Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis

David  R. McMullin; Shawn Hoogstra; Kimberlynn  P. McDonald; Mark  W. Sumarah; Justin  B. Renaud

doi:10.3791/59712

Natürliche Produktentdeckung mit LC-MS/MS Diagnostic Fragmentierungs-Filterung: Anwendung für die...

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Chemistry

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Natural Product Discovery with LC-MS/MS Diagnostic Fragmentation Filtering: Application for Microcystin Analysis

Natürliche Produktentdeckung mit LC-MS/MS Diagnostic Fragmentierungs-Filterung: Anwendung für die Mikrocystist-Analyse

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07:18 min

May 31, 2019

DOI: 10.3791/59712-v

David R. McMullin¹, Shawn Hoogstra², Kimberlynn P. McDonald¹, Mark W. Sumarah^1,2, Justin B. Renaud²

¹Department of Chemistry,Carleton University Ottawa, ²London Research and Development Center,Agriculture and Agri-Food Canada

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Die in MZmine implementierte Diagnostik-Fragmentierungsfilterung ist ein eleganter, nach der Übernahme eingesetzter Ansatz, um LC-MS/MS-Datensätze für ganze Klassen bekannter und unbekannter Naturprodukte zu überprüfen. Dieses Tool sucht MS/MS-Spektren nach Produkt-Ionen und/oder neutralen Verlusten, die der Analyst als diagnostisch für die gesamte Klasse von Verbindungen definiert hat.

Natürliche Produkte werden oft als eine Klasse von Verbindungen biosynthetisiert, und nicht als ein einziges Produkt. Die diagnostische Fragmentierungsfilterung ist ein einfacher Ansatz, um alle strukturell verwandten Verbindungen in einem komplexen Gemisch zu erkennen. Die diagnosediagnostische Fragmentierungsfilterung, die in der MZmine-Software implementiert ist, ermöglicht es dem Analytiker, Massenspektrometrie-Datensätze für neue natürliche Produkte zu untersuchen, die andernfalls fehlen würden.

Dazu gehören neue Bioprodukte, aber auch neue Giftstoffe. Die diagnostische Fragmentierungsfilterung, die auf Toxinklassen angewendet wird, die Lebensmittel und Wasser kontaminieren, kann die Expositionsbewertungen informieren. Wenn es auf mikrobielle und Pflanzliche Extrakte angewendet wird, kann es zur Entdeckung neuer Verbindungen führen.

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