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Methodenartikel

Untersuchung des Mechanismus der San Jie Tong Mai-Formel gegen Arteriosklerose mittels Netzwerkpharmakologie und Proteomik

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DOI:

10.3791/70080

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17. April 2026

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1Department of Cardiology, the Third Affiliated Clinical Hospital of Changchun University of Chinese Medicine, 2Department of Respiratory, The Affiliated Hospital of Changchun University of Chinese Medicine, 3The Affiliated Hospital of Changchun University of Chinese Medicine

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Diese Studie zeigt, dass die San Jie Tong Mai-Formel die Atherosklerose bei ApoE-/- Mäusen abschwächt, indem sie den Hsd11b1-vermittelten Glukokortikoidstoffwechsel reguliert und dadurch Dyslipidämie und vaskuläre Entzündungen verbessert. Integrierte Netzwerkpharmakologie, Proteomik und molekulare Docking-Analysen offenbaren einen multikomponentigen, multi-zielmäßigen synergistischen Mechanismus, der den anti-atherosklerotischen Effekten zugrunde liegt.

Zusammenfassung

Diese Studie hatte zum Ziel, den Mechanismus der San Jie Tong Mai-Formel (SJTMF) gegen Arteriosklerose (AS), eine der Hauptursachen für kardiovaskuläre Morbidität, aufzuklären. Mit ApoE-/- Mausmodellen zeigten wir, dass SJTMF die Progression von AS-Plaque signifikant hemmt. Durch eine integrierte Netzwerk-Pharmakologie- und Proteomik-Strategie wurden fünf zentrale bioaktive Komponenten identifiziert: Beta-Sitosterol, Naringenin, Luteolin, Isorhamnetin und 3-Beta-Hydroxy-24-Methylen-8-Lanosten-21-oic-Säure. Gleichzeitig zeigte die Proteomik 129 AS-bezogene Proteine, die differenziell exprimiert wurden. Das molekulare Andocken bestätigte hochaffine Bindungsinteraktionen zwischen diesen Komponenten und dem Schlüsselziel Hsd11b1, deren Bindungsenergien alle unter -5 kcal/mol lagen. Mechanistische Untersuchungen zeigten außerdem, dass SJTMF den Hsd11b1-vermittelten Glukosestoffwechsel regulieren kann. Diese Regulation trägt zu einer erheblichen Verbesserung sowohl der Dyslipidämie als auch der vaskulären Entzündung bei und hemmt so die AS-Entwicklung. Gemeinsam zeigt diese Arbeit erstmals den innovativen Mechanismus, mit dem eine traditionelle chinesische Medizinformel Anti-AS-Effekte durch multikomponentige synergetische Regulation des Hsd11b1-Ziels ausübt, was neue Erkenntnisse für therapeutische Interventionen bietet.

Einleitung

Arteriosklerose (AS), eine chronisch entzündliche Erkrankung, die die systemische Gefäße betrifft, bildet die primäre pathologische Grundlage für kardiovaskuläre und zerebrovaskuläre Ereignisse1. Seine Pathogenese umfasst komplexe Wechselwirkungen zwischen genetischen, Umwelt-, psychosozialen und multifaktoriellen pathologischen Faktoren und weist multistufige und polygene Merkmale auf. Obwohl die aktuellen therapeutischen Strategien – insbesondere lipidsenkende Mittel wie Statine und Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Typ 9 (PCSK9)-Inhibitoren – die Spiegel des Low-Density Lipoprotein-Cholesterins (LDL-C) effektiv senken, adressieren sie nicht vollständig das Restentzündungsrisiko, das wiederkehrende kardiovaskuläre Ereignisseverursacht 2. Darüber hinaus begrenzen therapieassoziierte Nebenwirkungen (z. B. neu auftretender Diabetes, Myotoxizität, hepatorenale Beeinträchtigung) die langfristige Anwendung und Intensivierung der lipidsenkenden Therapie 3,4. Diese Einschränkungen unterstreichen die Notwendigkeit komplementärer Ansätze, die gezielt auf die vaskuläre Entzündung abzielen, einschließlich entzündungshemmender Therapien, um das kardiovaskuläre Risiko über die reine Lipidsenkung hinaus weiter zu reduzieren.

