Sample Drift Correction Following 4D Confocal Time-lapse Imaging

Adam Parslow; Albert Cardona; Robert J. Bryson-Richardson

doi:10.3791/51086

Beispiel Drift Korrektur Nach 4D Konfokale Zeitraffer-Imaging

JoVE Journal
Bioengineering
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Sample Drift Correction Following 4D Confocal Time-lapse Imaging

Beispiel Drift Korrektur Nach 4D Konfokale Zeitraffer-Imaging

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10:04 min

April 12, 2014

DOI: 10.3791/51086-v

Adam Parslow¹, Albert Cardona², Robert J. Bryson-Richardson¹

¹School of Biological Sciences,Monash University, ²Janelia Farm Research Campus,Howard Hughes Medical Institute

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Zeitraffer-Mikroskopie ermöglicht die Visualisierung von Entwicklungsprozessen. Wachstum oder Drift der Proben während der Bildaufnahme reduziert die Fähigkeit, genau zu verfolgen und zu messen Zellbewegungen während der Entwicklung. Wir beschreiben die Verwendung von Open-Source-Bildbearbeitungssoftware für dreidimensionale Probe Drift über die Zeit zu korrigieren.

Die Zeitraffermikroskopie ermöglicht eine Visualisierung der Entwicklungs-, Wachstums- oder Driftprozesse der Probe, die über dieses Bild erfolgen. Die Akquisition kann dazu führen, dass die Zellbewegungen nicht verfolgt oder verfolgt werden können, das folgende Protokoll. Wir verwenden Open-Source-Software zur Bildverarbeitung, um die dreidimensionale Drift im Laufe der Zeit zu korrigieren.

Die Erfassung einer Reihe von optischen Schnitten in verschiedenen Fokusebenen ermöglicht die Erstellung eines dreidimensionalen Modells der Probe. Dies kann auf vier Dimensionen erweitert werden, indem eine Zeitrafferreihe von 3D-Datensätzen erstellt wird. In Langzeit-Zeitrafferexperimenten ist es üblich, Probenbewegungen zu beobachten.

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