Name: Langfristige, High-Resolution Konfokale Zeitraffer Bildgebung Arabidopsis Cotyledon Epidermis während der Keimung (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-12-31T14:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 1 s
Description: Lernen Sie die langfristige konfokale Zeitraffer-Bildgebung von Arabidopsis Keimblättern zur Untersuchung der epidermalen Entwicklung und Stomata-Differenzierung. Diese Methode ermöglicht die dynamische Verfolgung von Proteinen während der Zellteilung.

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Wir danken Amanda Rychel für die Unterstützung bei der Entwicklung der Zeitraffer-Protokoll und Lynn Pillitteri für den Bau von POLAR :: POLAR-eGFP. Wir sind auch dankbar ABRC für die Bereitstellung der pm-rb konstruieren. Dieses Protokoll wurde durch eine Unterstützung aus dem PRESTO Auszeichnung von Japan Science Technology and Agency entwickelt. Forschung POLAR wurde auch von der University of Washington Royalty Research Fund (RRF-4098) und der National Science Foundation (MCB-0855659) unterstützt. KMP ist ein NSF Graduate Research Fellow (DGE-0.718.124) und KUT ist ein HHMI-GBMF Ermittler.

Ein. Seed Sterilisation <ol><li> Bereiten seed Sterilisationslösung: 33% Bleiche, 0,1% Triton X-100. </li><li> Ort Samen tragenden gewünschten fluoreszierenden Reporter-Konstrukt (en) und Genotyp (en) in 1,7 ml Röhrchen und anwendbar 1 ml Sterilisationslösung. Inkubieren auf Kolbenpendel für 15 min. </li><li> In einer sterilen Haube, verwenden Sie eine Pipette, um eine Sterilisation Lösung von Rohr zu entfernen, so dass Samen hinter sich. Spülen mit 1 ml sterilem Wasser. Wiederholen Sie viermal. </li><li> Inkubieren bei 4 ° C für zwei Tage oder länger. </li></ol> 2. Vorbereitung der Chamber Slide Medien <ol><li> Mix 20 ml 0,5% ige Lösung von Bacto Agar (nicht reine Agarose) in Wasser in einem 200 ml Kolben, und einer Mikrowelle bis gelöst. Seien Sie vorsichtig, wenn Kochen der Lösung. </li><li> Abkühlen der Lösung auf etwa 60 ° C </li><li> Sammeln Sie 1 ml Agar-Lösung mit einer Pipette und langsam auf dem Deckglas in der Kammer Schieber (Lab-Tek II Chambered # 1.5 deutschen Deckglas System) anzuwenden. Lösung which ist zu heiß oder zu schnell kann Leim oder Riss Glasschmelze angewendet. </li><li> Unmittelbar fügen Sie eine zweite ml Agar-Lösung. Agarmedien sollte nun vollständig bedeckt den Boden des Schlittens Kammer. Dies Minimalmedien ausreicht, um die Entwicklung in einer Pflanze Cotyledone, die gespeicherten Nährstoffe für vier bis fünf Tage durch Aufrechterhalten Feuchtigkeit und Ermöglichen Gasdiffusionselektrode enthält unterstützen. </li><li> Cool Slide auf dem Labortisch mit Kammer abgedeckt. Wenn Kolben fest verschlossen wird, kann Lösung gespeichert und erneut erhitzt für zukünftige Verwendung. </li></ol> 3. Seed Dissection <ol><li> Entfernen Rohr steriles Saatgut von 4 ° C Lagerung. </li><li> Legen Sie ein Papiertuch auf der Bühne einem Binokular und befeuchten mit Wasser. Gewebe einzustellen, um eine glatte Oberfläche zu erzeugen. Tissue wird verwendet, um Samen für die Präparation zu stabilisieren. </li><li> Pipet 20-30 Samen aus der Tube auf das Gewebe, wobei darauf geachtet, sie in der Binokular Sichtfeld des platzieren. </li><li> Mit scharfen Pinzette (Roboz, # 5 Biologie Spitze), Entfernen Sie vorsichtig die Samenschale vom Setzling innen. Beide äußeren und inneren Integumenten müssen entfernt werden. </li><li> Beim Abbilden das Keimblatt, ist es vorteilhaft, das Hypokotyl und Würzelchen zu entfernen. Keimblätter enthalten ausreichend Nährstoffe für mehrere Tage unter dieses Protokoll zu entwickeln. Wenn intakten, wird das Hypocotyl begradigen und drastisch verlängern, Bewegen der Cotyledone aus dem Zeitablauf Sichtfeld. Verwenden Sie ein Skalpell, um die Keimblätter frei von der Hypokotyl schneiden. </li><li> Halten seziert Kotyledonen in Wasser getaucht, in ein Mikroröhrchen oder ähnliches. </li><li> Wiederholen 3,4-3,6 bis die gewünschte Anzahl von Cotyledonen erreicht ist. 15-20 erfolgreiche Dissektionen sind vor der Montage empfohlen. </li></ol> 4. Montage Keimblätter in der Chamber Slide <ol><li> Mit einem kleinen (18 mm 2) Deckglas, schneiden durch die Agar-Medien und heben Sie die gesamte Schicht aus der Kammer slide ist durch den Glasboden. </li><li> Pipette seziert Cotyledonen mit einem Minimum an Wasser aus anhältRohr in der Kammer gleiten, unter das angehobene