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Methodenartikel

Quantifizierung der antimykotischen Aktivität von Peptiden gegen Candida albicans

3.1K Aufrufe

DOI:

10.3791/64416

13. Januar 2023

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Dieses Protokoll beschreibt ein Verfahren zur Gewinnung quantitativer Daten über die antimykotische Aktivität von Peptiden und anderen Verbindungen, wie z. B. niedermolekularen Antimykotika, gegen Candida albicans. Die Verwendung der optischen Dichte anstelle der Zählung koloniebildender Einheiten zur Quantifizierung der Wachstumshemmung spart Zeit und Ressourcen.

Zusammenfassung

Herkömmliche Methoden zur Durchführung von antimykotischen Empfindlichkeitstests für Candida albicans sind zeitaufwändig und es fehlen quantitative Ergebnisse. Ein gängiger Ansatz beruht beispielsweise darauf, Zellen, die mit unterschiedlichen Konzentrationen antimykotischer Moleküle behandelt wurden, auf Agarplatten zu plattieren und dann die Kolonien zu zählen, um die Beziehung zwischen Molekülkonzentration und Wachstumshemmung zu bestimmen. Diese Methode erfordert viele Platten und viel Zeit, um die Kolonien zu zählen. Ein anderer gängiger Ansatz eliminiert die Platten und das Zählen von Kolonien, indem mit Antimykotika behandelte Kulturen visuell inspiziert werden, um die Mindestkonzentration zu ermitteln, die zur Hemmung des Wachstums erforderlich ist. Die visuelle Inspektion liefert jedoch nur qualitative Ergebnisse, und Informationen über das Wachstum bei subinhibitorischen Konzentrationen gehen verloren. Dieses Protokoll beschreibt eine Methode zur Messung der Empfindlichkeit von C. albicans gegenüber antimykotischen Peptiden. Durch die Verwendung optischer Dichtemessungen von Kulturen reduziert die Methode den Zeit- und Materialaufwand, der benötigt wird, um quantitative Ergebnisse zum Kulturwachstum bei verschiedenen Peptidkonzentrationen zu erhalten. Die Inkubation des Pilzes mit Peptiden wird in einer 96-Well-Platte unter Verwendung eines geeigneten Puffers durchgeführt, wobei die Kontrollen keine Wachstumshemmung und eine vollständige Wachstumshemmung darstellen. Nach der Inkubation mit dem Peptid werden die resultierenden Zellsuspensionen verdünnt, um die Peptidaktivität zu reduzieren, und dann über Nacht gezüchtet. Nach dem Wachstum über Nacht wird die optische Dichte jeder Vertiefung gemessen und mit den Positiv- und Negativkontrollen verglichen, um die resultierende Wachstumshemmung bei jeder Peptidkonzentration zu berechnen. Die Ergebnisse mit diesem Assay sind vergleichbar mit den Ergebnissen mit der traditionellen Methode der Beschichtung der Kulturen auf Agarplatten, aber dieses Protokoll reduziert den Plastikmüll und den Zeitaufwand für die Zählung der Kolonien. Obwohl sich die Anwendungen dieses Protokolls auf antimykotische Peptide konzentriert haben, wird die Methode auch auf die Untersuchung anderer Moleküle mit bekannter oder vermuteter antimykotischer Aktivität anwendbar sein.

Einleitung

Candida albicans ist ein Mitglied der menschlichen Mikrobiota, die zahlreiche Stellen besiedelt, darunter die Mundhöhle, die Haut, den Magen-Darm-Trakt und die Vagina1. Bei Patienten, die aufgrund von Krankheiten wie dem humanen Immundefizienzvirus (HIV) und immunsuppressiven Behandlungen immungeschwächt sind, kann die Besiedlung von C. albicans zu einer lokalen oder systemischen Candidose führen 2,3. Die Verwendung von derzeit verfügbaren niedermolekularen antimykotischen Therapeutika wie Amphotericin B, Azolen oder Echinocandinen kann durch Löslichkeits- und Toxizitä....

