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DOI: 10.3791/63934-v
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Hier stellen wir ein detailliertes Protokoll für die Isolierung und Identifizierung von antibiotikaresistenten Bakterien aus Wasser und die molekulare Charakterisierung ihrer Antibiotikaresistenzgene (ARGs) vor. Die Verwendung von kulturbasierten und nicht-kulturbasierten (metagenomischen Analysen) Techniken liefert vollständige Informationen über die gesamte bakterielle Vielfalt und den Gesamtpool verschiedener ARGs, die in Süßgewässern aus Mumbai, Indien, vorhanden sind.
Unsere Methode beantwortet zentrale Fragen, wie zum Beispiel: Wie hoch ist die Gesamtbelastung mit antibiotikaresistenten Bakterien in der Wasserprobe? Was ist die Identität dieser Bakterien und was sind verschiedene Arten von antibiotikaresistenten Merkmalen und Genen, die sie tragen? Der Vorteil unseres Protokolls besteht darin, dass es auch Bakterien nachweisen kann, die nicht im Labor gezüchtet werden können und einen erheblichen Anteil der gesamten Bakterien in der Wasserprobe ausmachen.
Daher wird theoretisch kein Bakterium oder seine resistenten Eigenschaften ausgelassen. Diese kombinatorische Technik, die sowohl kulturbasierte als auch kulturunabhängige Techniken umfasst, kann für jede Probe repliziert und angepasst werden, die aus Abwasser, pharmazeutischen oder Krankenhausabwässern, klinischen und nichtklinischen Umgebungen und mehr gewonnen wird. Neben Devika werden Harshali Shinde und Maitri Mishra, beide leitende Forschungsstipendiaten aus meinem Labor, die experimentellen Verfahren demonstrieren.
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