Agarschicht. </li><li> Senken Sie die Agar auf die Keimblätter. Wenn überschüssiges Wasser vorhanden ist, legen Sie ihn weg mit einem Gewebe, darauf achtend, nicht die Keimblätter stören. Die Proben sollten nicht mehr so ​​leicht zu bewegen, wenn Mount abgeschlossen ist. </li><li> Zeigen Abdeckung auf Kammerobjektträgers und bewegen Folie Mikroskoptisch. </li></ol> 5. Time Lapse Imaging <ol><li> Richten invertierten konfokalen Mikroskop zur Abbildung der gewünschten Fluorophor (s). LSM700 Parameter verwendet: für GFP, Anregung bei 488 nm und Sammlung mit einem Bandpassfilter bei 440-530 nm; für RFP, Anregung bei 555 nm und Sammlung mit einem Bandpassfilter bei 570-610 nm aufweist. </li><li> Kontrollieren eingebettete Proben für Schäden. Programmieren Sie die Standorte der intakten, ordnungsgemäß montiert Keimblätter in Mikroskop-Software. Im Zen 2009: Fokus auf einer cotyledon mit 20x-Objektiv und bewegen Ziel Nutzraummitte Folie. Unter Acquisition Mode, ändern Zoom bis 0,5 und Baugröße &lt;/ Em&gt; 48x48 Pixel. Wählen Positionen Checkbox und Scan Übersicht Bild ... Button unter Positionen, dann erhöhen Horizontal und Vertikal tile Nummern 30-35. Wenn der Scan abgeschlossen ist, klicken Sie auf die Positionen Knopf unter der Registerkarte Dimensionen und Ort Fadenkreuz an jedem cotyledon zu beobachten. </li><li> Richten Sie z-Serie umfasst die cotyledon Epidermis aller samples.In Zen 2009: Klicken Sie auf die Z-Stack aktivieren. Wählen Sie jede Position unter Position Liste und klicken Sie auf Move to-Taste. Konzentrieren Sie sich auf der obersten Ebene des cotyledon Epidermis und klicken Sie auf die Set Erste Schaltfläche unter Z-Stack. Konzentrieren Sie sich auf die niedrigste Position, an der Epidermis ist sinnvoll sichtbar und klicken Sie auf die zuletzt eingestellte Taste. Klicken Sie auf die Schaltfläche neben Optimale, was zeigt, die besten z-Schichtdicke, zu setzen. Überprüfen Sie jede cotyledon zu bestätigen, dass diese Einstellungen alle Proben umfassen, die z-Parameter kann nicht für indiv. eingestellt werdenidual Positionen in Zen 2009. </li><li> Richten Sie Zeitreihen auf die gewünschte Auflösung und Länge. Abständen von 15-30 min für drei Tage gelten für Dynamik von Proteinen in epidermalen Zellteilung. Dieses Intervall kann je nach Bedarf geändert werden. Im Zen 2009: Klicken Sie auf die Time Series Kontrollkästchen. Unter Time Series, eingestellt Cycles für die Anzahl der Bilder, die gewünschte mit dem Schieberegler oder Eingabe in das Textfeld ein. Set Interval bis 30 und das Pull-Down-Menü min wählen. </li><li> Beginnen xyzt Multi-Positions-Scan. Beachten Sie, dass die Anzahl von Positionen, die die Scan-Daten begrenzt werden muß, wenn Gesamtabtastzeit größer ist als das gewünschte Intervall, die Zeitpunkte nicht korrekt sein. Es können maximal sechs gleichzeitige Positionen sind möglich, wenn Bildgebung GFP und RFP bei 59 z-Scheiben in einem 30-Minuten-Intervall mit unserem System. Im Zen 2009: Change Frame Size die gewünschte Auflösung und klicken Sie auf Start Experiment. </li></ol> 6. Video Editing <ol><li> Von der konfokalen Datendatei, machen eine maximale Intensität z-Projektion jedes Mal / Position Kombination und Export als Bild-Dateien in einem verlustfreien Format wie TIFF. Dateinamen sollten in eine Reihe pro Position (zB POLAR-GFP_pos1_0001, POLAR-GFP_pos1_0002, etc., nicht POLAR-GFP_0001_pos1) für die Software, um sie in einem Film zu kombinieren. Im Zen 2009: Verwenden Sie Copy: Subset unter der Registerkarte Verarbeitung Positionen in separate Dateien, dann Maximum Intensity Projection aufgeteilt. Schließlich, als TIFF exportieren (Datei: Export, in höherer Auflösung Bildfenster - Serie). </li><li> Verwenden FIJI 7,8 aufeinanderfolgenden Bildern, indem Sie das bUnwarpJ macro 9 (Plugins: Registrierung: bUnwarpJ) auszurichten. Ändern Registration Mode auf Mono. Alle Erweiterte Optionen können Standardwerte. Für lange Zeitspanne, laden und installieren Sie das Makro &quot;Affine + Konsequente Elastic 2D Image Registration&quot;, das wird bUnwarpJ zu einer Reihe von Bildern automatisch anzuwenden, und öffnen Sie yunsere Daten über Datei: Import: Image Sequence, es zu benutzen. Deaktivieren MOPS Sehenswürdigkeiten Extraktion und Lauf. </li><li> Verwenden FIJI / ImageJ oder Quicktime Pro, um die Reihenfolge der ausgerichteten Bilder öffnen und speichern in das gewünschte Videoformat (AVI ist eine gute Wahl). </li></ol>