In der traditionellen chinesischen Medizin (TCM) fällt AS in die Kategorien "Brustbehinderung" (Xiong Bi) und "Gefäßansammlung" (Mai Ji), wobei "Schleimstasis-Verschränkung" (Tanyu Hujie) als Kernpathogenese anerkannt wird. Geleitet vom Prinzip der "stasis-transformierenden Hydrotherapie" (Yuneng Huashui) entwickelte unsere Forschungsgruppe die "San Jie Tong Mai Formula (SJTMF)", bestehend aus 14 Kräutern, darunter Salvia miltiorrhiza (Danshen) und Whitmania pigra Whitman (Shuizhi), um die Schleimtrübung synergetisch aufzulösen, die Stase zu lösen und Diurese zu fördern. Erste klinische Studien zeigten die Wirksamkeit von SJTMF bei der signifikanten Verbesserung der Lipidprofile und der Stabilisierung/Umkehrung atherosklerotischer Plaques bei älteren Patienten mit Carotis AS5. Experimentelle Untersuchungen zeigten zudem ihre Fähigkeit, den AS-Fortschreiten zu hemmen, indem sie die Makrophagenpolarisation und Autophagiewegemoduliert 6,7. Dennoch stellen die Multi-Komponenten-, Multi-Ziel- und Multi-Weg-Eigenschaften der TCM-Formeln Herausforderungen dar, ihre integrierten regulatorischen Mechanismen systematisch mit konventionellen reduktionistischen Ansätzen zu klären.

Um die molekularen Mechanismen, die die anti-atherosklerotischen Effekte von SJTMF vermitteln, zu erforschen und die Herausforderungen anzugehen, verfolgte diese Studie eine integrierte multidisziplinäre Strategie. Die Netzwerkpharmakologie, konzipiert von Hopkins 8,9, wurde genutzt, um ein multidimensionales Netzwerk des "Kräuterkomponenten-Ziel-Krankheitswegs" zu konstruieren. Dieser Ansatz erleichterte die Vorhersage der primären Wirkstoffe von SJTMF und potenzieller therapeutischer Ziele für die AS-Intervention, was mit den ganzheitlichen regulatorischen Eigenschaften von TCM übereinstimmt. Ergänzend dazu überwachte die Proteomik-Technologie, die hochdurchsatz- und hochpräzise qualitative und quantitative Proteinanalysen10 nutzte, dynamisch Veränderungen im AS-assoziierten Proteinexpressionsprofil nach einer SJTMF-Intervention in Tiermodellen. Dies ermöglichte die Identifikation wichtiger Effektormoleküle und Signalereignisse und lieferte damit experimentelle Belege für mechanistische Erkundungen. Anschließend wurden hochpräzise molekulare Andocksimulationen durchgeführt, um die Bindungsmodi und Bindungsenergien zwischen den von der Netzwerkpharmakologie vorhergesagten Kernzielen und den wichtigsten bioaktiven Komponenten zu bewerten, was eine theoretische Grundlage für potenzielle Komponenten-Ziel-Interaktionen liefert11. Im Vergleich zu alternativen Ansätzen, wie etwa ausschließlich auf Netzwerkpharmakologie-Vorhersagen zu vertrauen (anfällig für hohe Falsch-Positiv-Raten und ohne experimentelle Validierung)12 oder die Kombination nur von Proteomik mit molekularem Andocken (das möglicherweise nicht die durch Netzwerkanalyse vorhergesagten Systeminteraktionen erfasst), adressiert diese integrierte Strategie synergetisch diese inhärenten Einschränkungen13.

Durch die Integration multidimensionaler Techniken zielt diese Studie darauf ab, systematisch die zentralen pharmakodynamischen Materialgrundlagen, das Kernzielnetzwerk und die multipathischen synergistischen Mechanismen von SJTMF zu erläutern. So wird eine mechanismengetriebene theoretische Unterstützung für die Modernisierung der TCM und die Entwicklung innovativer Medikamente bereitgestellt.

