Das vorliegende Protokoll beschreibt pH-Messungen in aus menschlichem Gewebe gewonnenen Magenorganoiden unter Verwendung von Mikroelektroden zur raumzeitlichen Charakterisierung der intraluminalen Physiologie.
Methodenartikel
Das vorliegende Protokoll beschreibt pH-Messungen in aus menschlichem Gewebe gewonnenen Magenorganoiden unter Verwendung von Mikroelektroden zur raumzeitlichen Charakterisierung der intraluminalen Physiologie.
Die Optimierung und detaillierte Charakterisierung von gastrointestinalen Organoidmodellen erfordert fortschrittliche Methoden zur Analyse ihrer luminalen Umgebungen. In dieser Arbeit wird eine hochgradig reproduzierbare Methode zur präzisen Messung des pH-Werts in der Lumina von menschlichen 3D-Magenorganoiden mittels mikromanipulatorgesteuerter Mikroelektroden vorgestellt. Die pH-Mikroelektroden sind im Handel erhältlich und bestehen aus abgeschrägten Glasspitzen mit einem Durchmesser von 25 μm. Für Messungen wird die pH-Mikroelektrode in das Lumen eines Organoids (>200 μm) vorgeschoben, das in Matrigel suspendiert ist, während eine Referenzelektrode in der Kulturplatte im umgebenden Medium eingetaucht ist.
Durch die Verwendung solcher Mikroelektroden zur Profilierung von Organoiden, die aus dem menschlichen Magenkörper stammen, zeigen wir, dass der luminale pH-Wert in jeder Kulturvertiefung bei ~7,7 ± 0,037 relativ konstant ist und dass kontinuierliche Messungen von mindestens 15 Minuten durchgeführt werden können. Bei einigen größeren Organoiden zeigten die Messungen einen pH-Gradienten zwischen der Epitheloberfläche und dem Lumen, was darauf hindeutet, dass pH-Messungen in Organoiden mit hoher räumlicher Auflösung durchgeführt werden können. In einer früheren Studie wurden Mikroelektroden erfolgreich zur Messung der luminalen Sauerstoffkonzentration in Organoiden eingesetzt, was die Vielseitigkeit dieser Methode für Organoidanalysen demonstriert. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Protokoll ein wichtiges Werkzeug für die funktionelle Charakterisierung des komplexen luminalen Raums innerhalb von 3D-Organoiden darstellt.
Organoide - multizelluläre Miniaturstrukturen, die aus Stammzellen gewonnen werden - haben unsere Fähigkeit, die menschliche Physiologie zu untersuchen, revolutioniert und beginnen, Tiermodelle zu ersetzen, selbst in regulatorischen Umgebungen1. Seit der Erstbeschreibung von Darmorganoiden durch Sato et al. im Jahr 2009 ist die Organoid-Technologie immens populär geworden2. Eine große Anzahl von Studien hat die zelluläre Zusammensetzung und Funktion von Organoidmodellen sehr detailliert charakterisiert 3,4,5,6. Der luminale Raum dieser multizellulären 3D-Strukturen ist jedoch weitgehend undefiniert 7,8. Das Lumen ist der zentrale Hohlraum von Organoiden, die aus Schleimhautgeweben gewonnen werden und von den apikalen Anteilen polarisierter Epithelzellen umgeben sind. Da zelluläre Sekretion und Absorption überwiegend an der apikalen Epitheloberfläche stattfinden, wird die luminale Mikroumgebung von Organoiden durch diese wichtigen physiologischen Prozesse gesteuert. Die derzeit verwendeten Organoidmodelle zeigen Variationen in den Signalmustern der Zellen, der Gesamtstammzelle, den Gradienten der Metabolitenkonzentration und den Umweltbedingungen9. Das Verständnis der organoiden luminalen Physiologie ist daher für die genaue Modellierung der Organfunktion und -pathologie notwendig. Leider behindert die relative Unzugänglichkeit des Lumens die funktionelle Analyse der luminalen Physiologie in 3D-Organoidenerheblich 10.
