Phage Phenomics: Physiologische Ansätze zur Charakterisierung Novel virale Proteine

13.3K Aufrufe

Zitiert von 10

09:40 Min.

11. Juni 2015

10.3791/52854-v

11. Juni 2015

13.3K Aufrufe

Savannah E. Sanchez¹ , Daniel A. Cuevas² , Jason E. Rostron¹ , Tiffany Y. Liang³ , Cullen G. Pivaroff¹ , Matthew R. Haynes¹ , Jim Nulton⁴ , Ben Felts⁴ , Barbara A. Bailey⁴ , Peter Salamon⁴ , Robert A. Edwards¹^,⁵^,⁶ , Alex B. Burgin⁷ , Anca M. Segall¹ , Forest Rohwer¹

¹Department of Biology, San Diego State University, ²Computational Science Research Center, San Diego State University, ³Bioinformatics and Medical Informatics Research Center, San Diego State University, ⁴Department of Mathematics and Statistics, San Diego State University, ⁵Department of Computer Science, San Diego State University, ⁶Mathematics and Computer Science Division, Argonne National Laboratory, ⁷SPARC Committee, Broad Institute

Hier präsentieren wir phänomische Ansätze zur funktionellen Charakterisierung von mutmaßlichen Phagengenen. Zu den Techniken gehören ein entwickelter Assay, der in der Lage ist, den anabolen Metabolismus des Wirts zu überwachen, die Multi-Phenotype Assay Plates (MAPs), zusätzlich zu der etablierten Methode der Metabolomik, die in der Lage ist, Auswirkungen auf den katabolen Metabolismus zu messen.