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Neuroscience
Computerbasiertes Multitaper-Spektrogrammprogramm für elektroenzephalographische Daten
Computerbasiertes Multitaper-Spektrogrammprogramm für elektroenzephalographische Daten
JoVE Journal
Neuroscience
This content is Free Access.
JoVE Journal Neuroscience
Computer-based Multitaper Spectrogram Program for Electroencephalographic Data

Computerbasiertes Multitaper-Spektrogrammprogramm für elektroenzephalographische Daten

Full Text
12,871 Views
04:13 min
November 13, 2019

DOI: 10.3791/60333-v

Christopher B. O'Brien1, Helen A. Baghdoyan1,2,3, Ralph Lydic1,2,3

1Department of Psychology,University of Tennessee, 2Department of Anesthesiology,University of Tennessee, 3Oak Ridge National Laboratory

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol describes an open-source MATLAB program that generates multitaper spectrograms for analyzing electroencephalographic (EEG) data. It enables users to create customizable spectrograms without requiring prior knowledge of signal processing.

Key Study Components

Area of Science

  • Electrophysiology
  • Signal processing
  • Neuroscience

Background

  • Electroencephalography (EEG) is used to monitor brain activity.
  • Multitaper techniques enhance spectral analysis of EEG data.
  • Understanding the effects of various substances on EEG dynamics is crucial.
  • Common opiates show significant impacts on cortical EEG patterns.

Purpose of Study

  • To provide a user-friendly method for generating multitaper spectrograms.
  • To analyze the dynamic changes in EEG frequency and power.
  • To visualize the effects of different opiates on cortical EEG power.

Methods Used

  • The study employs a compiled MATLAB program for spectrogram computation.
  • The biological model involves chronic implantation of EEG and EMG electrodes in mice.
  • EEG data must be collected in millivolts approximately 7-10 days post-surgery.
  • Participants score EEG data using appropriate software to categorize sleep states.
  • Important files must be in EDF or CSV format for compatibility with the program.

Main Results

  • The program successfully visualizes EEG dynamics and compares effects of various opiates.
  • Notable spectral power changes were observed following morphine and buprenorphine administration.
  • EEG power levels were higher with saline treatment compared to buprenorphine in the 0.5 to 4 Hz frequency range.
  • Chronic electrode implantation facilitated long-term studies on substance effects.

Conclusions

  • This study demonstrates the utility of the MATLAB program for EEG data analysis.
  • The program’s open-source nature allows for broader accessibility in neuroscience research.
  • Insights gained may elucidate the impacts of opiates on brain activity, aiding in drug-related research.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using the MATLAB program?
The program is open source and user-friendly, requiring no prior signal processing knowledge, making it accessible for various research applications.
How is the EEG data collected?
EEG data is collected from mice with implanted electrodes, typically 7-10 days after surgery, recording signals in millivolts over the desired experimental period.
What type of data can be obtained using this method?
Users can obtain detailed spectrograms that illustrate EEG frequency and power dynamics, allowing for the study of the effects of substances on brain activity.
Can the method be adapted for different research needs?
Yes, the program allows customization of spectrogram parameters, enabling researchers to tailor the analysis to their specific experimental designs.
Are there any limitations to this protocol?
The main limitation is that it requires some familiarity with managing file formats and basic understanding of EEG data interpretation.
What type of scoring is done on the EEG data?
Each 10-second bin of the EEG data is independently scored for wakefulness, REM sleep, or non-REM sleep using specialized software.

Dieses Protokoll stellt ein Open-Source-, kompiliertes MATLAB-Programm bereit, das Multitaper-Spektrogramme für elektroenzephalografische Daten generiert.

Dieses Protokoll ist wichtig, da es Benutzern ermöglicht, anpassbare Multitaper-Spektrogramme ohne vorheriges Wissen über die Signalverarbeitung zu entwickeln. Der wichtigste technische Vorteil des Programms ist das benutzerfreundliche Design des Programms und die Möglichkeit, Multitaper-Spektrogramme mit Computern ohne MATLAB-Lizenzierung zu erstellen. Sieben bis zehn Tage nach der Elektrodenimplantationsoperation konfigurieren Sie das Datenerfassungssystem, um alle Signale in Millivolt aufzuzeichnen, und erhalten Sie EEG-Aufnahmen für die gewünschte experimentelle Dauer.