Die Fähigkeit, pH-Profile zu untersuchen, ist besonders wichtig im Magen, der dafür berüchtigt ist, den steilsten Protonengradienten im Körper zu haben, der von etwa 1-3 im Lumen bis nahezu neutral am Epithelreicht 11,12,13. Es gibt nach wie vor eine erhebliche Lücke in unserem Verständnis der mikroskaligen Aufrechterhaltung des pH-Gradienten des Magens und der Bedeutung von Organoidmodellen bei der Rekapitulation dieses dynamischen Milieus über die Magenschleimschicht. Traditionelle Ansätze zur Analyse des pH-Werts von Organoiden beinhalten die Verwendung von pH-empfindlichen Farbstoffen, bei denen es sich um fluoreszierende oder kolorimetrische Indikatoren handeln kann. McCracken et al. verwendeten eine luminale Injektion von SNARF-5F - einem ratiometrischen pH-Indikator - in Organoide, um einen Abfall des luminalen pH-Werts als Reaktion auf die Histaminbehandlung zu analysieren. Solche Farbstoffe können in die Nährmedien eingearbeitet werden, was eine nicht-invasive Überwachung des pH-Werts in Echtzeit ermöglicht. pH-empfindliche Farbstoffe erfordern nicht nur komplexe Kalibrierschritte, die zu einer schlechten Zuverlässigkeit und Genauigkeit bei Messungen beitragen, sondern solche Farbstoffe neigen auch dazu, innerhalb spezifischer Nachweisbereiche zu arbeiten, die möglicherweise nicht repräsentativ für den gesamten pH-Bereich innerhalb der interessierenden Mikroumgebung sind14,15. Es könnte jedoch als sinnvoll angesehen werden, Indikatorfarbstoffe für Bestätigungsversuche zu verwenden. Optische Nanosensoren, die fluoreszierende optodenbasierte pH-Sensoransätze verwenden, wurden ebenfalls entwickelt. Solche Sensortechniken erfordern jedoch mikroskopische Bildgebung und sind auch anfällig für Photobleichung, Phototoxizität sowie Bildgebungsverzerrungen16,17. Darüber hinaus haben Brooks et al. 3D-gedruckte Multiwell-Platten mit Mikroelektroden entwickelt, auf denen Organoide plattiert werden können18. Dieser Ansatz erlaubt jedoch keine Messungen direkt im Inneren des Organoid-Lumens.
Elektrodenbasierte pH-Messungen können im Vergleich zu anderen Methoden eine verbesserte Genauigkeit erreichen und eine Echtzeit-pH-Überwachung ermöglichen. Darüber hinaus ermöglichen pH-Elektroden, die an Mikromanipulatoren montiert sind, eine überlegene räumliche Auflösung von pH-Messungen, da die genaue Position der Elektrodenspitze fein gesteuert werden kann. Dies ermöglicht eine höchstmögliche Flexibilität und Reproduzierbarkeit bei der Analyse von Organoidmodellen. Bei den hier verwendeten Elektroden handelt es sich um miniaturisierte pH-Mikroelektroden, die auf der Grundlage der Diffusion von Protonen durch selektives pH-Glas arbeiten, das einen dünnen Platindraht umgibt. Die Mikroelektrode wird mit einer externen Ag-AgCl-Referenzelektrode verbunden und anschließend mit einem hochohmigen Millivolt-Messgerät verbunden. Das elektrische Potential zwischen den beiden Elektrodenspitzen, wenn es in dieselbe Lösung getaucht wird, spiegelt den pH-Wert der Lösung19 wider. Solche Microprofiling-Systeme wurden bei der metabolischen Analyse von Biofilmen20,21, planktonischen Algen22, menschlichen Sputumproben23 und sogar in mesenchymalen Stammzell-Sphäroiden24 eingesetzt. Sowohl unser Labor als auch Murphy et al. haben zuvor mikromanipulatorgesteuerte O2 -Mikroelektroden verwendet, um die Sauerstoffkonzentrationen in den luminalen Räumen von Organoiden zu bewerten. Murphy et al. kombinierten diese Methode mit mathematischer Modellierung, um einen Sauerstoffgradienten innerhalb ihrer Sphäroide aufzudecken. Unsere Gruppe war in der Lage, einen reduzierten luminalen Sauerstoffgehalt in gewebeabgeleiteten Magenorganoiden im Vergleich zur umgebenden extrazellulären Matrixzu finden 25.
Hier stellen wir eine detaillierte Methode für die manuelle Mikroelektrodenprofilierung des luminalen pH-Werts in Organoiden des sphärischen Gastrointestinaltrakts vor, die ein verbessertes physiologisches Verständnis ihrer komplexen luminalen Mikroumgebung ermöglicht. Wir gehen davon aus, dass diese Technik der Erforschung der Physiologie von Organoiden durch hochauflösende Echtzeitmessungen des pH-Werts auf der Mikroskala eine neue Dimension hinzufügen wird. Darüber hinaus könnte das folgende Protokoll leicht für die Analyse von O2, N2O, H2, NO, H2S, Redox und Temperatur in verschiedenen Arten von Organoidmodellen angepasst werden. Physiologisches Profiling dient als wertvolles Instrument zur Optimierung der Bedingungen von Organoidkulturen, um In-vivo-Umgebungen besser nachzuahmen und dadurch die Relevanz und den Nutzen von Organoidmodellen in der biomedizinischen Forschung zu erhöhen.
