Artículo de método

Identificación de inhibidores de la quinasa que modulan la respuesta de los timocitos a señales fuertes de TCR

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8 de julio de 2025

En este artículo

Resumen

Fuente: Chen, E. W., et al. Identificación de mediadores de la señalización del receptor de células T mediante el cribado de bibliotecas de inhibidores químicos. J. Vis. Exp. (2019).

En este video, describimos un método para identificar los inhibidores de quinasas de moléculas pequeñas que modulan la apoptosis de timocitos inmaduros CD4+CD8+ doblemente positivos autorreactivos. La apoptosis se induce en los timocitos dobles positivos activándolos con perlas magnéticas recubiertas de anti-CD3 y anti-CD28; A continuación, se realiza un tratamiento con inhibidores de moléculas pequeñas y un análisis de citometría de flujo para detectar si los inhibidores modulan la expresión del marcador apoptótico.

Protocolo

Todos los procedimientos que involucran modelos animales han sido revisados por el comité institucional local de cuidado de animales y la junta de revisión veterinaria de JoVE.

>1. Cribado de la biblioteca de inhibidores de quinasas (ensayo independiente de la centrífuga)

  1. Tratamiento de los timocitos con inhibidores de la cinasa
    1. Prepara una suspensión de timocitos.
    2. Diluir los timocitos en RPMI completo para obtener una suspensión de timocitos de 25 x 106 células/mL.
    3. Añada 40 μl de timocitos a cada pocillo de una placa de pequeño volumen, utilizando una pipeta multicanal. Coloque el plato sobre hielo.
    4. Diluir los inhibidores de la placa madre, DMSO y dexametasona en RPMI completo en una proporción de cuatro partes de RPMI completo por una parte de inhibidor/DMSO/dexametasona (factor de dilución de 5).
      nota: Como los volúmenes utilizados en esta placa de pequeño volumen son 5 veces más pequeños que en el método convencional, los inhibidores y los reactivos de control se diluyen cinco veces antes de añadirlos a los timocitos de la placa.
    5. Añada 0,5 μL de inhibidores de cinasa a la placa de 96 pocillos desde los pocillos correspondientes de la placa inhibidora preparada en el paso 1.1.4.
    6. Prepare ocho pocillos de controles sin tratar. Prepare cuatro pocillos de controles tratados con vehículos añadiendo 0,5 μl del DMSO preparado en el paso 1.1.4. Prepare cuatro pocillos de 5 μM de controles tratados con dexametasona, utilizando la dexametasona diluida preparada en el paso 1.1.4 (Figura 1).

>2. Estimulación de timocitos mediante perlas anti-CD3/CD28

  1. Asegúrese de que las cuentas se vuelvan a suspender de manera uniforme. Tome 1 mL de perlas y lávelas con 2 mL de PBS. Separe las perlas con un soporte magnético y aspire la solución. Vuelva a suspender las perlas en 1 mL de RPMI.
    nota: La proporción de cuentas a celdas es de 1 a 2,5. Ajuste la cantidad de perlas, en función del número de pocillos a estimular y del número de timocitos utilizados.
  2. Agregue 10 μL de suspensión de perlas a cada muestra tratada con inhibidor, las cuatro muestras tratadas con DMSO y cuatro de las ocho muestras no tratadas. Agregue 10 μL de RPMI completo a los cuatro pocillos restantes sin tratar. La Figura 1 muestra la disposición general de las placas.
    nota: El volumen final de los pozos es de 50 μL, que está dentro de la capacidad máxima de los pozos. Es importante tener precaución y mantener las placas en posición vertical, para evitar derrames cruzados de pocillos.
  3. Para mezclar, agite la placa con un agitador orbital de microplacas. Alternativamente, mezcle el contenido de los pocillos con una pipeta multicanal.
  4. Incubar los timocitos en una incubadora a 37 °C, 5% deCO2 durante 17 - 20 h (o toda la noche) con tapa antievaporación.

3. Configuración de la lavadora de placas

NOTA: Las instrucciones para configurar la arandela de placas son proporcionadas por el fabricante. Los pasos se mencionan brevemente a continuación. Se necesitan aproximadamente 150 ml de solución para cada paso de cebado.