Verstärken und digitalisieren Sie die ungefilterten EEG-Signale mit der entsprechenden Datenerfassungsinstrumentation und Software. Dann haben zwei verschiedene Individuen unabhängig voneinander Punkten jeder 10-Sekunden-Behälter des digitalen EEG, blaue Spur, und EMG, schwarze Spur, Aufnahmen wie Wachheit, REM-Schlaf, oder Nicht-REM-Schlaf in einem geeigneten Schlaf-Scoring-Software-Programm. Laden Sie das kompilierte Multitaper Spectrogram Programm herunter.

Für die Spektrogrammberechnung erhalten Sie unformatierte, unverarbeitete EEG-Daten im EDF- oder CSV-Dateiformat, platzieren Sie die Datei an demselben Speicherort wie die kompilierte Programmdatei, und starten Sie das Spectrogram-Programm. Folgen Sie den Popup-Eingabeaufforderungen, und wählen Sie das entsprechende Dateiformat aus. Geben Sie den gesamten EEG-Dateinamen ein, und wählen Sie die Parameter für die Spektrogrammberechnung aus.

Geben Sie Titel sowohl für das Spektrogramm als auch für eEG ein. Klicken Sie dann auf Datei und Speichern, um das resultierende Spektrogramm und die EEG-Ablaufverfolgung im gewünschten Dateiformat zu speichern. Diese Abbildung zeigt repräsentative Ähnlichkeiten und Unterschiede im kortikalen EEG während der Wachheit, nicht-REM-Schlaf, und REM-Schlaf.

Dieses Hypnogramm wurde verwendet, um die zeitliche Organisation der Schlaf- und Wachzustände auf der Grundlage von Bewertungen der EEG- und EMG-Aufnahmen darzustellen. Im Gegensatz zum diskretisierten Hypnogramm kann ein Spektrogramm verwendet werden, um hochdynamische Veränderungen der EEG-Frequenz und -Leistung als Funktion der Zeit zu veranschaulichen und die Ähnlichkeiten zwischen dem kortikalen EEG-Signal während der Wachheit und dem REM-Schlaf hervorzuheben. Diese Multitaper-Spektrogramme fassen jeweils vier Stunden EEG-Aufnahmen nach systemischer Verabreichung von Saline, Morphin, Buprenorphin oder Fentanyl zusammen.

Diese Abbildung zeigt die Verwendung von Spektrogrammen, um die Auswirkungen verschiedener Opiate auf die kortikale EEG-Leistung zu visualisieren. Die langsame Aktivität, die im Salinezustand vorhanden ist, wird durch Morphin und Buprenorphin eliminiert. Nach der Fentanyl-Verabreichung kann eine langsame Deltaleistung beobachtet werden.

EEG-Änderungen, die durch die Spektrogramme veranschaulicht werden, können weiter quantifiziert und als die durchschnittliche dominierende Spektralleistung jeder Halbfrequenz ausgedrückt werden. Wie in diesem Diagramm dargestellt, ergab die Mittelung der Spektralleistung innerhalb bestimmter EEG-Frequenzbänder, dass im Frequenzbereich von 0,5 bis vier Hertz die EEG-Leistung bei der Salinebehandlung viel höher war als bei Buprenorphin. Mäuse mit chronisch implantierten EEG- und EMG-Elektroden bleiben viele Monate gesund und ermöglichen neuartige Studien über Wechselwirkungen zwischen Arzneimitteln und chronische nadierende Arzneimittel.

Darüber hinaus können diese Techniken neue Erkenntnisse über die Bemühungen zur Entwicklung chemischer Gegenmaßnahmen gegen Opiat-induzierte Atemdepressionen liefern.

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Neurowissenschaften Ausgabe 153 Neurowissenschaften Fentanyl Morphin Buprenorphin Schlaf chemische Bedrohungen

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