Kritische Schritte
Der Einsatz immunologisch basierter Techniken bei der Untersuchung komplexer Signalwege durch spezifischen Nachweis von Phosphoproteinen erfordert, dass experimentelle Variablen streng kontrolliertwerden 22, die Probenvorbereitung akribisch ist und ergänzende Techniken zur Validierung eingesetzt werden. Die Integration dieser Praktiken gewährleistet die Reproduzierbarkeit, Präzision und Robustheit der Daten und trägt letztendlich zu zuverlässigeren biologischen Schlussfolgerungen bei. Diese Bemühungen verbessern nicht nur die wissenschaftliche Strenge der Methode, sondern erweitern auch ihre Anwendbarkeit in komplexen Studien zur Zellsignalisierung und -regulation. Die richtige Anästhesie und eine schonende Handhabung sind entscheidend für die Minimierung von physiologischem Stress, der die experimentellen Ergebnisse erheblich verändern kann, insbesondere in Studien, die sich auf Immunantworten oder Signalwege konzentrieren. Die Sicherstellung geeigneter Analgetika-Protokolle trägt weiter zur Aufrechterhaltung des Tierschutzes bei und verhindert gleichzeitig schmerzbedingten Stress, der die Daten beeinträchtigen könnte. Die Aufrechterhaltung aseptischer Bedingungen während des Eingriffs ist von entscheidender Bedeutung, um Infektionen zu verhindern, die zu Entzündungsreaktionen führen und möglicherweise experimentelle Ergebnisse verfälschen können. Dazu gehören das Sterilisieren von Geräten, das Tragen sauberer Handschuhe und die gründliche Desinfektion der Aspirationsstelle.
Phosphorylierte Proteine sind bei der Manipulation biologischer Proben sehr anfällig für die Dephosphorylierung durch Phosphatasen22,23. Um die Phosphorylierungszustände während der Verarbeitung zu erhalten, ist eine sofortige Fixierung unerlässlich. Es wurden zwei verschiedene Fixierungs-/Permeabilisierungsmethoden getestet: ein Cytofix/Cytoperm-Kit und die gängige Formaldehyd/Methanol-Methode, die im Protokoll beschrieben ist. Unter diesen lieferte die methanolbasierte Methode sauberere Ergebnisse mit helleren Fluoreszenzsignalen, was sie zur bevorzugten Wahl machte. Nach der Fixierung können die Proben kurzfristig bei -20 °C oder langfristig bei -80 °C gelagert werden. In Experimenten lieferten fixierte Proben, die bis zu drei Monate bei -80 °C gelagert wurden, konsistente Ergebnisse. Bei der Antikörperfärbung kann eine Inkubation über Nacht die Genauigkeit erhöhen, insbesondere bei subtilen Phosphorylierungsverschiebungen, obwohl dies vom spezifischen Experiment und den untersuchten Arzneimittelwirkungen abhängt. Eine kürzere Inkubation von 1 h wurde auch auf Eis getestet, das vor Licht geschützt war, was in bestimmten Fällen zu akzeptablen Ergebnissen führte. Um eine genaue Bewertung des Hintergrundrauschens zu gewährleisten, werden Isotypkontrollen als Referenz für unspezifische Bindungen empfohlen, wie in Abbildung 3 dargestellt.
Modifikationen und Fehlerbehebung der Technik
Um technische Fähigkeiten zu entwickeln, üben die Auszubildenden in unserer Gruppe die Nadeleinstichtechnik an euthanasierten Mäusen, wobei die korrekte Platzierung durch Sektion bestätigt werden kann. Das Verfahren an lebenden Tieren wird am effizientesten von zwei Bedienern durchgeführt, wobei sich einer auf die Aspirationen konzentrieren kann, während ein Assistent sich den Aufgaben der Tierüberwachung und der Probenhandhabung widmet. In seltenen Fällen, in denen es nicht möglich ist, nach mehreren Versuchen eine Aspiration zu erhalten, ist es ratsam, den Eingriff abzubrechen, da das Verletzungsrisiko mit jedem Versuch steigt. Ebenso wichtig ist die Überwachung der Tiere nach dem Eingriff. Die Beobachtung auf Anzeichen von Infektionen, Schmerzen oder Stress gewährleistet das Wohlbefinden der Mäuse und die Zuverlässigkeit der Studie. Die Wohnbedingungen sollten die Genesung unterstützen, mit angemessener Einstreu und Ernährung, um äußere Stressfaktoren zu minimieren.
