June 17th, 2009
Das Video dokumentiert Methoden zur Erhebung Coastal Marine Wasserproben und deren Verarbeitung für verschiedene Downstream-Anwendungen einschließlich Biomasse-Konzentration, Aufreinigung von Nukleinsäuren, Zell-Hülle und Fülle, Nährstoff-und Spurengasen analysiert.
Hallo, ich bin Elena Kova vom Labor von Stephen Hallam in der Abteilung für Mikrobiologie und Immunologie an der University of British Columbia. Heute zeigen wir Ihnen ein Verfahren zum Sammeln von Meerwasser für physikalische, chemische und biologische Analysen. Wir verwenden dieses Verfahren in unserem Labor, um ozeanische grafische Parameter von Meerwasser zu untersuchen.
Also lasst uns loslegen. Zuerst wird die Anzahl der Würfe und die Tiefen in jedem Guss zugewiesen, dann werden die zu beprobenden Tiefen und das Gesamtvolumen bestimmt, das für den aktuellen Guss gesammelt werden soll. Stellen Sie sicher, dass sich die Durchfluss- und Kin-Wasserprobenahmegeräte in der geöffneten Position befinden und dass alle Ventile und Zapfhähne geschlossen sind.
Befestigen Sie das CTD an der Basis der Schnur und senken Sie es für die tiefste Tiefe im Profil ins Wasser. Bringen Sie ein Probenahmegerät unmittelbar nach dem CTD auf die Leitung. Vergewissern Sie sich, dass die Leitung richtig in die Gerätehalterung eingepasst und die Schrauben festgezogen sind.
Befestigen Sie an jedem Gerät mit Ausnahme der tiefsten Probenahmetiefe einen beschwerten Messenger, bevor Sie es ins Wasser lassen. Verringern Sie die Linie und den Abstand zwischen der ersten angegebenen Tiefe und der nächsten, und montieren Sie dann ein anderes Probenahmegerät. Beachten Sie, dass für Tiefenintervalle, in denen großvolumige Wasserproben entnommen werden, insgesamt zwei x 12-Liter-Flaschen nacheinander in einem Abstand von etwa 0,75 Metern geladen werden.
Nachdem alle Geräte in der Leitung sind, senken Sie die Leitung auf die tiefste Tiefe ab und lassen Sie zwei Minuten verstreichen. Schicken Sie einen Boten nach unten, der jedes Gerät in die Schließposition bringt. Lassen Sie einige Minuten verstreichen, bevor Sie die Schnur wiederfinden.
Um sicherzustellen, dass alle Geräte geschlossen sind, wickeln Sie die Leine ein und entladen Sie jedes Gerät auf das Deck, wenn es aus dem Wasser kommt. Für Tiefen, die große Probenvolumina für die Protein-DNA- oder RNA-Aufreinigung erfordern, setzen Sie zwei Probenahmegeräte zusammen ein. Sammeln Sie RNA sofort aus einer Flasche und filtern Sie sie auf dem Schiff.
Nachdem Sie Chemikalien und Nährstoffe in der anderen Flasche probiert haben, lassen Sie das restliche Wasser in das Auto ab, um ein Endvolumen von 20 Litern zu erhalten. Für Proben mit geringem Volumen stellen Sie einen Liter Wasser für die Filtration in sterilen Nalgene-Flaschen beiseite. In der Regel werden Proben mit geringem Volumen aus 16 Tiefenintervallen als 16 x Ein-Liter-Proben und sechs x 20-Liter-Proben als Proben mit hohem Volumen entnommen.
Entnehmen Sie bei der Entnahme von Gasproben immer Sauerstoff- und Spurengasproben. Befestigen Sie zunächst ein dünnes Stück Schlauch am Zapfhahn des Wasserprobenahmegeräts. Legen Sie das andere Ende des Schlauchs in die glos Serumflaschen.
Spülen Sie die Serumflasche dreimal aus, probieren Sie jedoch Wasser und füllen Sie es bis zum Überlaufen, sodass keine Luftblasen vorhanden sind. Geben Sie 50 Mikroliter Quecksilberchlorid in die Serumflasche. Achten Sie darauf, dass keine Luftblasen in die Probe gelangen.
