Artículo de método

RNAi mediada por derribo de genes y transgénesis por microinyección en el nematodo Necromenic Pristionchus pacificus

16K vistas

DOI:

10.3791/3270

16 de octubre de 2011

En este artículo

Resumen

En organismos modelo, la transgénesis pueden manipular las funciones de genes, mientras que el ARNi puede caída transcripciones de ARNm específico de 1-2. Este protocolo tiene como objetivo ilustrar las técnicas necesarias para introducir ADN transmitido de forma estable y transitoria de ARN de doble cadena en el nemátodo necromenic Pristionchus pacificus Para los estudios de la biología evolutiva, de desarrollo y comportamiento.

Resumen

A pesar de que es cada vez más asequibles para los organismos modelo emergente para obtener genomas secuenciados completamente, más a fondo la función de genes y análisis de expresión de ARN de interferencia y la transgénesis estable siguen siendo limitados en muchas especies debido a la anatomía particular y la biología molecular celular del organismo. Por ejemplo, en las afueras de la corona Caenorhabditis grupo que incluye Caenorhabditis elegans 3, de forma estable de transmisión en las líneas transgénicas no Caenorhabditis especies no han sido reportados en este phylum engañosa (Nematoda), con la excepción de Strongyloides stercoralis 4 y 5 Pristionchus pacificus. Para facilitar la ampliación del papel de P. pacificus en el estudio del desarrollo, la evolución y el comportamiento de 6-7, se describe aquí los métodos actuales para el uso de microinyección para la fabricación de animales transgénicos y knock por RNAi. Al igual que las gónadas de los P. pacificus es sincitial y capaz de incorporar el ADN y ARN en los ovocitos cuando se entrega por microinyección directa. A diferencia de C. elegans Sin embargo, la herencia del transgén estable y la expresión somática en P. pacificus requiere la adición de ADN genómico digerido con endonucleasas auto complementario a los extremos de los transgenes blanco y marcadores coinyección 5. La adición de ADN genómico de transporte es similar a la necesidad de expresión del transgen en Strongyloides stercoralis 4 y en las células germinales de C. elegans. Sin embargo, no está claro si el requisito específico de ADN de los animales genómica propia se debe a P. pacificus soma es muy eficiente en el silenciamiento no complejos multi-copia genes o conjuntos de extracromosómico en P. pacificus requieren secuencias genómicas para el montaje adecuado cinetocoro durante la mitosis. La migración ventral de la (de dos brazosdidelphic) en las gónadas hermafroditas complica aún más la capacidad de inyectar ambas gónadas en los gusanos individual 8. También demostrar el uso de microinyección para derribar un mutante dominante (rodillo, tu92) mediante la inyección de ARN de doble cadena (dsRNA) en las gónadas para obtener información no rodar progenie F 1. A diferencia de C. elegans, pero como la mayoría de otros nematodos, P. pacificus PS312 no es receptiva a RNAi sistémico a través de la alimentación y el remojo y por lo tanto dsRNA debe ser administrado por microinyección en las gónadas sincitial. En este estudio, esperamos que para describir el proceso de microinyección necesarias para transformar un promotor PPA-EGL-4:: reportero GFP fusión y caída de un rodillo dominante prl-1 (tu92) mutante en un protocolo informativo visual.

Protocolo

1. Transgénesis: la preparación de ADN

  1. Dominante co-inyección marcador: pRL3 [PPA-prl-1 (tu92)]
    El pRL3 plásmido es un dominante co-inyección marcador para identificar visualmente los eventos exitosos de transformación. Este plásmido codifica para un alelo mutante dominante (tu92) del gen de la PPA-prl-1 estrechamente relacionado con el SQT-1 gen del colágeno en el C. elegans y transforma la locomoción sinusoidal de tipo salvaje en las agujas del reloj movimientos de torsión a lo largo del cuerpo del gusano del eje 1,5. El animal se transforma muy similar a la del marcador de selección p....

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Discusión

Las poblaciones de P. pacificus se encuentran en estrecha relación con varias especies de escarabajo en todo el mundo y es un modelo intermedio entre los nematodos de vida libre y nematodos parásitos. La fuerza de la P. pacificus como un organismo modelo emergente radica en la integración de sus mapas genéticos y físicos que promuevan la asignación de posición de los mutantes aislados imparcial pantallas adelante genéticos (es decir, no sólo por los genes candidatos previamente caract.......

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Divulgaciones

No hay conflictos de interés declarado.

Agradecimientos

Los autores están muy agradecidos a RJ Sommer y Wang X para obtener ayuda con microinyección, así como de las perspicaces observaciones de los revisores anónimos. Este trabajo es apoyado por el NIH subvención SC2GM089602.

....

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Producto: Catálogo #: Proveedor:
DMI3000 inyección microscopio DMI3000 Leica
Microinyector manipulador (transmisión directa) Narashige BC-3 de rótula Tritech Investigación
Extractor de agujas Narashige PC-10 Tritech Investigación
Microinyector ™ Todo-Digital Multi-La presión del sistema Narashige Minj-D Tritech Investigación
GeneElute ™ mamíferos ADN genómico Miniprep Kit G1N70 Sigma
pJet Jet kit de clonación K1231 Fermentas
GeneJET plásmido kit Miniprep K0502 Fermentas
ADN Clean & Concentrador ™ D4005 Zymo Investigación
BLOCK-IT ™ RNAi TOPO ® kit de transcripción K3500-01 y K3650-01 Invitrogen
Agar Difco ™ Noble DF0142-15-2 Fisher Scientifi
Microscopio cubierta de vidrio (1,5 - 0,16 a 0.19mm de espesor, tamaño: 50 x 45 mm) 12-554-F Fisher Scientific
Capilares de vidrio (filamento) 615000 Los sistemas AM
Aceite de parafina (Heavy) O122-1 Fisher Scientific
KH 2 PO 4 P386-500 Fisher Scientific
Na 2 HPO 4 AC20651-5000 Fisher Scientific
NaCl BP3581 Fisher Scientific
MgSO4 M80-500 Fisher Scientific

Referencias

  1. Fire, A., Xu, S., Montgomery, M. K., Kostas, S. A., Driver, S. E., Mello, C. C. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature. 391, 806-811 (1998).
  2. Ahringer, J. Reverse Genetics. Wormbook. , (2006).
  3. Mello, C. C., Kramer, J. M., Stinchcomb, D., Ambros, V.

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Reimpresiones y permisos

Solicitar permiso para reutilizar el texto o las figuras de este artículo de JoVE

Solicitar permiso

Etiquetas

Silenciamiento g nico por RNAit cnica de microinyecci nprotocolo de transg nesisARN de doble cadenapreparaci n de ADN gen micomicroscop a de fluorescenciainyecci n gonadalcribado de F1herencia estable del transg n

Artículos relacionados