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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Fuente: Torchia, M. L. G., et al. Discriminación de siete subconjuntos de células inmunitarias mediante citometría de flujo de dos fluorocromos. J. Vis. Exp. (2019)
Este video muestra una técnica basada en citometría de flujo que utiliza dos fluorocromos para identificar linfocitos T CD4+ y CD8+, linfocitos T γδ, linfocitos B, linfocitos citolíticos naturales (NK) y monocitos en linfocitos mononucleares de sangre periférica humana (PBMCs). Al incubar las células con anticuerpos conjugados con fluorocromo contra los marcadores de superficie, los subconjuntos de células se identifican utilizando una estrategia óptima de activación por citometría de flujo.
Todos los procedimientos relacionados con la recolección de muestras se han realizado de acuerdo con las directrices del IRB del instituto.
NOTA: Este protocolo ha sido probado en células de sangre periférica aisladas frescas o congeladas y sangre entera.
1. Tinción celular
NOTA: Es importante elegir pares de fluorocromos prácticamente sin superposición espectral para reducir la dispersión de datos debido al alto desbordamiento de un fluorocromo en el otro detector de fluorocromo. Para lograr una identificación óptima de todos los subconjuntos de células, se deben utilizar fluorocromos con un alto rendimiento cuántico, como los pares de anticuerpos PE-BV421 y PE-APC.
>2. Titulación de anticuerpos
NOTA: La titulación de anticuerpos es el paso más crítico para obtener datos reproducibles y de alta calidad. La valoración de γδ anti-CD3, -CD8, -CD14, -CD19 y -TCR sigue el procedimiento estándar mediante el cual la concentración de anticuerpos para separar de forma óptima los picos positivos y negativos se deriva mediante el índice de tinción máximo. Se deben seleccionar diluciones en el pico o más cerca del pico en el lado ascendente de la curva del índice de tinción (Figura 1A-C). El anticuerpo anti-CD4 se titula para situar el pico de la población CD4 positiva entre las poblaciones CD3 monopositivas y los linfocitos T CD3+/CD8+, más cerca de la señal CD3 monopositivo para discriminar mejor las poblaciones CD8dim (linfocitos T CD8+ γδ y linfocitos T NK). En la misma línea, la titulación de CD56 tiene como objetivo posicionar las células NK CD56+ entre la población CD3+ y CD3-.
>3. Estrategia de compuerta
Tabla 1: Panel de anticuerpos utilizado para la tinción de dos células inmunitarias de fluorocromo de PBMC (combinación BV421-PE).
| blanco | clon | fluorocromo | vendedor | concentración | propósito |
| CD3 | UCHT1 | BV421 | Bd | 1/20 | linaje |
| CD56 | NCAM16.2 | BV421 | Bd | 1/900 | |
| TCRγδ | B1 | BV421 | bio | 1/30 | |
| CD4 | RPA-T4 | pei | Bd | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | pei | Bd | 1/20 | |
| CD14 | M5E2 | pei | Bd | 1/15 | |
| CD19 | HIB19 | pei | Bd | 1/300 | |
| Células muertas | L/D Azul | Lt | 1/300 | Discriminación de vivos/muertos | |
| BD = BD Biociencias, Bio = BioLeyenda, LT = Tecnologías de la Vida | |||||
Tabla 2: Panel de anticuerpos utilizado para la tinción de células inmunitarias de dos fluorocromos de PBMC (APC-PE combinación).
| blanco | clon | fluorocromo | vendedor | concentración | propósito |
| CD3 | UCHT1 | Apc | Bd | 1/20 | linaje |
| CD56 | NCAM16.2 | Apc | Bd | 1/60 | |
| TCRγδ | B1 | Apc | bio | 1/30 | |
| CD4 | RPA-T4 | pei | Bd | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | pei | Bd | 1/20 | |
| CD14 | M5E2 | pei | Bd | 1/15 | |
| CD19 | HIB19 | pei | Bd | 1/300 | |
| Células muertas | L/D Azul | Lt | 1/300 | Discriminación de vivos/muertos | |
| BD = BD Biociencias, Bio = BioLeyenda, LT = Tecnologías de la Vida | |||||
Tabla 3: Panel de anticuerpos utilizado para teñir PBMC congelado de un paciente con mieloma múltiple.
