Name: Denaturierende Gradienten-Gelelektrophorese (DGGE) (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-02-25T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 52 s
Description: Lernen Sie die Denaturierende Gradienten-Gelelektrophorese (DGGE) zur Analyse bakterieller Gemeinschaften in Biofilmen. Diese Methode ermöglicht die Untersuchung von 16S rRNA-Sequenzen zur Erforschung mikrobieller Dynamiken.

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denaturierende gradienten-gelelektrophorese (dgge)

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

Denaturierende Gradienten-Gelelektrophorese (DGGE)

Okay. Hallo, mein Name ist Celeste Peterson und ich bin wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Harvard University, wo ich mikrobielle Biofilm-Gemeinschaften erforsche. Ich charakterisiere die bakteriellen Gemeinschaften, indem ich ihre 16S-NrRNA-Sequenz analysiere und untersuche, wie sich diese Sequenz im Verlauf der Zeit und im Raum verändert. Dazu verwende ich die DDGE.Dies ist kein normaler Acryl meines Wells; er muss während des Betriebs bei 60 Grad gehalten werden, und der Puffer muss kontinuierlich durchgepumpt werden. Daher werden wir den Puffer etwa eine Stunde lang erwärmen, bis er 60 Grad erreicht hat, und anschließend können wir den Towel laufen lassen. Jetzt werde ich diese Platte mit verdünnter uc-Lösung waschen, um Verunreinigungen zu entfernen, und dann einschalten.So etwas kann Regelmäßigkeiten verursachen. Es ist wichtig, das gesamte Wasser abzuwischen. Wenn ich das Gel zusammenbaue, werde ich diesen Chip auf der Außenseite des Gels anbringen.Das Gel befindet sich also zwischen diesen beiden Glasscheiben, und der Chip wird außen liegen und das Gel dazwischen nicht beeinflussen. Nun werde ich das Gel in diesen Klammern zusammenbauen und sie dann zusammendrücken, ind

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Research

Forschung

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Biology

Biologie

Denaturierung Harnstoff-Polyacrylamid-Gelelektrophorese wird verwendet, um Einzelstrang-DNA oder RNA getrennt bis zu einer Grenze von 500 Nukleotiden. Urea in Kombination mit Hitze denaturiert Proben und unstrukturierte Einzelstränge in der Gel-Matrix migrieren nach ihrem Molekulargewicht.

Denaturierung Urea Polyacrylamidgelelektrophorese (Urea PAGE)

Ein Basis-Protokoll für die Trennung von DNA-Fragmenten unter Verwendung von Agarosegel-Elektrophorese beschrieben.

Agarosegel-Elektrophorese für die Trennung von DNA-Fragmenten

Dieses Video demonstriert die auf zweidimensionalen halbdenaturierenden Agarosegelelektrophoresen basierende Trennung von Amyloidfasern. Die Technik trennt die polymorphen Amyloid-Aggregate anhand ihrer heterogenen Größe.

Zweidimensionale semi-denaturierende Agarose-Gelelektrophorese: Eine Technik zur Trennung polymorpher Amyloidfasern basierend auf Größenheterogenität

In diesem Video demonstrieren wir eine zweidimensionale Gelelektrophorese-Methode, die einzelne Proteine aus einer komplexen Proteinmischung trennt, die aus Tumorgeweben des humanen nichtfunktionellen Hypophysenadenoms (NFPA) gewonnen wurde. Die Proteine werden in der ersten Dimension anhand ihrer elektrischen Ladung und in der zweiten Dimension anhand von Molekulargewichten weiter getrennt.

Zweidimensionale Polyacrylamid-Gelelektrophorese: eine Trenntechnik zur Analyse von Proteinen in komplexen Proteingemischen basierend auf Ladung und Molekulargewicht

Der schnelle Nachweis und die zuverlässige Quantifizierung von RNA-Editing-Ereignissen auf genomischer Ebene bleiben eine Herausforderung und basieren derzeit auf direkten RNA-Sequenzierungsmethoden. Das hier beschriebene Protokoll verwendet die Mikrotemperaturgradientengelelektrophorese (μTGGE) als einfache, schnelle und tragbare Methode zum Nachweis der RNA-Bearbeitung.

Ein Nonsequencing-Ansatz für den schnellen Nachweis der RNA-Editierung

Dieses Video zeigt das Protokoll eines in-vitro-Angiogenese-Assay, rekapituliert mehrere Stufen der Angiogenese. Zeitraffer-Bilder von Keimen, Lumenbildung, Verzweigung und Anastomose - die wichtigsten Merkmale der Angiogenese - gezeigt werden.

Optimierte Fibringel Bead Assay für das Studium der Angiogenese

Wir beschreiben ein Protokoll für die Mikrofabrikation der Gradienten-erzeugenden Mikrofluidik-Gerät, das räumliche und zeitliche Verläufe in klar definierten Mikroumgebung erzeugen können. Bei diesem Ansatz kann der Gradient-Erzeugung mikrofluidischen Gerät verwendet, um gerichtete Wanderung, Embryogenese, Wundheilung und Krebs Metastasen zu untersuchen.

Ein Gradient-Erzeugung Mikrofluidikvorrichtung für Zellbiologie

SDD-AGE ist eine nützliche Technik für die Erkennung und Charakterisierung von Amyloid-ähnlichen Polymeren in den Zellen. Hier zeigen wir eine Anpassung, dass diese Technik zugänglich großflächige Anwendungen macht.

Screening für Amyloid-Aggregation durch Semi-denaturierenden Detergens-Agarose-Gel-Elektrophorese

Wir beschreiben ein Verfahren zur Gewinnung von hohem Molekulargewicht von genomischer DNA aus planktonischen Biomasse auf 0,22 um Sterivex Filter, durch Cäsiumchlorid-Dichtegradientenzentrifugation zur Reinigung folgte konzentriert.

DNA-Extraktion von 0,22 pM Sterivex Filter und Cäsiumchlorid-Dichtegradientenzentrifugation

In diesem Video, beschreiben wir die Charakterisierung von Multiproteinkomplexen (MPL) durch blaue nativen Polyacrylamidgelelektrophorese (BN-PAGE). In einer ersten Dimension sind dialysiert Zelllysaten durch BN-PAGE getrennt an die einzelnen MPL zu identifizieren. In einer zweiten Dimension SDS-PAGE, werden MPC von Interesse weiter unterteilt, um ihre Wähler durch Immunoblot analysieren.

Blaue Native Polyacrylamid-Gelelektrophorese (BN-PAGE) zur Analyse von Multiproteinkomplexen aus Zelllysaten

Lernen Sie die Denaturierende Gradienten-Gelelektrophorese (DGGE) zur Analyse bakterieller Gemeinschaften in Biofilmen. Diese Methode ermöglicht die Untersuchung von 16S rRNA-Sequenzen zur Erforschung mikrobieller Dynamiken.

Denaturierende Gradienten-Gelelektrophorese (DGGE)

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