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Preparación de líneas celulares de Derribo condicional de la expresión génica y la medición de los efectos desmontables en la muerte celular inducida por E4orf4

DOI:

10.3791/4442

October 21st, 2012

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Summary

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Contribución del factor de remodelación de la cromatina ACF a la muerte celular inducida por E4orf4 se midió. El protocolo incluye la selección de clones de células en las que el tratamiento con doxiciclina induce desmontables condicional de la ACF subunidades Acf1 y SNF2h, y el uso del ensayo de DAPI para medir E4orf4 inducida por la muerte celular en las líneas celulares inducibles.

Abstract

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Inactivación funcional de la expresión génica en células de mamífero es crucial para el estudio de la contribución de una proteína de interés a 1,2 diversas vías. Sin embargo, desmontables condicional de la expresión génica se requiere en los casos cuando desmontables constitutiva no es tolerado por las células durante un largo periodo de tiempo 3-5. Aquí se describe un protocolo para la preparación de líneas celulares que permiten desmontables condicional de subunidades del factor de remodelación de la cromatina ACF. Estas líneas celulares de facilitar la determinación de la contribución de la ACF para la inducción de muerte celular por el adenovirus E4orf4 proteína 6. Las secuencias que codifican los ARN de horquilla corta para las subunidades Acf1 y SNF2h del factor de remodelación de la cromatina ACF se clonaron al lado de un promotor inducible por doxiciclina en un plásmido también contiene un gen para el gen de resistencia a neomicina. Resistentes a la neomicina se seleccionaron clones de células en presencia de G418 y aislado. Las líneas celulares resultantes fueron inducidos porel tratamiento con doxiciclina, y una vez Acf1 o los niveles de expresión reducida SNF2h fueron, las células fueron transfectadas con un plásmido que codifica E4orf4 o un vector vacío. Para confirmar el efecto específico de las construcciones shRNA, los niveles de Acf1 o SNF2h proteínas se restauraron a niveles de tipo silvestre por cotransfección con un plásmido que expresa Acf1 o SNF2h que se volvieron resistentes a la shRNA por introducción de mutaciones silenciosas. La capacidad de E4orf4 para inducir la muerte celular en las diferentes muestras se determinó por un ensayo de DAPI, en los que se midió la frecuencia de aparición de núcleos con morfologías apoptóticas en la población de células transfectadas 7-9.

El protocolo aquí descrito puede ser utilizado para la determinación de la contribución funcional de proteínas diferentes a la inducción de muerte celular por los socios de sus proteínas en los casos en que puede ser desmontables constitutiva celular letal.

Protocol

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1. Generación de líneas celulares inducibles

  1. Antes del experimento se necesita para encontrar la concentración mínima del fármaco G418 que mata todas las células utilizadas para la preparación de las líneas celulares deseados. Para este propósito, la placa de las células de elección en varios duplicados de placas a 70% de confluencia en el medio que se utilizará durante el experimento y añadir concentraciones crecientes de G418 (0-1.000 g por ml). Monitorear las células diariamente para determinar la concentración mínima G418 que mata a las células de manera eficiente. La muerte celular se observa dentro de 3-7 días.
  2. Antes de la generación de lín....

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Discussion

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Desmontables de la expresión génica específica es un enfoque importante para la investigación de la contribución de una proteína a las vías de regulación. Desde desmontables constitutivo de expresión de genes esenciales afecta negativamente la proliferación celular, su estudio puede requerir ya sea introducción transitoria de siRNAs o la aplicación de sistemas estables desmontables condicionales. Generación de líneas celulares estables con capacidad de expresión inducida por el fármaco de shRNAs descritos aquí, proporci.......

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Disclosures

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No hay conflictos de interés declarado.

Acknowledgements

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Este trabajo fue apoyado (en parte) por la Israel Science Foundation (Grant 399/11), por la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) en el marco de la cooperación germano-israelí Proyecto (DIP), y por el Instituto de la Familia Rappaport de Investigación en las Ciencias Médicas.

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Nombre del reactivo Empresa Número de catálogo Comentarios (opcional)
Alta glucosa DMEM Gibco 41965
Tet sistema aprobado de FBS Clontech 631106
L-glutamina Gibco 25030
Pen Strep Gibco 15140
0,25% de tripsina-EDTA Gibco 25200
T-Rex-293 células Invitrogen R710-07
G418 Sigma A1720
blasticidin Invitrogen R210-01
pSuperior.neo + plásmido GFP Oligoengine VEC-PBS-0007/0008
jetPIE Transfección Polyplus 101-40
doxiciclina Sigma D9891
paraformaldehído Microscopía Electrónica de Ciencias 15710
4 ',6-diamidino-2-fenilindol (DAPI) Sigma D9542
Fluoromount-G SouthernBiotech 0100-01

References

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  1. Brummelkamp, T. R., Bernards, R., Agami, R. A system for stable expression of short interfering RNAs in mammalian cells. Science (New York, N.Y). 296, 550-553 (2002).
  2. Brummelkamp, T. R., Bernards, R., Agami, R. Stable suppression of tumorigenicity by virus-med....

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Conditional KnockdownGene Expression KnockdownE4orf4 Induced Cell DeathDoxycycline InductionshRNA Cell LinesChromatin RemodelingACF SubunitsWestern BlotDAPI AssayApoptotic Morphology

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