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Protokoll

Alle Tierverfahren wurden mit Zustimmung des Versuchshauskomitees der Changchun University of Chinese Medicine durchgeführt (Ethikgenehmigung Nr. 2023521). Spezifische pathogenfreie (SPF) männliche C57BL/6J- und ApoE⁻/⁻ -Mäuse (5 Wochen alt, 18–22 g) wurden in die Studie aufgenommen (Laboratory Animal Use License Nos. SCXK (JI) 2023-002 und SCXK (SU) 2021-0013). Informationen zu Reagenzien und Instrumentierung finden Sie in der Materialtabelle.

1. Netzwerkpharmakologie

  1. Vorhersage der aktiven Komponenten und Ziele von SJTMF
    1. Untersuchen Sie die aktiven Bestandteile von Salvia miltiorrhiza, Panax notoginseng, Artemisia scoparia, Poria cocos, Alisma plantago-aquatica L, Amomum villosum, Santalum albumL, Citrus aurantium und Citrus reticulata Peel unter Verwendung der oralen Bioverfügbarkeit (OB) ≥ 30 % und der Arzneimittelähnlichkeit (DL) ≥ 0,18 als Kriterien.
    2. Untersuchen Sie die aktiven Bestandteile von Whitmania pigra Whitman, Bombyx batryticatus, Periostracum cicadae, Caulis bambusae in Taeniam und Ophicalcitum durch Anwendung der Fünferregel von Lipinski, mit folgenden Parametern: miLogP ≤ 5, nOHNH ≤ 5 und nOH ≤ 10.
    3. Kombinieren Sie die gescreenten Verbindungen mit ihren SMILES-Codes, um Verbindungsziele vorherzusagen.
      HINWEIS: Details zu den beiden oben genannten Datenbanken finden Sie in der Materialtabelle.
  2. Vorhersage von AS-bezogenen Zielen und Aufbau eines "Arzneimittel-Komponenten-Ziel"-Netzwerks.
    1. Nutzen Sie die GeneCards-Datenbank, um AS-bezogene Krankheitsziele mit standardisierter Krankheitsterminologie abzurufen.
    2. Verwenden Sie Venny 2.1 Software, um die sich überschneidenden Ziele zwischen SJTMF und AS als potenzielle therapeutische Ziele von SJTMF für AS zu identifizieren.
    3. Verwenden Sie Cytoscape 3.9.1, um ein "Arzneimittel-Komponenten-Ziel"-Netzwerkdiagramm zu erstellen.
      HINWEIS: Für Details zu den oben genannten Datenbanken siehe Materialtabelle.

2. Akklimatisierung

  1. Alle Mäuse werden in SPF-Einrichtungen untergebracht (24 °C; 50-60 % Luftfeuchtigkeit; 12 Stunden Hell/Dunkel-Zyklus). Stellen Sie ad libitum Standardessen und Wasser bereit. Rechnen Sie 7 Tage für die Akklimatisierung ein, bevor Sie Experimente beginnen.

