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Nehmen Sie ein gereinigtes Mausgehirn, bei dem Zellen, die fluoreszierende Proteine exprimieren, und Lipide entfernt wurden, um Transparenz für die Tiefenstrukturbildgebung mit hoher Auflösung zu gewährleisten.
Ein Hydrogel-Netz bewahrt Biomoleküle und erhält neuronale Netzwerke.
Übertragen Sie das Gehirn in eine Bildgebungskammer mit einem Agarosering zur Unterstützung.
Befestigen Sie das Gewebe mit Klebstoff und füllen Sie die Kammer mit einer Brechungsindex-Matching-Lösung, um die Lichtstreuung zu minimieren und eine stabile Bildgebungsumgebung zu schaffen.
Stellen Sie die Kammer auf einen konfokalen Mikroskoptisch und senken Sie das Objektiv vorsichtig in die Lösung, um eine kontinuierliche Kontaktsäule zu schaffen.
Verwenden Sie Epifluoreszenz, um die interessierenden Bereiche zu lokalisieren. Passen Sie dann den Laser und die Bildgebungsparameter an, um die Bildqualität zu optimieren.
Erfassen Sie eine Reihe von Z-Stapeln, um eine dreidimensionale Darstellung des Gewebes zu erstellen.
Verwenden Sie geeignete Software, um die zelluläre Morphologie zu analysieren, einschließlich dendritischer Dorne, ihrer Stacheln sowie der Verteilung und Dichte von Neuronen.
Um eine große Gewebebildgebungskammer für Gewebe mit einer Dicke von mehr als 5 Millimetern zu konstruieren, verwenden Sie eine 10 Zentimeter große Glasschale mit einer hohen Wand. Platzieren Sie ein konisches 50-Milliliter-Rohr in der Mitte und stellen Sie sicher, dass der Durchmesser des Rohrs groß genug ist, um den Tubus der verwendeten Objektivlinse aufzunehmen. 3% Agarose in Wasser herstellen und in den Raum zwischen der Glasschale und dem konischen Rohr gießen.
Anschließend eine Stunde abkühlen lassen. Dadurch entsteht ein Ring aus fester Agarose. Kleben Sie das Gewebe mit Sekundenkleber sicher auf den Boden der Kammer und füllen Sie die Kammer mit Brechungsindex-Matching-Lösung, die zu polymerisieren beginnen kann, wenn sie nicht vor Luft geschützt und bei 4 Grad Celsius gelagert wird. Nehmen Sie das Bild mit einem konfokalen Mikroskop auf.
Schalten Sie alle relevanten bildgebenden Geräte ein. Legen Sie die Probe auf den Tisch. Nähern Sie sich dem Immersionsmedium vorsichtig mit dem Objektiv und bilden Sie eine durchgehende Medienkolonne. Finden Sie mit Hilfe der Epifluoreszenz ein geeignetes Bildgebungsfeld. Legen Sie zunächst die Einstellungen für Auflösung und Scangeschwindigkeit fest.
Wenn Sie mit einem konfokalen Mikroskop fotografieren, schließen Sie die Lochblende vollständig, um den kleinsten optischen Schnitt und damit die beste Z-Auflösung zu erhalten. Erhöhen Sie allmählich die Laserleistung oder die Sensorverstärkung, bis ein geeignetes Bild mit einem hohen Signal-Rausch-Verhältnis erhalten wird. Wenn Sie standardmäßige EGFP- oder tdTomato-Zweifarbbildgebung verwenden, legen Sie die Einstellungen für die Lichtsammlung fest.
Legen Sie die Parameter des Z-Stapels basierend auf dem beobachteten Start und den Endpunkten des Gewebes fest. Legen Sie die Schrittweite basierend auf der gewünschten Z-Auflösung fest. Kleinere Schrittgrößen führen zu einer höheren Z-Auflösung, können aber zu Probenbleichen führen.
Wenn Sie mit den Einstellungen für die Bildaufnahme zufrieden sind, erfassen Sie das Bild. Stellen Sie sicher, dass das Bild ein hohes Signal-Rausch-Verhältnis aufweist und deutliche Grenzen der Strukturen aufweist.