Für die durchflusszytometrische Analyse wird empfohlen, alle fixierten und konservierten Proben von verschiedenen Knochenmarkaspirationstagen gleichzeitig zu verarbeiten. Schwankungen bei der Rehydrierung und Färbung der Probe aufgrund unterschiedlicher Handhabungstage oder Bediener können die vom Zytometer erfasste Fluoreszenzempfindlichkeit beeinträchtigen. Um konsistente Ergebnisse zu gewährleisten, optimieren Sie die Zytometer-Spannungseinstellungen, um alle gefärbten Proben innerhalb des Nachweisbereichs zu halten, bevor Sie fortfahren. Das Alexa Fluor 488-konjugierte p-4EBP1-Protein weist die höchste Helligkeit unter den Markern in diesem Panel auf, was es zu einer zuverlässigen Referenz für die Einstellung des maximalen Nachweisbereichs macht. Obwohl das in diesem Protokoll vorgestellte Antikörperpanel keine Kompensationsanpassungen erforderte, kann dies je nach verwendetem spektralem Durchflusszytometer variieren.
Begrenzungen
Eine der größten Einschränkungen dieser Technik ist die Anzahl der Zellen, die während der Knochenmarkpunktion entnommen werden. Um zuverlässige Ergebnisse zu gewährleisten, ist es wichtig, genügend Zellen zu färben, um mindestens etwa 10.000 Zellen pro Probe zu analysieren. Die Analyse von zu wenigen Zellen kann zu erheblichen Abweichungen zwischen den Proben führen, was die Genauigkeit und Interpretierbarkeit der Daten beeinträchtigt. Die Sicherstellung einer ausreichenden Anzahl von Zellen ist entscheidend für robuste und reproduzierbare mechanistische Studien.
Für die Datenanalyse wird die in Abbildung 3A dargestellte Gating-Strategie angewendet. Zunächst werden nach Ausschluss von Dubletten die interessierenden Zellen mit einem humanen CD45-Antikörper identifiziert, der mit BUV395 gekoppelt ist. Als nächstes erfolgt das Gating für lebende Zellen mit Zombie NIR. Schließlich wird für jedes Phosphoprotein die mediane Fluoreszenzintensität (MFI) berechnet (Abbildung 3B). Alle Zellen, die auf alle phosphorylierten Proteine analysiert wurden, wurden mit der gleichen Strategie gegatet, um Konsistenz und Vergleichbarkeit zwischen den AML-Zellpopulationen zu gewährleisten.
Eine weitere Einschränkung dieser Methode ist das Potenzial für Hintergrundrauschen, das durch unspezifische Antikörperbindung, unzureichendes Waschen, Zellautofluoreszenz oder unsachgemäße Permeabilisierung entstehen kann. Dies kann die Signalspezifität beeinträchtigen und die Genauigkeit der Phosphoflow-Zytometrie-Analyse verringern. Für Benutzer, die auf diese Probleme stoßen, wird ein zusätzlicher Waschschritt empfohlen, um Hintergrundgeräusche zu reduzieren, und Fc-blockierende Reagenzien können verwendet werden, um unspezifische Bindungen zu minimieren. Darüber hinaus kann die Fluoreszenz toter Zellen die Ergebnisse beeinträchtigen, was die Verwendung von Viabilitätsfarbstoffen unerlässlich macht. Wichtig ist, dass für eine genaue Analyse die Anzahl der analysierten Zellen nicht weniger als 500 AML-Zellen betragen sollte, um zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse zu gewährleisten. Es ist auch wichtig sicherzustellen, dass während der Färbung eine ähnliche Anzahl von Zellen verwendet wird, um die Konsistenz zwischen den Proben zu wahren. Trotz dieser Einschränkungen kann eine sorgfältige Optimierung der Steuerungen und Gating-Strategien die Zuverlässigkeit der Methode erhöhen.
