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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Dieses Protokoll bietet eine Methode zur primären Isolierung von murinen T-Zellen und eine Zeitraffermikroskopie der T-Zellmigration unter spezifischen Umweltbedingungen mit quantitativer Analyse.
Die adaptive Immunantwort beruht auf der Fähigkeit einer T-Zelle, als Reaktion auf Krankheitserreger und Fremdkörper durch Blut, Lymphe und Gewebe zu wandern. Die T-Zell-Migration ist ein komplexer Prozess, der die Koordination vieler Signaleingänge aus der Umwelt und lokalen Immunzellen erfordert, einschließlich Chemokinen, Chemokinrezeptoren und Adhäsionsmolekülen. Darüber hinaus wird die Motilität von T-Zellen durch dynamische Umgebungsreize beeinflusst, die den Aktivierungszustand, die Transkriptionslandschaft, die Expression von Adhäsionsmolekülen und vieles mehr verändern können. In vivo macht es die Komplexität dieser scheinbar miteinander verflochtenen Faktoren schwierig, einzelne Signale zu unterscheiden, die zur T-Zell-Migration beitragen. Dieses Protokoll bietet eine Reihe von Methoden, von der T-Zellisolierung bis hin zur computergestützten Analyse, um die T-Zellmigration in Echtzeit unter hochspezifischen Umweltbedingungen zu bewerten. Diese Bedingungen können dazu beitragen, Mechanismen aufzuklären, die die Migration regulieren, unser Verständnis der T-Zell-Kinetik zu verbessern und starke mechanistische Beweise zu liefern, die durch Tierversuche nur schwer zu erlangen sind. Ein tieferes Verständnis der molekularen Wechselwirkungen, die sich auf die Zellmigration auswirken, ist wichtig, um verbesserte Therapeutika zu entwickeln.
T-Zellen sind die Haupteffektoren der adaptiven, antigenspezifischen Immunantwort. Auf Populationsebene sind T-Zellen heterogen und bestehen aus zellulären Untergruppen mit unterschiedlichen spezialisierten Funktionen. Wichtig ist, dass CD8+ T-Zellen die wichtigsten zytolytischen Effektoren des Immunsystems sind, die infizierte oder dysfunktionale Zellen direkt eliminieren1.
Reife CD8+ T-Zellen befinden sich im Gewebe und zirkulieren auf der Suche nach Antigenen durch Blut und Lymphgefäße. Während der Infektion werden T-Zellen mit Antigenen im Blut oder Gewebe präsentiert und fließen schnell in die Milz oder den nächstgelegenen drainierenden Lymphknoten ab, um eine produktive Immunantwort zu starten. In beiden Fällen werden T-Zellen aktiviert, durchlaufen eine klonale Expansion und verlassen das Lymphsystem, um ins Blut zu gelangen, falls dies nicht bereits der Fall ist. Während dieses Prozesses bewirkt die intrazelluläre Signalübertragung die Herunterregulierung der lymphatischen Homing-Rezeptoren und die Hochregulierung zahlreicher Integrin- und Chemokinrezeptoren, die für die gewebespezifische Migration unerlässlich sind2. Letztendlich wird die gerichtete Migration von T-Zellen zu den Infektionsherden durch konvergierende Umweltsignale angetrieben, zu denen auch Integrin- und Chemokin-Signale gehören.
Chemokine können grob in zwei Hauptklassen eingeteilt werden: (1) homöostatische Signale, die für die Differenzierung, das Überleben und die Basalfunktion essentiell sind, und (2) Entzündungssignale wie CXCL9, CXCL10 und CCL3, die für die Chemotaxis benötigt werden. Im Allgemeinen erzeugen Chemokine einen Signalgradienten, der die gerichtete Migration, die sogenannte Chemotaxis, antreibt und zusätzlich die Integrin-Expression1 aktiviert. Die Chemotaxis ist fein reguliert und hochempfindlich, wobei T-Zellen in der Lage sind, auf winzige Änderungen des Gradienten zu reagieren, die sie in eine bestimmte Richtung oder einen bestimmten Ort führen können.