3. Vorbereitung der SJTMF

  1. Bereiten Sie die 14-Kraut-Formulierung vor, die enthält: Salvia miltiorrhiza (Dan Shen) 30 g, Artemisia scoparia (Yin Chen) 10 g, Panax notoginseng (San Qi) 10 g, Poria cocos (Fu Ling) 10 g, Amomum villosum (Sha Ren) 10 g, Alisma plantago-aquatica L (Ze Xie) 30 g, Santalum albumL (Tan Xiang) 10 g, Citrus reticulata Schale (Chen Pi) 10 g, Citrus aurantium (Zhi Qiao) 10 g, Whitmania pigra Whitman (Shui Zhi) 10 g, Periostracum cicadae (Chan Tui) 10 g, Bombyx batryticatus (Jiang Can) 10 g, Caulis bambusae in Taeniam (Zhu Ru) 10 g und Ophicalcitum (Hua Rui Shi) 30 g.
  2. Dekokte Kräutermaterialien (insgesamt 1.800 g) 3× mit 8 Bänden destilliertem Wasser (1,5 Stunden pro Extraktion).
  3. Filtern Sie durch Mull und 100-Mesh Nylon.
  4. Filtrat bei 60 °C konzentrieren (Dichte: 1,23–1,27). Trockenkonzentrat unter reduziertem Druck bei 70 °C.
  5. Pulverisieren Sie getrockneten Extrakt mit einem 80-Maschen-Sieb (Ertrag: 20,6 %).
    HINWEIS: Nach einem zuvor veröffentlichten Bericht7 erhielten die Mäuse 3,56 g∙kg⁻¹∙Tag⁻¹ SJTMF-Extrakt (normalisiert nach Körperoberfläche).

4. Modellgründung

  1. AS bei ApoE-/- Mäusen mit einer 12-wöchigen fettreichen Diät (HFD; 20 % Fett, 1,25 % Cholesterin) induzieren. Messen Sie das Körpergewicht in 7-Tage-Abständen zur Stoffwechselüberwachung.
  2. Ordne C57BL/6J-Mäuse der Kontrollgruppe zu (Kontrolle, normale Ernährung + Kochsalzlösung). Zufällig werden erfolgreich modellierte Mäuse in vier Gruppen eingeteilt: Modellgruppe, Atorvastatin-Gruppe (0,0026 mg/g Atorvastatin), SJTMF-L-Gruppe (niedrig dosierte SJTMF, 3,56 g∙kg-1∙Day-1), SJTMF-H Gruppe (hochdosierte SJTMF, 7,12 g∙kg-1∙Day-1)7. Führe alle Interventionen morgens über 4 Wochen mit standardisiertem 0,4 ml Gavage durch.
    HINWEIS: Die Lagerlösungen von SJTMF wurden gemäß unserem festgelegten Protokoll7 vorbereitet. Die experimentellen Interventionen begannen in Woche 9, wobei die morgendliche Dosierung den klinischen temporalen Rhythmus aufrechterhielt. Mäuse wurden als erfolgreich modelliert, wenn offensichtliche atherosklerotische Plaques in der Aorta durch grobe Oil Red O-Färbung7 beobachtet wurden.

5. Probenentnahme, Aortenentnahme und -konservierung

HINWEIS: Nach 4 Wochen intragastrischer Verabreichung fasten Sie alle Mäuse für 12 Stunden (Wasser ad libitum). Missen Sie das Endgewicht und opfern Sie es dann durch eine zervikale Verrenkung unter Narkose.

  1. Schneide den Mausabdomen bis zum Xiphoideus-Prozess ein.
  2. Isolieren Sie die Aorta von der Aortenwurzel zur gemeinsamen Bifurkation der Iliakalarterie.
  3. Entfernen Sie überschüssiges Fettgewebe und durchschneiden Sie die Aorta etwa 1 cm distal vom Aortenbogen.
  4. Fixieren Sie die Aorta in Paraformaldehyd oder frieren Sie sie in flüssigem Stickstoff ein.
    HINWEIS: Sammeln Sie das Serum und lagern Sie die Aortengewebe bei -80 °C für zukünftige Analysen.
  5. HE-Fleck
    1. Setze Abschnitte in Xylol in der Reihenfolge für jeweils 20 Minuten, insgesamt doppelt so; Dann für jeweils 10 Minuten auf absolutes Ethanol übergeben, insgesamt zweimal. Hydrieren Sie Abschnitte, indem Sie durch eine absteigende gegraduerte Ethanolserie (95 %, 90 %, 80 %, 70 %) 5 Minuten pro Konzentration gehen.
    2. Färben in der Reihenfolge mit 0,4 % Hämatoxylin für 3–8 Minuten, dann mit 0,5 % Eosinlösung für 1–3 Minuten.
      HINWEIS: Spüle zwischen den Schritten gründlich mit destilliertem Wasser ab.
    3. Trocknen Sie die Abschnitte über eine aufsteigende Ethanolserie (95 % bis zum absoluten Ethanol), 5 Minuten pro Konzentration. Räume jeweils 5 Minuten lang mit Xylen frei, insgesamt zweimal. Lassen Sie es vollständig an der Luft trocknen und befestigen Sie es dann mit Neutralharz.
    4. Beobachten Sie unter dem Mikroskop und machen Sie Bilder.

