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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Hier stellen wir ein Protokoll vor, um das Taylor-Ausbreitungsexperiment an die Mikroskala anzupassen, indem Mikrokanäle verwendet werden, die im eigenen Haus mit einem Desktop-Craft-Cutter hergestellt wurden. Die experimentelle Plattform kann verwendet werden, um den Diffusionskoeffizienten von passiven Einzelspezies-Tracern zu berechnen und die Wechselwirkung und Trennung von Ionen mit mehreren Spezies zu visualisieren.
Das Gebiet der Mikrofluidik hat zunehmend an Bedeutung gewonnen, da es eine schnelle und präzise Steuerung von Flüssigkeiten und Partikeln ermöglicht und so die Synthese von Verbindungen und die Trennung von Gemischen erleichtert. Wir haben eine zugängliche, wiederholbare mikroskalige Adaption des Taylor-Dispersionsexperiments perfektioniert, bei der Mikrokanäle verwendet wurden, die im eigenen Haus mit einem Desktop-Craft-Cutter hergestellt wurden. Die Einstiegskosten für diese schnelle und zugängliche Mikrofluidik-Xurographie-Technik betragen ca. 300 USD und sind damit um Größenordnungen niedriger als bei typischen Photolithographie-Methoden. Die druckgetriebene laminare Strömung einer programmierbaren Spritzenpumpe transportiert eine injizierte Tracerlösung flussabwärts im Mikrokanal, wo eine digitale Spiegelreflexkamera (D-SLR) mit einem Makroobjektiv die Entwicklung der Tracerkonzentration im Laufe der Zeit an einem festen Ort erfasst. Mit dieser experimentellen Plattform können wir die Diffusionskoeffizienten für passive Tracer einzelner Spezies unter verschiedenen experimentellen Bedingungen berechnen. Anschließend erweiterten wir das Protokoll auf Elektrolytgemische und beobachteten vorläufige Hinweise auf Diffusivitätsänderungen, die sich aus nichttrivialen Ionen-Ionen-Kupplungseffekten ergeben. Diese zugängliche experimentelle Methode bietet ein praktisches Werkzeug zur Untersuchung des Transports mehrerer Spezies und bietet Einblicke in die komplexen Wechselwirkungen, die die Ionenmobilität steuern.
In den letzten Jahren wurden erhebliche Forschungsanstrengungen auf die Erforschung und Entwicklung kostengünstiger mikrofluidischer Geräte konzentriert, die eine präzise Steuerung des Flusses, der Partikel und des Transports gelöster Stoffe ermöglichen. Multispezies-Elektrolytlösungen spielen eine entscheidende Rolle in einer Vielzahl von Anwendungen, von der Energiespeicherung und biomedizinischen Diagnostik bis hin zur Umweltüberwachung und Wasserreinigung. Das Verständnis, wie verschiedene Ionenspezies in diesen Systemen diffundieren und interagieren, ist für die Optimierung der Leistung und Stabilität in elektrochemischen und transportgetriebenen Prozessen unerlässlich.
Wenn eine Elektrolytlösung Ionen mit unterschiedlichen Diffusionskoeffizienten enthält, induziert ihre ungleiche Migration ein internes elektrisches Feld, auch wenn keine extern angelegte Spannung vorhanden ist. Schneller diffundierende Ionen neigen dazu, sich von langsameren zu trennen, wodurch vorübergehend ein Ladungsungleichgewicht entsteht. Um die Elektroneutralität zu erhalten, erzeugt das System ein diffusionsinduziertes elektrisches Potential. Dieses Feld verlangsamt die schnelleren Ionen und beschleunigt die langsameren. Das resultierende elektrische Potential hängt von den relativen Ionenmobilitäten und Konzentrationsgradienten ab und wird durch die Nernst-Planck-Gleichungen unter Elektroneutralitätsbedingungen gut beschrieben. Klassische elektrochemische Modelle, wie die Henderson- und die Nernst-Gleichung, quantifizieren dieses Phänomen, indem sie es mit Ionentransportzahlen und Konzentrationsunterschieden in Beziehung setzen1.