Zusätzlich zu diesen T-Zell-bezogenen Faktoren wird die Migration auch von der Zusammensetzung und Dichte der extrazellulären Matrix (EZM) beeinflusst. Die EZM besteht aus einem dichten Netzwerk von Proteinen, darunter Kollagen und Proteoglykane, die das Gerüst für adhäsive Integrinrezeptoren auf T-Zellen bilden. Integrine sind eine vielfältige Familie von Transmembranproteinen, jedes mit hochspezialisierten Bindungsdomänen und nachgeschalteten Signaleffekten. Die dynamische Expression von Integrinrezeptoren auf der Oberfläche einer T-Zelle ermöglicht eine schnelle Anpassung an ihre sich verändernde Umgebung3. Wichtig ist, dass Integrine die EZM und intrazelluläre Zytoskelett-Aktinnetzwerke verbinden, die zusammenarbeiten, um die für die T-Zellbewegung erforderliche Antriebskraft zu erzeugen.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass die Migrationsmuster je nach Phänotyp der Immunzellen oder Umweltsignalen variieren. Diese komplexen biologischen Prozesse werden durch die Expression von Zytokinen, Chemokinen und Integrinen auf der Oberfläche der T-Zelle, den umgebenden Zellen und dem lokalen, infizierten Gewebe streng reguliert. In vivo können diese Migrationsmechanismen komplex sein und sich aus mehreren additiven Signalen ergeben4. Aufgrund dieser Komplexität kann es unmöglich sein, einen kausalen Zusammenhang zwischen scheinbar ineinandergreifenden Variablen herzustellen. Um dies zu überwinden, gibt es mehrere In-vitro-Ansätze , um spezifische Aspekte der T-Zell-Migration zu untersuchen, wie z. B. die Reaktion auf spezifische Chemokinsignale und die Interaktion zwischen T-Zell-Integrinen und EZM-bindenden Proteinen. Dieses Protokoll befasst sich mit Methoden zur Isolierung und Aktivierung von murinen CD8+ T-Zellen mit In-vitro-Migrationsassays im zweidimensionalen Raum und computergestützten Analysewerkzeugen zur Analyse der spezifischen T-Zellmigration. Diese Verfahren sind für den Benutzer vorteilhaft, da sie keine ausgeklügelten Materialien oder Vorrichtungen erfordern, wie bei einigen anderen Zellmigrationsassays, die in der Literatur beschrieben sind. Die mit diesen Methoden erzeugten Zellmigrationsdaten können auf vereinfachte Weise Hinweise auf Immunantworten liefern, die eine weitere, fundierte Untersuchung in vivo ermöglichen.
Die Tierprotokolle wurden vom University Committee on Animal Resources an der University of Rochester genehmigt. Die Mäuse in dieser Studie wurden im pathogenfreien Raum der Tiereinrichtung der University of Rochester gehalten. Für die vorliegende Studie wurden männliche/weibliche C57BL/6-Mäuse im Alter von 6-12 Wochen (15-30 g) verwendet. Die Isolierung des Gewebes von Mäusen kann auf einem Labortisch mit Handschuhen zum Bedecken der Hände und einer Gesichtsmaske zum Bedecken von Nase und Mund oder in einer Biosicherheitswerkbank durchgeführt werden. Alle Zellkultur- und Plattenvorbereitungen müssen in einer Biosicherheitswerkbank durchgeführt werden. Die in dieser Studie verwendeten Reagenzien und Geräte sind in der Materialtabelle aufgeführt.
1. CD8+ T-Zellreinigung und -aktivierung
2. Anheben der aktivierten CD8+ T-Zellen
3. Zubereitung der Glasschale
4. Vorbereitung der Zellen
5. Zeitraffer-Mikroskopie
6. Softwaregestützte Analyse der T-Zell-Migration
Die Bestätigung der T-Zell-Aktivierung kann durch Durchflusszytometrie erreicht werden, wobei nach einer erhöhten Expression von CD69 und CD44 gesucht wird, die kanonische Marker für die Aktivierung in murinen T-Zellen sind6. Zusätzlich kann die Reinheit der T-Zellpopulation durch Durchflusszytometrie für CD3+ CD8+ T-Zellen bestimmt werden. Diese Methode ergibt >90 % CD8+ T-Zellpopulation.
Die T-Zell-Migration kann mit softwaregestützten Zellverfolgungsprogrammen bewertet werden, die sowohl reproduzierbar als auch auf die Bedürfnisse des Prüfarztes abgestimmt sind. Zu den grundlegenden Parametern, die zur Bestimmung experimenteller Effekte verwendet werden, gehören die zelluläre Geschwindigkeit (Migrationslänge pro einer bestimmten Zeit, um zu bestimmen, wie schnell sich eine Zelle bewegt), die Verschiebung (Migrationsentfernung, eine gerade Linie vom Startpunkt zum Endpunkt, um zu bestimmen, wie weit eine Zelle wandert), die Spurlänge (Migrationsentfernung, die Gesamtlänge des Migrationspfads, um zu bestimmen, wie weit eine Zelle wandert), und mäandernder Index (MI liegt zwischen 0 und 1, um die Geradlinigkeit der Migration zu bestimmen, 1 = gerade). Diese Parameter werden verwendet, um Migrationsunterschiede zwischen naiven und aktivierten CD8+ T-Zellen zu bewerten, die entlang von ICAM-1-beschichtetem Glas mit CXCL12 kriechen (Abbildung 1). Eine erhöhte durchschnittliche Geschwindigkeit, Verschiebung und ein erhöhter Mäanderindex wurden bei aktivierten CD8+ T-Zellen im Vergleich zu naiven Zellen beobachtet, was darauf hindeutet, dass aktivierte T-Zellen eine erhöhte Migrationsfähigkeit aufweisen. Ebenso kann mit diesen Methoden der Einfluss verschiedener Chemokine auf zelluläre Migrationsmuster aufgeklärt werden. Zum Beispiel zeigen aktivierte CD8+ T-Zellen eine erhöhte Migration in Gegenwart von CXCL12, aber nicht von CCL2 oder CCL22, und die Migration nimmt dosisabhängig bis zu einer Sättigungskonzentration zu (Abbildung 2). Darüber hinaus ermöglicht die softwaregestützte Zellverfolgung die Charakterisierung der individuellen Zellmigration, was ein Verständnis der Auswirkungen einzelner Liganden auf das Verhalten von T-Zellen ermöglicht. Repräsentative Zellverläufe sind in Abbildung 3 zu sehen.