6. Vollständige Proteinpräparation aus Aortengewebeproben

HINWEIS: Proteine wurden aus den Aortengeweben jeder der drei experimentellen Gruppen (Kontrollgruppe, Modellgruppe, SJTMF-H-Gruppe) isoliert.

  1. Aortengewebe im Lysepuffer homogenisieren (1,5 % SDS/100 mM Tris-HCl, pH 8,5) und dann 15 Minuten bei 95 °C inkubieren, um eine Proteindenaturierung zu erreichen.
  2. Kühlen Sie die Proben ab, zentrifugieren Sie sie dann bei 12.000 × g und 4 °C für 5 Minuten und sammeln Sie den Überstandsstoff. Fällen Sie die Proteine im Supernatant mit der Aceton-Ausfällungsmethode aus.
  3. Lösen Sie das Protein-Präzipitat erneut auf (8 M Harnstoff/100 mM Tris-HCl, pH 8,5), bereiten dann das BCA-Testkit gemäß den Anweisungen des Herstellers vor und bestimmen Sie die Gesamtproteinkonzentration, siehe Materialtabelle).
    HINWEIS: Mit derselben Proteinmenge in verschiedenen Proben wurde die gelöste Lösung verwendet, um alle Proben auf das gleiche Volumen zu füllen.
  4. Führen Sie Proteinreduktion und Alkylierung mit TCEP und CAA bei 37 °C für 1 Stunde durch.
  5. Trypsin (1:50) zur Proteinprobe hinzufügen und 24 Stunden bei 37 °C inkubieren (siehe Materialtabelle).
  6. Verwenden Sie TFA, um den pH-Wert auf 6,0 zu stellen und die Verdauung zu beenden. Zentrifugieren Sie die Probe bei 12.000 × g für 15 Minuten und reinigen Sie dann die Peptide aus dem Supernatant mit einer selbstgemachten SDB-RPS-Entsalzsäule (siehe Materialtabelle).
    HINWEIS: Das Peptid-Eluat wurde vakuumgetrocknet und bei -20 °C für spätere Verwendung gelagert.

7. Flüssigchromatographie – Tandem-Massenspektrometrie (LC – MS/MS)

  1. Injizieren Sie 200 ng Peptidverdauung mit einem Injektionsvolumen von 1 μL in eine C18-Fallensäule (75 μm × 2 cm, 3 μm, 100 Å). Anschließend wurden die Peptide auf einer umgekehrten C18-Analysesäule (75 μm × 15 cm, 1,7 μm, 100 Å) bei einer Durchflussrate von 0,3 μL/min getrennt.
  2. Verwenden Sie Wasser mit 0,1 % Ameisensäure (FA) als mobile Phase A und Acetonitril (ACN) mit 0,1 % FA als mobile Phase B (siehe Materialtabelle). Wenden Sie einen linearen Gradient von 12 % auf 30 % B über 0–12 Minuten an, gefolgt von einer Erhöhung von 30 % auf 80 % B über 12–15 Minuten, und halte die Säulenwäsche bei 80 % B von 15–18 Minuten. Stellen Sie die Durchflussrate von 0 bis 15 Minuten auf 0,300 μL/min ein und erhöhen Sie sie dann von 16 bis 18 Minuten auf 0,400 μL/min. Stellen Sie die Kapillarspannung auf 1500 V ein.
  3. Erfassen Sie MS- und MS/MS-Spektren im Bereich von 100 bis 1700 m/z.
  4. Scanne die Ionenmobilität im Bereich von 0,6 bis 1,6 Vs/cm². Stelle die Akkumulierungszeit und Rampezeit auf 50 ms ein.

