Alle Daten stammen von der klinischen Patientin, deren SDR-Operation im BJ Dongzhimen Hospital durchgeführt wurde. Das Protokoll folgt den Richtlinien des Forschungsethikkomitees des Dongzhimen-Krankenhauses und wurde von diesem genehmigt.
ANMERKUNG: Die gesamte Karte des Modellrekonstruktionsprotokolls ist in Abbildung 1 dargestellt. Die hochauflösenden Computertomographie-Daten (HRCT) und die Dixon-Daten sind Rohmaterial für die Modellierung. Die Erstellung des 3D-Modells besteht dann aus der Bildregistrierung und -fusion. Das endgültige digitale 3D-Modell wird mit der PolyJet-Technologie gedruckt, einem hochpräzisen 3D-Druckverfahren, das glatte und genaue Teile aus einer Vielzahl von Materialien herstellt. Um die räumliche Beziehung zwischen Wirbel und Spinalnerv exakt beschreiben zu können, werden HRCT-Daten und Dixon-Bildserien verwendet. Das Dixon-Scanning kann Wasser- und Fetttrennungsbilder identifizieren, in denen die Dixon-Wasserphasen-Bildserie verwendet werden kann, um die Struktur der Spinalnerven zu extrahieren, und die Dixon-in-Phase-Bildserie verwendet werden kann, um die Registrierung der Knochenstruktur zu überprüfen.

Abbildung 1: Die gesamte Karte des Protokolls. Die Forschungsmethodik dieser Studie beinhaltet die Fusion von CT- und Magnetresonanz-Dixon-Sequenzen. Konkret wird die CT-Wirbelstruktur mit der identischen Wirbelstruktur registriert, die in der Dixon-in-Sequenz enthalten ist, gefolgt von einer Fusion mit der Dixon-w-Sequenz für den Spinalnerv. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
1. Datenerhebung und -aufbereitung
- Hochauflösendes CT für Wirbel
HINWEIS: Der Parameterunterschied hängt nicht von der Forschungsmethode ab.- Legen Sie die Datenressourcen von der CT-Gerätestation fest.
HINWEIS: Hier kommt das CT-Gerät SIEMENS-CTAWP73396 zum Einsatz.
- Öffnen Sie die Syngo CT 2012B-Software , um Daten vom Scanprotokoll SpineRoutine_1 zu empfangen. Wählen Sie die Pixelgröße und die Schichtdicke (ST) des Datensatzes aus, um sie an die Größe der Wirbel anzupassen, die im digitalen 3D-Modell dargestellt werden sollen.
- Verwenden Sie einen ST von 1 mm mit einer Matrixgröße von 512 Pixel x 512 Pixel, wobei der Pixelabstand 0,3320 mm beträgt. Die tatsächliche Größe des erreichten 3D-Volumens beträgt 512 x 512 x 204 Voxel.
- Dixon-Sequenz für den Spinalnerv
HINWEIS: In dieser Studie wird ein 1,5-T-MRT-Gerät verwendet.- Stellen Sie die Dixon-Bildauflösung auf 290 Pixel x 320 Pixel, den Pixelabstand auf 0,9375 mm und die Schichtdicke auf 3 mm ein, um genaue Daten zu erhalten.
- Stellen Sie die Wiederholungszeit auf 5.160 ms und die Echozeit auf 94 ms ein.
- Stellen Sie sicher, dass jede gescannte Schicht aus Vier-Phasen-Bildern besteht, nämlich Dixon-in, Dixon-opp, Dixon-F und Dixon-w.
- Bereiten Sie Datenspeicherdateien für die Modellrekonstruktion vor.
HINWEIS: Eine klar definierte Datenspeicherstruktur ist für die Nachverfolgung bequemer.- Erstellen Sie einen Projektordner, der alle Daten des Patienten enthält.
- Bereiten Sie verschiedene Dateipfade für HRCT- und MRT-Dixon-Daten vor, indem Sie verschiedene Ordner für die DICOM-Daten (Digital Imaging and Communications in Medicine) erstellen.
- Erstellen Sie unter dem Projekt einen separaten Ordner für alle Analyseergebnisse.
2. Das digitale 3D-Wirbelmodell
HINWEIS: Alle Teilprozessfunktionen stammen von Software-Tools, deren Eigentum Beijing Intelligent Entropy Science &; Technology Co Ltd. ist.
- Rufen Sie den Dicom2Mat-Unterprozess im MATLAB-Arbeitsplatz auf, um das 3D-Volumen aus den DICOM-Dateien abzurufen, die im HRCT-Datenordner gespeichert sind.
- Nachdem Sie den Dicom2Mat-Unterprozess durchlaufen haben, zeigen Sie jeden Slice innerhalb des 3D-Volumens über die grafische Benutzeroberfläche (GUI) an, wie in Abbildung 2 dargestellt.
