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Zebrafisch Whole Mount High-Resolution Doppel Fluorescent In-situ Hybridisierung
Zebrafisch Whole Mount High-Resolution Doppel Fluorescent In-situ Hybridisierung
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JoVE Journal Biology
Zebrafish Whole Mount High-Resolution Double Fluorescent In Situ Hybridization

Zebrafisch Whole Mount High-Resolution Doppel Fluorescent In-situ Hybridisierung

Full Text
24,000 Views
12:31 min
March 25, 2009

DOI: 10.3791/1229-v

Tim Brend1, Scott A. Holley1

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,Yale University

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a high-resolution double fluorescent in situ hybridization protocol for analyzing gene expression patterns in zebrafish embryos. The method allows for the determination of the overlap of expression domains of two genes, utilizing a propidium iodide nuclear counter-stain to enhance tissue organization visualization.

Key Study Components

Area of Science

  • Developmental Biology
  • Gene Expression Analysis
  • Fluorescent Imaging Techniques

Background

  • Whole mount in situ hybridization is widely used in developmental biology.
  • This technique helps visualize gene expression in embryos.
  • High-resolution imaging is crucial for understanding gene interactions.
  • Counter-staining techniques improve the clarity of tissue organization.

Purpose of Study

  • To provide a detailed protocol for double fluorescent in situ hybridization.
  • To analyze the expression patterns of single and overlapping genes.
  • To enhance visualization of mRNA distribution in zebrafish embryos.

Methods Used

  • Hybridization of antisense ribo probes to target mRNA.
  • Use of peroxidase-conjugated antibodies for detection.
  • Application of aramide-conjugated fluoro four for visualization.
  • Washing unbound IDE to reveal subcellular mRNA patterns.

Main Results

  • Successful visualization of gene expression patterns in zebrafish embryos.
  • Ability to compare expression of two genes using distinct probes.
  • High-resolution imaging reveals detailed subcellular distribution.
  • Demonstrated effectiveness of the protocol in a laboratory setting.

Conclusions

  • The protocol provides a reliable method for gene expression analysis.
  • High-resolution imaging is essential for developmental biology studies.
  • Future applications may include comparative studies of gene function.

Frequently Asked Questions

What is whole mount in situ hybridization?
It is a technique used to visualize gene expression in whole embryos.
What organisms can this method be applied to?
This method is demonstrated using zebrafish embryos.
How does the double fluorescent method work?
It uses two distinct probes to visualize the expression of two genes simultaneously.
What is the role of propidium iodide in this protocol?
Propidium iodide is used as a nuclear counter-stain to enhance tissue organization visibility.
What are the advantages of high-resolution imaging?
High-resolution imaging allows for detailed visualization of subcellular mRNA distribution.
Can this protocol be adapted for other species?
While this protocol is specific to zebrafish, adaptations may be possible for other organisms.

Whole mount in situ Hybridisierung ist eine der am häufigsten verwendeten Techniken in der Entwicklungsbiologie. Hier präsentieren wir ein hochauflösendes Doppel-Fluoreszenz-in situ-Hybridisierung Protokoll zur Analyse der genauen Expressionsmuster eines einzelnen Gens und zur Bestimmung der Überlappung der Ausdruck Domains von zwei Genen. Wir gehören eine Propidiumiodid nukleare Gegenfärbung des Gewebes Organisation hervorzuheben.

Dieses Verfahren ermöglicht es uns, Muster der Genexpression in Zebrafischembryonen mit hoher Auflösung zu bestimmen, eine Antisense-Ribosonde wird mit der komplementären Ziel-mRNA hybridisiert. Die markierte Ribo-Sonde wird durch einen Antikörper erkannt, der an ein Peroxidase-Enzym konjugiert ist, Aramid-konjugiertes Fluorvier wird den Embryonen zugesetzt, und die Peroxidase wandelt die IDE in eine hochreaktive Verbindung um. Dies führt zu einer stabilen Ablagerung des Fluorviers, ungebundene IDE wird weggespült und zeigt das detaillierte subzelluläre Muster der mRNA-Verteilung.

Die Expression eines zweiten Gens kann mit einer eindeutig markierten Sonde und einem anderen Tyrom fluoro four beobachtet werden, was einen detaillierten Vergleich der Expression ermöglicht. Hallo, ich bin Tim Brent aus dem Labor von Scott Holly in der Abteilung für Molekular-, Zell- und Entwicklungsbiologie an der Yale University. Heute zeigen wir Ihnen ein Verfahren zur hochauflösenden Doppelfluoreszenz in situ von Zebrafischembryonen in allen Laboratorien.

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