Patient-derived Organoids (PDO) sind eine dreidimensionale (3D) Kultur, die die Tumorumgebung in vitro nachahmen kann. Bei hochgradigem serösem Ovarialkarzinom stellen PDOs ein Modell zur Untersuchung neuartiger Biomarker und Therapeutika dar.
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Patient-derived Organoids (PDO) sind eine dreidimensionale (3D) Kultur, die die Tumorumgebung in vitro nachahmen kann. Bei hochgradigem serösem Ovarialkarzinom stellen PDOs ein Modell zur Untersuchung neuartiger Biomarker und Therapeutika dar.
Organoide sind dynamische 3D-Tumormodelle, die erfolgreich aus patientischem Ovarialtumorgewebe, Aszites oder Pleuraflüssigkeit gezüchtet werden können und bei der Entdeckung neuartiger Therapeutika und prädiktiver Biomarker für Eierstockkrebs helfen. Diese Modelle rekapitulieren die klonale Heterogenität, die Tumormikroumgebung sowie Zell-Zell- und Zell-Matrix-Interaktionen. Darüber hinaus wurde gezeigt, dass sie morphologisch, zytologisch, immunhistochemisch und genetisch mit dem Primärtumor übereinstimmen. So erleichtern Organoide die Erforschung von Tumorzellen und der Tumormikroumgebung und sind Zelllinien überlegen. Das vorliegende Protokoll beschreibt verschiedene Methoden zur Erzeugung von von Patientinnen stammenden Ovarialkarzinom-Organoiden aus Patiententumoren, Aszites und Pleuraflüssigkeitsproben mit einer Erfolgsrate von mehr als 97%. Die Patientenproben werden sowohl durch mechanischen als auch durch enzymatischen Aufschluss in zelluläre Suspensionen getrennt. Die Zellen werden dann mit einem Basalmembranextrakt (BME) plattiert und mit optimierten Wachstumsmedien unterstützt, die Nahrungsergänzungsmittel enthalten, die spezifisch für die Kultivierung von hochgradigem serösem Ovarialkarzinom (HGSOC) sind. Nach der Bildung der ersten Organoide können die PDOs eine Langzeitkultur aufrechterhalten, einschließlich der Passage zur Expansion für nachfolgende Experimente.
Im Jahr 2021 wurde bei etwa 21.410 Frauen in den Vereinigten Staaten neu epithelialer Eierstockkrebs diagnostiziert, und 12.940 Frauen starben an dieser Krankheit1. Obwohl in der Chirurgie und Chemotherapie ausreichende Fortschritte erzielt wurden, entwickeln über 70% der Patienten mit fortgeschrittener Erkrankung eine chemotherapeutische Resistenz und sterben innerhalb von 5 Jahren nach der Diagnose 2,3. Neue Strategien zur Behandlung dieser tödlichen Krankheit und repräsentative, verlässliche Modelle für die präklinische Forschung sind daher dringend erforderlich.
Krebszelllinien und patientenabgeleitete Xenotransplantate (PDX), die aus primären Ovarialtumoren hergestellt werden, sind die wichtigsten Instrumente, die in der Eierstockkrebsforschung verwendet werden. Ein großer Vorteil von Krebszelllinien ist ihre schnelle Expansion. Ihre kontinuierliche Kultur führt jedoch zu phänotypischen und genotypischen Veränderungen, die dazu führen, dass die Krebszelllinien von der ursprünglichen primären Krebstumorprobe abweichen. Aufgrund der bestehenden Unterschiede zwischen der Krebszelllinie und dem Primärtumor haben Arzneimittelassays, die positive Effekte in Zelllinien haben, inklinischen Studien nicht die gleichen Effekte 2. Um diese Einschränkungen zu überwinden, werden PDX-Modelle verwendet. Diese Modelle werden erstellt, indem frisches Eierstockkrebsgewebe in immundefiziente Mäuse implantiert wird. Da es sich um In-vivo-Modelle handelt, ähneln sie den biologischen Eigenschaften des Menschen genauer und sind wiederum prädiktiver für die Ergebnisse von Arzneimitteln. Diese Modelle weisen jedoch auch erhebliche Einschränkungen auf, einschließlich der Kosten, des Zeitaufwands und der Ressourcen, die für ihre Erstellung erforderlich sind4.
