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DOI: 10.3791/2887-v
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Wir bieten ein verbessertes Protokoll zur Extraktion von DNA mit hohem Molekulargewicht aus hypersaline mikrobielle Matten. Mikrobielle Zellen sind von der Matte Matrix vor der DNA-Extraktion und Reinigung getrennt. Dies erhöht die Konzentration, Qualität und Größe der DNA. Das Protokoll kann für andere feuerfeste Proben verwendet werden.
Das übergeordnete Ziel dieses Verfahrens ist es, hochmolekulare DNA aus hypersalzhaltigen mikrobiellen Matten zu extrahieren. Dies wird erreicht, indem zunächst mikrobielle Zellen aus der mikrobiellen Matte homogenisiert und extrahiert werden. Die mikrobiellen Zellen werden dann mit Hilfe von Gefrier-, Auftau- und chemischen Methoden gelegt.
Als nächstes folgt die Entfernung von Zelltrümmern und RNA mit organischen Extraktionen und RNAs, gefolgt von der DNA-Extraktion. Der letzte Schritt des Verfahrens ist die DNA-Fällung und -Reinigung. Letztendlich können Ergebnisse erzielt werden, die DNA von hoher Molekulargewichtsqualität und -konzentration zeigen.
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