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Protokoll

Die Genehmigung wurde von der University of Maryland, College Park, Institutional Biosafety Committee (IBC) für die Arbeit mit C. albicans in diesem Protokoll (PN 274) eingeholt. In der vorliegenden Studie wurde der C . albicans-Stamm SC5314 (siehe Materialtabelle) verwendet; Es kann jedoch auch jede andere Sorte verwendet werden.

1. Vorbereitung des Puffers, des sterilen Wassers und des Nährmediums

  1. Steriler 0,1 M Natriumphosphatpuffer (NaPB)26 wird bei einem pH-Wert von 7,4 hergestellt und mit sterilem Wasser auf 2 mM und 1 mM verdünnt. Die Herstellung vo....

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Ergebnisse

Die Verwendung von OD600-Messungen zur Quantifizierung der Wachstumsminderung durch antimykotische Peptide spart im Vergleich zum Platieren von Proben und Zählen von KBE erheblich Zeit. Die in diesem Protokoll beschriebene Methode erfordert, dass die Schritte an drei verschiedenen Tagen ausgeführt werden. Am ersten Tag wird ca. 1 h benötigt, um die Puffer und Medien (ohne Sterilisationszeit) vorzubereiten und die Ausgangskultur von C. albicans für die Inkubation über Nacht zu beimpfen. Am zweiten Tag .......

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Diskussion

Dieses Protokoll beschreibt einen effizienten Ansatz zur Gewinnung quantitativer Daten zur antimykotischen Aktivität von AMPs gegen den Pilzerreger C. albicans. Ein gängiger alternativer Ansatz zum Testen von Peptiden und anderen Antimykotika ist die Bouillon-Mikrodilution, die im Standard M2718 des Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) beschrieben ist, aber dieser Standard konzentriert sich auf die Erzielung qualitativer visueller Ergebnisse anstelle von quantitativen Ergebnisse.......

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Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden finanziellen Interessen haben.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde von den National Institutes of Health (R03DE029270, T32AI089621B), der National Science Foundation (CBET 1511718), dem Bildungsministerium (GAANN-P200A180093) und einem Cross-Campus Seed Grant der University of Maryland unterstützt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
96-Well-Platten (runder Boden)VWR10062-902
Absorptions-Mikroplatten-ReaderN/AN/AJedes verfügbare Mikroplatten-Reader ist
ausreichendC. albicans Stamm SC5314ATCC MYA-2876Andere C. albicans können ebenfalls verwendet werden
HämozytometerN/AN/AKann verwendet werden, um eine Standardkurve zu erstellen, die die Zellzahl mit OD600
MikroplattenschüttlerVWR2620-926
Peptid(e)N/AN/APeptide können von jedem zuverlässigen Anbieter kommerziell synthetisiert werden; eine Reinheit von ≥ Die Entfernung von 95 % und Trifluoressigsäuresalz zu Hydrochloridsalz wird empfohlen
Reagenzreservoire für MehrkanalpipettenVWR18900-320Vereinfacht das Pipettieren in Multiwell-Platten mit einer Mehrkanalpipette
Natriumphosphat, zweibasischFisher ScientificBP332-500Zur Herstellung von NaPB
Natriumphosphat, einbasischFisher ScientificBP329-500Zur Herstellung von NaPB
UV-SpektralphotometerN/AN/AJedes verfügbare UV-Spektralphotometer ist ausreichend
YPD-Medium PulverBD Life Sciences242820Kann auch aus Hefeextrakt, Pepton und Dextrose hergestellt werden
in Beziehung setzt

Referenzen

  1. Gulati, M., Nobile, C. J. Candida albicans biofilms: Development, regulation, and molecular mechanisms. Microbes and Infection. 18 (5), 310-321 (2016).
  2. Arya, N. R., Rafiq, N. B. Candidiasis. StatPearls. , StatPearls Publishing. Treasure Island, FL. (2021).
  3. de Oliveira Santos, G. C., et al.....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Tags

Antifungale Peptideoptische DichteWachstumshemmungPeptidquantifizierung96 Well PlatteSeriendilutionkoloniebildende EinheitenHefesuspensionAntifungale Empfindlichkeit