- Visualisieren Sie dann die Intensitätsverteilung der HRCT-Daten der Wirbel anhand der hist-Funktion (Abbildung 3).
- Rufen Sie den NoiseClean-Unterprozess auf, um das vom Gerät erzeugte Signalrauschen unter den HRCT-Datendateipfaden zu löschen.
- Verwenden Sie den Unterprozess "Wirbelfunktion" unter demselben Pfad, um das Wirbelmodell zu erhalten, bei dem es sich ebenfalls um ein 3D-Volumen handelt, jedoch nur mit der Knochenstruktur (Abbildung 4). Die Parameter des Hochpassfilters mit einer Intensität von 190 bis 1.656.
3. Das digitale 3D-Spinalnervenmodell
HINWEIS: Dixon-in enthält die Knochenstruktur, während Dixon-w die neuronale Struktur beschreibt.
- Verwenden Sie den Dicom2Mat-Unterprozess in beiden Pfaden der Dixon-in- und Dixon-w-Sequenzen, um deren 3D-Volumen zu erhalten.
- Visualisieren Sie außerdem jede einzelne Schicht, die ein 3D-Volumen darstellt, mithilfe der in Abbildung 5 dargestellten grafischen Oberfläche. Greifen Sie auf diese Visualisierung zu, sobald der Dicom2Mat-Teilprozess abgeschlossen ist.
- Verwenden Sie die Funktion Spinal_Nerve , um das Spinalnervenmodell mit Hochpassfilterparametern zu rekonstruieren, deren Intensität von 180 bis 643 reicht. Da die Signale des Nervs in der Dixon-w-Sequenz sehr hoch sind, extrahieren Sie das 3D-Volumen des Spinalnervs, indem Sie Punkte mit geringer Intensität herausfiltern.
- Wenn der Spinal_Nerve Teilprozess abgeschlossen ist, überprüfen Sie das Modell, das in der in Abbildung 6 gezeigten grafischen Benutzeroberfläche generiert wurde.
4. Registrierung und Verschmelzung
HINWEIS: Die wichtigste Erkenntnis ist, dass die Knochenarchitektur sowohl in der HRCT- als auch in der Dixon-in-Bildgebungssequenz vorhanden ist.
- Kopieren Sie die drei bisher erhaltenen 3D-Volumen in den Dateipfad des Projekts, das Sie in Schritt 3.1 erstellt haben. Die Modelle von HRCT und Dixon-in haben die gleiche Wirbelstruktur, und die Modelle von Dixon-in und Dixon-w haben die gleichen Koordinaten.
- Geben Sie dann die Dateinamen der drei Modelle als Eingabe in den vertebra_fusion-Unterprozess ein, um das Fusionsmodell zu generieren. Dies kann in Abbildung 7 visualisiert werden.
- Die Fusion ist in der Regel gut gelungen. Wenn aus Sicht des Arztes eine Feinabstimmung erforderlich ist, fügen Sie derselben Funktion Koordinatenparameter in alle Richtungen hinzu, um das Fusionsmodell zu korrigieren. Wenn aus klinischer Sicht leichte Fehler bei der Fusion beobachtet werden, verwenden Sie die vertebra_fusion-Funktion , um die Fusionskoordinaten fein abzustimmen. Dieser Prozess beinhaltet Parameteranpassungen an den sechs Dimensionen der Koordinatenrichtung (XYZ-Koordinaten und deren Drehung).
- Erstellen Sie im Projektverzeichnis einen separaten Ordner für die Ausgabe des Ergebnisses des Fusionsmodells.
5. Digitale Modelldateien für den 3D-Druck
HINWEIS: Für die Herstellung des oben genannten digitalen Modells wird eine ausgereifte 3D-Druckvorrichtung mit der Implementierung von Delaunay-Triangulationen verwendet. Hier kam der Stratasys J55 Prime 3D-Drucker zum Einsatz.
- Exportieren Sie die für den 3D-Druck zu verwendenden Fusionsmodelle in den DICOM-Formatsequenzen unter den Dateipfad des Fusionsverzeichnisses. Verwenden Sie den Mat2Dicom-Algorithmus, um den Exportvorgang auszuführen, indem Sie das Fusionsmodell eingeben.
- Öffnen Sie die DICOM-Dateisequenz, die zuvor mit Materialise Mimics V20 exportiert wurde. Um den Exportvorgang durchzuführen, navigieren Sie zum Menü Exportieren auf der Registerkarte Datei und wählen Sie das VRML-Format aus. Der Dateipfad für den Export kann frei an die Anforderungen des Benutzers angepasst werden.
- Da es sich beim transparenten bunten 3D-Druck um eine professionelle Dienstleistung handelt, komprimieren und verpacken Sie die VRML-Dateien und senden Sie sie an den Dienstleister. Das Ergebnis des 3D-Drucks ist in Abbildung 8 dargestellt.