PDOs bieten ein alternatives Modell für die präklinische Forschung, das die Einschränkungen sowohl von Krebszelllinien als auch von PDX-Modellen überwindet. PDOs rekapitulieren den Tumor und die Tumormikroumgebung eines Patienten und bieten somit ein in vitro kontrollierbares Modell, das sich ideal für die präklinische Forschungeignet 2,3,5. Diese 3D-Modelle verfügen über Selbstorganisationsfähigkeiten, die den Primärtumor modellieren, was ein Merkmal ist, das ihre zweidimensionalen (2D) Zelllinien-Gegenstücke nicht besitzen. Darüber hinaus wurde gezeigt, dass diese Modelle genetisch und funktionell ihre Muttertumoren repräsentieren und somit zuverlässige Modelle für die Untersuchung neuartiger Therapeutika und biologischer Prozesse sind. Kurz gesagt, sie bieten langfristige Expansions- und Speicherfähigkeiten, die denen von Zelllinien ähneln, umfassen aber auch die Mikroumgebung und die Zell-Zell-Interaktionen, die Mausmodellen innewohnen 4,6.
Das vorliegende Protokoll beschreibt die Erstellung von PDOs aus patienteneigenen Tumoren, Aszites und Pleuraflüssigkeitsproben mit einer Erfolgsrate von mehr als 97%. Die PDO-Kulturen können dann über mehrere Generationen erweitert und zum Testen der Sensitivität der medikamentösen Therapie und prädiktiver Biomarker verwendet werden. Diese Methode stellt eine Technik dar, die verwendet werden könnte, um Behandlungen basierend auf den therapeutischen Reaktionen von PDOs zu personalisieren.
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Alle menschlichen Gewebeproben, die für Forschungszwecke gesammelt wurden, wurden gemäß dem vom Institutional Review Board (IRB) genehmigten Protokoll gewonnen. Die unten beschriebenen Protokolle wurden in einer sterilen menschlichen Gewebekulturumgebung durchgeführt. Die schriftliche Einverständniserklärung wurde von menschlichen Probanden eingeholt. Geeignete Patienten mussten eine Diagnose oder vermutete Diagnose von Eierstockkrebs haben, bereit und in der Lage sein, eine Einverständniserklärung zu unterschreiben, und mindestens 18 Jahre alt sein. Tumorgewebe (bösartiger Primärtumor oder metastasierende Stellen), Aszites und Pleuraflüssigkeit wurden von einwilligenden Patienten zum Zeitpunkt ihres Eingriffs gewonnen. Diese Proben wurden sofort ins Labor transportiert und mit den unten beschriebenen Methoden für die Organoiderzeugung aufbereitet.
1. Medienvorbereitung
2. Ernte von Organoiden aus Aszites und Pleuraflüssigkeit
HINWEIS: Aszites und Pleuraflüssigkeit müssen so schnell wie möglich verarbeitet werden, um die beste Ausbeute an Organoiden zu erzielen. Tauen Sie zuvor aliquotierten BME-, DNase I- und DNase I-Reaktionspuffer (siehe Materialtabelle) auf, indem Sie ihn auf Eis legen, bis der Inhalt verflüssigt ist.

Abbildung 1: Beschichtung von Organoiden von Eierstockkrebs von Patientinnen. Repräsentatives Bild der Organoid-Beschichtung. Aliquote der Organoidmischung werden sorgfältig plattiert, um sicherzustellen, dass sich keine Blasen bilden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
3. Ernte von Organoiden aus Gewebe
HINWEIS: Das Gewebe muss so schnell wie möglich verarbeitet werden, um die beste Ausbeute an Organoiden zu erzielen.

Abbildung 2: Tumorgewebe vor der Dissektion. Repräsentatives Bild von Tumorgewebe, das für die Organoiderzeugung gewonnen wurde. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
4. Passage von Organoiden
HINWEIS: Wenn die Probe konfluent ist, kann jede Organoid-Vertiefung wöchentlich zu zwei neuen Vertiefungen geleitet werden.
5. Einfrieren und Auftauen von Organoiden
6. Einbetten und Erzeugen von formalinfixierten Paraffin-eingebetteten (FFPE) Objektträgern zur Bewertung der Organoidzusammensetzung
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Um PDOs zu erzeugen, wurden die Proben mechanisch und enzymatisch zu Einzelzellsuspensionen aufgeschlossen. Die Zellen wurden dann in BME resuspendiert und mit speziell hergestellten Medien ergänzt (Abbildung 3). Organoide werden in der Regel über einen Zeitraum von 10 Tagen etabliert, danach zeigen sie diskrete Organoide in Kultur (Abbildung 4).