  1. Prepare el sistema de lavado con un 70% de etanol que contenga un 1% de Tween 20.
  2. Prepare el sistema de lavado con agua desionizada que contenga un 1% de Tween 20.
  3. Prepare el sistema de lavado con tampón de lavado FACS.

>4. Tinción de antígenos de superficie

  1. Prepare una mezcla de tinción de anticuerpos que contenga anticuerpos anti-TCRβ, anti-CD4, anti-CD8 y anti-CD69. Diluir los anticuerpos en el tampón de lavado FACS en una proporción de 1:100 (v/v).
  2. Lave la placa 9 veces, utilizando 55 μL de tampón de lavado FACS por lavado, utilizando el sistema automatizado de lavado de flujo laminar.
    nota: Al final de los lavados, habrá 25 μL de volumen residual en cada pocillo.
  3. Vuelva a suspender las células en 25 μL de la mezcla de anticuerpos de tinción preparada en el paso 1.4.1.
  4. Si las muestras se transfieren desde una placa de 96 pocillos, vuelva a suspender las células en 50 μL de la mezcla de anticuerpos y transfiera las muestras a la placa de pequeño volumen. Este paso corresponde al método número 2, como se muestra en la Figura 2A.
  5. Para mezclar, agite la placa con un agitador orbital de microplacas o mezcle las muestras con una pipeta multicanal e incube en hielo durante 30 min.

>5. Fijación de células

  1. Lave la placa 9 veces, utilizando 55 μL de tampón de lavado FACS por lavado, utilizando el sistema automatizado de lavado de flujo laminar.
  2. Añadir tampón de fijación/permeabilización (viene con el kit de apoptosis de caspasa-3 activo; lo mismo con el tampón de permeabilidad/lavado 10x mencionado en el paso 1.6.1 y el anticuerpo anti-caspasa-3 en el paso 1.6.2) a 50 μL por pocillo.
  3. Incubar en hielo durante 30 min.

>6. Tinción intracelular para caspasa activa 3

  1. Prepare 1x tampón de permanente/lavado diluyendo 25 mL de 10x tampón de permanente/lavado en 225 mL de agua ultrapura.
  2. Prepare la tinción de caspasa activa intracelular añadiendo 1 mL de anticuerpo anti-caspasa-3 a 2 mL de tampón 1x permanente/lavado. La relación entre el anticuerpo y el tampón de permanente/lavado es de 1:2.
  3. Prepare el sistema de lavado con 1x tampón de permanente/lavado.
  4. Lave la placa 9 veces con 1x tampón de permanente/lavado, a 55 μL por cada lavado.
  5. Añadir 25 μL de la tinción de caspasa intracelular preparada en el paso 1.6.2 a todos los pocillos.
  6. Para mezclar, agite la placa con un agitador orbital de microplacas o mezcle las muestras con una pipeta multicanal e incube en hielo durante 1 h.
  7. Lave la placa 9 veces con 1x tampón de permanente/lavado, a 55 μL por cada lavado.
  8. Agregue 25 μL de tampón de lavado FACS a todos los pocillos.
  9. Transfiera las muestras a tubos de microtitulación después de una mezcla adecuada mediante pipeteo.
  10. Añadir otros 50 μL de tampón de lavado FACS a los pocillos vacíos y repetir el paso 1.6.9.
  11. Repita los pasos 1.6.9 y 1.6.10 2x hasta que se recojan 200 μL de las muestras en los tubos de microtitulación.
    nota: El propósito de los procedimientos descritos en los pasos 1.6.10 y 1.6.11 es asegurar la máxima recuperación de las células de la placa de pequeño volumen. Si el número de células no es un problema, después del paso 1.6.10, simplemente rellene los tubos de microtitulación a 200 μL con tampón de lavado FACS.
  12. Ejecute un análisis de citometría de flujo de las muestras y analice los resultados con un programa de análisis FACS. La activación de la caspasa-3 y la expresión de CD69 se analizan en la puerta que contiene timocitos CD4+CD8+DP.

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Resultados

figure-results-1
Figura 1: Disposición de la placa del ensayo de activación de timocitos. (Arriba) Las columnas 1 y 12 están reservadas para los controles, mientras que las columnas 2 a 11 son muestras tratadas con inhibidores (beige). El control negativo (no estimulado [NS]; gris) ocupa los pocillos A1 a D1, y el control positivo para la muerte celular (tratado con dexametasona [DEX]; morado) ocupa los pocillos E1 a H1. Las columnas 2 a 12 contiene...