Verschließen Sie die Serumflasche mit einem Gummistopfen C-Crimp mit einer Aluminiumkappe und lagern Sie sie dann auf Eis, um Proben für Nährstoffmessungen wie Nitrat, Phosphat und Silikat zu sammeln. Spülen Sie zunächst eine 60-ml-Spritze mit Probenwasser. Befestigen Sie dann einen 0,2 Mikrometer großen Acro-Scheibenfilter in einer Reihe.
Drücken Sie ca. zwei ml Wasser durch die Spritze. Um den Filter zu spülen. Spülen Sie eine Polyethylenflasche dreimal mit ca. 10 ml gefiltertem Wasser aus.
Schütteln Sie die Flasche beim Spülen und geben Sie dann gefiltertes Probenwasser in die etwa zu drei Vierteln gefüllten Flaschen. Lagern Sie die Probe auf Eis. Entleeren Sie die Sammelröhrchen mit distalem Wasser, um Proben für Ammoniakmessungen zu entnehmen.
Spülen Sie zuerst die Sammelröhrchen, aber das Wasser vollständig ab. Füllen Sie einen 10-ml-Messzylinder mit Probenwasserleitung mit fünf ml Messwasser aus dem Messzylinder und entleeren Sie den Rest aus dem Zylinder. Geben Sie dann die fünf ml wieder in den leeren Zylinder.
Sobald Proben aus allen Tiefen entnommen wurden, werden 7,5 ml Ammonium in jedes Röhrchen gegeben. Um Proben für die Zellzählung zu entnehmen, füllen Sie ein vorbeschriftetes 50-ml-Falcon-Röhrchen mit 5,4 ml und einer Höhe von 37 % bis zur 50-ml-Markierung, um eine Endkonzentration von 4 % zu erreichen. Achten Sie darauf, dass das Röhrchen nicht überläuft. Lagern Sie die Probe auf Eis, um Proben zu sammeln.
Für Schwefelwasserstoffmessungen. Füllen Sie ein vorbeschriftetes 50-ml-Falcon-Röhrchen mit drei ml Zinkacetat bis zum Rand. Achten Sie darauf, dass der Schlauch nicht überläuft.
Lagern Sie die Probe auf Eis, um kleine Mengen zu sammeln. Für die Konzentration von Biomasse. Füllen Sie einen Liter Nalgene-Flaschen bis zum Rand, um große Mengen für die Biomassekonzentration zu sammeln.
20 Liter Ballonflaschen bis zum Rand füllen. Das Endergebnis der Meerwasserprobenahme ergibt etwa 32 bis 48. Gasproben, 32 Ammoniumproben.
16 Schwefelwasserstoffproben. 16 Proben für die Zellzählung. Sechs 20-Liter-Autos, 16 Ein-Liter-Flaschen und vier Sterex.
Punkt zwei Zwei-Mikrometer-Filter mit mikrobieller Biomasse werden für später aufbewahrt. RNA-Isolierung. Wir haben gerade gezeigt, wie man verschiedene Arten von Wasserproben für die biochemische Analyse sammelt.
Dies erfordert ein hohes Maß an Vorbereitung und Planung. Planen Sie also zwei Tage vor der Reise ein, um die Dinge in Ordnung zu bringen, und einen Tag danach für die Aufräumarbeiten, lassen Sie kein Salzwasser mit einer Peraltpumpe oder in die Aluminium-Zago-Box kommen, die zum Transport der Feldausrüstung verwendet wird. Behandeln Sie das Gerät mit Respekt und es wird lange Zeit gute Dienste leisten.
Das war's also. Vielen Dank fürs Zuschauen und viel Erfolg bei Ihren Experimenten.
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Dieses Video dokumentiert Methoden zur Sammlung von marinen Küstenwasserproben und deren Verarbeitung für verschiedene nachgelagerte Anwendungen, einschließlich Biomassekonzentration, Nukleinsäureaufreinigung, Zellabfluss, Nährstoff- und Spurengasanalysen.
Robust seawater sampling and collection protocols are foundational for generating high-quality datasets in marine biopharma discovery, enabling accurate assessment of environmental variables and biological materials. These methods underpin downstream analyses such as nucleic acid purification, cell abundance quantification, and nutrient profiling, which are critical for target validation and mechanistic de-risking in marine-derived drug discovery. Standardized collection ensures reproducibility and comparability across discovery programs, supporting portfolio-wide decision-making.
Seawater sampling and collection methods are positioned at the front end of the marine biopharma discovery continuum, providing foundational material for workflows spanning target validation, screening, and translational research.