Dieses Protokoll erfordert 3D-Organoide mit einem Durchmesser von mindestens 200 μm, die ein ausgeprägtes Lumen haben und in eine künstliche extrazelluläre Matrix (ECM, z. B. Matrigel) eingebettet sind. Humanes Magengewebe für die Organoid-Gewinnung wurde mit Genehmigung des Institutional Review Board der Montana State University und mit Einverständniserklärung von Patienten gewonnen, die sich bei Bozeman Health einer oberen Endoskopie unterziehen (Protokoll # 2023-48-FCR, zu D.B.) oder als befreite Proben des ganzen Magens oder des Schlauchmagens aus dem National Disease Research Interchange (Protokoll #DB062615-EX). Informationen über die für diese Studie verwendeten Organoidlinien und Durchgangsnummern sind in Tabelle 1 enthalten, und die Medienzusammensetzung ist in Tabelle 2 aufgeführt. Siehe zuvor veröffentlichte Protokolle für die Erzeugung und Aufrechterhaltung von gastrointestinalen Organoidlinien 6,26,27.
1. Vorbereitung von humanen Magenorganoiden für die Erstellung von pH-Profilen
2. Auspacken und Kalibrieren von Mikroelektroden
HINWEIS: Um Messungen im Mikromaßstab zu ermöglichen, wird zusätzlich zur pH-Sensor-Mikroelektrode eine separate Referenzelektrode verwendet, anstatt ein integriertes (und damit sperrigeres) Design zu verwenden. Sowohl die pH-Mikroelektrode als auch die Referenzelektrode müssen nass gelagert werden. Lassen Sie die Luft nicht länger als 10 Minuten am Stück auskommen. Bestimmen Sie die geeignete Spitzengröße für die Anwendung. Hier haben wir eine potentiometrische pH-Mikroelektrode mit einem abgeschrägten Spitzendurchmesser von 25 μm verwendet.
3. Erstellung von pH-Profilen menschlicher Magenorganoide
HINWEIS: Das folgende Protokoll wird für Rechtshänder beschrieben. VORSICHT: Deaktivieren Sie alle Energiesparoptionen auf Ihrem PC, da laufende Messungen unterbrochen werden, wenn der PC in den Energiesparmodus wechselt.
4. Motorisierte Profilierung (optional)
ANMERKUNG: Diese Option erfordert einen Mikromanipulator, der auf einem mechanischen Motortisch montiert ist, der schließlich von einer Computersoftware über eine Motorsteuerung31 gesteuert wird.
5. Reinigung der Elektroden
6. Lagerung von Elektroden
HINWEIS: Beide Elektroden sind bei Raumtemperatur an einem Ort mit geringer Aktivität zu lagern, sicher vor versehentlicher Beschädigung.
7. Methylrot-Injektion (fakultativ)
HINWEIS: Methylrot ist ein kolorimetrischer Indikatorfarbstoff, der zur Validierung der Mikroelektrodenmessungen verwendet werden kann.
Die Sekretion von Säure ist eine entscheidende Funktion des menschlichen Magens. Inwieweit die Säuresekretion in Organoiden modelliert werden kann, ist jedoch noch umstritten 6,32,33,34. Aus diesem Grund haben wir das oben beschriebene Protokoll entwickelt, um die Säureproduktion in Magenorganoiden genau zu messen. Insbesondere verwendeten wir nicht stimulierte Organoide aus adulten Stammzellen, die unter Standardexpansionsbedingungen kultiviert worden waren, die mehrmals durchlaufen worden waren, was zu einem Verlust von parietalen Zellen führte35. Daher war das Vorhandensein von säuresezernierenden Parietalzellen und eine aktive Säurefreisetzung in unserem Modellsystem nicht zu erwarten.
