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DOI: 10.3791/50810-v
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Eine biochemische Ansatz beschrieben, um die in vivo-Protein-Protein-Interaktionen (PPI) der Membranproteine zu identifizieren. Das Verfahren kombiniert Proteinvernetzung, Affinitätsreinigung und Massenspektrometrie, und ist an fast jedem Zelltyp oder Organismus. Mit diesem Ansatz wird auch die Identifizierung der transienten PPI möglich.
Das übergeordnete Ziel dieses Verfahrens ist es, in vivo Proteine, Proteininteraktionen von Membranproteinen durch ein Membran-Streptokokken-Protein-Interaktionsexperiment oder Membranwirbelsäule zu identifizieren. Dies wird durch die in vivo-Vernetzung mit dem reversiblen Vernetzer für Formaldehyd erreicht. Der zweite Schritt besteht darin, das strept-markierte Membranköderprotein zusammen mit den vernetzten Beuteproteinen zu reinigen.
Als nächstes wird die Vernetzung durch Kochen umgekehrt. Der letzte Schritt ist die Trennung des Membranköderproteins und der co-gereinigten Beuteproteine durch Natriumsulfat, Polyacrylamid-Gelelektrophorese oder SDS-Seite. Letztendlich werden Immun-Blotting und Massenspektrometrie-Analysen verwendet, um die Beuteproteine zu identifizieren, was die Analyse von Membranprotein-Wechselwirkungen ermöglicht.
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