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JoVE Journal Bioengineering
Membrane-SPINE: A Biochemical Tool to Identify Protein-protein Interactions of Membrane Proteins In Vivo

Membran-DORN: Ein Tool, um biochemische Protein-Protein-Interaktionen von Membranproteinen Identifizieren In Vivo

Full Text
14,144 Views
10:53 min
November 7, 2013

DOI: 10.3791/50810-v

Volker Steffen Müller1, Karolin Tschauner1, Sabine Hunke1

1Molekulare Mikrobiologie,Universität Osnabrück

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Eine biochemische Ansatz beschrieben, um die in vivo-Protein-Protein-Interaktionen (PPI) der Membranproteine ​​zu identifizieren. Das Verfahren kombiniert Proteinvernetzung, Affinitätsreinigung und Massenspektrometrie, und ist an fast jedem Zelltyp oder Organismus. Mit diesem Ansatz wird auch die Identifizierung der transienten PPI möglich.

Das übergeordnete Ziel dieses Verfahrens ist es, in vivo Proteine, Proteininteraktionen von Membranproteinen durch ein Membran-Streptokokken-Protein-Interaktionsexperiment oder Membranwirbelsäule zu identifizieren. Dies wird durch die in vivo-Vernetzung mit dem reversiblen Vernetzer für Formaldehyd erreicht. Der zweite Schritt besteht darin, das strept-markierte Membranköderprotein zusammen mit den vernetzten Beuteproteinen zu reinigen.

Als nächstes wird die Vernetzung durch Kochen umgekehrt. Der letzte Schritt ist die Trennung des Membranköderproteins und der co-gereinigten Beuteproteine durch Natriumsulfat, Polyacrylamid-Gelelektrophorese oder SDS-Seite. Letztendlich werden Immun-Blotting und Massenspektrometrie-Analysen verwendet, um die Beuteproteine zu identifizieren, was die Analyse von Membranprotein-Wechselwirkungen ermöglicht.

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