8. Analyse der Proteinfunktion

HINWEIS: Differentiell exprimierte Proteine (DEPs) aus der Proteomik wurden mit Schlüsselzielen aus der Netzwerkpharmakologie überschnitten, und die sich überlappenden Zielproteine wurden für die funktionelle Annotation der Genontologie (GO) und die Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) Signalweganreicherungsanalyse ausgewählt. Funktionale Kategorien und Wege mit P < 0,05 wurden als signifikant angesehen.

  1. Analysieren Sie die DIA-Rohdaten im bibliotheksfreien Modus.
  2. Durchsuche die Spektrendateien in der Maus-Proteinsequenzdatenbank.
  3. Stellen Sie die Hauptsuchparameter ein.
    1. Aktivieren Sie Optionen zur Erzeugung von Vorläuferionen für die in silico-vorhergesagte spektrale Bibliotheksgenerierung.
    2. Spezifizieren Sie das Enzym mit maximal 2 erlaubten fehlenden Spaltungen (siehe Materialtabelle).
    3. Setze die Carbamidomethylierung von Cystein (C) als feste Modifikation.
    4. Setzen Sie die Oxidation von Methionin (M) und Protein-N-terminaler Acetylierung als variable Modifikationen fest.
    5. Stellen Sie die Genauigkeit der Vorläufermassen und die MS1-Massengenauigkeit auf 15 ppm ein.
    6. Ermöglichen Sie eine Übereinstimmung zwischen Durchläufen und heuristische Proteininferenz.
    7. Setzen Sie die Schwelle für die Vorläufer-Falschentdeckungsrate (FDR) auf 1 % für eine zuverlässige Identifizierung.
  4. Führe die DIA-NN (1.8.2 Beta 11) Analyse durch.
    HINWEIS: Führen Sie eine Quantifizierung auf Proteinebene mit DIA-NN durch und führen Sie bioinformatische Analysen und Visualisierungen mit R durch. Signifikant wurden DEPs durch den P-Wert aus dem T-Test des Studenten und die Schwellenwerte für Faltungsänderung bestimmt.

9. Molekulares Andocken

  1. Laden Sie die dreidimensionale Kristallstruktur des Zielproteins aus der RCSB-PDB-Datenbank herunter und speichern Sie sie im PDB-Format; In der Zwischenzeit laden Sie die Molekularstruktur der aktiven Kernkomponente von SJTMF aus der PubChem-Datenbank herunter und speichern Sie sie im SDF-Format.
  2. Verwenden Sie PyMOL 2.6.0, um Wasserentfernung und Hydrierung der Zielproteinstruktur durchzuführen, irrelevante endogene Liganden zu entfernen und die verarbeitete Proteinstruktur im PDB-Format zu speichern; erhalten Sie die Docking-Pocket-Parameter über das Getbox-Plugin von PyMOL, wobei die Gridbox-Parameter wie folgt gesetzt sind: center_x = -7,2, center_y = 53,4, center_z = 30,6, size_x = 73,7, size_y = 85,9, size_z = 67,2 und die Anzahl der Andock-Konformationen num_modes = 10.
  3. Importiere die verarbeitete Zielproteindatei und die Datei der SJTMF-Kern-Compound-Datei separat in AutoDock Tools 1.5.6, um beide Dateien in das PDBQT-Format umzuwandeln, und führe dann ein molekulares Docking mit AutoDock Vina 1.1.2 basierend auf den oben definierten Grid-Box-Parametern durch.
  4. Visualisieren Sie die molekularen Andockergebnisse mit PyMOL.

10. Statistiken

  1. Führen Sie statistische Analysen durch.
  2. Drücken Sie die Ergebnisse als Mittelwert ± Standardabweichung (SD) aus.
  3. Spezifizieren Sie die Verwendung des Tukey'schen Honest Significant Difference (HSD)-Tests für Post-hoc-Analysen nach Einweg-ANOVA, wenn die Daten Normalität und Homogenität der Varianzen erfüllten; wenden Sie den Games-Howell-Test für heteroskedastische Daten an. Betrachten wir ein p < 0,05 als statistisch signifikant.
  4. Visualisieren Sie die Daten mit GraphPad Prism8.0.2.

