Automatisierte Kapillarelektrophorese-basierte Analyse der Fragmentgrößenverteilung von cfDNA: eine DNA-Mikrochip-basierte Methode zur Untersuchung der Größenverteilung von DNA-Fragmenten, die aus Bioflüssigkeiten isoliert wurden

Eine sterbende Zelle setzt Fragmente von zellfreier oder cfDNA außerhalb der Zelle frei. Um die Größenverteilung von cfDNA-Fragmenten zu analysieren, beginnen Sie mit einem Multiwell-DNA-Chip - einem elektrophoretischen Miniatur-Kapillarsystem. Jedes Well im Chip enthält an seiner Basis zahlreiche mikrofluidische Trennkanäle.

Laden Sie die Polysaccharid-Gel-Matrix und die Fluoreszenzfarbstoffmischung in die dafür vorgesehene Vertiefung auf dem Chip. Positionieren Sie den Chip auf der Ansaugeinheit, die mit einer leeren Spritze ausgestattet ist. Schließen Sie die Ansaugeinheit und drücken Sie den Kolben nach unten, um Druck nach unten zu erzeugen. Dies erleichtert den Eintrag des viskosen Gels aus der Vertiefung in den jeweiligen Trennkanal.

Öffnen Sie die Assemblierung, und füllen Sie die verbleibenden Vertiefungen mit cfDNA-Suspension und einer DNA-Leiter des bekannten Größenbereichs. Montieren Sie den Chip auf dem Fragmentanalysator. Die starke Spannung steuert den Eintritt der cfDNA-Suspension aus den Probenvertiefungen in den mit der Gelmatrix vorgeladenen Trennkanal, wo die DNA mit dem Farbstoff gefärbt wird.

Wenn sich die DNA von der Kathode zur Anode bewegt, wandern kleinere