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Artículo de método

La identificación de genes inducida por la desregulación de Sarcoma de Kaposi asociado al virus del herpes (HVSK)

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DOI:

10.3791/2078

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14 de septiembre de 2010

En este artículo

Resumen

Factores de la célula huésped juegan un papel crítico en el establecimiento y mantenimiento de sarcoma de Kaposi (SK). Resumimos los métodos para identificar los factores de la célula huésped alterada en las células infectadas por HVSK DMVEC, y en el tejido tumoral KS. Genes celulares alteradas por el virus servirá como posible objetivo (s) de nuevas terapias.

Resumen

Actualmente KS es el más predominante del VIH / SIDA relacionados con tumores malignos en el sur de África y de ahí el mundo. 1,2 Se caracteriza por ser un tumor angioproliferative de las células endoteliales vasculares y produce enfermedades raras células B linfoproliferativos en forma de linfomas derrame pleural (PEL) y algunas formas de enfermedad de Castleman multicéntrica. 5.3 Sólo 1.5% de las células KS lesiones apoyar activamente la replicación lítica del sarcoma de Kaposi asociado al virus del herpes (HVSK), el agente etiológico asociado con sarcoma de Kaposi, y está claro que los factores celulares que interactuar con factores virales en el proceso de oncogénesis y la progresión del tumor 6,7. Identificación de la novela factor del huésped determinantes que contribuyen a la patología de KS es esencial para el desarrollo de marcadores de pronóstico para la progresión tumoral y la metástasis, así como para el desarrollo de nuevas terapias para el tratamiento del sarcoma de Kaposi 8. Los detalles del vídeo que acompaña a los métodos que utilizamos para identificar a la célula huésped programas de expresión de genes alterados en las células endoteliales microvasculares dérmicas (DMVEC) después de la infección HVSK y en el tejido tumoral KS. 9 Una vez que los genes desregulados son identificados por análisis de microarrays, los cambios en la expresión de la proteína se confirmada por inmunoblot y la inmunofluorescencia doble etiquetado. Cambios en la expresión transcripcional de genes desregulados se confirmó in vitro por cuantitativa en tiempo real de reacción en cadena de la polimerasa (QRT-PCR). La validación de los resultados in vitro usando tejidos de archivo tumor KS también se realiza por inmunohistoquímica doble etiquetado y de microarrays de tejidos 8,10. Nuestro enfoque para identificar los genes que están alteradas en el microambiente del tejido del tumor KS permitirá el desarrollo de la in vitro y, posteriormente, en los sistemas modelo in vivo para descubrimiento y evaluación de nuevos terapéuticos potenciales para el tratamiento del sarcoma de Kaposi.

Protocolo

1. KSVH cultivo y la infección de DMVEC

  1. La línea celular BCBL-1, originalmente aislado de un linfoma de cavidades corporales basados ​​en humanos, se cultiva en completo RPMI 1640 (Gibco, Grand Island, NY). BCBL-1 se extraen células del nitrógeno líquido, transportado en hielo seco, y rápidamente se descongela durante 1 minuto a 37 ° C. Una alícuota de 50 L de BCBL-1 en las células a una densidad de 1x10 4 células / ml a 500 ml de medio RPMI 1640 suplementado con 10% de suero fetal bovino, penicilina 1x / estreptomicina y se distribuye en frascos de 175 cm, a 50 ml / frasco .
  2. Los frascos de BCBL-1 células se incubaron a 37 º C en una a....

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Discusión

Las metodologías utilizadas en este informe se puede realizar en una variedad de entornos de laboratorio. Que requieren algún equipo especial o acceso a instalaciones básicas. Las debidas precauciones se deben tomar al hacer experimentos con virus patógenos infecciosos como HVSK que puede requerir el uso de un nivel biosaftey 3 (BSL-3) instalaciones. Adquisiciones de los tejidos también debe ser aprobado por las juntas de revisión institucional adecuado (IRB).

Estas metodologías en conjunto .......

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Divulgaciones

No hay conflictos de interés declarado.

Agradecimientos

Damos las gracias a James EK Hildreth, Meharry Medical College, por su asesoramiento y revisión de este manuscrito. También queremos agradecer a Diana Marver para la edición del manuscrito. Este trabajo fue apoyado por el Centro de Meharry Vanderbilt para la Investigación del SIDA (NIH P30 AI054999-05), el Centro de Salud SIDA disparidades de Investigación, NIH RR019192 5U54-05, el Centro de Meharry de Investigación Clínica, de Subvenciones del NIH P20RR011792, y por el NIH conceder P01 CA113239. DJA fue parcialmente financiado por las subvenciones piloto del Centro Vanderbilt-Meharry for AIDS Research (CFAR) y el Centro para la Investigación Clínica Meharry (CRC). <....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
RPMI 1640Invitrogen05-0001DJ
TPASigma-AldrichP1585
PBS pH 7,4Invitrogen10010-023
Butirato de sodioSigma-Aldrich19364 (FLUKA)
Medio EBM-2Lonza Inc.CC-3156+ suplemento de kits de balas
Células DMVEC (HMVEC)Lonza Inc.CC2543
Suero de ternero fetalHycloneSH30066.03
Penicilina/estreptomicinaInvitrogen15140-122
Placas con cámarasNalge Nunc international154461
Ac. m. LANA del VHSKVector LaboratoriesVP-H913dilución 1:50/IFA
Ac. p. caprino contra galectina-3R&D SystemsAF1154
Asno anti-cabra FITCJackson ImmunoResearch705-095-1
Asno anti-cabra RhoJackson ImmunoResearch705-295-003dilución 1:100/IFA
Medio de montajeVector LaboratoriesH 1500Vectashield con DAPI
Kit de ensayo de proteína BCAPierce, Thermo Scientific23235
NitrocelulosaBio-Rad161-0112
Conj. asno anti-cabraSanta Cruz Biotechnology, Inc.SC 2020
Sustrato para WesternPierce, Thermo Scientific34075
Biotina-conejo anti cabraDako305-065-045
Conj. AP-estreptavidinaDakoK 0492 (kit)
Conjunto RNasa sin DNasaQiagen79254
Ciclador MJ MiniBio-RadPTC-1148C
BiofotómetroEppendorf952000006
Centrífuga RC 6 PlusSorvall, Thermo Scientific46910
Ultracentrífuga Coulter Optima L-90KBeckman Coulter Inc.392052
Sistema de detección de PCR en tiempo real MYiQ iCyclerBio-Rad170-9770
Microscopio fluorescente TE 2000SNikon InstrumentsTE2000S
2100 BioanalizadorAgilent TechnologiesG2938C
Eclipse E 200Nikon InstrumentsE 200
Centrífuga Sorvall Legend RTThermo Fisher Scientific, Inc.75004377

Referencias

  1. Sitas, F., Newton, R. Kaposi's sarcoma in South Africa. J Natl Cancer Inst Monogr. 28, 1-4 (2001).
  2. Moore, P. S., Chang, Y. Kaposi's sarcoma associated herpesvirus. Field's Virology. Knipe, D. M., Howley, P. M. , Lippincott Williams and Wilkins. Philadelphia, PA. 2803-2833 (2002).
  3. Chang, Y., Cesarman, E., Pessin, M. S., Lee, F., Culpepper, J.....

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Reimpresiones y permisos

Etiquetas

Sarcoma de Kaposiinfección por KSHVinmunohistoquímica de marcaje dualmicroarrays de tejidorecuperación de antígenosproteínas virales del huéspedtinción por inmunofluorescenciavalidación mediante qRT-PCRanálisis de microarrayscélulas endoteliales