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Artículo de método

Visualización de las bacterias en los nematodos mediante microscopía de fluorescencia

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DOI:

10.3791/4298

19 de octubre de 2012

En este artículo

Resumen

Para estudiar el mutualismo entre Xenorhabdus Bacterias y Steinernema, se han desarrollado métodos para monitorizar la presencia bacteriana y la ubicación dentro de los nematodos. El enfoque experimental, que se puede aplicar a otros sistemas, implica bacterias de ingeniería para expresar la proteína verde fluorescente y la visualización, utilizando bacterias de microscopía de fluorescencia dentro del nematodo transparente.

Resumen

Simbiosis, la convivencia de dos o más organismos, se han generalizado en todos los reinos de la vida. Como dos de los organismos más ubicuos en la tierra, nematodos y bacterias formar una amplia variedad de asociaciones simbióticas que van desde beneficioso para patógena 1-3. Una de estas asociaciones es la relación de beneficio mutuo entre las bacterias y nematodos Steinernema Xenorhabdus, que ha surgido como un sistema modelo de simbiosis 4. Nematodos entomopatógenos Steinernema son, con su simbionte bacteriano para matar insectos 5. Para la transmisión entre huéspedes de insectos, las bacterias colonizan el intestino de la etapa del nemátodo infectivo juvenil 6-8. Recientemente, varias otras especies de nematodos se ha demostrado que las bacterias utilizan para matar insectos 9-13, y las investigaciones han comenzado a examinar las interacciones entre los nematodos y bacterias en estos sistemas <sup> 9.

Se describe un método para la visualización de un simbionte bacteriano dentro de o en un host nematodo, tomando ventaja de la transparencia óptica de los nematodos cuando se vieron por microscopía. Las bacterias se han diseñado para expresar una proteína fluorescente, lo que permite su visualización por microscopía de fluorescencia. Se dispone de muchos plásmidos que llevan los genes que codifican proteínas que presentan fluorescencia a longitudes de onda diferentes (es decir, verde o rojo), y la conjugación de los plásmidos procedentes de una cepa de Escherichia coli donante en un receptor simbionte bacteriano tiene éxito para una amplia gama de bacterias. Los métodos descritos se han desarrollado para investigar la asociación entre Steinernema carpocapsae y Xenorhabdus nematophila 14. Métodos similares se han utilizado para investigar otros bacteria nematodos asociaciones 9, 15-18 y por lo tanto, el enfoque es en general aplicable.

El METhod permite la caracterización de la presencia bacteriana y la localización dentro de los nematodos en diferentes etapas de desarrollo, y proporciona información sobre la naturaleza de la asociación y el proceso de colonización 14, 16, 19. El análisis microscópico revela tanto la frecuencia de colonización dentro de una población y la localización de las bacterias a los tejidos del huésped 14, 16, 19-21. Esto es una ventaja sobre otros métodos de seguimiento de las bacterias dentro de las poblaciones de nematodos, tales como sonicación 22 o molienda 23, que puede proporcionar los niveles medios de la colonización, pero no puede, por ejemplo, discriminar poblaciones con una alta frecuencia de bajas cargas simbiontes de poblaciones con una baja frecuencia de las cargas simbiontes altas. La discriminación de la frecuencia y de la carga de bacterias colonizadoras puede ser especialmente importante en el cribado o la caracterización de mutantes bacterianos para fenotipos colonización 21, 24. En efecto, la microscopía de fluorescencia se ha utilizado en el cribado de alto rendimiento de mutantes bacterianos de los defectos de colonización 17, 18, ​​y es menos laborioso que otros métodos, incluyendo la sonicación 22, 25-27 y disección nematodos individuales 28, 29.

Protocolo

1. Construcción de una cepa bacteriana fluorescente mediante conjugación

  1. Crece la cepa receptora (simbionte para ser examinadas) y la cepa donante durante la noche. La cepa donante, generalmente Escherichia coli, debe ser capaz de donar ADN a través de la conjugación y deben transformarse con un. Plásmido (Tabla 2) que lleva un gen que codifica una proteína fluorescente Dependiendo del plásmido, una cepa auxiliar conjugación también puede ser necesaria. Si es así, esta cepa también se cultivaron durante la noche. La cepa donante y la tensión auxiliar debería ser cultivadas con antibióticos para seleccionar para el mantenimiento de....