Für unsere Experimente haben wir Organoide mit Durchmessern zwischen 200 μm und 1.000 μm verwendet, die auf Glasbodenschalen ausgesät wurden. Zunächst haben wir zwei verschiedene Spitzengrößen für die Mikroelektroden getestet – eine pH-25 mit einem Spitzendurchmesser von 25 μm und eine pH-50 mit einem Spitzendurchmesser von 50 μm. Wie in Abbildung 2A gezeigt, gab es keinen signifikanten Unterschied zwischen den Messungen mit den kleineren und den größeren Spitzen. Interessanterweise war der Ausgangs-pH-Wert in den Organoiden bei ~pH 8 tendenziell leicht alkalisch. Mit der 25 μm pH-25-Spitze bewerteten wir als nächstes die Variation des luminalen pH-Werts innerhalb verschiedener zehn Organoide, die auf derselben Kulturplatte aufbewahrt wurden, wobei drei Messungen von jedem Organoid durchgeführt wurden (Abbildung 2B). Innerhalb einer Platte zeigte der luminale pH-Wert einzelner Organoide nur geringe, nicht signifikante Schwankungen (8,16 ± 0,12; p ≥0,0445-0,99) (Abbildung 2B). Wir verglichen auch intraluminale pH-Messungen innerhalb von fünf verschiedenen Organoidlinien mit Passagen von 3 bis 16 (Abbildung 2C). Auch hier fanden wir konsistente pH-Messungen innerhalb jeder Kultur, aber eine signifikante Variabilität zwischen den Organoidlinien. Der luminale pH-Wert blieb jedoch im Allgemeinen zwischen pH 7,3 und pH 8,2, innerhalb einer Größenordnung, und es gab keinen offensichtlichen Trend für den durchschnittlichen pH-Wert, wenn man die Zahlen der frühen und späten Passage verglich (Abbildung 2C). Als nächstes fragten wir, ob der pH-Wert des Organoid-Lumens in direktem Zusammenhang mit dem pH-Wert des organoiden Expansionsmediums und der extrazellulären Matrix (ECM) steht. Der Vergleich zwischen dem Medium, der die Organoide umgebenden EZM und dem Organoidlumen ergab signifikante Unterschiede im pH-Wert, wobei der luminale pH-Wert der Organoide niedriger war als der der EZM und der EZM-pH-Wert niedriger als der der umgebenden organoiden Expansionsmedien (Abbildung 2D), was darauf hindeutet, dass der luminale pH-Wert der Organoide physiologisch relevant war und nicht direkt durch die Kulturumgebung bestimmt wurde. In sechs unabhängigen Experimenten haben wir einen durchschnittlichen luminalen pH-Wert gemessen, der mit 7,13 ± 0,09 nahezu neutral war.
Ein motorisierter Mikromanipulator wurde verwendet, um pH-Messungen des Organoid-Lumens mit höherer räumlicher Auflösung zu erhalten. Dieser Ansatz ist relevant, wenn der pH-Wert oder andere Gradienten innerhalb des mit Schleim gefüllten Organoidlumen29 aufgezeichnet werden müssen. Abbildung 2E zeigt zwei repräsentative Reihen von pH-Messungen in großen Organoiden (>1.000 μm Durchmesser), die den Eintrittspunkt in jedes Organoid zeigen und in einer Tiefe von ~800 μm enden. Da die beiden profilierten Organoide nicht den gleichen Durchmesser hatten, sind die Messungen nicht sofort vergleichbar. Unabhängig davon zeigen wir Hinweise auf einen leichten pH-Gradienten von Δ0,6 zwischen der Epitheloberfläche und dem tieferen Organoidlumen (Abbildung 2E). Um die Machbarkeit von pH-Messungen in den Organoiden im Laufe der Zeit zu bestimmen, die Messungen des Behandlungsansprechens in Echtzeit ermöglichen würden, zeichneten wir den intraluminalen pH-Wert in einem repräsentativen Organoid für etwa 20 Minuten auf und stellten fest, dass der Messwert nach einer anfänglichen Anpassungsphase sehr konsistent blieb (Abbildung 2F). Um die luminalen pH-Messungen mit einer unabhängigen Methode zu validieren, verwendeten wir einen pH-sensitiven kolorimetrischen Farbstoff (Methylrot), den wir mit einem Mikromanipulator-montierten Nanoliter-Autoinjektor in das Organoid-Lumen injizierten (Abbildung 2G). Die gelbe Färbung des Farbstoffs bestätigte, dass das Organoid-Lumen einen pH-Wert von >6,2 aufwies, was mit den Mikroelektrodenmessungen übereinstimmte, die einen nahezu neutralen pH-Wert zeigten. Insgesamt verdeutlichen diese repräsentativen Ergebnisse die Machbarkeit und Reproduzierbarkeit von Mikroelektroden-basierten pH-Messungen in Organoidkulturen.