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Divulgaciones

No se han declarado conflictos de interés.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
RPMIHyCloneSH30027FS
FBSHyCloneSH3007103
L-GlutaminaHyCloneSH3003401
Piruvato de sodioHyCloneSH3023901
10 veces PBS Vivantis PB0344 – 1L
Biblioteca de detección de quinasas (96 pocillos)Química de las Islas Caimán10505El contenido exacto de la biblioteca puede variar
DmsoSigma AldrichD2650
dexametasonaSigma AldrichD4902
perlas anti-CD3/CD28Thermo Fisher Scientific11452D
Kit de apoptosis FITC Active Caspasa-3BD Pharmingen550480Contiene tampón de fijación/permeabilización, tampón 10X Perm/Wash y anticuerpo anti-caspasa 3
Lavadora DA-Cell CURIOX HT1000
Placa de celda DA de 96 pocillosCURIOX96-DC-CL-05
anticuerpos
CD3e BioLeyenda 100236
TCRbBD Biociencias553174
CD4BD Biociencias740007
CD8BD Biociencias563786
CD69eBiociencia25-0699-42
Inhibidores
TG003Química de las Islas CaimánDe la Biblioteca de Cribado de Quinasas
TG003Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PKC 412Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
DoramapimodQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PaclitaxelQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ErlotinibQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Necrostatina-5Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
NVP-BEZ235Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Ftalazinona pirazolQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-879Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
1-NA-PP1Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Torín 1Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida IIQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
BIBF 1120Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SMI-4aQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida XI (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10657Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AS-703026Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Cloruro de queleritrinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
TunicamicinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
GSK 1059615Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
RuxolitinibQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Necrostatina-1Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 505124Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
INK128Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Canertinib (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 431542Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PD 173074Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Ácido valproico (sal de sodio)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PD 0325901Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 203580Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
VX-702Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
EmodinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CHIR99021Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
bioQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Imatinib (mesilato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Sunitinib MalatoQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
GefitinibQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PP2Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
3-MetiladeninaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida IQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida IVQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida VQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
NSC 663284Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
D 4476Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
NU 7026Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
H-9 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Indirubina-3'-monoximaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
KN-62Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
KN-93Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CGP 57380Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Iso-olomoucinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
(S)-Glycyl-H-1152 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Bisindolilmaleimida VIII (acetato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ST638Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SU 6656Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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SB 203580 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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YM-201636Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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PP242Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ABT-869Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10622Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
17β-hidroxi WortmanninaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10626Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SU 6668Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10572Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
N,N-dimetilesfingosinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
LY294002Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
U-0126Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
StaurosporinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
KN-92 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AS-605240 (sal de potasio)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
O-1918Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Y-27632 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
LeelaminaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PD 98059Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PD 169316Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
TGX-221Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
(S)-H-1152 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AS-605240Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
D-eritro-esfingosina C-18Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
OSU03012Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
JNJ-10198409Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Leelamina (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Leelamida de ácido araquidónicoQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Leelamida de ácido láuricoQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AS-252424Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10505Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PI-103Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PIK-75 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Inhibidor de la esfingosina quinasa 2Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PiceatannolQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SC-1Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
(R)-RoscovitinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
BAHÍA-43-9006Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10561Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AS-604850Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Inhibidor de la α PI3-quinasa 2Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ML-9Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
TriciribinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Análogo de la erbstatinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
KenpaulloneQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
OlomoucineQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-494Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-825Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-1478Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 216763Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 415286Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-17Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
H-8 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
LFM-A13Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SC-514Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ApigeninaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-18Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10554Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
DRBQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
RG-13022Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
RG-14620Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-490Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
AG-82Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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AG-183Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Lavendustin CQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
ZM 336372Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
5-YodotubercidinaQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SB 202190Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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NilotinibQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
SP 600125Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
L-treo-esfingosina C-18Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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HA-1077 (clorhidrato)Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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WortmanninQuímica de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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KT 5823Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
Janex 1Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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CAY10576Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
NH125Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
TWS119Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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CAY10577Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CAY10578Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
PD 184161Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
CCT018159Química de las Islas Caimán-De la Biblioteca de Cribado de Quinasas
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