Die Taylor-Dispersionsanalyse ist seit langem eine leistungsfähige Technik zur Messung der molekularen Diffusivität, indem beobachtet wird, wie sich ein gelöster Stoff in einer druckgetriebenen laminaren Strömung durch einen geraden Kanalausbreitet 2,3. Es berücksichtigt das Zusammenspiel zwischen Advektion und Diffusion und ermöglicht eine genaue Ableitung der molekularen Diffusionskoeffizienten aus den effektiven Dispersionsraten. Diese Methode ist besonders attraktiv, weil sie Präzision, minimalen Probenbedarf und schnelle Datenerfassung kombiniert. Traditionell für Einzelspezies-Tracer verwendet, ermöglichen neuere theoretische Erweiterungen nun die Anwendung auf Mehrspezies-Systeme, was es den Forschern ermöglicht, theoretisch auf der Grundlage des gekoppelten Transportverhaltens auf individuelle Ionendiffusivitäten zu schließen4.
Die hohen Kosten und die technische Komplexität herkömmlicher mikrofluidischer Aufbauten, die oft auf reinraumabhängiger Photolithographie basieren, stellen jedoch erhebliche Hindernisse für die breitere Einführung dieser Methode dar. In dieser Arbeit stellen wir eine kostengünstige, zugängliche und reproduzierbare Adaption der Taylor-Dispersionstechnik vor, bei der Mikrokanäle verwendet werden, die mittels Xurographie mit einem Desktop-Craft-Cutter hergestellt werden. Dieser Ansatz mit Anlaufkosten von ca. 300 USD ermöglicht ein schnelles Prototyping und eine konsistente Kanalherstellung, ohne dass kostspielige Spezialeinrichtungen erforderlich sind5. Unter Verwendung von Hellfeld-Bildgebung über eine D-SLR-Kamera und ein Makroobjektiv erstellt das Protokoll eine Zeitreihe der Entwicklung der Tracerkonzentration an einem festen Erfassungspunkt stromabwärts der Injektionsstelle6. Wir zeigen, dass diese Plattform die Diffusionskoeffizienten für passive Einzelspezies-Tracer genau messen kann und erweitern die Methode zur Analyse von Multispezies-Elektrolytsystemen. Die Ergebnisse zeigen deutliche Signaturen von Diffusivitätsschwankungen, die durch Ionen-Ionen-Kopplungseffekte entstehen. Diese zugängliche und kostengünstige Methode bietet ein praktisches Werkzeug zur Untersuchung von Ionentransportphänomenen in komplexen Elektrolytgemischen. Zum Beispiel kann der vorgeschlagene Versuchsaufbau leicht angepasst werden, um als Mikromischer verwendet zu werden, um die Mischeffizienz von Mehrspezies-gelösten Stoffen7 zu bewerten, oder um die gewünschten Polymer-Molekulargewichtsverteilungen durch einen computergesteuerten Rohrströmungsreaktor8 zu entwerfen.
1. Vorbereitung der Materialien
HINWEIS: In diesem Bericht werden mikrofluidische Chips hergestellt, indem Mikrokanaldesigns in eine einzige Schicht Polyimidband mit einer Breite b = 2,54 cm und einer Dicke von h = 100 μm geschnitten werden, die dann zwischen zwei Polyesterplatten versiegelt wird. Das Aspektverhältnis des Mikrokanals (λ = h/w) ist abhängig von der Dicke des Polyimids; Die Breite des Kanals (W) ist das einzige Querschnittsmerkmal, das in diesem Protokoll geändert werden kann.