| blanco | clon | fluorocromo | catálogo | vendedor | concentración | propósito |
| CD3 | UCHT1 | BV421 | 562426 | Bd | 1/20 | linaje |
| CD56 | NCAM16.2 | BV421 | 562751 | Bd | 1/900 | |
| TCRγδ | B1 | BV421 | 331217 | bio | 1/30 | |
| CD4 | RPA-T4 | pei | 555347 | Bd | 1/450 | |
| CD8 | RPA-T8 | pei | 555367 | Bd | 1/20 | |
| CD14 | M5E2 | pei | 555398 | Bd | 1/15 | |
| CD19 | HIB19 | pei | 555413 | Bd | 1/300 | |
| CCR7 | G043H7 | AF647 | 353217 | bio | 1/30 | diferenciación |
| CD45RA | HI100 | APC-H7 | 560674 | Bd | 1/60 | |
| CCR4 | 1G1 | PE-Cy7 | 561034 | Bd | 1/60 | Ésimo subconjuntos |
| CCR6 | G034-E3 | BV605 | 353419 | bio | 1/30 | |
| CXCR3 | 1C6/CXCR3 | AF488 | 561730 | Bd | 1/30 | |
| CD57 | NK-1 | PE-CF594 | 562488 | Bd | 1/900 | Activación/Agotamiento |
| HLA-DR | G46-6 | BV510 | 563083 | Bd | 1/30 | |
| CD16 | 3G8 | BUV395 | 563784 | Bd | 1/30 | NK: Activación de monocitos |
| Células muertas | L/D Azul | L-23105 | Lt | 1/300 | Discriminación de vivos/muertos | |

Figura 1: Titulación representativa de anticuerpos. (A) El diagrama de puntos muestra la expresión de CD8 en PBMC fresco teñido con la concentración indicada del anticuerpo. (B) La tabla representa la mediana y la desviación estándar de la intensidad fluorescente de la población CD8+, la mediana de la intensidad fluorescente CD8- y el índice de tinción derivado para cada concentración probada. (C) El gráfico muestra cómo derivar la concentración óptima del anticuerpo en función del índice de tinción. (D) Titulación representativa del anticuerpo CD4. El panel D ha sido modificado de Boin et al. 2017

Figura 2: Estrategia representativa de compuertas y resultados de la discriminación por subpoblaciones. (A) Representación esquemática de la exclusión de dobletes, la discriminación de células vivas y la activación de linfocitos y monocitos basada en el tamaño. (B) Subpoblaciones de linfocitos identificadas con el enfoque de dos fluorocromos. (C) Monocitos identificados con el enfoque de dos fluorocromos. La cifra ha sido modificada con respecto a Boin et al. 2017
| CD3 | BD Biociencias | 562426 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_11152082 |
| CD56 | BD Biociencias | 562751 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_2732054 |
| TCRgd | BD Biociencias | 331217 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_2562316 |
| CD4 | BD Biociencias | 555347 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_395752 |
| CD8 | BD Biociencias | 555367 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_395770 |
| CD14 | BD Biociencias | 555398 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_395799 |
| CD19 | BD Biociencias | 555413 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_395813 |
| CD3 | BD Biociencias | 555335 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_398591 |
| CD56 | BD Biociencias | 555518 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_398601 |
| TCRgd | BD Biociencias | 331211 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_1089215 |
| CCR7 | Bioleyenda | 353217 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_10913812 |
| CD45RA | BD Biociencias | 560674 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_1727497 |
| CCR4 | BD Biociencias | 561034 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_10563066 |
| CCR6 | BD Biociencias | 353419 | Anticuerpo para la tinción RARO: AB_11124539 |
| CXCR3 | BD Biociencias | 561730 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_10894207 |
| CD57 | BD Biociencias | 562488 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_2737625 |
| HLA-DR | BD Biociencias | 563083 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_2737994 |
| CD16 | BD Biociencias | 563784 | Anticuerpo para la tinción RRID: AB_2744293 |
| Células muertas | Tecnologías para la vida | L-23105 | Discriminación entre vivos y muertos |
| Placa inferior en V de 96 pocillos | Termo pescador | 249570 | Placa para teñir |
| Clasificador de células FACSAria IIu | BD Biociencias | Citómetro de flujo | |
| FCS Express 6 | Software De Novo | Análisis FACS | |
| Prisma Graphpad | Software GraphPad | análisis de datos |