Abbildung 1: Überblick über die Methode. (A) Schematische Darstellung des Profilierungsaufbaus. Die Mikroelektrode in Abbildung 1A stammt von der Unisense-Website. 36 (B) Repräsentatives Bild einer Organoidkultur, die für die Profilierung bereit ist, der umgebenden EZM und des umgebenden Mediums (Maßstabsbalken = 5 mm). (C) Beispiel für die korrekte Positionierung der Mikroelektrode zur Vorbereitung der Organoid-Sondierung (Maßstabsleiste = 500 μm). Abkürzung: ECM = extrazelluläre Matrix. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Validierung der Mikrosensor-Profilierung in menschlichen Magenorganoiden. (A) Vergleich von Messungen des mittleren Lumen-pH-Werts mit 25 μm (pH-25) und 50 μm (pH-50) Mikroelektrodenspitzen. Daten von 10 einzelnen Organoiden, jedes aus einem einzigen repräsentativen Experiment. (B) Es wurden drei Wiederholungs-pH-Messungen für 10 einzelne Organoide durchgeführt. Einfache ANOVA mit mehreren Vergleichen (p = 0,1229). (C) pH-Messungen, die mit einer pH-25-Elektrode durchgeführt wurden, sind innerhalb jeder von fünf Organoidlinien, die bei unterschiedlichen Durchgangszahlen analysiert wurden, konsistent; 4-10 Organoide gemessen pro Linie, basierend auf Größe und Verfügbarkeit. Einfache ANOVA mit mehreren Vergleichen (p < 0,0001). (D) pH-Messungen in Magenorganoiden und dem umgebenden Matrigel und Medium (n = 6 unabhängige Experimente). Messungen durch Penetration von Magenepithelorganoiden mit einem pH-25. Jeder Datenpunkt ist der Mittelwert von 10 einzelnen pH-Messungen innerhalb eines einzigen Organoids. Einfache ANOVA (p < 0,0001). (E) Epithel-zu-Lumen-pH-Profile von zwei repräsentativen Organoiden unter Verwendung eines motorisierten Mikromanipulators. (F) Stabilität des pH-Werts über die Zeit (~19,8 min) in einem repräsentativen Organoid. (G) Mikroinjektion von Methylrot, pH-Indikatorfarbstoff und HCl in das Organoidlumen des Magens. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
| Spender | |||||
| Abbildung | Linie | Durchgang | Sex | Alter | Ethnizität |
| 2A | 35 | 6 | F | 40 | B |
| 2B | 7 | 15 | F | 26 | B |
| 7 | 4 | F | 26 | B | |
| 1 | 16 | F | 45 | C | |
| 34 | 3 | F | 44 | Unbekannt | |
| 35 | 6 | F | 40 | B | |
| 2C | 7 | 15 | F | 26 | B |
| 2D | 36 | 1 | Unbekannt | ||
| 7 | 5 | F | 26 | B | |
| 37 | 1 | Unbekannt | |||
| 31 | 3 | F | 45 | H | |
| 7 | 9 | F | 26 | B | |
| 7 | 4 | F | 26 | B | |
| 2E | 10 | 15 | F | 43 | Unbekannt |
| 2F | 34 | 3 | F | 33 | C |
| 2G | 7 | 5 | F | 26 | B |
Tabelle 1.
| Organoides Expansionsmedium für den menschlichen Magen (L-WRN) | |
| L-WRN konditioniertes Medium | 50% |
| Erweitertes DMEM/F12 | 37% |
| Fötales Rinderserum | 10% |
| Penicillin/Streptomycin | 1% |
| L-Glutamin | 1% |
| Gentamycin | 0.10% |
| Amphotericin B | 0.10% |
| HEPES-Puffer | 0.40% |
| Nr. Y-27632 | 0.10% |
| Nr. SB-431542 | 0.10% |
Tabelle 2.