<ol><li>Sulston, J. E., Schierenberg, E., White, J. G., Thomson, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Embryonic+Cell+Lineage+of+the+Nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">The Embryonic Cell Lineage of the Nematode Caenorhabditis elegans.</a> Developmental Biology. 100, 64(1983).</li>
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</ol>

Keine Interessenskonflikte erklärt.

Diese Zeitraffer-konfokalen Technik erlaubt Längsschnittstudien von fluoreszierend markierte Protein Expression und Lokalisierung in einzelnen Zellen der Arabidopsis Cotyledone Epidermis, die im Fall von polaren und andere dynamisch ändernden Proteinen ist entscheidend für das Verständnis ihrer Funktion. Zuvor hat anhaltende Zeitspanne Bildgebung verwendet worden, um Arabidopsis root Pilzinfektion 11 und Meristem Wachstum 5,12 untersuchen, sondern indem die cotyledon Epidermis erw...

<table border="1"><tbody><tr><td> Namen Reagenz </td><td> Firma </td><td> Catalog Number </td><td> Kommentare </td></tr><tr><td> Bacto Agar </td><td> BD </td><td> 214010 </td><td></td></tr><tr><td> Ein-Kammer-slide </td><td> Nunc (Thermo Scientific) </td><td> 155360 </td><td> Oder Zwei-Kammer (155.379) </td></tr><tr><td> Laser Scanning konfokalen Mikroskop </td><td> Zeiss </td><td> LSM700 </td><td> Zen 2009 Software </td></tr><tr><td> 20x Objektiv </td><td> Zeiss </td><td> 420650-9901 </td><td> NA 0,8, Plan-APOCHROMAT </td></tr><tr><td> Seziermikroskop </td><td> Benz (National) </td><td> 431TBL </td><td> Leuchtet von unten </td></tr><tr><td> Nr. 5 Zangen, Biologie Spitze </td><td> Roboz Surgical Instrument </td><td> RS-4978 </td><td> Sehr feine Spitzensind kritisch </td></tr></tbody></table>

langfristige, high-resolution konfokale zeitraffer bildgebung<em&gt; arabidopsis cotyledon</em&gt; epidermis während der keimung