2. Aufbau des Versuchsaufbaus
3. Versuchslauf
4. Datenverarbeitung
(1)Die Schritte zur Herstellung von mikrofluidischen Chips sind in Abbildung 1 dargestellt. In Abbildung 2 sind die vorgeschlagenen Schritte zum Anschließen des PTFE-Schlauchs an die Spritzenspitze aufgeführt, die zum Einspritzen des Hintergrundstroms von deionisiertem Wasser (DI) in den mikrofluidischen Chip durch die programmierbare Spritzenpumpe verwendet wird. Abbildung 3 enthält ein beschriftetes Foto des gesamten Versuchsaufbaus. Abbildung 4 enthält nicht maßstabsgetreue Diagramme der Draufsicht (Abbildung 4A) und der Seitenansicht (Abbildung 4B) des Versuchsaufbaus, die die relative Positionierung von Mikrofluidik-Chips und Kameras hervorheben. Abbildung 5 zeigt die Abfolge der Operationen, die während der Datenverarbeitungsphase des Protokolls auf die experimentellen Bilder angewendet wurden. In Abbildung 5A zeigen wir, wie der Code den Mikrokanal horizontal ausrichtet (falls erforderlich), dann zeigt Abbildung 5B das Zuschneiden des quadratischen Interessenbereichs, der um den Aufnahmepunkt zentriert ist und dessen Seitenlänge durch die Mikrokanalbreite festgelegt wird. Abbildung 5C isoliert den blauen Kanal vom vollen RGB-Bild im zugeschnittenen Interessenbereich. und schließlich zeigt Abbildung 5D den invertierten Intensitätswert für den Blaukanal des beschnittenen Bereichs, der durch Subtraktion von 255 (der maximalen Intensität für jeden Farbkanal) erhalten wird.
Abbildung 6 überlagert die Ergebnisse eines experimentellen Durchlaufs (gestrichelt) mit der entsprechenden extrapolierten Anpassung (Volumenkörper). Hier ist jeder experimentelle Datenpunkt der gemittelte invertierte Intensitätswert des blauen Kanals, der durch die in Abbildung 5 gezeigten Datenverarbeitungsschritte berechnet wurde. Am festen Einfangpunkt stromabwärts des Tracereinlasses sagt die Taylor-Dispersionstheorie 2,5,9 voraus, dass die Entwicklung der Tracerkonzentration im Laufe der Zeit wie folgt beschrieben wird:
(2)
wobei C(t) die querschnittlich gemittelte Tracerkonzentration (g/L) ist, die nachweislich linear mit der gemessenen Intensität des Tracers zusammenhängt; C0 ist die anfängliche Tracerkonzentration (g/L), U ist die Durchflussrate (cm/s), t ist die Zeit (s) und x (cm) ist die axiale Koordinate im Kanal in Bezug auf die Tracer-Injektionsstelle. K ist der erhöhte Dispersionskoeffizient des Tracers (cm2/s), der auf das Zusammenspiel von Advektion und molekularer Diffusion zurückzuführen ist. Wir geben die experimentellen Parameter ein und verwenden die nichtlineare Kurvenanpassungsanwendung des Codes (curveFitter), um den besten Anpassungswert für K zu finden. Drei experimentelle Rahmen für die Zeit t = 140 s, 150 s und 200 s sind neben den experimentellen (gestrichelten) und angepassten (soliden) Kurven dargestellt, die für einen experimentellen Lauf bei der Durchflussrate U = 0,1 cm/s in einem Mikrokanal mit einer Länge von 18,77 cm und einem Seitenverhältnis λ = 1/4 erzeugt wurden; dies entspricht der Péclet-Nummer Pe
88. Hier besteht der Tracer aus 0,6 g/L Fluorescein-Natriumsalz, verdünnt in DI-Wasser mit einem molekularen Diffusionskoeffizienten, der in der Literatur10,11 als κ = 5,70 x 10-6 cm2/s angegeben ist. Alle Experimente, über die in diesem Manuskript berichtet wird, wurden bei einer Raumtemperatur von 22 °C durchgeführt.
Der experimentelle verstärkte Dispersionskoeffizient K kann verwendet werden, um die Gültigkeit unseres Versuchsaufbaus und -protokolls zu vergleichen, indem eine verwandte Größe berechnet wird – der Dispersionsfaktor 2,5,9,12, f. Dieser Parameter hängt von der Geometrie des Kanals ab undwird wie folgt berechnet: 5,12,13:
(3)
Dabei ist κ der molekulare Diffusionskoeffizient des Tracers (cm2/s) und H/2 die gewählte charakteristische Länge. Die Péclet-Zahl ist ein dimensionsloser Parameter, der das Verhältnis von advektiven zu diffusiven Effekten quantifiziert, Pe = Uh/(2κ). Abbildung 7 zeigt eine gute Übereinstimmung zwischen den Ergebnissen des Dispersionsfaktors aus experimentellen Läufen in Mikrokanälen mit rechteckigen Querschnitten von drei verschiedenen Aspektverhältnissen und Flussraten und dem theoretischen Verhalten des Dispersionsfaktors 5,12,13.