Ergänzende Abbildung S1: Expression von Ionentransportern in menschlichen Magenorganoiden. Relative Kopienzahlen normalisiert auf 18S rRNA. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung S2: Menschliches Magenorganoid mit deformierter Architektur nach Punktion mit der pH-Mikrosensorsonde. Maßstabsleiste = 1 mm. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzendes Video S1: Erfolgloser Profilierungsversuch in einer Magenorganoidkultur. Die 25 μm pH-Mikroelektrode wird manuell in Richtung des interessierenden Organoids vorgeschoben. Nach einem fehlgeschlagenen Versuch aufgrund einer Fehleinschätzung des Winkels wird ein anderer Winkel versucht und es zeigt sich, dass dem Organoid die strukturelle Integrität fehlt, um profiliert zu werden (die sphärische Struktur ist nicht stabil und verformt sich beim Eindringen in die Elektrode). Der Benutzer leitet dann um, um ein anderes Organoid zu versuchen. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Der eingeschränkte Zugang zum luminalen Raum von Organoiden hat unser Verständnis der physiologischen Dynamik dieser Mikroumgebung stark eingeschränkt. Ein zuverlässiges Werkzeug für funktionelle Analysen der luminalen Physiologie wird unsere Fähigkeit erweitern, Organoide als In-vitro-Modelle für die Physiologie, Pharmakologie und Krankheitsforschung zu nutzen. Organoide sind hochgradig abstimmbare, physiologisch relevante Modelle mit dem zusätzlichen Potenzial, die genetische Variabilität innerhalb der menschlichen Population zu replizieren. Bestehende Methoden zur pH-Messung im Inneren des Organoidlumens verwenden pH-empfindliche Farbstoffe oder Nanopartikel, Methoden, die häufig mit Fluoreszenzmikroskopie oder Spektroskopie gekoppelt werden müssen 16,17,37. Das beschriebene mikrosensorbasierte Profiling-Verfahren bietet einen neuen Weg, um den intraluminalen pH-Wert von gastrointestinalen Organoiden mit neuer räumlicher Präzision zu messen. Unsere Methode zeigt eine konsistente und zuverlässige Messung des gastrointestinalen luminalen pH-Werts des Organoids sowie den Nachweis eines pH-Gradienten. In unveröffentlichten Experimenten haben wir die Expression der Gene der SLC-Familie SLC4A2 und 26A7 bestätigt, von denen bekannt ist, dass sie für die Bikarbonatsekretion verantwortlich sind, sowie von SLC9A3, 9A4 und 9A8, die für den Protonenaustausch verantwortlich sind (Ergänzende Abbildung S1)38,39,40,41. Unsere Studien deuten auf eine Dominanz der Bikarbonatsekretion und einen Mangel an Parietalzellen in unseren Organoiden hin, was die Alkalinität erklären könnte.
Es ist darauf zu achten, dass die verwendeten Mikroelektroden gut für das Organoid-Mikroprofiling geeignet sind – dazu gehört auch die Auswahl des richtigen Spitzendurchmessers. Wir haben sowohl 25-μm- als auch 50-μm-Spitzen ausprobiert und ähnliche Ergebnisse erzielt (Abbildung 2A), haben uns aber gemäß den Empfehlungen des Herstellers für die kleinere Spitzengröße entschieden, da erwartet wurde, dass sie weniger invasiv ist und eine höhere räumliche Auflösung bietet, da die Messungen über den abgeschrägten Spitzenbereich gemittelt werden. Als Nachteil sind kleinere Spitzen jedoch zerbrechlicher. Die Größe der Organoide muss bei der Bestimmung der gewünschten räumlichen Auflösung berücksichtigt werden.
Ein kritischer Schritt im Protokoll bestand darin, sicherzustellen, dass der intraluminale pH-Wert des Organoids vom pH-Wert in der EZM und anschließend im umgebenden Kulturmedium unterschieden werden kann. Man würde eine vernünftige Menge an Metabolitenfluss in und aus den Organoiden erwarten42. Wir gehen davon aus, dass der pH-Wert eines Organoids von seiner Umgebung beeinflusst wird, und fanden in sechs unabhängigen Experimenten heraus, dass die Organoide durchweg weniger alkalisch waren als ihre Umgebung (Abbildung 2D). Darüber hinaus ist die Stabilität bei der Profilerstellung genauso wichtig wie bei der Sensorkalibrierung.
Es wird erwartet, dass aus Gewebe gewonnene Organoide ein gewisses Maß an Variabilität von Spender zu Spender aufweisen, so dass es wichtig ist, jede Organoidlinie zu Studienbeginn zu profilieren, bevor experimentelle Interventionen wie z. B. eine medikamentöse Behandlung angewendet werden43. Wir vermuten, dass Schwankungen des pH-Werts innerhalb einer Organoidkultur auf lokale Ionengradienten auf der Mikroskala und die heterogene Verteilung des luminalen Schleims zurückzuführen sind, die durch Immunfluoreszenz und immunhistochemische Färbung bestimmt wurde (unveröffentlichte Daten). Die beobachteten Schwankungen des pH-Werts zwischen einzelnen Organoidlinien und -passagen können auf individuelle Unterschiede in der Zellzusammensetzung und der sekretorischen Aktivität der Organoide zurückzuführen sein. Wir fanden auch heraus, dass einige Organoidlinien von Natur aus schwieriger zu durchdringen waren als andere. In ähnlicher Weise können einige ihre strukturelle Integrität verlieren und beim Eintritt der Elektrode kollabieren (Ergänzende Abbildung S2 und Ergänzendes Video S1). Dies scheint nicht mit der Organoidpassage verbunden zu sein, wurde aber am häufigsten bei Organoiden mit einem Durchmesser von mehr als ~1,5 mm beobachtet. In einer früheren Studie konnten wir zeigen, dass der Schleim im Inneren der Organoide heterogen verteilt war29. Aufgrund dieser Heterogenität wird es schwierig zu bestimmen, ob (oder in welchem Ausmaß) die Schleimverteilung eine Messung beeinflusst hat.