Long-term, High-resolution Confocal Time Lapse Imaging of Arabidopsis Cotyledon Epidermis during Germination

Imaging in vivo Dynamik zellulärer Verhalten während einer Entwicklungsstörung Sequenz kann eine leistungsstarke Technik für das Verständnis der Mechanik des Gewebes Strukturierung sein. Während tierischen Entwicklung treten Schlüssel Zellproliferation und Strukturierung Ereignisse sehr schnell. Zum Beispiel, in Caenorhabditis elegans alle Zellteilungen für die Larven Bauplan erforderlich sind innerhalb von sechs Stunden nach der Befruchtung abgeschlossen, mit sieben mitotische Zyklen 1, die sechzehn oder mehr Mitosen von Drosophila Embryogenese treten in weniger als 24 Stunden 2. Im Gegensatz dazu sind Zellteilungen der Pflanzenentwicklung langsam, typischerweise in der Größenordnung von einem Tag 3,4,5. Dies stellt eine einzigartige Herausforderung und eine Notwendigkeit für die langfristige Echtzeit-Bildgebung für die Dokumentation dynamische Verhalten der Zellteilung und Differenzierung Ereignisse während Pflanzen Organogenese. Arabidopsis Epidermis ist ein hervorragendes Modellsystem zur Untersuchung Signalisierung, das Schicksal der Zelle, und die Entwicklung der Pflanzen. In der cotyledon besteht dieses Gewebe von Luft-und Wasser-resistente Pflaster Zellen mit gleichmäßig verteilten Spaltöffnungen, Ventile sich öffnen und schließen, um den Gasaustausch und Wasserverlust zu kontrollieren. Richtigen Abstand dieser Spaltöffnungen ist entscheidend für ihre Funktion und ihre Entwicklung folgt eine Sequenz von asymmetrischen Teilung und Zelldifferenzierung Schritte, um die organisierte Epidermis (Abb. 1) zu produzieren. Dieses Protokoll ermöglicht die Beobachtung der Zellen und Proteine ​​in der Epidermis über mehrere Tage der Entwicklung. Dieser Zeitrahmen ermöglicht eine präzise Dokumentation der Stammzell-Divisionen und Differenzierung von epidermalen Zellen, einschließlich Spaltöffnungen und epidermalen Pflaster Zellen. Fluoreszierende Proteine ​​können zu interessierenden Proteine ​​fusioniert werden, um ihre Dynamik während der Zellteilung und Differenzierung Prozesse zu beurteilen. Diese Technik ermöglicht es uns, die Lokalisierung eines neuen Proteins, POLAR 6 zu verstehen, während der Proliferation Stadium der Stomata-lineage Zellen in the Arabidopsis Cotyledone Epidermis, wo sie in Zellen asymmetrischen Teilung vorhergehenden Ereignisse und bewegt sich zu einem charakteristischen Bereich des Zellcortex kurz vor Teilung erfolgt exprimiert wird. Bilder können registriert und gestrafft werden Video leicht unter Verwendung Public Domain Software, um dynamische Protein-Lokalisierung und Zelltypen zu visualisieren, wie sie im Laufe der Zeit ändern.

<html> Ein Satz von informativen Zeitpunkten mit diesem Verfahren gesammelt wird in 3 gezeigt. Zellmembranen mit RFP (pm-rb) und GFP ist POLAR Protein unter seinem nativen Promotor fusioniert (POLAR :: POLAR-GFP) 6 Auf der 30-Minuten-Zeitskala markiert sind, sehen wir Zellteilungen zusammen mit den Veränderungen in der Protein-Lokalisierung vor ihnen. Asymmetrische Zellteilungen in der Stomata Abstammungslinie Form Stammzell-Vorstufen wie Stomata genannt meristemoids, die die Fähigkei...

