten und (B) stabile GFP-exprimierende murine Thymozyten auf OP9-DL4 an Tag 3 nach der zweiten Transduktion. Zum Einsatz kam ein Olympus-IX71 Fluoreszenzmikroskop mit einem 40x-Objektiv und einem 480/30 Filter, der für die GFP-Detektion geeignet ist. Maßstabsbalken = 40 μm. Abkürzungen: GFP = grün fluoreszierendes Protein; DN = doppelt negativ. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 3: Durchflusszytometrie der Thymozytendepletion. Repräsentative Durchflusszytometrie-Diagramme zur Analyse der Expression von CD4 und CD8 auf Thymozyten von 7-8 Wochen alten weiblichen C57BL/6J-Mäusen (A) vor der Depletion und (B) nach der Depletion von CD4+ und CD8+ unter Verwendung von Mikrokügelchen und LD-Säulen gemäß den Anweisungen des Herstellers. Die Punktdiagramme auf der linken Seite zeigen Tore basierend auf der Größe und Komplexität des Ereignisses (FCS-A bzw. SSC-A). Das mittlere Bild zeigt FSC-H im Vergleich zu FSC-A, um einzelne Zellen zu gate und Dubletten auszuschließen. In den Diagrammen auf der rechten Seite wurden die Zellen als CD4 und CD8 aus dem Einzelzell-Gate definiert. Abkürzungen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = seitliche Streupeakfläche; FSC-H = Vorwärtsstreu-Peak-Höhe; FITC = Fluorescein-Isothiocyanat; PE = Phycoerythrin. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 4: Durchflusszytometrie der retroviralen Transduktionseffizienz der Thymozyten. (A) Nicht transduzierte Thymozyten, die auf OP9-DL4 kokultiviert wurden; (B) retroviral transduzierte Thymozyten auf OP9-DL4 an Tag 3 nach der Transduktion. Abkürzungen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = seitliche Streupeakfläche; FSC-H = Vorwärtsstreu-Peak-Höhe; FITC = Fluorescein-Isothiocyanat; PE = Phycoerythrin; DN = doppelt negativ. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.

Abbildung 5: Durchflusszytometrie der transduzierten Thymozyten nach 4 Tagen OP9-DL4-Cokultur. (A) Nicht transduziert und (B) transduziert mit pMIG-Retrovirus. Die Zellen wurden zuerst auf lebende Zellen und dann auf der Grundlage von Größe und Komplexität (FCS-A bzw. SSC-A) gegiert, gefolgt von der Darstellung von FSC-H im Vergleich zu FSC-A, um einzelne Zellen zu erreichen und Dubletten auszuschließen. Für nicht transduzierte Zellen haben wir die folgende Gate-Strategie verwendet. Vom Einzelzell-Gate aus wurden die Zellen als einfach positiv (CD4+ oder CD8+), doppelt positiv (CD4+/CD8+) und doppelt negativ (CD4−/CD8−) definiert. Aus dem doppelt negativen Gatter (CD4−/CD8−) wurden die Zellen dann als CD44+, CD25+, CD44+/CD25+ und CD44−/CD25− definiert, wie in Abbildung A gezeigt. Für die pMIG-transduzierten Zellen, die in Tafel B gezeigt sind, wurden die Zellen aus dem Einzelzell-Gate zunächst als GFP+/GFP− definiert, und dann aus GFP+-Zellen wurde die Zellpopulationsverteilung in die wichtigsten T-Zell-Entwicklungsstadien, wie sie durch CD4-, CD8-, CD44- und CD25-Expression definiert sind, mit der gleichen Gate-Strategie wie für die untraducierten Zellen bestimmt. Abkürzungen: FSC-A = forward scatter-peak area; SSC-A = seitliche Streupeakfläche; FSC-H = Vorwärtsstreu-Peak-Höhe; FITC = Fluorescein-Isothiocyanat; GFP = grün fluoreszierendes Protein. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.