Abbildung 1: Mikrofluidische Chipherstellung. (A) Design für die obere Polyesterplatte eines 21 x 5 cm großen Chips. Der Desktop-Bastelschneider schneidet drei Löcher von links nach rechts, die als Strömungseinlauf, Prüfspureinlass bzw. Strömungsauslass dienen. (B) Design für einen 18,77 cm Polyimid-Mikrokanal mit einem Fangpunkt 15 cm stromabwärts vom Tracer-Einlass. (C) Explosionszeichnung der mikrofluidischen Chipbaugruppe, von unten nach oben: untere Polyesterschicht, Polyimid-Mikrokanalschicht, obere Polyesterschicht mit Polyimiddichtung und 3D-gedrucktem Port. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Diagramm, das zeigt, wie ein PTFE-Schlauch an eine Spritzenspitze angeschlossen wird. Der Schlauch-ID beträgt 0,3048 mm und der Außendurchmesser der 27-G-Spritzenspitze 0,4064 mm, so dass ein kleiner Schnitt von ca. 1 mm (links) hilfreich sein kann, um einen breiteren Öffnungsbereich für die Führung der Spritzenspitze (Mitte) zu schaffen. Führen Sie den Schlauch mit einer Pinzette über die Spritzenspitze und ziehen Sie ihn nach unten (rechts). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Beschriftetes Foto des Versuchsaufbaus. Von links nach rechts: Eine D-SLR-Kamera mit einem 20 mm f/2 Makroobjektiv ist mit der Vorderseite nach unten auf einem Stativ montiert, um den Mikrokanal einzufangen, der auf die beleuchtete Lichttafel geklebt ist. Eine 0,5-ml-Glasspritze, die über einen PTFE-Schlauch mit dem Mikrokanal verbunden ist, wird auf die programmierbare Spritzenpumpe gesetzt. Der Fernauslöser wird verwendet, um die Kamera während der Versuchsläufe zu aktivieren. Die Mikropipette wird verwendet, um den Tracer-Anfangszustand zu erzeugen, wie in Schritt 3.2 des Protokolls beschrieben. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Diagramme des Versuchsaufbaus (nicht maßstabsgetreu). (A) Draufsicht, von links nach rechts: programmierbare Spritzenpumpe, montiert mit einer 0,5-ml-Glasspritze; PTFE-Schlauch, der die Spritzenpumpe mit dem Mikrofluidik-Chip verbindet; Mikrofluidik-Chip, der auf eine Lichtplatte in 1 cm Entfernung vom Rand geklebt wird; Mikropipette zur Injektion der Tracerlösung durch das Tracer-Einlassloch; D-SLR-Kamera mit Makroobjektiv, das mit der Vorderseite nach unten auf einem Stativ montiert ist, um den Aufnahmepunkt einzurahmen. (B) Seitenansicht von links nach rechts: PTFE-Schlauch, der die Spritzenpumpe mit dem Mikrofluidik-Chip verbindet; Spritzenspitze und 3D-gedruckter Anschluss auf mikrofluidischem Chip; Mikropipette zur Injektion der Tracerlösung durch das Tracer-Einlassloch; D-SLR-Kamera mit Makroobjektiv, das mit der Vorderseite nach unten 1 cm über dem Aufnahmepunkt montiert ist. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: Bildverarbeitungsschritte im bereitgestellten Code (siehe Ergänzungsdatei 5). (A) Gedrehtes experimentelles Bild, so dass der Mikrokanal horizontal ist. Maßstabsleiste: 1000 μm. (B) Quadratische Auswahl für den zu beschneidenden Bereich of Interest (ROI) mit einer Seitenlänge, die dem Abstand zwischen den Mikrokanalwänden entspricht; hier 400 μm. (C) Cropped ROI, bei dem der Blaukanal aus dem vollen Rot-, Grün- und Blaubild (RGB) ausgewählt wird. Maßstabsleiste: 200 μm. (D) Invertierter blauer Kanal für den beschnittenen ROI. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: Querschnittlich gemittelte Tracerintensität über die Zeit am Aufnahmepunkt der Kamera für Fluoreszein-Tracer (gestrichelt), überlagert mit der extrapolierten Kurvenanpassung (durchgezogen). Dieser Versuch wurde mit einem 0,6 g/l Fluorescein-Natriumsalz in DI-Wassertracer auf einem Mikrokanal mit einer Länge von 18,77 cm und einem Seitenverhältnis λ = 1/4 bei einer Flussrate von 0,1 cm/s und Pe