Zusammengenommen unterstützen diese Daten die Wirksamkeit der aktuellen Methoden, indem sie bestätigen, dass wir (1) die Zellmigration auf individueller Zellbasis verfolgen und (2) Unterschiede in der Migration von CD8+ T-Zellen basierend auf dem Aktivierungsstatus und in Gegenwart verschiedener Chemokine und Adhäsionsmoleküle unterscheiden können. Dieser Assay ist ein entscheidender Schritt bei der Entschlüsselung komplexer Signalmechanismen und der Information über fokussierte In-vivo-Experimente , die die biologischen Beiträge spezifischer Signale auf zelltypspezifische Weise weiter untersuchen können.

Abbildung 1: In vitro Assays für naive und aktivierte CD8+ T-Zellmigration. Naive oder CD3/CD28-aktivierte CD8+ T-Zellen der Maus durften 10 Minuten lang auf ICAM-1 plus CXCL12 migrieren. Geschwindigkeit, Verschiebung und Mäanderindex der Zellmigration wurden mittels Zeitraffermikroskopie und Volocity analysiert. Jede Gruppe hat 36 einzelne T-Zellen (Mittelwert ± SEM). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: In vitro Assays zur Chemokin-abhängigen Migration von aktivierten CD8+ T-Zellen. CD3/CD28-aktivierte CD8+ T-Zellen der Maus durften auf ICAM-1 plus einem indizierten Chemokin migrieren. Die Verhältnisse der Anzahl der Zellen, die 20 min lang mehr als 50 μm kriechen (prozentual von der Gesamtmenge), wurden in einem Sichtfeld bestimmt. Ein einzelner Assay analysierte >10 Zellen (n = 3 Assays pro Gruppenmittelwert ± SEM). Ungekoppelter t-Test, *p< 0,05 im Vergleich zur Kontrolle. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Migrationsspuren von aktivierten CD8+ T-Zellen auf ICAM-1 plus CXCL12 für 20 min. Jede farbige Linie zeigt die Zugbahn jeder T-Zelle in einer Richtung vom Punkt der Zelle in die entgegengesetzte Richtung an. In diesem speziellen Assay wanderten 24 von 38 Zellen in einer signifikanten Länge (mindestens dem Abstand ihrer Zellbreite nach unserer Definition). T-Zellen wanderten in unterschiedlich langen Abständen, was darauf hindeutet, dass sich jede Zelle in einem anderen Aktivierungs- oder Priming-Status befand. Alle wandernden Zellen bewegten sich in unterschiedliche Richtungen, unter der Bedingung, dass die Oberfläche gleichmäßig beschichtet war. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Die Autoren erklären, dass alle Recherchen und die Erstellung des Manuskripts in Abwesenheit von kommerziellen oder finanziellen Beziehungen durchgeführt wurden, die als potenzieller Interessenkonflikt ausgelegt werden könnten.
Dieses Protokoll bietet eine Methode zur primären Isolierung von murinen T-Zellen und eine Zeitraffermikroskopie der T-Zellmigration unter spezifischen Umweltbedingungen mit quantitativer Analyse.