Mikrosensoren sind minimal-invasive Werkzeuge, die die intraluminale Physiologie von Organoiden mit hoher Geschwindigkeit und hoher räumlicher Auflösung profilieren können. Solche Sensoren stören auch chemische Gradienten nicht und sind minimal empfindlich gegenüber Turbulenzen in der interessierenden Mikroumgebung. Die kleine Bauform wird durch die Trennung der Sensorelektrode von der Referenzelektrode ermöglicht - Standard-pH-Sonden für Labore kombinieren diese beiden Elektroden, was zu einer größeren Größe führt. Optische pH- undO2-Nanosensoren für intrazelluläre Messungen wurden von der Cash-Gruppe an der Colorado School of Mines entwickelt und haben sich erfolgreich bei der Messung von Metaboliten sowohl in Maus- als auch in Biofilmmodellen bewährt. Aufgrund der Heterogenität des Organoid-Lumens können solche Sensoren jedoch zu nicht interpretierbaren Ergebnissen führen17. McCracken et al. analysierten den luminalen pH-Wert in embryonalen Stammzell-Oroiden durch Injektion von SNARF-5F und Visualisierung des pH-empfindlichen Farbstoffs mit konfokaler Echtzeitmikroskopie37. Bemerkenswert ist, dass die von McCracken berichteten Messungen den pH-Werten unserer aktuellen Studie sehr ähnlich waren (Abbildung 2B, C). Unsere Technik könnte vielleicht in einer Monolayer-Architektur mit einem eher vertikalen Aufbau wie bei der Biofilmprofilierung angewendet werden, obwohl dies ein Risiko für eine Beschädigung der Elektrodendarstellen könnte 44. Zukünftige Studien könnten auch sequentielle Messungen des pH-Werts über mehrere Tage beinhalten, um Veränderungen im Zusammenhang mit der Zellentwicklung zu bewerten. Da sich mittelgroße Organoide nach der Sondierung in der Regel erholen und heilen, könnte ein Organoid theoretisch mehrmals untersucht werden, solange die Sterilität der Kulturen aufrechterhalten werden kann. Bei der Verfeinerung unseres Verständnisses der pH-Dynamik in Organoidmodellen muss die räumliche Auflösung eine Priorität für die präzise Kartierung der komplexen und historisch unzugänglichen 3D-Mikroumgebung darin sein.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Protokoll eine detaillierte Methode für genaue Messungen des pH-Werts mit hoher räumlich-zeitlicher Auflösung unter Verwendung von pH-Mikroelektroden bietet, die an einem Mikromanipulator und einem Stereomikroskop montiert sind. Diese Methode wurde mit aus humanen adulten Stammzellen gewonnenen Organoiden validiert und eignet sich für epitheliale Organoide mit einem Durchmesser von mindestens 200 μm, die ein ausgeprägtes Lumen aufweisen. Wir gehen davon aus, dass diese Methode durch die Auswahl alternativer Mikroelektroden leicht an andere Arten von Organoiden und die Messung alternativer Verbindungen wie NO oder O2 angepasst werden kann.
Die Autoren haben keine Interessenkonflikte offenzulegen.
Die Autoren danken Dr. Ellen Lauchnor, Dr. Phil Stewart und Bengisu Kilic für ihre bisherige Arbeit und Unterstützung bei den O2 -Mikrosensoren; Andy Sebrell für die Ausbildung in Organoidkultur und Mikromanipulation; Lexi Burcham für die Unterstützung bei der Organoidkultur, der Medienvorbereitung, der Datenaufzeichnung und der Organisation; und Dr. Susy Kohout für allgemeine Ratschläge in Elektrophysiologie. Wir danken Dr. Heidi Smith für ihre Unterstützung bei der Bildgebung und danken der Center for Biofilm Engineering Bioimaging Facility an der Montana State University, die durch Mittel des National Science Foundation MRI Program (2018562), des M.J. Murdock Charitable Trust (202016116), des US-Verteidigungsministeriums (77369LSRIP & W911NF1910288) und der Montana Nanotechnology Facility (ein NNCI-Mitglied, unterstützt durch den NSF Grant ECCS-2025391) unterstützt wird.