Bedeutung der Technik
Die Technik der Knochenmarkpunktion wurde bereits veröffentlicht3; In diesem Protokoll ist jedoch eine aktualisierte Technik enthalten, die zwei Vorteile hervorhebt: eine verbesserte Immobilisierung und die Verwendung eines Zwei-Nadel-Ansatzes, um die Präzision und Konsistenz bei der Knochenmarkaspiration zu verbessern und Probleme mit einer Verstopfung der Nadel mit Knochenfragmenten zu vermeiden. Für Längsschnittstudien kann die Femuraspiration mehrmals durchgeführt werden, was eine leistungsstarke Methode zur Verfolgung biologischer Veränderungen im Laufe der Zeit bei einzelnen Tieren darstellt. Zwischen den Aspirationen am selben Oberschenkelknochen wird ein Erholungsintervall von mindestens einem Monat empfohlen, um eine ausreichende Knochenheilung und Regeneration des Knochenmarks zu ermöglichen. Bei der Verwendung des kontralateralen Femurs ist ein kürzeres Intervall von einer Woche ausreichend, um sicherzustellen, dass sich die Maus von den Auswirkungen der Analgesie und der Anästhesie erholt hat, ohne übermäßigen Stress oder physiologische Variabilität zu verursachen.
Insgesamt bietet diese kombinierte murine Knochenmarkaspirations- und Durchflusszytometrie-Technik wertvolle Einblicke in wichtige Signalwege, einschließlich JAK/p-STAT5, mTORC1/p-4EBP1, mTORC1/p-RPS6 und MEK/p-ERK1/2. Diese Signalwege spielen eine wichtige Rolle bei der Behandlungsresistenz bei AML. Diese Technik ermöglicht die wiederholte Probenahme desselben Tieres und ermöglicht so die Echtzeitüberwachung des Krankheitsverlaufs und des Therapieansprechens auf Einzelzellebene.
Die Phosphoflow-Zytometrie erfasst Phosphorylierungsereignisse und bewahrt die zelluläre Heterogenität 4,23,24. Dies macht es besonders wertvoll für das Verständnis der dynamischen zellulären Reaktionen auf die Therapie in bestimmten leukämischen Subpopulationen.
Zukünftige Anwendungen
Dieses Protokoll bietet ein wertvolles Instrument zur Untersuchung der zugrunde liegenden Mechanismen der Therapieanpassung und des Auftretens von Resistenzen bei AML und ebnet den Weg für tiefere Einblicke und potenzielle therapeutische Fortschritte. Zukünftige Studien könnten diesen Ansatz mit Einzelzell-Transkriptomik oder Proteomik integrieren, um die molekularen Mechanismen, die Resistenz und Krankheitsprogression antreiben, weiter zu untersuchen25. Darüber hinaus könnte die Anwendung dieser Methode auf andere hämatologische Malignome oder entzündliche Erkrankungen ihren Einfluss in der translationalen Forschung erweitern.
Durch die Verfeinerung dieses Protokolls und die Beseitigung seiner Grenzen könnte dieser Ansatz zu einer Standardmethode für die Untersuchung der Phosphoprotein-Signalübertragung bei hämatologischen Erkrankungen werden und letztendlich zur Entwicklung effektiverer therapeutischer Strategien beitragen. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Protokoll ein wertvolles Instrument zur Untersuchung der zugrunde liegenden Mechanismen der Therapieanpassung und des Auftretens von Resistenzen bei AML darstellt und den Weg für tiefere Einblicke und potenzielle therapeutische Fortschritte ebnet.