Wir danken früheren und aktuellen Mitgliedern des Kim-Labors, die im Laufe der Zeit zur Entwicklung dieser Protokolle beigetragen haben. Repräsentative Daten wurden durch P01 AI102851/AI/NIAID NIH HHS/Vereinigte Staaten und P01 HL018208/HL/NHLBI NIH HHS/Vereinigte Staaten ermöglicht. Diese Veröffentlichung wurde zum Teil durch die Fördernummer T32 ermöglicht, die GM135134 des Institutional Ruth L. Kirschstein National Research Service Award vergeben wurde.
| 10 cm Schale | Corning | 353003 | oder gleichwertig |
| 15 mL konisches Röhrchen | ThermoFisher | 339650 | oder gleichwertig |
| 1x DPBS | Gibco | 14190144 | ohne Calcium und ohne Magnesium |
| 6-Well-Platte nicht TC-behandelt | Corning | 3736 | oder gleichwertig |
| 70 & Mikro; m Zellsieb | FisherScientific | 352350 | oder gleichwertig |
| ACK Lysing Puffer | ThermoFisher | A1049201 | oder gleichwertige |
| Allegra 6KR Zentrifuge | ThermoScientific | sorvall 16R mit tx400 3655 Rotor und Eimer | oder gleichwertiges |
| Beta Mercaptoethanol | Sigma | M3148 | oder gleichwertig |
| CellTrace Violet | ThermoFisher | C34571 | oder gleichwertig |
| Zentrifuge | ThermoScientific | Sorvall ST 16R | oder gleichwertig |
| Kollagen (IV) | Corning | 354233 | oder gleichwertige |
| DeltaT-Kulturschale .17 mm dickes Glas klar | Bioptechs | 04200417C | |
| Dynabeads Schafe Anti-Ratte | IgG Invitrogen | 11035 | |
| DynaMag 15 Magnet | ThermoFisher Scientific | 12301D | oder gleichwertig |
| Easy sep Maus T-Zell-Isolationskit | Stammzelle | 19851 | |
| FBS | SigmaAldrich | F2442-500ML | oder gleichwertig |
| Fibronektin | SigmaAldrich | 10838039001 | oder gleichwertig |
| Fidschi | http://fiji.sc/ | Weblink | |
| Filterwürfel | Nikon oder Olympus | ||
| GK1.5 | ATCC | TIB-207 | |
| HEPES | ThermoFisher | 15630080 | oder gleichwertige |
| HQ CCD-Kamera | CoolSNAP | oder gleichwertig | |
| ImageJ | http://imagej.nih.gov/ij/h | Weblink | |
| ImageJ automatisches Tracking-Plug-in | http://imagej.net/TrackMate | Weblink | |
| ImageJ manuelles Tracking plug in | https://imagej.nih.gov/ij/plugins/track/track.html | weblink | |
| L-15 | Verschiedenes | Siehe Materialien | Medium Rezept: Leibovitz' s L-15 Medium ohne Phenolrot (Gibco) ergänzt mit 1-5 g/L Glukose |
| Liebovitz's L-15 Medium, kein Phenolrot | ThermoFisher | 21083027 | |
| Luer Lok Einwegspritze | Fisher Scientific | 14-955-459 | oder gleichwertig |
| Lymphozytentrennmedium | Corning | 25-072-CI | oder gleichwertig |
| M5/114 | ATCC | TIB-120 | |
| MEM Nicht-essentielle Aminosäuren | ThermoFisher | 11140050 | oder gleichwertig |
| Mikroskop-Heizsystem | Okolab | okolab.com | Sonderanfertigungen verfügbar |
| Millicell EZ Objektträger | Millipore | C86024 | |
| Mojosort Maus CD8+ Naï ve T-Zell-Isolationskit | Biolegend | 480043 | |
| Maus E-Cadherin | R& D systems | 8875-EC-050 | oder gleichwertig |
| Chirurgisches Dissektionsset für Mäuse | Fisher Scientific | 13-820-096 | oder gleichwertige |
| NIS-Elemente | Nikon | Software | |
| non-TC 24wp | Corning | 353047 | oder gleichwertiges |
| Penicillin-Streptomycin | ThermoFisher | 15140122 | oder gleichwertiges |
| Protein A | ThermoFisher Scientific | oder gleichwertig | |
| R9 | Verschiedene | Siehe Materialien | Medium Rezept: RPMI 1640x ergänzt mit 10 % FBS, 1 % Antibiotikum-Antimykotikum (Gibco), 20 mM HEPES-Puffer (Gibco), 1 % MEM nicht-essentielle Aminosäuren (Gibco), 50 μ M β-Mercaptoethanol (Sigma-Aldrich) |
| Rekombinante Maus ICAM-1 Fc Chimäre | R& D systems | 796-IC-050 | oder gleichwertig |
| Rekombinante Maus IL2 | Biolegend | 575410 | oder gleichwertig |
| RPMI 1640x | ThermoFisher | 11875093 | oder gleichwertige |
| T-Pins | Fisher Scientific | S99385 | oder gleichwertig |
| TE2000-U Mikroskop | Nikon | oder gleichwertig | |
| Verschiedene rekombinante Maus Chemokin | R& D-Systeme | oder gleichwertige | |
| VCAM-1 Fc-Chimäre | F& D systems | 643-VM-050 | oder gleichwertig |
| Volocity | PerkinElmer | Software |