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Discusión

El protocolo aquí descrito proporciona un método para la detección óptica de las bacterias dentro de un huésped nematodo (Figura 1). Este método tiene la ventaja de la transparencia óptica de los nematodos y la capacidad de las bacterias de etiquetas fluorescentemente, lo que permite el análisis in vivo de las bacterias dentro del huésped nemátodo (Figura 3). En concreto, este enfoque identifica la localización de bacterias dentro de su huésped. Al contar una población.......

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Divulgaciones

No hay conflictos de interés declarado.

Agradecimientos

Los autores desean agradecer a Eugenio Vivas, Heungens Kurt, Eric Martens, Charles Cowles, Sugar Darby, Stabb Eric, y Ciche Todd por sus contribuciones al desarrollo de este protocolo y las herramientas utilizadas. KEM y JMC fueron apoyados por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) Premio Nacional de Servicio de Investigación T32 (AI55397 "Los microbios en Salud y Enfermedad"). JMC fue apoyado por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF) de Becas de Postgrado de Investigación. Este trabajo fue apoyado por becas de la Fundación Nacional de Ciencia (IOS-0920631-0950873 y IOS).

....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Nombre del reactivo Empresa Número de catálogo Comentarios (opcional)
Lípidos Agar
(Estéril)
8 gramos de caldo nutriente, 15 gramos de agar de extracto de levadura, 5 gramos, 890 ml de agua, 10 ml de 0,2 g / ml de MgCl 2. 6 H 2 0, 96 ml de jarabe de maíz solución *, 4 ml de aceite de maíz *
Revuelva los medios de comunicación mientras se vierte placas
* Añadir ingrediente estéril después del autoclavado
Solución de jarabe de maíz
(Estéril)
7 ml de jarabe de maíz, 89 ml de agua
mezcla y autoclave
Huevo Solution 16,6 ml de sodio 12% de hipoclorito, 5 ml de KOH 5 M, 80 ml de agua
Lisogenia Caldo
(Estéril)
5 gramos de extracto de levadura, 10 g de triptona, 5 gramos de sal, 1 l de agua
mezcla y autoclave
Microcentrifugue Pescador 13-100-675 Cualquier microcentrífuga que contiene tubos de microcentrífuga funcionará
Centrífugo Beckman 366802 Gran mesa centrífuga superior que posee el 15 ml y 50 ml tubos cónicos
Estéril 60 mm X 15 mm Petri Dish Pescador 0875713
50 ml tubos de centrífuga Pescador 05-539-6
15 ml tubos de centrífuga Pescador 05-531-6
Estéril 100 mm X 20 mm Petri Dish Pescador 0875711Z Más profundo que el estándar de placas de Petri
24-así placa Greiner Bio-One 662000-06
Microscopio El microscopio tiene capacidad fluorescentes compatibles con el fluoróforo
Paraformaldehído Microscopía Electrónica de Ciencias 15710
PBS
(Estéril)
8 g de NaCl
0,2 g de KCl
1,44 g de Na 2 HPO 4
0,24 g de KH 2 PO 4
1 L de agua

Ajuste a un pH de 7,4 y agua a 1 L y autoclave
Tubos de microcentrífuga Pescador 05-408-138 2 ml o 1,5 ml tubos
Shaker Cualquier agitador que hace que el líquido se mueva suavemente funcionará
Ácido diaminopimélico Sigma D-1377 Si es necesario, suplementar medios a una concentración de 1 mM o

Referencias

  1. Holterman, M., van der Wurff, A. Phylum-wide analysis of SSU rDNA reveals deep phylogenetic relationships among nematodes and accelerated evolution toward crown clades. Mol. Biol. Evol. 23, 1792-1800 (2006).
  2. Lambshead, P. J. D., Boucher, G.

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Etiquetas

Simbionte bacterianohospedador nematodoXenorhabdus nematophilaSteinernema carpocapsaemétodo de conjugaciónaislamiento de huevosfrecuencia de colonizaciónmicroscopía ópticamarcaje con GFP