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Eierstockkrebs ist aufgrund seines fortgeschrittenen Stadiums bei der Diagnose sowie der häufigen Entwicklung einer Chemotherapieresistenz extrem tödlich. Viele Fortschritte in der Eierstockkrebsforschung wurden durch die Verwendung von Krebszelllinien und PDX-Modellen erzielt. Es besteht jedoch ein offensichtlicher Bedarf an einem repräsentativeren und erschwinglicheren In-vitro-Modell . PDOs repräsentieren nachweislich die Tumorheterogenität, die Tumormikroumgebung sowie die genomischen und transkriptomischen ...
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Die Autoren haben nichts zu offenbaren.
Wir sind dankbar für die Anleitung von Ron Bose, MD, PhD, und die Unterstützung von Barbara Blachut, MD, bei der Erstellung dieses Protokolls. Wir möchten uns auch bei der School of Medicine der Washington University in der Abteilung für Geburtshilfe und Gynäkologie und der Abteilung für gynäkologische Onkologie, dem Dean's Scholar Program der Washington University und dem Reproductive Scientist Development Program für die Unterstützung dieses Projekts bedanken.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 1 % HEPES | Life Technologies | 15630080 | |
| 1 % Penicillin-Streptomycin | Fisher Scientific | 30002CI | |
| 1,5 mL Eppendorf Röhrchen | Genesee Scientific | 14125 | |
| 10 cm Gewebekulturschale | TPP | 93100 | |
| 10 mL Serologische Pipette | |||
| 100 & Mikro; m Cell Filter | MidSci | 100ICS | |
| 15 mL Zentrifugenröhrchen | Corning | 430052 | |
| 2 mL Cryovial | Simport Scientific | T301-2 | |
| 2% Paraformaldehyd Fixativ | Sigma-Aldrich | ||
| 37 ° C Wasserbad | NEST | 602052 | |
| 3dGRO R-Spondin-1 Conditioner Media Supplement | Millipore Sigma | SCM104 | |
| 6-Well-Platten | TPP | 92006 | |
| 70% Ethanol | Sigma-Aldrich | R31541GA | |
| A83-01 | Sigma-Aldrich | SML0788 | |
| Advanced DMEM/F12 | ThermoFisher | 12634028 | |
| Agar | Lamda Biotech | C121 | |
| B-27 | Life Technologies | 17504044 | |
| Zentrifuge | |||
| Cultrex Typ 2 | R& D Systems | 3533-010-02 | Basalmembran-Extrakt |
| DNase I | New England Bio Labs | M0303S | |
| DNase I Reaktionspuffer | New England Bio Labs | M0303S | |
| EGF | PeproTech | AF-100-15 | |
| FBS | Sigma-Aldrich | F2442 | |
| FGF-10 | PeproTech | 100-26 | |
| FGF2 | PeproTech | 100-18B | |
| gentleMACS C Tubes | Miltenyi BioTech | 130-096-334 | |
| gentleMACS Octo Dissoziator mit Heizelementen | Miltenyi BioTech | 130-096-427 | Wir verwenden das Protokoll des Herstellers. |
| GlutaMAX | Life Technologies | 35050061 | Dipeptid-, L-Alanyl-L-Glutamin-Hämatoxylin |
| und Eosin-Färbeset | Fisher Scientific | NC1470670 | |
| Histoplast Paraffinwachs | Fisher | Scientific 22900700 | |
| Mikrozentrifuge | |||
| Mr. Frosty Gefrierbehälter | Fisher Scientific | 07202363S | |
| N-Acetylcystein | Sigma-Aldrich | A9165 | |
| Nicotinamid | Sigma-Aldrich | N0636 | |
| p1000 Pipette mit Spitzen | |||
| p200 Pipette mit Spitzen | |||
| Pasteurpipetten 9" | Fisher Scientific | 1367820D | |
| PBS | Fisher Scientific | MT21031CM | |
| Pipettierhilfe | |||
| Prostaglandin E2 | R& D Systems | 2296 | |
| Puromycin | ThermoFisher | A1113802 | |
| Rekombinanter Maus-Noggin | PeproTech | 250-38 | |
| Recovery Zellkultur-Einfriermedium | Invitrogen | 12648010 | |
| Lysionspuffer für rote Blutkörperchen | BioLegend | 420301 ROCK-Inhibitor | |
| (Y-27632) | R& D Systems | 1254/1 | |
| SB202190 | Sigma-Aldrich | S7076 | |
| T75 Kolben | MidSci | TP90076 | |
| Gewebekulturhaube | |||
| Gewebeeinbettungskassette | |||
| TrypLE Express | Invitrogen | 12604013 | tierischen Ursprungs freies, rekombinantes Enzym |
| Typ II Kollagenase | Life Technologies | 17101015 | |
| Vortex |
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