Wir beschreiben ein Protokoll mit Kammer-Objektträgern und Medien zu pflanzen Keimblätter für die konfokale Bildgebung der Epidermis über mehrere Tage der Entwicklung immobilisieren, zu dokumentieren stomatal Differenzierung. Fluorophor-markierte Proteine ​​können dynamisch durch Expression und subzelluläre Lokalisation verfolgt werden, das Verständnis ihrer möglichen Rollen bei der Zellteilung und Zelltyp-Differenzierung.

Langfristige, High-Resolution Konfokale Zeitraffer Bildgebung<em&gt; Arabidopsis Cotyledon</em&gt; Epidermis während der Keimung

Die Bildgebung der In-vivo-Dynamik des Zellverhaltens über eine Entwicklungssequenz hinweg kann eine leistungsstarke Technik zum Verständnis der Mechanik von Gewebe sein ...

Das Ziel des folgenden Experiments besteht darin, die frühen Ereignisse der epidermalen Entwicklung nach der Samenkeimung auf zellulärer Ebene sichtbar zu machen. Dazu wird zunächst die Samenschale entfernt, um im zweiten Schritt einen klaren Blick auf die Kosin zu ermöglichen. Die Kosin werden unter einer Schicht Agar-Medium montiert, die sie fixiert und ihre Entwicklung unterstützt. Anschließend wird eine Zeitrafferaufnahme über mehrere Tage durchgeführt, um das Wachstum und die Teilung der epidermalen Zellen in vivo zu beobachten.Es wurden Ergebnisse erzielt, die dynamische Genexpression und Proteinlokalisation basierend auf sichtbarer Fluoreszenz zeigen. Der Hauptvorteil dieser Technik gegenüber etablierten Methoden, wie beispielsweise Standbildern der Gus-Färbung oder GFP-Fusionen, liegt darin, dass sie die dynamische Bewegung von Proteinen während der Zellteilung und Differenzierung sichtbar macht. Die Arabidopsis-Samen für dieses Experiment werden in einer Samensterilisationslösung, bestehend aus 33 % Haushaltsnatriumhypochlorit und 0,1 % Triton X-100, sterilisiert. Dazu werden Samen, die die gewünschten fluoreszierenden Reporterkonstrukte und Genotypen tragen, in ein 1,7-Mi

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Wir beschreiben die Verwendung von Perfluordecalin als infiltrative Eindeckmedium. Dies ist eine einfache Methode zur Verbesserung der Tiefe der Bildgebung...

Eine einfache Methode zur Bildgebung Arabidopsis Leaves Mit Perfluordecalin als Infiltrative Imaging Medium

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Dieses Protokoll beschreibt ein Verfahren zur raschen Sammlung von Bildern von Arabidopsis Keimlingen Reaktion auf einen Reiz der Schwerkraft unter Verwendung von handelsüblichen Flachbettscanner. Die Methode ermöglicht kostengünstige, High-Volume-Erfassung von hochauflösenden Bildern zugänglich für Downstream-Analyse-Algorithmen.

Mit Flachbett-Scanner mit hoher Auflösung zeitversetzt Bilder von der Arabidopsis-Wurzel gravitropen Antwort sammeln

Ca2 + Signalweg reguliert verschiedene biologische Prozesse in Pflanzen. Hier präsentieren wir Ansätze zur Überwachung abiotischen Stress induziert räumliche und zeitliche Ca 2 +-Signale in Arabidopsis Zellen und Geweben unter Verwendung der genetisch codierten Ca2 +-Indikatoren Aequorin oder Case12.

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Lernen Sie die langfristige konfokale Zeitraffer-Bildgebung von Arabidopsis Keimblättern zur Untersuchung der epidermalen Entwicklung und Stomata-Differenzierung. Diese Methode ermöglicht die dynamische Verfolgung von Proteinen während der Zellteilung.

Langfristige, High-Resolution Konfokale Zeitraffer Bildgebung

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