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Ergebnisse

SJTMF unterdrückt die Bildung von atherosklerotischer Plaque bei ApoE-/- Mäusen
Um die hemmende Wirkung von SJTMF auf AS zu untersuchen, wurde das ApoE-/Mausmodell verwendet, um Veränderungen des Körpergewichts zu überwachen und histopathologische Veränderungen in der Aorta zu beobachten. Im Vergleich zur Modellgruppe milderte die SJTMF-Intervention die Körpergewichtszunahme bei HFD-gefütterten ApoE-/-...

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Diskussion

Obwohl frühere Studien gezeigt haben, dass SJTMF entzündungshemmende Effekte hat und in ApoE⁻/⁻-Mausmodellen 6,7 eine Makrophagepolarisation induziert, bleiben die spezifischen molekularen Mechanismen, die seiner anti-atherosklerotischen Aktivität zugrunde liegen, unklar. Das Prinzip der "gleichen Behandlung für verschiedene Krankheiten" in der traditionellen...

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Offenlegungen

Die Autoren haben keine Interessenkonflikte zu erklären.

Danksagungen

Diese Studie wurde von der Naturwissenschaftlichen Stiftung der Provinz Jilin (Nr. YDZJ202401644ZYTS) unterstützt.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
2-Chloracetamid (CAA)Sigma-AldrichC0627-100G
4%-Paraformaldehyd-FixlösungSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.80096618
0.5 & Strich; 10 & Mikro; L MikropipetteEppendorf4924000029
10 & Strich; 100 & Mikro; L MikropipetteEppendorf4924000053
20 – 200 & Mikro; L MikropipetteEppendorf4924000061
100 – 1.000 & Mikro; L MikropipetteEppendorf4924000088
1000 & Mikro; L-PipettenspitzenNEST Life Science Co., Ltd.303216
10 & Mikro; L-PipettenspitzenNEST Life Science Co., Ltd.301016
20 & Mikro; L-PipettenspitzenNEST Life Science Co., Ltd.302106
15-mL ZentrifugenröhreNEST Life Science Co., Ltd.601052
1,5 mL ZentrifugenröhreNEST Life Science Co., Ltd.615601
Eine hochdurchgängige experiment- und referenzbasierte Datenbank der traditionellen chinesischen Medizin (HERB)/http://herb.ac.cn/v2
Acetonitril (LC-MS)Thermo Fisher ScientificA955-4
AcetonylacetonSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10000418
AmmoniakwasserSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10011028
AutoklavShanghai Sanshen Medical Devices Co., Ltd.YM75
Acclaim PepMap (75µ m*2cm, C18, 3µ m, 100Å)Thermo164535
AURORA ULTIMATE (75µ m*25 cm, 1,6 mm und mikro; m, 100Å)AURORAAUR3-25075C18-CSI
BCA-Protein-Assay-KitSangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.C503021-0500
Tischgekühlte Zentrifuge mit hoher GeschwindigkeitHunan Kecheng Instrument Equipment Co., Ltd.H1 - 16KR
Bromophenol BlueSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.71008060
BlockheizerHangzhou Miu InstrumenteDKT-100
ChloroformSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10006818
ChemilumineszenzbildgebungssystemHangzhou Shenhua Technology Co., Ltd.SH - 523
Clean BenchSuzhou Jinghua Equipment Co., Ltd.SW-CJ-2D
DeckglasJiangsu Shitai Experimental Equipment Co., Ltd.10212450C
Cytoscape v3.9.1//
DIA-NN (V1.8.1)Das Francis Crick Institutgithub.com/vdemichev/DiaNN
Digitales Display mit Konstant-Temperatur-WasserbadChangzhou Jinnan Instrument Manufacturing Co., Ltd.HH - W600
Destaining ShakerWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.TSY-B
EntwässerungsmaschineWuhan Junjie Electronics Co., Ltd.JT-12J
EosinWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.E8090
Einbettung von ParaffinSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.69019361
Ethanol AbsoluteSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10009218
EinbettungsmaschineWuhan Junjie Electronics Co., Ltd.JB-P5
GraphPad-Prisma/8.0.2
GletscheressigsäureSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10000218
GeneCards/https://www.genecards.org/
GlycerolSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10010618
GlycinBiofroxx1275GR500
Gen-Ontologie (GO)/geneontology.org
HämatoxylinWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.G1140
Horizontaler ShakerHaimen Qilinbeier Instrument Manufacturing Co., Ltd., JiangsuTS - 1
Hydrophober BarrierestiftServicebioWG1066-1
HCIXinyang Chemische ReagenzfabrikGB622-89
Hochleistungs-FlüssigkeitschromatographieAgilent1200
IsopropanoSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.80109218
Image-Pro PlusMedienkybernetikVersion 6.0
BildbildsystemNikonDS-Fi3
IRIS-Fine Mikro-ZerlegungsscherenRWD Life Science Co., Ltd.S12004-09
Kyoto-Enzyklopädie der Gene und Genome (KEGG)/www.genome.jp/kegg/
Objektträger mit dem MikroskopNantong Mevid Life Science Co., Ltd.PC2-301
MikrowellenofenGalanz Mikrowellenofen Elektrogeräte Co., Ltd.P70D20TL-P4
Mini-ZentrifugeDragon LabD1008E
Neutrales HarzWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.G8590
NaClSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10019318
NCBI/www.ncbi.nlm.nih.gov
Kontaktloser UltraschallzellpulverisiererSCIENTZ08-III
n-ButanolSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.100052190
OfenShanghai Huitai Instrument Manufacturing Co., Ltd.DHG-9140A
PubChem/https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
PBS-PhosphatpufferpulverWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.P1010
Pathologisches MikrotomLeica Instruments Co., Ltd. (Shanghai)RM2016
Tragbare ZentrifugeWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.D1008
R 4.5.1//
RIPA Lysis-Puffer (1,5 ML)MeilunbioMA0151
Natriumdodecylsulfat (SDS)Sigma-AldrichL3771-500G
SpeedVacGemmyCV200
SPSS-SoftwareIBM SPSS-StatistikenVersion 22
Nahtbindende ZangeRWD Life Science Co., Ltd.FC11001R-11
Stereo-DissektionsmikroskopRWD Life Science Co., Ltd.77001S
Spin-Säulen RMCWBIOCW0597S
timsTOF Pro MassenspektrometerBruker DaltonicstimsTOF Pro
Pharmakologie-Datenbank und Analyseplattform für traditionelle chinesische Medizinsysteme (TCMSP)/https://tcmspw.com/tcmsp.php
ThermomischerHangzhou Miu InstrumenteMTC-100
Trifluoressigsäure (TFA)Sigma-Aldrich299537-500G
Tris(2-Carboxyethyl)Phosphinhydrochlorid (TCEP)Sigma-AldrichC4706-10G
TrypsinSigma-AldrichT575-31N-10
GewebehomogenisiererHangzhou Miu InstrumenteMT-30K
Tris(Hydroxymethyl)Aminomethan (Tris-Base)Sigma-AldrichT1503-1KG
UltiMate 3000 RSLCnano SystemThermowissenschaftlichUltiMate 3000 RSLCnano
UniProt (03.01.2023)Das Francis Crick Institutgithub.com/vdemichev/DiaNN
HarnstoffSigma-Aldrich51456-500G
Venny2.1/https://www.bioinformatics.com.cn/static/others/jvenn/example.html
Vortex-MixerKylin-BellWIRBEL-5
Vannas Federbelastete SchereRWD Life Science Co., Ltd.S11001-08
Wasser (LC-MS)Thermo Fisher ScientificW6-4
XylenSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10023418

Referenzen

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