88 durchgeführt. Die Intensität des invertierten Blaukanals für drei experimentelle Frames von 140 s (blau), 150 s (orange) und 200 s (grün) wird über dem Diagramm angezeigt, wobei die Helligkeit zur besseren Übersichtlichkeit verdoppelt wird. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 7: Dispersionsfaktor vs. Mikrokanal-Aspektverhältnis. Vergleich von theoretischen (blaue Kurve) und experimentellen Werten (schwarze Datenpunkte) für den Dispersionsfaktor f. Die theoretische Kurve wird mit Hilfe des integrierten Lösers für partielle Differentialgleichungen der Finite-Elemente-Methode in Wolfram Mathematica (NDSolve)12 erhalten. Wir zeigen den Durchschnitt und die Standardabweichung der experimentellen Daten für: vier Versuche mit λ = 0,1 und einer Flussrate von 0,02 cm/s; zwölf Versuche mit λ = 0,25 und Flussraten 0,05 cm/s (vier), 0,1 cm/s (vier) und 0,2 cm/s (vier); Vier Versuche mit λ = 0,5 und einer Durchflussrate von 0,1 cm/s. Alle Experimente wurden an Mikrokanälen mit einer Länge von 6,07 cm durchgeführt (mit einem Fangpunkt 3 cm stromabwärts vom Tracer-Einlass); Die Ergebnisse wurden dann auf 18,77 cm großen Mikrokanälen verglichen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Ergänzende Datei 1: .sdlprt Datei für den Port Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Datei 2: . DXF-Vorlagendatei der Chip-Deckschicht. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Akte 3: . DXF-Vorlagendatei der Chipdichtungen. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Zusatzdatei 4: . DXF-Template-Datei des Chip-Mikrokanals. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Datei 5: MATLAB-Codedateien, die für die Datenverarbeitung verwendet werden. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Die Autoren haben nichts offenzulegen.
Hier stellen wir ein Protokoll vor, um das Taylor-Ausbreitungsexperiment an die Mikroskala anzupassen, indem Mikrokanäle verwendet werden, die im eigenen Haus mit einem Desktop-Craft-Cutter hergestellt wurden. Die experimentelle Plattform kann verwendet werden, um den Diffusionskoeffizienten von passiven Einzelspezies-Tracern zu berechnen und die Wechselwirkung und Trennung von Ionen mit mehreren Spezies zu visualisieren.
Bernardi und Teague bedanken sich für die Unterstützung durch das Lab for Education & Application Prototypes (LEAP) am Worcester Polytechnic Institute sowie für die Finanzierung durch die Simons Foundation durch eine Reiseunterstützung für Mathematiker (Preisnummer 963534). Bernardi und Teague danken auch Geneva Isaacson, Justin Shen und Tom Kohen für die frühe Arbeit am Versuchsaufbau, Remy Kaplinsky und Academic & Research Computing am Worcester Polytechnic Institute für die Unterstützung beim 3D-Druck sowie Daniel M. Harris, Eli Silver und anderen Mitgliedern des Harris Lab an der Brown University für ihre Einblicke und hilfreichen Ratschläge bei der Einrichtung der ersten Experimente am Worcester Polytechnic Institute.
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