Besonderer Dank gilt dem gesamten Unisense-Team, das diese Arbeit möglich gemacht hat, insbesondere Dr. Andrew Cerskus, Dr. Laura Woods, Dr. Lars Larsen, Dr. Tage Dalsgaard, Dr. Line Daugaard, Dr. Karen Maegaard und Mette Gammelgaard. Die Finanzierung unserer Studie erfolgte durch die National Institutes of Health Grants R01 GM13140801 (D.B., R.B.) und UL1 TR002319 (K.N.L.) sowie einen Research Expansion Award des Montana State University Office for Research and Economic Development (D.B.). Abbildung 1A wurde mit BioRender erstellt.
| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 3 m KCl | Unisense | ||
| 5 mL Wobble-nicht serologische Pipet, einzeln verpackt, Papier/Kunststoff, Beutel, steril | CellTreat | 229091B | |
| 10 mL Wobble-nicht serologische Pipet, einzeln verpackt, Papier/Kunststoff, Beutel, steril | CellTreat | 229092B | |
| 15 mL Zentrifugenröhrchen - Schaumstoffgestell, steril | CellTreat 229412 | ||
| 24-Well-Gewebekulturplatte, steril | CellTreat | 229124 | |
| 25 mL Wobble-not serologische Pipet, einzeln verpackt, Papier/Kunststoff, Beutel, steril | CellTreat | 229093B | |
| 35 mm Schale | Nr. 1.5 Deckglas | 20 mm Glasdurchmesser | Unbeschichtetes | MatTek | P35G-1.5-20-C | |
| 50 mL Zentrifugenröhrchen - Schaumstoffgestell, steril | CellTreat | 229422 | |
| 70% Ethanol | BP82031GAL | BP82031GAL | |
| 70 μ; m Cell Sieb, einzeln verpackt, steril | CellTreat | 229483 | |
| 1.000 & Mikro; L Pipettenspitzen mit verlängerter Länge und geringer Retention, steril | CellTreat | 229037 | |
| Amphotericin B (Fungizone) Lösung | HyClone Laboratories, Inc | SV30078.01 | |
| Biosicherheitswerkbank | Nuaire | NU-425-600 | Klasse II Typ A/B3 |
| Rinderserumalbumin | Fisher Bioreagents | BP1605-100 | |
| Zellwiederherstellungslösung | Corning | 354253 | Zelldissoziationslösung |
| DMEM/F-12 (Advanced DMEM) | Gibco | 12-491-015 | |
| Dulbeccos Modifikation von Eagles Medium (DMEM) | Fisher Scientific | 15017CV | |
| Fötales Rinderserum | HyClone Laboratories, Inc | SH30088 | |
| G418 Sulfat | Corning | 30-234-CR | |
| Gentamycin Sulfat | IBI | Scientific IB02030 | |
| HEPES, Freie Säure | Cytiva | SH30237.01 | |
| HP Pavillion 2-in-1 14" Laptop Intel Core i3 | HP | M03840-001 | |
| Salzsäure | Fisher Scientific | A144C-212 | |
| Inkubator | Fisher Scientific | 11676604 | |
| iPhone 12 Kamera | Apple | ||
| L-Glutamin | Cytiva | SH3003401 | |
| Large Kimberly-Clark Professional Kimtech Science Kimwipes Delicate Task Wischer, 1-lagig | Fisher Scientific | 34133 | |
| M 205 FA Stereomikroskop | Leica | ||
| Matrigel Membran Matrix 354234 | Corning | CB-40234 | |
| MC-1 UniMotor Controller | Unisense | ||
| Methylrot | |||
| MM33 Mikromanipulator | Marzhauser Wetzlar | 61-42-113-0000 | Rechtshänder |
| MS-15 Motorisiertischer Tisch | Unisense | ||
| Nanoject-II | Drummond | 3-000-204 | Nanoliter-Autoinjektor |
| Penicillin/Streptomycin (10.000 U/ml) | Gibco | 15-140-148 | |
| pH-Mikroelektroden | Unisense | 50-109158, 25-203452, 25-205272, 25-111626, 25-109160 | Die SensorTrace-Software ist nicht mit Apple-Computern kompatibel |
| Referenzelektrode | Unisense | REF-RM-001652 | Die SensorTrace-Software ist nicht kompatibel mit Apple Computer |
| SB 431542 | Tocris Bioscience | 16-141-0 | |
| Smartphone Kamera Adapter | Gosky | ||
| Spezifikationen Laborstativ LS | Unisense | LS-009238 | |
| Trypsin-EDTA 0,025%, phenolrot | Gibco | 25-200-056 | |
| UniAmp | Unisense | 11632 | |
| United Biosystems Inc MINI-ZELLENABSTREIFER 200/PK | Fisher | MCS-200 | |
| Y-27632 Dihydrochlorid | Tocris Bioscience | 12-541-0 | |
| µ Sensor-Kalibrierkit | Unisense/ Mettler Toledo | 51-305-070, 51-302-069 | pH 4,01 und 9,21, 20 mL Packungen |
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