Der Colony-Forming Unit (CFU)-Test ist eine grundlegende Technik zur Untersuchung hämatologischer Erkrankungen, einschließlich myelodysplastischer Syndrome (MDS) und akuter myelooider Leukämie (AML). Dieser Test verwendet halbfeste Medien, die mit definierten Zytokin-Kombinationen ergänzt werden, um das dreidimensionale Wachstum und die linienspezifische Differenzierung von erythroiden und myeloiden Vorläuferzellen zu unterstützen. Allerdings stellen periphere Blut- und Knochenmarkproben von Patienten abgeleitete periphere Blut- und Knochenmarkproben aufgrund verminderter Lebensfähigkeit, erhöhter Handhabungsempfindlichkeit und Variabilität im Koloniewachstum technische Herausforderungen dar. Darüber hinaus zeigen bestehende Richtlinien zur Identifizierung und Zählung von Kolonien erhebliche Variabilitäten bei der Definition von Koloniegröße und Linientypen, was die Reproduzierbarkeit zwischen den Studien einschränkt. Das hier beschriebene Protokoll ist für das Wachstum und die Differenzierung hämatopoietischer Stamm- und Vorläuferzellen optimiert, die aus MDS- und AML-Patientenproben isoliert wurden. Das Protokoll legt Wert auf sanfte Zellbehandlung, sterile Verarbeitung von Patientenproben, optimierte Kulturbedingungen und auf die auf patientenabgeleitete Zellen zugeschnittene Wachstumsdauern. Dieses Protokoll bietet einen praktischen Rahmen für CFU-Assays mit patientenabgeleiteten Proben und etabliert eine Standardkennzahl für konsistente Kolonienzählungen und -analysen in der hämatologischen Malignologieforschung.